Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A109FBZ6

Protein Details
Accession A0A109FBZ6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
27-48LSIPTRRKTSPSKRASPAKVGAHydrophilic
440-470GPSTPSPSAAHKKRRARRRQPSSPVKQETDPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
449-459AHKKRRARRRQ
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 11.5, cyto 5.5, pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009061  DNA-bd_dom_put_sf  
IPR000465  XPA  
IPR022656  XPA_C  
IPR037129  XPA_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF05181  XPA_C  
CDD cd21075  DBD_XPA-like  
Amino Acid Sequences MQSSDEYSDPHDHPSDDDYDPRPSSSLSIPTRRKTSPSKRASPAKVGAQAPIEPLKRTLSLYSLPAEIIDAILYEPTLRIHDHMALARTCRTLRAVYYTPPPAGNTYASFSSPVWAALVAQRPFEGQGRPSYSYKHMAIAGLYPSKEKETRLKHLWSDRFDESKMIVLGSKRTSEQRKWDRALSTYVVHPAKHKKMLIRSEEWTDAIADVAKQRITKTTAKQNYKLSDAELGRIHCIEKPNPCHRGGAPMQLYVEAVVERVAYKLHGGYQGHLELVKTLAERAAKANQTRRAKAAGTWQPPTPQKTPKKSRQAGGNGDEPKPTPGWRQLTPPPIVLGDDDHDDEASSPTSGPSRAAAPGSIFISDNASHALMSMEPKTPTRRPMKRAFQDEDEDEDEEDTIIFATPPPLSQQRQQQQQQLPTPLSPFGGVDPVSMVMGAGPSTPSPSAAHKKRRARRRQPSSPVKQETDPVGGMVMAYDDSRLGLGTGQGENDEVKPSFGKPLQVAVASGSGSAAGPAQALPKFEGLAWLSPCSEDAAVVVGGGFTAQQDARGFEGGVKKEEQEEQTLRRNDGRPARRGTKRDYSIYA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.31
3 0.27
4 0.32
5 0.3
6 0.34
7 0.35
8 0.34
9 0.31
10 0.27
11 0.28
12 0.27
13 0.33
14 0.34
15 0.44
16 0.51
17 0.56
18 0.62
19 0.62
20 0.64
21 0.66
22 0.69
23 0.69
24 0.72
25 0.74
26 0.77
27 0.84
28 0.84
29 0.82
30 0.77
31 0.74
32 0.71
33 0.63
34 0.57
35 0.49
36 0.44
37 0.39
38 0.39
39 0.34
40 0.27
41 0.29
42 0.28
43 0.27
44 0.29
45 0.26
46 0.23
47 0.24
48 0.26
49 0.26
50 0.23
51 0.21
52 0.19
53 0.18
54 0.14
55 0.11
56 0.08
57 0.06
58 0.05
59 0.05
60 0.05
61 0.05
62 0.05
63 0.06
64 0.08
65 0.09
66 0.1
67 0.13
68 0.16
69 0.19
70 0.22
71 0.25
72 0.25
73 0.27
74 0.28
75 0.29
76 0.26
77 0.25
78 0.25
79 0.23
80 0.23
81 0.29
82 0.29
83 0.3
84 0.37
85 0.39
86 0.37
87 0.36
88 0.35
89 0.29
90 0.29
91 0.27
92 0.22
93 0.21
94 0.21
95 0.2
96 0.21
97 0.18
98 0.17
99 0.16
100 0.14
101 0.11
102 0.09
103 0.1
104 0.12
105 0.2
106 0.2
107 0.2
108 0.2
109 0.2
110 0.22
111 0.24
112 0.22
113 0.16
114 0.23
115 0.28
116 0.32
117 0.32
118 0.34
119 0.36
120 0.39
121 0.38
122 0.33
123 0.29
124 0.25
125 0.25
126 0.23
127 0.23
128 0.2
129 0.19
130 0.17
131 0.17
132 0.21
133 0.22
134 0.23
135 0.28
136 0.33
137 0.41
138 0.47
139 0.51
140 0.53
141 0.61
142 0.65
143 0.59
144 0.58
145 0.53
146 0.5
147 0.45
148 0.4
149 0.31
150 0.28
151 0.24
152 0.19
153 0.16
154 0.15
155 0.18
156 0.19
157 0.2
158 0.18
159 0.25
160 0.32
161 0.35
162 0.45
163 0.51
164 0.58
165 0.6
166 0.63
167 0.58
168 0.54
169 0.53
170 0.45
171 0.36
172 0.29
173 0.32
174 0.29
175 0.26
176 0.29
177 0.33
178 0.37
179 0.41
180 0.42
181 0.4
182 0.48
183 0.55
184 0.56
185 0.52
186 0.49
187 0.47
188 0.46
189 0.41
190 0.32
191 0.24
192 0.18
193 0.14
194 0.11
195 0.08
196 0.07
197 0.09
198 0.09
199 0.1
200 0.1
201 0.14
202 0.19
203 0.24
204 0.29
205 0.38
206 0.46
207 0.51
208 0.56
209 0.59
210 0.57
211 0.54
212 0.49
213 0.39
214 0.37
215 0.31
216 0.29
217 0.25
218 0.23
219 0.2
220 0.2
221 0.19
222 0.15
223 0.18
224 0.19
225 0.23
226 0.31
227 0.38
228 0.42
229 0.42
230 0.42
231 0.39
232 0.43
233 0.38
234 0.38
235 0.31
236 0.28
237 0.27
238 0.25
239 0.25
240 0.16
241 0.15
242 0.07
243 0.05
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.05
248 0.04
249 0.04
250 0.05
251 0.05
252 0.07
253 0.11
254 0.11
255 0.12
256 0.14
257 0.14
258 0.14
259 0.14
260 0.12
261 0.08
262 0.08
263 0.08
264 0.06
265 0.05
266 0.07
267 0.07
268 0.08
269 0.1
270 0.14
271 0.17
272 0.21
273 0.27
274 0.34
275 0.38
276 0.39
277 0.39
278 0.37
279 0.34
280 0.32
281 0.35
282 0.35
283 0.33
284 0.34
285 0.33
286 0.35
287 0.38
288 0.41
289 0.36
290 0.38
291 0.43
292 0.51
293 0.6
294 0.65
295 0.72
296 0.72
297 0.71
298 0.71
299 0.7
300 0.66
301 0.6
302 0.57
303 0.49
304 0.45
305 0.42
306 0.33
307 0.27
308 0.22
309 0.2
310 0.16
311 0.2
312 0.24
313 0.24
314 0.29
315 0.34
316 0.39
317 0.39
318 0.37
319 0.3
320 0.26
321 0.25
322 0.2
323 0.15
324 0.1
325 0.1
326 0.09
327 0.09
328 0.08
329 0.08
330 0.08
331 0.08
332 0.07
333 0.06
334 0.06
335 0.06
336 0.08
337 0.08
338 0.08
339 0.08
340 0.09
341 0.1
342 0.1
343 0.1
344 0.1
345 0.11
346 0.11
347 0.11
348 0.1
349 0.09
350 0.11
351 0.11
352 0.11
353 0.1
354 0.09
355 0.08
356 0.08
357 0.08
358 0.06
359 0.08
360 0.09
361 0.11
362 0.12
363 0.14
364 0.2
365 0.23
366 0.31
367 0.39
368 0.45
369 0.5
370 0.59
371 0.68
372 0.7
373 0.76
374 0.72
375 0.66
376 0.63
377 0.57
378 0.51
379 0.43
380 0.35
381 0.27
382 0.22
383 0.18
384 0.13
385 0.11
386 0.07
387 0.05
388 0.04
389 0.04
390 0.04
391 0.06
392 0.06
393 0.06
394 0.1
395 0.16
396 0.18
397 0.23
398 0.33
399 0.39
400 0.49
401 0.54
402 0.59
403 0.6
404 0.65
405 0.66
406 0.61
407 0.54
408 0.46
409 0.43
410 0.35
411 0.28
412 0.21
413 0.16
414 0.12
415 0.13
416 0.12
417 0.1
418 0.1
419 0.1
420 0.09
421 0.08
422 0.07
423 0.04
424 0.05
425 0.05
426 0.04
427 0.04
428 0.05
429 0.07
430 0.07
431 0.09
432 0.1
433 0.17
434 0.27
435 0.36
436 0.47
437 0.54
438 0.64
439 0.72
440 0.82
441 0.86
442 0.87
443 0.89
444 0.9
445 0.91
446 0.92
447 0.94
448 0.93
449 0.92
450 0.88
451 0.81
452 0.71
453 0.64
454 0.57
455 0.49
456 0.39
457 0.29
458 0.22
459 0.18
460 0.16
461 0.12
462 0.08
463 0.05
464 0.05
465 0.05
466 0.04
467 0.05
468 0.05
469 0.05
470 0.05
471 0.05
472 0.06
473 0.09
474 0.09
475 0.1
476 0.1
477 0.11
478 0.12
479 0.12
480 0.15
481 0.12
482 0.13
483 0.14
484 0.15
485 0.21
486 0.22
487 0.25
488 0.22
489 0.27
490 0.28
491 0.27
492 0.26
493 0.21
494 0.2
495 0.16
496 0.15
497 0.1
498 0.08
499 0.07
500 0.07
501 0.06
502 0.05
503 0.05
504 0.06
505 0.1
506 0.11
507 0.13
508 0.14
509 0.15
510 0.15
511 0.15
512 0.19
513 0.18
514 0.22
515 0.22
516 0.22
517 0.22
518 0.21
519 0.22
520 0.19
521 0.17
522 0.12
523 0.1
524 0.1
525 0.1
526 0.09
527 0.09
528 0.06
529 0.06
530 0.06
531 0.05
532 0.03
533 0.06
534 0.06
535 0.1
536 0.11
537 0.13
538 0.15
539 0.16
540 0.16
541 0.18
542 0.26
543 0.25
544 0.28
545 0.28
546 0.27
547 0.29
548 0.35
549 0.33
550 0.34
551 0.37
552 0.4
553 0.48
554 0.52
555 0.51
556 0.53
557 0.54
558 0.54
559 0.59
560 0.62
561 0.6
562 0.65
563 0.72
564 0.74
565 0.76
566 0.76
567 0.77
568 0.75