FuNGI

A0A109FB56

Protein Details

Accession

A0A109FB56

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
254-277	DSEDDAPKRKKRKQRGEASAARGK	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
160-162	KKR
260-287	PKRKKRKQRGEASAARGKKKANNKKSKQ

Subcellular Location(s)

mito 9.5, mito_nucl 9.333, cyto_nucl 8.333, nucl 8, cyto 7.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR013197 RNA_pol_III_RPC82-rel_HTH IPR008806 RNA_pol_III_Rpc82_C IPR039748 RPC3 IPR024550 TFIIEa/SarR/Rpc3_HTH_dom IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003697 F:single-stranded DNA binding GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF08221 HTH_9 PF05645 RNA_pol_Rpc82 PF02002 TFIIE_alpha

Amino Acid Sequences

MSSATQSGTERSRLLQHVVYQQFGAAVGEIASILLFRGALSFPQLAKLTALPPSLVHASLLVLSTHCLLFHSETEVGGRLTELYELNHDAIERRLRGGMYVEMAIEWEGGPQLGQVVEVLWKEGMLRREDLVEVVRCQLAAERGVDDFGAGMDGDDPKGKKRAKEADKVAEDAERLVRKAFAQGYIQIVTPGSQLSPSSLEIKWEEELRALIKGIPSTKDLKEVKDKLKQKQKSWAEEERARAMGKSTDVAAEDSEDDAPKRKKRKQRGEASAARGKKKANNKKSKQGIFSKGGSDPDTVSERGDDSDDDDDDGAPEEVFYRVNEERFHLQWRAHLLRSYASDLYNPQIATVLGIILDITTTDCQSMAETQSRPVSLHQISQYYERLKHKPDLSAALAKHKHDPSWPPSAKRGSSPRAGDYILATCEVLSGLDRWGISTRETLLMQQGESTHAKWAVDWAMLGKAMKRSLVEAIIRDKLGDKAIRCWRILEAKGKLEEKHLARLAFLPVKEAREVLSQLSSAGLIEPQEIPRSADRAPSRTIYLWFVDFNKVVTSLIHHHYKALANLQAQRQHQLELRRGLVDKRERSDVRADPTLLSARDREMIVELDKVLEALSVACLRVDEQLFVLREFDPEPEVV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.35
2	0.35
3	0.37
4	0.43
5	0.44
6	0.43
7	0.36
8	0.33
9	0.29
10	0.25
11	0.2
12	0.1
13	0.08
14	0.06
15	0.06
16	0.06
17	0.06
18	0.05
19	0.04
20	0.04
21	0.04
22	0.04
23	0.04
24	0.06
25	0.06
26	0.07
27	0.11
28	0.14
29	0.14
30	0.19
31	0.21
32	0.2
33	0.21
34	0.22
35	0.2
36	0.22
37	0.22
38	0.18
39	0.17
40	0.21
41	0.21
42	0.2
43	0.18
44	0.13
45	0.13
46	0.14
47	0.14
48	0.1
49	0.09
50	0.09
51	0.11
52	0.1
53	0.1
54	0.09
55	0.11
56	0.13
57	0.14
58	0.18
59	0.17
60	0.17
61	0.18
62	0.19
63	0.17
64	0.14
65	0.13
66	0.09
67	0.09
68	0.11
69	0.1
70	0.09
71	0.12
72	0.14
73	0.15
74	0.15
75	0.14
76	0.14
77	0.18
78	0.24
79	0.22
80	0.21
81	0.23
82	0.23
83	0.24
84	0.25
85	0.22
86	0.18
87	0.17
88	0.15
89	0.13
90	0.14
91	0.12
92	0.1
93	0.08
94	0.06
95	0.05
96	0.05
97	0.05
98	0.05
99	0.05
100	0.05
101	0.05
102	0.05
103	0.05
104	0.08
105	0.08
106	0.09
107	0.08
108	0.08
109	0.09
110	0.13
111	0.17
112	0.17
113	0.19
114	0.19
115	0.2
116	0.21
117	0.21
118	0.22
119	0.2
120	0.19
121	0.19
122	0.18
123	0.17
124	0.16
125	0.17
126	0.15
127	0.14
128	0.14
129	0.13
130	0.13
131	0.14
132	0.13
133	0.11
134	0.08
135	0.06
136	0.06
137	0.04
138	0.04
139	0.05
140	0.06
141	0.06
142	0.1
143	0.11
144	0.13
145	0.22
146	0.25
147	0.27
148	0.36
149	0.46
150	0.51
151	0.6
152	0.65
153	0.67
154	0.66
155	0.64
156	0.56
157	0.47
158	0.39
159	0.3
160	0.28
161	0.19
162	0.17
163	0.17
164	0.17
165	0.15
166	0.2
167	0.2
168	0.17
169	0.18
170	0.19
171	0.22
172	0.22
173	0.21
174	0.17
175	0.15
176	0.13
177	0.11
178	0.1
179	0.07
180	0.06
181	0.06
182	0.07
183	0.09
184	0.1
185	0.13
186	0.13
187	0.15
188	0.16
189	0.18
190	0.17
191	0.17
192	0.16
193	0.13
194	0.14
195	0.13
196	0.13
197	0.11
198	0.11
199	0.1
200	0.12
201	0.13
202	0.14
203	0.16
204	0.19
205	0.2
206	0.27
207	0.28
208	0.3
209	0.38
210	0.43
211	0.47
212	0.52
213	0.58
214	0.59
215	0.68
216	0.71
217	0.65
218	0.69
219	0.7
220	0.69
221	0.7
222	0.68
223	0.66
224	0.63
225	0.62
226	0.54
227	0.48
228	0.4
229	0.33
230	0.26
231	0.2
232	0.16
233	0.14
234	0.11
235	0.1
236	0.11
237	0.11
238	0.1
239	0.08
240	0.08
241	0.08
242	0.08
243	0.08
244	0.08
245	0.14
246	0.19
247	0.25
248	0.34
249	0.41
250	0.5
251	0.61
252	0.72
253	0.76
254	0.82
255	0.85
256	0.85
257	0.84
258	0.82
259	0.77
260	0.7
261	0.62
262	0.54
263	0.46
264	0.42
265	0.46
266	0.5
267	0.54
268	0.61
269	0.65
270	0.72
271	0.8
272	0.79
273	0.75
274	0.72
275	0.68
276	0.61
277	0.56
278	0.49
279	0.41
280	0.37
281	0.32
282	0.25
283	0.18
284	0.16
285	0.17
286	0.15
287	0.13
288	0.12
289	0.11
290	0.1
291	0.11
292	0.08
293	0.08
294	0.09
295	0.08
296	0.08
297	0.08
298	0.07
299	0.07
300	0.08
301	0.06
302	0.04
303	0.04
304	0.05
305	0.05
306	0.05
307	0.05
308	0.09
309	0.1
310	0.11
311	0.12
312	0.14
313	0.17
314	0.17
315	0.21
316	0.19
317	0.18
318	0.19
319	0.26
320	0.26
321	0.24
322	0.25
323	0.22
324	0.22
325	0.23
326	0.24
327	0.18
328	0.15
329	0.15
330	0.14
331	0.15
332	0.15
333	0.13
334	0.1
335	0.1
336	0.09
337	0.09
338	0.08
339	0.06
340	0.04
341	0.04
342	0.04
343	0.03
344	0.03
345	0.02
346	0.03
347	0.04
348	0.04
349	0.04
350	0.04
351	0.05
352	0.05
353	0.07
354	0.08
355	0.12
356	0.13
357	0.15
358	0.16
359	0.17
360	0.17
361	0.16
362	0.2
363	0.17
364	0.2
365	0.2
366	0.21
367	0.21
368	0.24
369	0.27
370	0.24
371	0.29
372	0.31
373	0.33
374	0.35
375	0.4
376	0.39
377	0.39
378	0.38
379	0.37
380	0.35
381	0.36
382	0.33
383	0.36
384	0.36
385	0.33
386	0.38
387	0.34
388	0.32
389	0.31
390	0.36
391	0.32
392	0.41
393	0.43
394	0.4
395	0.45
396	0.5
397	0.47
398	0.47
399	0.5
400	0.44
401	0.47
402	0.47
403	0.42
404	0.39
405	0.38
406	0.32
407	0.26
408	0.23
409	0.16
410	0.14
411	0.12
412	0.09
413	0.08
414	0.08
415	0.06
416	0.05
417	0.05
418	0.05
419	0.07
420	0.07
421	0.08
422	0.1
423	0.11
424	0.11
425	0.12
426	0.13
427	0.14
428	0.15
429	0.14
430	0.17
431	0.16
432	0.15
433	0.15
434	0.14
435	0.15
436	0.16
437	0.16
438	0.15
439	0.15
440	0.15
441	0.14
442	0.17
443	0.14
444	0.13
445	0.12
446	0.11
447	0.1
448	0.11
449	0.12
450	0.11
451	0.13
452	0.14
453	0.15
454	0.14
455	0.15
456	0.16
457	0.2
458	0.2
459	0.19
460	0.23
461	0.24
462	0.24
463	0.22
464	0.21
465	0.19
466	0.22
467	0.23
468	0.2
469	0.26
470	0.35
471	0.39
472	0.38
473	0.38
474	0.38
475	0.42
476	0.45
477	0.45
478	0.41
479	0.42
480	0.47
481	0.49
482	0.45
483	0.41
484	0.44
485	0.38
486	0.41
487	0.39
488	0.34
489	0.32
490	0.33
491	0.35
492	0.32
493	0.3
494	0.26
495	0.25
496	0.27
497	0.27
498	0.25
499	0.21
500	0.2
501	0.21
502	0.18
503	0.17
504	0.15
505	0.15
506	0.15
507	0.13
508	0.09
509	0.08
510	0.07
511	0.06
512	0.08
513	0.09
514	0.11
515	0.13
516	0.14
517	0.16
518	0.18
519	0.2
520	0.2
521	0.26
522	0.29
523	0.3
524	0.33
525	0.33
526	0.35
527	0.34
528	0.36
529	0.31
530	0.29
531	0.27
532	0.25
533	0.25
534	0.26
535	0.23
536	0.22
537	0.2
538	0.18
539	0.17
540	0.15
541	0.17
542	0.18
543	0.23
544	0.28
545	0.27
546	0.27
547	0.31
548	0.33
549	0.33
550	0.32
551	0.31
552	0.3
553	0.36
554	0.41
555	0.44
556	0.42
557	0.45
558	0.4
559	0.39
560	0.39
561	0.41
562	0.43
563	0.42
564	0.43
565	0.41
566	0.42
567	0.43
568	0.48
569	0.5
570	0.49
571	0.48
572	0.55
573	0.53
574	0.55
575	0.59
576	0.56
577	0.53
578	0.52
579	0.49
580	0.41
581	0.43
582	0.44
583	0.37
584	0.33
585	0.28
586	0.24
587	0.26
588	0.25
589	0.22
590	0.19
591	0.21
592	0.2
593	0.2
594	0.18
595	0.16
596	0.16
597	0.14
598	0.12
599	0.09
600	0.08
601	0.06
602	0.09
603	0.09
604	0.09
605	0.1
606	0.1
607	0.11
608	0.16
609	0.17
610	0.15
611	0.15
612	0.22
613	0.23
614	0.24
615	0.25
616	0.19
617	0.2
618	0.2
619	0.2

A0A109FB56

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer