Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A109FHF1

Protein Details
Accession A0A109FHF1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MPKGGKNRRRGKNENEGDKREBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-12GKNRRRGK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR006196  RNA-binding_domain_S1_IF1  
IPR001253  TIF_eIF-1A  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50832  S1_IF1_TYPE  
CDD cd05793  S1_IF1A  
Amino Acid Sequences MPKGGKNRRRGKNENEGDKRELVFKEEGQEYAQVIKMLGNGRVWINQGDIVLLSLRDFQDGKADVIQKYSSDEARKLKQYGELPETAKINETDVYGGEDGDDMVDFGEVSGEDEGPLNGAVPESDSDESIGGGKDDFDIDDI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.86
2 0.84
3 0.79
4 0.73
5 0.68
6 0.59
7 0.53
8 0.44
9 0.37
10 0.31
11 0.27
12 0.28
13 0.26
14 0.26
15 0.22
16 0.23
17 0.19
18 0.18
19 0.18
20 0.13
21 0.11
22 0.11
23 0.13
24 0.14
25 0.15
26 0.13
27 0.13
28 0.14
29 0.15
30 0.16
31 0.13
32 0.13
33 0.12
34 0.11
35 0.1
36 0.09
37 0.08
38 0.07
39 0.06
40 0.06
41 0.07
42 0.07
43 0.08
44 0.08
45 0.08
46 0.12
47 0.14
48 0.14
49 0.15
50 0.18
51 0.16
52 0.18
53 0.18
54 0.13
55 0.14
56 0.14
57 0.14
58 0.13
59 0.17
60 0.2
61 0.23
62 0.27
63 0.26
64 0.25
65 0.28
66 0.3
67 0.31
68 0.3
69 0.3
70 0.27
71 0.29
72 0.29
73 0.23
74 0.21
75 0.16
76 0.14
77 0.12
78 0.11
79 0.09
80 0.09
81 0.11
82 0.09
83 0.09
84 0.08
85 0.07
86 0.06
87 0.06
88 0.06
89 0.03
90 0.03
91 0.03
92 0.03
93 0.03
94 0.04
95 0.03
96 0.05
97 0.06
98 0.05
99 0.06
100 0.06
101 0.06
102 0.07
103 0.07
104 0.06
105 0.05
106 0.05
107 0.05
108 0.06
109 0.07
110 0.1
111 0.11
112 0.11
113 0.12
114 0.12
115 0.12
116 0.12
117 0.11
118 0.08
119 0.08
120 0.08
121 0.08
122 0.08