Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A109FFV3

Protein Details
Accession A0A109FFV3    Localization Confidence High Confidence Score 15.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
374-398GKGKGGGRKKAAPQKKRSRASEDEDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
359-392KGKKRKAATASASAAGKGKGGGRKKAAPQKKRSR
428-429RK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 14.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011513  Nse1  
IPR014857  Nse1_RING_C4HC3-type  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0030915  C:Smc5-Smc6 complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0016740  F:transferase activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF07574  SMC_Nse1  
PF08746  zf-RING-like  
Amino Acid Sequences MAPRASASNGRRRAAADSDGDDDRRQPVAGPSRQRQKGQANGIQAAYDAEVDALQLDHPEKTLRHLFLQTLMSRKVIPLDTARELYMHCVKLCKVKHPDAFETFVAELEPGLSLCGLDIKTTRDQDSGASFIALVNTIEDEVSKLATDYKAEEIAFFRAVVDKIMTARKLAYSTPSDEAVRLAKAPITKANAMQLLTSFLANGWLSLHSSGRLMLSPRSLLELAPYLRETFSQGEDSNDEDAPDCEQERTIVDCNLCMSIVTSGYACPNKGCGIRLHTYCVAQRLGQDGRCPARLDPNNTNACQQIWPRDPTTRKFYGTVVGVLAFEDAGDDDDNDDDDEEEEDEDDMSSMAAGSSAVKGKKRKAATASASAAGKGKGGGRKKAAPQKKRSRASEDEDEDEEDELEDDDDEDEAYGGGRAASSPAARRKRSSRAAAATTRADDSADEEEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.44
3 0.38
4 0.34
5 0.36
6 0.37
7 0.37
8 0.33
9 0.3
10 0.27
11 0.24
12 0.21
13 0.19
14 0.25
15 0.33
16 0.4
17 0.48
18 0.54
19 0.63
20 0.69
21 0.71
22 0.71
23 0.7
24 0.71
25 0.71
26 0.68
27 0.63
28 0.6
29 0.57
30 0.48
31 0.39
32 0.31
33 0.21
34 0.16
35 0.1
36 0.07
37 0.06
38 0.06
39 0.06
40 0.05
41 0.05
42 0.07
43 0.08
44 0.08
45 0.1
46 0.13
47 0.13
48 0.2
49 0.27
50 0.27
51 0.3
52 0.32
53 0.32
54 0.34
55 0.39
56 0.36
57 0.34
58 0.33
59 0.31
60 0.29
61 0.28
62 0.27
63 0.22
64 0.23
65 0.22
66 0.26
67 0.29
68 0.3
69 0.29
70 0.25
71 0.25
72 0.27
73 0.29
74 0.26
75 0.23
76 0.24
77 0.25
78 0.33
79 0.35
80 0.39
81 0.41
82 0.48
83 0.53
84 0.57
85 0.61
86 0.57
87 0.59
88 0.49
89 0.44
90 0.35
91 0.29
92 0.23
93 0.16
94 0.12
95 0.08
96 0.08
97 0.05
98 0.05
99 0.04
100 0.04
101 0.04
102 0.07
103 0.07
104 0.08
105 0.09
106 0.13
107 0.19
108 0.21
109 0.23
110 0.21
111 0.21
112 0.22
113 0.24
114 0.21
115 0.16
116 0.14
117 0.12
118 0.11
119 0.11
120 0.09
121 0.07
122 0.05
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.05
127 0.05
128 0.05
129 0.05
130 0.05
131 0.05
132 0.07
133 0.07
134 0.08
135 0.09
136 0.11
137 0.13
138 0.13
139 0.13
140 0.13
141 0.14
142 0.14
143 0.12
144 0.11
145 0.11
146 0.11
147 0.11
148 0.1
149 0.09
150 0.11
151 0.14
152 0.14
153 0.12
154 0.13
155 0.13
156 0.14
157 0.14
158 0.16
159 0.16
160 0.18
161 0.2
162 0.21
163 0.2
164 0.19
165 0.19
166 0.17
167 0.14
168 0.12
169 0.1
170 0.1
171 0.11
172 0.12
173 0.15
174 0.17
175 0.17
176 0.18
177 0.2
178 0.21
179 0.2
180 0.18
181 0.15
182 0.13
183 0.13
184 0.12
185 0.09
186 0.06
187 0.08
188 0.08
189 0.08
190 0.06
191 0.06
192 0.07
193 0.07
194 0.08
195 0.06
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.08
200 0.08
201 0.09
202 0.1
203 0.1
204 0.1
205 0.11
206 0.11
207 0.1
208 0.1
209 0.12
210 0.11
211 0.11
212 0.12
213 0.1
214 0.1
215 0.1
216 0.12
217 0.1
218 0.11
219 0.12
220 0.12
221 0.13
222 0.13
223 0.15
224 0.14
225 0.12
226 0.11
227 0.1
228 0.1
229 0.09
230 0.09
231 0.08
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.08
236 0.1
237 0.11
238 0.12
239 0.12
240 0.12
241 0.13
242 0.12
243 0.11
244 0.08
245 0.07
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.05
250 0.06
251 0.09
252 0.1
253 0.1
254 0.09
255 0.1
256 0.13
257 0.14
258 0.16
259 0.15
260 0.2
261 0.25
262 0.26
263 0.3
264 0.28
265 0.29
266 0.29
267 0.29
268 0.24
269 0.2
270 0.2
271 0.2
272 0.22
273 0.21
274 0.22
275 0.23
276 0.25
277 0.27
278 0.28
279 0.23
280 0.3
281 0.34
282 0.39
283 0.4
284 0.46
285 0.48
286 0.47
287 0.48
288 0.39
289 0.35
290 0.31
291 0.28
292 0.27
293 0.28
294 0.31
295 0.32
296 0.39
297 0.43
298 0.45
299 0.5
300 0.46
301 0.43
302 0.42
303 0.4
304 0.37
305 0.33
306 0.29
307 0.22
308 0.18
309 0.15
310 0.14
311 0.13
312 0.07
313 0.05
314 0.04
315 0.04
316 0.05
317 0.05
318 0.05
319 0.05
320 0.06
321 0.07
322 0.07
323 0.07
324 0.06
325 0.06
326 0.07
327 0.07
328 0.07
329 0.07
330 0.07
331 0.07
332 0.07
333 0.06
334 0.05
335 0.05
336 0.04
337 0.04
338 0.04
339 0.03
340 0.03
341 0.04
342 0.06
343 0.11
344 0.14
345 0.2
346 0.26
347 0.32
348 0.4
349 0.44
350 0.49
351 0.5
352 0.57
353 0.57
354 0.6
355 0.57
356 0.53
357 0.49
358 0.42
359 0.38
360 0.29
361 0.23
362 0.16
363 0.18
364 0.22
365 0.27
366 0.34
367 0.38
368 0.45
369 0.54
370 0.63
371 0.68
372 0.71
373 0.77
374 0.81
375 0.86
376 0.88
377 0.85
378 0.84
379 0.81
380 0.79
381 0.79
382 0.72
383 0.66
384 0.58
385 0.53
386 0.45
387 0.37
388 0.29
389 0.19
390 0.15
391 0.11
392 0.09
393 0.07
394 0.07
395 0.07
396 0.07
397 0.07
398 0.06
399 0.06
400 0.05
401 0.06
402 0.05
403 0.05
404 0.05
405 0.05
406 0.05
407 0.07
408 0.09
409 0.12
410 0.19
411 0.29
412 0.39
413 0.43
414 0.5
415 0.57
416 0.65
417 0.72
418 0.73
419 0.73
420 0.73
421 0.76
422 0.75
423 0.72
424 0.66
425 0.59
426 0.52
427 0.42
428 0.34
429 0.26
430 0.24