Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A109FL90

Protein Details
Accession A0A109FL90    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
261-289GPDPTAPGSPRKKRKPGPVTSPHFKKAKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
187-193GKGKKKG
269-290SPRKKRKPGPVTSPHFKKAKKV
Subcellular Location(s) cyto 12, mito 10, nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015886  DNA_glyclase/AP_lyase_DNA-bd  
IPR035937  MutM-like_N-ter  
IPR010979  Ribosomal_S13-like_H2TH  
Gene Ontology GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0003906  F:DNA-(apurinic or apyrimidinic site) endonuclease activity  
GO:0016799  F:hydrolase activity, hydrolyzing N-glycosyl compounds  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006284  P:base-excision repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF06831  H2TH  
Amino Acid Sequences MSGMAHVRGQASPVYRVPRAKSPGTDAIWPPEKYCKLAITFEGDDGEIGEWAFCDPRRLGRIKLVDADESELTRVPPLGDLGADPLLAMPSVDTLADAFAKRSAPIKAVLLDQNGPLCGIGNYMVDEILYQAAIHPSLPASYIGQPSQRDLLAELHAQIRAVTVAAVAVDANAERFPDNWLFKFRWGKGKKKGKEVLFLLPDGSTSSISHLTVGGRTSAIVDKVQKLPEDLDAFLATPKRSRIAADLDGDKAVDAQQLVGGPDPTAPGSPRKKRKPGPVTSPHFKKAKKVT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.34
3 0.4
4 0.43
5 0.48
6 0.51
7 0.52
8 0.5
9 0.52
10 0.55
11 0.52
12 0.54
13 0.47
14 0.49
15 0.51
16 0.48
17 0.42
18 0.43
19 0.42
20 0.39
21 0.4
22 0.36
23 0.32
24 0.35
25 0.35
26 0.33
27 0.32
28 0.3
29 0.28
30 0.23
31 0.19
32 0.17
33 0.15
34 0.08
35 0.07
36 0.06
37 0.05
38 0.06
39 0.08
40 0.08
41 0.11
42 0.12
43 0.18
44 0.25
45 0.28
46 0.31
47 0.37
48 0.43
49 0.42
50 0.46
51 0.42
52 0.37
53 0.35
54 0.35
55 0.28
56 0.22
57 0.19
58 0.14
59 0.13
60 0.12
61 0.11
62 0.08
63 0.08
64 0.08
65 0.08
66 0.07
67 0.07
68 0.09
69 0.09
70 0.08
71 0.07
72 0.06
73 0.06
74 0.06
75 0.05
76 0.03
77 0.03
78 0.04
79 0.04
80 0.04
81 0.04
82 0.05
83 0.06
84 0.06
85 0.06
86 0.08
87 0.08
88 0.09
89 0.12
90 0.12
91 0.12
92 0.14
93 0.15
94 0.15
95 0.17
96 0.18
97 0.18
98 0.17
99 0.17
100 0.15
101 0.14
102 0.12
103 0.09
104 0.08
105 0.06
106 0.06
107 0.06
108 0.05
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.05
113 0.05
114 0.05
115 0.04
116 0.04
117 0.03
118 0.03
119 0.04
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.05
126 0.05
127 0.06
128 0.09
129 0.1
130 0.11
131 0.14
132 0.14
133 0.15
134 0.16
135 0.14
136 0.12
137 0.12
138 0.13
139 0.11
140 0.11
141 0.11
142 0.11
143 0.11
144 0.11
145 0.09
146 0.07
147 0.06
148 0.05
149 0.04
150 0.03
151 0.03
152 0.03
153 0.03
154 0.03
155 0.03
156 0.03
157 0.03
158 0.03
159 0.03
160 0.04
161 0.04
162 0.05
163 0.08
164 0.13
165 0.15
166 0.16
167 0.2
168 0.21
169 0.27
170 0.34
171 0.34
172 0.4
173 0.43
174 0.51
175 0.57
176 0.67
177 0.67
178 0.69
179 0.74
180 0.68
181 0.7
182 0.64
183 0.61
184 0.53
185 0.47
186 0.38
187 0.3
188 0.26
189 0.19
190 0.17
191 0.1
192 0.08
193 0.1
194 0.11
195 0.11
196 0.11
197 0.11
198 0.11
199 0.11
200 0.12
201 0.1
202 0.09
203 0.08
204 0.1
205 0.11
206 0.12
207 0.13
208 0.15
209 0.18
210 0.22
211 0.25
212 0.24
213 0.23
214 0.23
215 0.26
216 0.25
217 0.22
218 0.2
219 0.18
220 0.18
221 0.18
222 0.2
223 0.16
224 0.16
225 0.17
226 0.18
227 0.18
228 0.2
229 0.22
230 0.26
231 0.3
232 0.32
233 0.33
234 0.32
235 0.31
236 0.29
237 0.25
238 0.18
239 0.14
240 0.11
241 0.08
242 0.07
243 0.08
244 0.09
245 0.1
246 0.11
247 0.11
248 0.1
249 0.1
250 0.11
251 0.11
252 0.12
253 0.13
254 0.21
255 0.31
256 0.41
257 0.52
258 0.61
259 0.71
260 0.78
261 0.87
262 0.89
263 0.89
264 0.89
265 0.89
266 0.88
267 0.88
268 0.87
269 0.83
270 0.81
271 0.72