FuNGI

A0A109FCT2

Protein Details

Accession

A0A109FCT2

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
359-384	YTPIDTAKQLRKRRLRRGEDPRVLPA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
369-375	RKRRLRR

Subcellular Location(s)

mito 17, cyto 5.5, cyto_nucl 5.5, nucl 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007133 RNA_pol_II-assoc_Paf1
Gene Ontology	GO:0016593 C:Cdc73/Paf1 complex GO:0016570 P:histone modification GO:0006368 P:transcription elongation by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF03985 Paf1

Amino Acid Sequences

MSSQKSSKADLLVRVRYQNPLPAPPFPPKLLHIPTTPHRYATYDFLAPIQGERELPMILDAELGMPLELGKTAPGAPSMGGDYWLGNRSAIAPPPLTKGNEDANIGDEDAFLLDDPTAAATSTAAGSGPGTPGRANVVDVSKKVDVSWLRKTEYLSSEAGNMRHALQNLNGNAKPAPAELDPLDRDGRAAAIAATFDAAHIPLSELRHPTKRGVTAVESFDLLPDDDLWANEYDLVRFGEDPSSIATNEPPRLGPDPRLPRAIFRDLTEVLPEGQGRVAYYLPINDDTALSYTEKRYSAEETLEDEAFEFRWVRDYEIAGMRQLTQEFVFSFDAGEEATAGEAKVKPITTAARQKGAYYTPIDTAKQLRKRRLRRGEDPRVLPAPIDPETGMPEEAFWDGINLKLVAPEKSFPPEELARWRAFKEQVSAPLPRPVQETAAAKREGEKVDVGESAAANGVAEGQATVVEEAMQALEGGAQAASGESQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.56
2	0.54
3	0.53
4	0.51
5	0.5
6	0.46
7	0.47
8	0.46
9	0.46
10	0.48
11	0.51
12	0.53
13	0.48
14	0.47
15	0.42
16	0.47
17	0.47
18	0.47
19	0.42
20	0.44
21	0.5
22	0.55
23	0.53
24	0.47
25	0.43
26	0.43
27	0.42
28	0.41
29	0.37
30	0.3
31	0.29
32	0.27
33	0.27
34	0.24
35	0.22
36	0.18
37	0.14
38	0.12
39	0.13
40	0.14
41	0.12
42	0.12
43	0.11
44	0.11
45	0.09
46	0.09
47	0.08
48	0.07
49	0.07
50	0.07
51	0.06
52	0.05
53	0.05
54	0.05
55	0.05
56	0.05
57	0.05
58	0.06
59	0.07
60	0.08
61	0.08
62	0.09
63	0.09
64	0.1
65	0.12
66	0.11
67	0.11
68	0.11
69	0.11
70	0.13
71	0.15
72	0.14
73	0.12
74	0.12
75	0.13
76	0.16
77	0.18
78	0.18
79	0.18
80	0.19
81	0.23
82	0.27
83	0.26
84	0.24
85	0.26
86	0.28
87	0.28
88	0.28
89	0.25
90	0.23
91	0.22
92	0.21
93	0.17
94	0.12
95	0.09
96	0.08
97	0.08
98	0.05
99	0.05
100	0.04
101	0.04
102	0.04
103	0.05
104	0.05
105	0.05
106	0.05
107	0.04
108	0.05
109	0.05
110	0.05
111	0.05
112	0.05
113	0.05
114	0.06
115	0.07
116	0.07
117	0.08
118	0.08
119	0.09
120	0.12
121	0.12
122	0.12
123	0.13
124	0.18
125	0.19
126	0.2
127	0.24
128	0.22
129	0.21
130	0.2
131	0.24
132	0.24
133	0.27
134	0.36
135	0.35
136	0.36
137	0.38
138	0.4
139	0.4
140	0.37
141	0.34
142	0.27
143	0.23
144	0.25
145	0.26
146	0.25
147	0.2
148	0.18
149	0.16
150	0.18
151	0.18
152	0.15
153	0.14
154	0.2
155	0.21
156	0.25
157	0.24
158	0.22
159	0.22
160	0.21
161	0.19
162	0.14
163	0.15
164	0.1
165	0.12
166	0.11
167	0.15
168	0.16
169	0.17
170	0.18
171	0.15
172	0.15
173	0.12
174	0.12
175	0.07
176	0.07
177	0.05
178	0.04
179	0.04
180	0.04
181	0.04
182	0.04
183	0.04
184	0.04
185	0.04
186	0.04
187	0.04
188	0.05
189	0.07
190	0.09
191	0.11
192	0.14
193	0.18
194	0.22
195	0.24
196	0.26
197	0.28
198	0.29
199	0.28
200	0.27
201	0.27
202	0.26
203	0.26
204	0.23
205	0.2
206	0.17
207	0.15
208	0.13
209	0.1
210	0.07
211	0.05
212	0.06
213	0.05
214	0.05
215	0.07
216	0.07
217	0.07
218	0.08
219	0.08
220	0.07
221	0.08
222	0.08
223	0.07
224	0.07
225	0.08
226	0.07
227	0.07
228	0.08
229	0.08
230	0.08
231	0.08
232	0.08
233	0.1
234	0.12
235	0.13
236	0.13
237	0.12
238	0.13
239	0.16
240	0.17
241	0.19
242	0.24
243	0.31
244	0.33
245	0.38
246	0.35
247	0.36
248	0.4
249	0.42
250	0.34
251	0.27
252	0.29
253	0.26
254	0.26
255	0.23
256	0.18
257	0.13
258	0.13
259	0.12
260	0.08
261	0.07
262	0.07
263	0.06
264	0.07
265	0.06
266	0.06
267	0.07
268	0.07
269	0.08
270	0.09
271	0.09
272	0.08
273	0.08
274	0.08
275	0.09
276	0.09
277	0.09
278	0.09
279	0.1
280	0.13
281	0.14
282	0.14
283	0.15
284	0.17
285	0.18
286	0.18
287	0.18
288	0.18
289	0.2
290	0.19
291	0.17
292	0.14
293	0.12
294	0.11
295	0.11
296	0.09
297	0.06
298	0.12
299	0.12
300	0.14
301	0.16
302	0.16
303	0.19
304	0.23
305	0.23
306	0.18
307	0.18
308	0.17
309	0.17
310	0.16
311	0.13
312	0.09
313	0.1
314	0.09
315	0.12
316	0.12
317	0.1
318	0.1
319	0.09
320	0.09
321	0.08
322	0.07
323	0.04
324	0.04
325	0.04
326	0.04
327	0.04
328	0.06
329	0.07
330	0.08
331	0.1
332	0.1
333	0.1
334	0.13
335	0.17
336	0.22
337	0.31
338	0.34
339	0.38
340	0.38
341	0.38
342	0.39
343	0.37
344	0.33
345	0.26
346	0.25
347	0.23
348	0.25
349	0.25
350	0.24
351	0.3
352	0.35
353	0.42
354	0.47
355	0.54
356	0.62
357	0.71
358	0.8
359	0.83
360	0.84
361	0.85
362	0.89
363	0.9
364	0.88
365	0.81
366	0.76
367	0.68
368	0.59
369	0.48
370	0.38
371	0.32
372	0.24
373	0.23
374	0.17
375	0.15
376	0.18
377	0.19
378	0.18
379	0.13
380	0.12
381	0.11
382	0.11
383	0.11
384	0.08
385	0.08
386	0.08
387	0.09
388	0.11
389	0.1
390	0.09
391	0.13
392	0.15
393	0.16
394	0.18
395	0.19
396	0.19
397	0.24
398	0.26
399	0.23
400	0.27
401	0.27
402	0.29
403	0.36
404	0.39
405	0.37
406	0.39
407	0.4
408	0.4
409	0.41
410	0.4
411	0.37
412	0.38
413	0.42
414	0.43
415	0.46
416	0.42
417	0.46
418	0.43
419	0.39
420	0.38
421	0.31
422	0.3
423	0.32
424	0.35
425	0.33
426	0.39
427	0.38
428	0.35
429	0.38
430	0.41
431	0.37
432	0.34
433	0.3
434	0.25
435	0.26
436	0.26
437	0.23
438	0.18
439	0.16
440	0.14
441	0.12
442	0.1
443	0.08
444	0.07
445	0.07
446	0.05
447	0.06
448	0.05
449	0.04
450	0.05
451	0.06
452	0.06
453	0.05
454	0.06
455	0.06
456	0.06
457	0.06
458	0.06
459	0.05
460	0.05
461	0.05
462	0.05
463	0.06
464	0.05
465	0.05
466	0.04

A0A109FCT2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer