Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A109FDF3

Protein Details
Accession A0A109FDF3    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
257-279ERLRAKAQKRLDKEKDRAKRDVKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
117-152RAPPKAKGNKAGKPRSNARGSAHSKGKGETARERMV
259-286LRAKAQKRLDKEKDRAKRDVKGKGKARE
410-441RSRKTKVAATASTARRGGKAPGDNKKKKKATA
Subcellular Location(s) cyto 9.5, cyto_nucl 8.5, mito 8, nucl 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018327  BHD_2  
IPR004583  DNA_repair_Rad4  
IPR038765  Papain-like_cys_pep_sf  
IPR018325  Rad4/PNGase_transGLS-fold  
IPR018326  Rad4_beta-hairpin_dom1  
IPR018328  Rad4_beta-hairpin_dom3  
IPR042488  Rad4_BHD3_sf  
IPR036985  Transglutaminase-like_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF10403  BHD_1  
PF10404  BHD_2  
PF10405  BHD_3  
PF03835  Rad4  
Amino Acid Sequences MSRYSTPLGSASASASASASESDYAVGRFPSNASTPNRHPLAAGYADQGYGGDHDHEQDADEEEEEEEAWDEVDIPQAAPPPPPLGSTADSLNAGTAEHGSATAGAGGAGIEIVIGRAPPKAKGNKAGKPRSNARGSAHSKGKGETARERMVRQERHKAHVMALLAMGLIRNRWLNDPELQARLVSQVPAALLNAFAHITPTRYPNARDRSRLFDRALSDLTSWWYTAFEIVPGKELSRRDVVEVEQEVESWEEEGERLRAKAQKRLDKEKDRAKRDVKGKGKAREPPLDPERIPLFPWQESPYLLTTSQRIAALDKSASTSKLPLHPASGQLIRPYEPASSSWEVLRPPPIEHKQTLNLAASTLRGSKDLSAQLFVALLRAIDIPARLVVSLQALEWRSRAQTTAPPARSRKTKVAATASTARRGGKAPGDNKKKKKATAPVIRKTHFDTTTDDDDADFVAVDQEADRQKSRSKAKSTAAPQSKAKATSAAKSGTSSAASDGSRPPRPTNGKGRSGANTTDPDVLVLSSSASAATSASDTDGSFEDGRGKLKYKVPKVNLRGPSSGAKVAAWKKDQQLRRGTSPDAYELSIAPAQWVEAYTRYNKEWIVVDPVRKRMRCAKLMEPPRAAARGGGAGNVLAYVVAYEEDGSARDVTPRYARAFVNVTLKSRVPTSSKVRKENGGSDWFAGMIAPFGRGFKLNRDVEEEEELWHRQANAPMPTSIGGFKSHPNYVLEQHLHRDEALRPGSKSLGLFKGEFTIFRRSDVVNVRSTENWYRTGRVVKSNEIPMKFVKQRAVTIHQRREEELAKMDGGEVDEQPLYAEEQTETYIPPPVVDGKVPKNNFGNIDLFVPSMLPAGAVHLRSKYAAKCAKELGIDYGEAIMGFEFRQRRALPVISGIVVAQEHEDTLRAAVATLEQSTYERELAKQQDRVLKRWKKLIQGLRIRQRLLDQFSQPEQATEPASVVRSLDRCLSASGTSAAIAQPSASETGPATSRLGKRPTISPSPSEEAPLPKRPARFAEPGSLSGKSTTGRSLRVRMPKAEEPPSNGHTPRRTTRSSARSVVGASDSTEEGPKGTGASAGMEGKPKGDEAQGDEVSASEGSEGGFEFDDDF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.13
3 0.11
4 0.11
5 0.11
6 0.11
7 0.09
8 0.09
9 0.1
10 0.11
11 0.11
12 0.12
13 0.12
14 0.12
15 0.12
16 0.13
17 0.16
18 0.18
19 0.25
20 0.3
21 0.36
22 0.41
23 0.49
24 0.51
25 0.46
26 0.44
27 0.4
28 0.39
29 0.35
30 0.31
31 0.25
32 0.23
33 0.23
34 0.22
35 0.19
36 0.13
37 0.1
38 0.1
39 0.1
40 0.1
41 0.12
42 0.13
43 0.13
44 0.13
45 0.14
46 0.16
47 0.14
48 0.14
49 0.13
50 0.12
51 0.13
52 0.12
53 0.11
54 0.09
55 0.08
56 0.07
57 0.06
58 0.07
59 0.07
60 0.11
61 0.11
62 0.1
63 0.12
64 0.16
65 0.17
66 0.18
67 0.2
68 0.19
69 0.19
70 0.2
71 0.21
72 0.22
73 0.23
74 0.23
75 0.23
76 0.22
77 0.22
78 0.2
79 0.18
80 0.14
81 0.11
82 0.1
83 0.09
84 0.07
85 0.07
86 0.07
87 0.07
88 0.07
89 0.07
90 0.06
91 0.05
92 0.05
93 0.05
94 0.05
95 0.04
96 0.04
97 0.03
98 0.03
99 0.02
100 0.03
101 0.03
102 0.04
103 0.04
104 0.08
105 0.1
106 0.14
107 0.23
108 0.31
109 0.37
110 0.46
111 0.55
112 0.6
113 0.69
114 0.76
115 0.75
116 0.75
117 0.78
118 0.77
119 0.74
120 0.71
121 0.65
122 0.65
123 0.64
124 0.64
125 0.63
126 0.59
127 0.54
128 0.5
129 0.52
130 0.46
131 0.47
132 0.46
133 0.46
134 0.5
135 0.51
136 0.51
137 0.54
138 0.58
139 0.62
140 0.61
141 0.64
142 0.61
143 0.65
144 0.7
145 0.62
146 0.55
147 0.5
148 0.43
149 0.33
150 0.28
151 0.22
152 0.15
153 0.13
154 0.11
155 0.07
156 0.06
157 0.07
158 0.09
159 0.11
160 0.15
161 0.17
162 0.2
163 0.24
164 0.31
165 0.32
166 0.32
167 0.31
168 0.28
169 0.26
170 0.25
171 0.22
172 0.15
173 0.12
174 0.1
175 0.1
176 0.11
177 0.11
178 0.08
179 0.08
180 0.08
181 0.08
182 0.08
183 0.07
184 0.09
185 0.09
186 0.12
187 0.13
188 0.16
189 0.2
190 0.23
191 0.28
192 0.34
193 0.44
194 0.48
195 0.54
196 0.55
197 0.59
198 0.63
199 0.65
200 0.58
201 0.53
202 0.48
203 0.45
204 0.42
205 0.35
206 0.28
207 0.23
208 0.24
209 0.2
210 0.18
211 0.13
212 0.12
213 0.11
214 0.12
215 0.11
216 0.11
217 0.13
218 0.13
219 0.16
220 0.16
221 0.16
222 0.19
223 0.2
224 0.21
225 0.24
226 0.24
227 0.23
228 0.25
229 0.25
230 0.27
231 0.27
232 0.25
233 0.2
234 0.19
235 0.18
236 0.16
237 0.15
238 0.09
239 0.08
240 0.06
241 0.06
242 0.08
243 0.1
244 0.11
245 0.11
246 0.15
247 0.2
248 0.23
249 0.31
250 0.38
251 0.45
252 0.51
253 0.62
254 0.68
255 0.72
256 0.78
257 0.81
258 0.81
259 0.79
260 0.8
261 0.75
262 0.74
263 0.72
264 0.73
265 0.71
266 0.72
267 0.74
268 0.72
269 0.73
270 0.72
271 0.71
272 0.69
273 0.64
274 0.63
275 0.6
276 0.58
277 0.51
278 0.49
279 0.45
280 0.37
281 0.36
282 0.31
283 0.3
284 0.25
285 0.27
286 0.25
287 0.23
288 0.23
289 0.24
290 0.21
291 0.19
292 0.19
293 0.17
294 0.16
295 0.16
296 0.18
297 0.16
298 0.14
299 0.14
300 0.15
301 0.16
302 0.15
303 0.14
304 0.15
305 0.15
306 0.16
307 0.15
308 0.16
309 0.17
310 0.22
311 0.25
312 0.23
313 0.25
314 0.26
315 0.27
316 0.29
317 0.29
318 0.24
319 0.23
320 0.24
321 0.21
322 0.21
323 0.2
324 0.17
325 0.15
326 0.15
327 0.18
328 0.19
329 0.19
330 0.19
331 0.2
332 0.2
333 0.2
334 0.25
335 0.2
336 0.2
337 0.28
338 0.33
339 0.36
340 0.37
341 0.39
342 0.38
343 0.39
344 0.4
345 0.33
346 0.27
347 0.22
348 0.21
349 0.17
350 0.14
351 0.14
352 0.11
353 0.1
354 0.11
355 0.11
356 0.15
357 0.18
358 0.18
359 0.17
360 0.16
361 0.16
362 0.16
363 0.14
364 0.11
365 0.07
366 0.06
367 0.05
368 0.05
369 0.05
370 0.06
371 0.06
372 0.06
373 0.06
374 0.07
375 0.06
376 0.05
377 0.06
378 0.06
379 0.06
380 0.06
381 0.09
382 0.1
383 0.1
384 0.11
385 0.12
386 0.12
387 0.12
388 0.13
389 0.11
390 0.15
391 0.22
392 0.31
393 0.33
394 0.39
395 0.41
396 0.46
397 0.51
398 0.51
399 0.52
400 0.49
401 0.48
402 0.48
403 0.52
404 0.48
405 0.46
406 0.49
407 0.43
408 0.4
409 0.39
410 0.33
411 0.28
412 0.28
413 0.26
414 0.23
415 0.29
416 0.32
417 0.41
418 0.51
419 0.59
420 0.65
421 0.73
422 0.72
423 0.69
424 0.7
425 0.69
426 0.69
427 0.71
428 0.74
429 0.73
430 0.76
431 0.73
432 0.66
433 0.61
434 0.57
435 0.48
436 0.39
437 0.34
438 0.31
439 0.34
440 0.32
441 0.28
442 0.21
443 0.19
444 0.18
445 0.14
446 0.08
447 0.04
448 0.04
449 0.04
450 0.04
451 0.04
452 0.07
453 0.09
454 0.11
455 0.12
456 0.13
457 0.17
458 0.24
459 0.33
460 0.37
461 0.41
462 0.46
463 0.49
464 0.56
465 0.57
466 0.59
467 0.57
468 0.53
469 0.49
470 0.46
471 0.45
472 0.38
473 0.34
474 0.31
475 0.26
476 0.25
477 0.27
478 0.25
479 0.22
480 0.21
481 0.22
482 0.16
483 0.15
484 0.12
485 0.1
486 0.11
487 0.1
488 0.11
489 0.14
490 0.18
491 0.22
492 0.24
493 0.24
494 0.3
495 0.36
496 0.4
497 0.47
498 0.49
499 0.51
500 0.52
501 0.53
502 0.48
503 0.45
504 0.4
505 0.32
506 0.27
507 0.22
508 0.21
509 0.18
510 0.15
511 0.13
512 0.11
513 0.08
514 0.06
515 0.05
516 0.04
517 0.04
518 0.03
519 0.03
520 0.03
521 0.03
522 0.04
523 0.04
524 0.04
525 0.04
526 0.05
527 0.05
528 0.06
529 0.06
530 0.08
531 0.08
532 0.08
533 0.11
534 0.11
535 0.12
536 0.13
537 0.14
538 0.17
539 0.22
540 0.29
541 0.34
542 0.41
543 0.45
544 0.53
545 0.57
546 0.61
547 0.62
548 0.59
549 0.52
550 0.47
551 0.44
552 0.37
553 0.32
554 0.24
555 0.17
556 0.19
557 0.22
558 0.24
559 0.23
560 0.24
561 0.28
562 0.35
563 0.39
564 0.4
565 0.45
566 0.45
567 0.47
568 0.47
569 0.43
570 0.38
571 0.35
572 0.3
573 0.23
574 0.19
575 0.15
576 0.12
577 0.13
578 0.11
579 0.1
580 0.08
581 0.07
582 0.06
583 0.06
584 0.06
585 0.05
586 0.06
587 0.08
588 0.1
589 0.13
590 0.13
591 0.15
592 0.14
593 0.15
594 0.15
595 0.15
596 0.2
597 0.2
598 0.26
599 0.28
600 0.36
601 0.41
602 0.39
603 0.41
604 0.43
605 0.47
606 0.47
607 0.49
608 0.49
609 0.51
610 0.59
611 0.62
612 0.53
613 0.48
614 0.43
615 0.39
616 0.32
617 0.23
618 0.16
619 0.13
620 0.12
621 0.11
622 0.09
623 0.08
624 0.07
625 0.07
626 0.06
627 0.03
628 0.02
629 0.02
630 0.02
631 0.02
632 0.02
633 0.03
634 0.03
635 0.04
636 0.04
637 0.05
638 0.06
639 0.06
640 0.08
641 0.08
642 0.1
643 0.13
644 0.15
645 0.16
646 0.19
647 0.19
648 0.2
649 0.23
650 0.23
651 0.28
652 0.27
653 0.27
654 0.26
655 0.26
656 0.24
657 0.23
658 0.23
659 0.18
660 0.23
661 0.31
662 0.39
663 0.45
664 0.51
665 0.52
666 0.54
667 0.54
668 0.53
669 0.49
670 0.43
671 0.37
672 0.31
673 0.29
674 0.24
675 0.2
676 0.15
677 0.09
678 0.06
679 0.05
680 0.05
681 0.05
682 0.05
683 0.06
684 0.09
685 0.1
686 0.14
687 0.23
688 0.23
689 0.24
690 0.3
691 0.31
692 0.31
693 0.34
694 0.29
695 0.21
696 0.22
697 0.22
698 0.16
699 0.16
700 0.14
701 0.13
702 0.15
703 0.2
704 0.21
705 0.22
706 0.21
707 0.21
708 0.21
709 0.2
710 0.18
711 0.13
712 0.12
713 0.11
714 0.15
715 0.17
716 0.18
717 0.19
718 0.2
719 0.21
720 0.22
721 0.26
722 0.26
723 0.24
724 0.26
725 0.25
726 0.24
727 0.22
728 0.22
729 0.18
730 0.22
731 0.25
732 0.24
733 0.23
734 0.24
735 0.25
736 0.24
737 0.23
738 0.2
739 0.2
740 0.2
741 0.2
742 0.19
743 0.22
744 0.2
745 0.21
746 0.2
747 0.24
748 0.23
749 0.24
750 0.26
751 0.22
752 0.28
753 0.34
754 0.34
755 0.3
756 0.32
757 0.32
758 0.31
759 0.35
760 0.35
761 0.3
762 0.32
763 0.29
764 0.3
765 0.31
766 0.37
767 0.35
768 0.38
769 0.39
770 0.38
771 0.41
772 0.47
773 0.49
774 0.43
775 0.42
776 0.36
777 0.41
778 0.4
779 0.39
780 0.36
781 0.33
782 0.36
783 0.4
784 0.45
785 0.48
786 0.54
787 0.59
788 0.58
789 0.57
790 0.55
791 0.54
792 0.49
793 0.42
794 0.35
795 0.28
796 0.23
797 0.22
798 0.2
799 0.16
800 0.14
801 0.13
802 0.09
803 0.09
804 0.09
805 0.09
806 0.09
807 0.08
808 0.08
809 0.07
810 0.08
811 0.07
812 0.08
813 0.09
814 0.09
815 0.09
816 0.09
817 0.12
818 0.11
819 0.11
820 0.11
821 0.13
822 0.14
823 0.16
824 0.21
825 0.25
826 0.33
827 0.34
828 0.37
829 0.37
830 0.39
831 0.39
832 0.37
833 0.31
834 0.24
835 0.25
836 0.21
837 0.18
838 0.15
839 0.13
840 0.1
841 0.08
842 0.07
843 0.05
844 0.04
845 0.08
846 0.1
847 0.12
848 0.13
849 0.13
850 0.14
851 0.16
852 0.2
853 0.19
854 0.25
855 0.31
856 0.32
857 0.34
858 0.36
859 0.37
860 0.35
861 0.34
862 0.29
863 0.24
864 0.21
865 0.18
866 0.16
867 0.13
868 0.11
869 0.1
870 0.06
871 0.05
872 0.05
873 0.09
874 0.11
875 0.12
876 0.18
877 0.19
878 0.22
879 0.26
880 0.29
881 0.26
882 0.27
883 0.28
884 0.22
885 0.22
886 0.19
887 0.15
888 0.12
889 0.11
890 0.08
891 0.06
892 0.06
893 0.06
894 0.07
895 0.06
896 0.07
897 0.07
898 0.06
899 0.06
900 0.06
901 0.07
902 0.08
903 0.08
904 0.08
905 0.08
906 0.09
907 0.11
908 0.13
909 0.14
910 0.14
911 0.14
912 0.21
913 0.29
914 0.34
915 0.36
916 0.4
917 0.47
918 0.49
919 0.55
920 0.59
921 0.59
922 0.58
923 0.64
924 0.64
925 0.64
926 0.7
927 0.73
928 0.72
929 0.74
930 0.79
931 0.79
932 0.8
933 0.71
934 0.63
935 0.6
936 0.57
937 0.53
938 0.49
939 0.43
940 0.42
941 0.44
942 0.47
943 0.41
944 0.35
945 0.3
946 0.26
947 0.24
948 0.19
949 0.17
950 0.14
951 0.15
952 0.14
953 0.13
954 0.16
955 0.15
956 0.17
957 0.2
958 0.2
959 0.2
960 0.21
961 0.22
962 0.18
963 0.19
964 0.18
965 0.15
966 0.14
967 0.13
968 0.12
969 0.1
970 0.1
971 0.08
972 0.07
973 0.08
974 0.09
975 0.08
976 0.09
977 0.09
978 0.12
979 0.13
980 0.15
981 0.16
982 0.21
983 0.26
984 0.33
985 0.37
986 0.39
987 0.41
988 0.46
989 0.51
990 0.53
991 0.52
992 0.48
993 0.5
994 0.51
995 0.49
996 0.45
997 0.41
998 0.4
999 0.43
1000 0.48
1001 0.47
1002 0.46
1003 0.49
1004 0.5
1005 0.54
1006 0.52
1007 0.54
1008 0.49
1009 0.52
1010 0.51
1011 0.52
1012 0.5
1013 0.44
1014 0.38
1015 0.31
1016 0.3
1017 0.21
1018 0.2
1019 0.23
1020 0.23
1021 0.29
1022 0.34
1023 0.39
1024 0.46
1025 0.55
1026 0.58
1027 0.57
1028 0.62
1029 0.63
1030 0.65
1031 0.67
1032 0.63
1033 0.59
1034 0.61
1035 0.59
1036 0.58
1037 0.54
1038 0.54
1039 0.52
1040 0.57
1041 0.59
1042 0.6
1043 0.6
1044 0.6
1045 0.67
1046 0.68
1047 0.69
1048 0.66
1049 0.59
1050 0.54
1051 0.5
1052 0.45
1053 0.37
1054 0.29
1055 0.22
1056 0.19
1057 0.18
1058 0.17
1059 0.18
1060 0.15
1061 0.14
1062 0.14
1063 0.13
1064 0.11
1065 0.11
1066 0.11
1067 0.1
1068 0.11
1069 0.14
1070 0.16
1071 0.17
1072 0.21
1073 0.21
1074 0.21
1075 0.21
1076 0.2
1077 0.19
1078 0.19
1079 0.21
1080 0.22
1081 0.3
1082 0.29
1083 0.29
1084 0.28
1085 0.26
1086 0.24
1087 0.21
1088 0.15
1089 0.07
1090 0.07
1091 0.06
1092 0.07
1093 0.07
1094 0.07
1095 0.07