FuNGI

A0A109FG52

Protein Details

Accession

A0A109FG52

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
403-433	DSDGGRKKKGSSKRRKKRVKRRVKAEGDSDQ	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
284-309	ARKGGKANGKKAAKSSSSSSSKRKKG
329-349	GKKGKGGKRAANGKARRKRAK
375-388	AAKKGKGKRRRAGK
407-426	GRKKKGSSKRRKKRVKRRVK

Subcellular Location(s)

mito 12.5, cyto_mito 10.333, cyto_nucl 7.333, cyto 7, nucl 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007832 RNA_pol_Rpc34 IPR016049 RNA_pol_Rpc34-like IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05158 RNA_pol_Rpc34

Amino Acid Sequences

MPPRASTSSAGAAAASAKKLSPVELKLLNAGLAVKGGEMLQNDLFAACGLSVTATTMDAVNGLLRKGLAQMLRTPSGQTMFRFLGKEEAKAMSSMDAEEKLVLNHIRDAGNMGIWSRTLTTKTGLPRATIAKALKVLEGKKTIKTVKSVKTPTRKIYMLTGIAPSVELTGGPWFTDNELDVELVETLKKVVRKFLQQKSQPPSVTVTDPSTSESTRIKPIYPVTATPLLPTSEQVLEWILKSGAAIVDLTKEHVEDLLDLMVFDGDVEKVLVNRLGPDGMPVAARKGGKANGKKAAKSSSSSSSKRKKGAESSSSDEDSDGSDTGGGTGKKGKGGKRAANGKARRKRAKLGSDTETESDDDQSSDFDSDAAAPSAAKKGKGKRRRAGKGSEDDDEEEEEASGDSDGGRKKKGSSKRRKKRVKRRVKAEGDSDQGVSSSESEDESSKRRKRGAAVEEADEAAEGGAGTDGGNTQYVYRMIRQYRPTVGWTDMPCGRCPVEEFCSEPPRRRAEAVRRPAQVSTGAPSTRIEFEGGIQGIGMLGGAGAAIGVSDAKWGELKGGIGNGVAPVNPVDCPAYKAWLDF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.2
2	0.17
3	0.14
4	0.13
5	0.16
6	0.17
7	0.21
8	0.24
9	0.25
10	0.3
11	0.33
12	0.34
13	0.33
14	0.33
15	0.29
16	0.23
17	0.2
18	0.14
19	0.11
20	0.1
21	0.07
22	0.07
23	0.07
24	0.09
25	0.09
26	0.12
27	0.12
28	0.12
29	0.12
30	0.12
31	0.12
32	0.09
33	0.09
34	0.05
35	0.05
36	0.04
37	0.05
38	0.05
39	0.06
40	0.06
41	0.06
42	0.07
43	0.07
44	0.07
45	0.07
46	0.07
47	0.09
48	0.09
49	0.09
50	0.1
51	0.09
52	0.1
53	0.11
54	0.15
55	0.15
56	0.16
57	0.23
58	0.28
59	0.3
60	0.31
61	0.3
62	0.29
63	0.3
64	0.31
65	0.26
66	0.26
67	0.26
68	0.28
69	0.28
70	0.26
71	0.32
72	0.29
73	0.3
74	0.27
75	0.27
76	0.24
77	0.24
78	0.24
79	0.16
80	0.15
81	0.14
82	0.14
83	0.12
84	0.12
85	0.12
86	0.12
87	0.11
88	0.14
89	0.15
90	0.14
91	0.15
92	0.18
93	0.17
94	0.17
95	0.2
96	0.16
97	0.16
98	0.15
99	0.13
100	0.11
101	0.1
102	0.11
103	0.1
104	0.11
105	0.12
106	0.13
107	0.15
108	0.19
109	0.24
110	0.31
111	0.3
112	0.29
113	0.31
114	0.34
115	0.33
116	0.35
117	0.31
118	0.26
119	0.28
120	0.28
121	0.27
122	0.28
123	0.28
124	0.28
125	0.34
126	0.33
127	0.33
128	0.39
129	0.41
130	0.4
131	0.45
132	0.48
133	0.48
134	0.56
135	0.61
136	0.64
137	0.69
138	0.73
139	0.71
140	0.69
141	0.62
142	0.54
143	0.51
144	0.48
145	0.4
146	0.34
147	0.3
148	0.23
149	0.22
150	0.2
151	0.14
152	0.09
153	0.07
154	0.05
155	0.05
156	0.06
157	0.06
158	0.06
159	0.07
160	0.07
161	0.08
162	0.09
163	0.09
164	0.08
165	0.08
166	0.08
167	0.08
168	0.08
169	0.07
170	0.07
171	0.06
172	0.05
173	0.05
174	0.08
175	0.11
176	0.11
177	0.18
178	0.22
179	0.32
180	0.42
181	0.5
182	0.57
183	0.61
184	0.69
185	0.69
186	0.72
187	0.62
188	0.54
189	0.49
190	0.42
191	0.37
192	0.31
193	0.27
194	0.2
195	0.2
196	0.21
197	0.19
198	0.17
199	0.17
200	0.18
201	0.18
202	0.23
203	0.24
204	0.22
205	0.23
206	0.25
207	0.28
208	0.27
209	0.26
210	0.24
211	0.28
212	0.27
213	0.24
214	0.24
215	0.19
216	0.17
217	0.17
218	0.15
219	0.11
220	0.11
221	0.1
222	0.1
223	0.09
224	0.09
225	0.1
226	0.07
227	0.07
228	0.07
229	0.07
230	0.05
231	0.05
232	0.05
233	0.04
234	0.06
235	0.06
236	0.07
237	0.07
238	0.07
239	0.06
240	0.07
241	0.07
242	0.05
243	0.06
244	0.05
245	0.05
246	0.05
247	0.05
248	0.04
249	0.04
250	0.03
251	0.03
252	0.03
253	0.03
254	0.03
255	0.03
256	0.04
257	0.04
258	0.05
259	0.05
260	0.06
261	0.06
262	0.06
263	0.06
264	0.07
265	0.07
266	0.06
267	0.07
268	0.06
269	0.07
270	0.1
271	0.1
272	0.09
273	0.11
274	0.16
275	0.22
276	0.27
277	0.31
278	0.37
279	0.39
280	0.4
281	0.4
282	0.4
283	0.35
284	0.32
285	0.31
286	0.31
287	0.35
288	0.39
289	0.45
290	0.49
291	0.53
292	0.56
293	0.56
294	0.52
295	0.53
296	0.58
297	0.56
298	0.51
299	0.51
300	0.49
301	0.46
302	0.42
303	0.33
304	0.25
305	0.19
306	0.15
307	0.1
308	0.06
309	0.06
310	0.05
311	0.06
312	0.09
313	0.08
314	0.07
315	0.12
316	0.12
317	0.16
318	0.2
319	0.23
320	0.29
321	0.36
322	0.41
323	0.45
324	0.53
325	0.56
326	0.62
327	0.67
328	0.69
329	0.7
330	0.74
331	0.75
332	0.7
333	0.72
334	0.71
335	0.72
336	0.69
337	0.67
338	0.62
339	0.56
340	0.54
341	0.47
342	0.39
343	0.3
344	0.23
345	0.18
346	0.14
347	0.11
348	0.09
349	0.09
350	0.08
351	0.08
352	0.07
353	0.06
354	0.05
355	0.06
356	0.07
357	0.07
358	0.06
359	0.05
360	0.06
361	0.12
362	0.13
363	0.15
364	0.2
365	0.29
366	0.39
367	0.49
368	0.59
369	0.61
370	0.71
371	0.79
372	0.8
373	0.79
374	0.77
375	0.77
376	0.7
377	0.64
378	0.55
379	0.47
380	0.41
381	0.33
382	0.25
383	0.16
384	0.12
385	0.1
386	0.08
387	0.07
388	0.06
389	0.05
390	0.04
391	0.08
392	0.12
393	0.14
394	0.16
395	0.17
396	0.21
397	0.3
398	0.4
399	0.48
400	0.56
401	0.65
402	0.74
403	0.84
404	0.91
405	0.94
406	0.96
407	0.96
408	0.96
409	0.95
410	0.94
411	0.94
412	0.92
413	0.87
414	0.82
415	0.77
416	0.7
417	0.6
418	0.5
419	0.39
420	0.3
421	0.24
422	0.18
423	0.12
424	0.09
425	0.08
426	0.08
427	0.09
428	0.1
429	0.12
430	0.18
431	0.27
432	0.33
433	0.37
434	0.41
435	0.45
436	0.5
437	0.58
438	0.59
439	0.59
440	0.57
441	0.54
442	0.51
443	0.46
444	0.39
445	0.29
446	0.21
447	0.11
448	0.07
449	0.04
450	0.03
451	0.03
452	0.03
453	0.03
454	0.03
455	0.04
456	0.05
457	0.06
458	0.06
459	0.06
460	0.09
461	0.11
462	0.13
463	0.16
464	0.23
465	0.27
466	0.35
467	0.39
468	0.42
469	0.46
470	0.47
471	0.46
472	0.42
473	0.4
474	0.39
475	0.36
476	0.36
477	0.35
478	0.34
479	0.33
480	0.33
481	0.3
482	0.26
483	0.27
484	0.27
485	0.27
486	0.27
487	0.3
488	0.33
489	0.42
490	0.44
491	0.48
492	0.49
493	0.52
494	0.53
495	0.55
496	0.58
497	0.59
498	0.67
499	0.7
500	0.71
501	0.68
502	0.67
503	0.63
504	0.55
505	0.48
506	0.39
507	0.33
508	0.31
509	0.27
510	0.25
511	0.26
512	0.27
513	0.25
514	0.24
515	0.21
516	0.15
517	0.17
518	0.22
519	0.21
520	0.18
521	0.15
522	0.14
523	0.12
524	0.12
525	0.1
526	0.03
527	0.02
528	0.02
529	0.02
530	0.02
531	0.02
532	0.02
533	0.02
534	0.02
535	0.02
536	0.03
537	0.04
538	0.05
539	0.06
540	0.07
541	0.08
542	0.09
543	0.11
544	0.12
545	0.13
546	0.14
547	0.14
548	0.13
549	0.13
550	0.13
551	0.12
552	0.11
553	0.1
554	0.09
555	0.1
556	0.1
557	0.11
558	0.13
559	0.13
560	0.17
561	0.18
562	0.23

A0A109FG52

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer