Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A109FIH6

Protein Details
Accession A0A109FIH6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
296-324LSNVQLSAKRWRRRKSSISEKGRKRTPLTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
304-320KRWRRRKSSISEKGRKR
Subcellular Location(s) nucl 10, mito 10, mito_nucl 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045348  CPSF4/Yth1  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0098789  P:pre-mRNA cleavage required for polyadenylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00642  zf-CCCH  
PF14608  zf-CCCH_2  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MAQVVVQTDPRKLFLHADLSIEPFLKSQLALRLDADRQLCPDHVVAHQPCPRGADCPYRHVQPSPLNFQPRPPVPQSAHARTVCKHWLRGLCKKGPQCEFMHEYHLRKMPECWFFAKYGFCSNGDECMYLHVTEEMRIRECPDYRKGFCPKGPDCKLKHVRRVMCPDYLVGFCKHGKDCPYGQCVWLLFLFQTFSLFSPTFRLYRKDWLEHAADPTGRSGSGAQDWNRDGGGGGGGGGGGGVDLSTITCFKCGEKGHFANQYVSRAGSHWFTIYCPAGAVTPHGCSLNLPMAVLVLSNVQLSAKRWRRRKSSISEKGRKRTPLTD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.34
3 0.31
4 0.33
5 0.31
6 0.32
7 0.32
8 0.28
9 0.24
10 0.17
11 0.17
12 0.14
13 0.13
14 0.13
15 0.19
16 0.21
17 0.22
18 0.23
19 0.27
20 0.28
21 0.32
22 0.31
23 0.24
24 0.24
25 0.25
26 0.24
27 0.22
28 0.22
29 0.19
30 0.19
31 0.27
32 0.27
33 0.33
34 0.37
35 0.36
36 0.36
37 0.38
38 0.36
39 0.31
40 0.33
41 0.35
42 0.34
43 0.39
44 0.42
45 0.43
46 0.45
47 0.44
48 0.46
49 0.43
50 0.47
51 0.47
52 0.49
53 0.53
54 0.5
55 0.52
56 0.54
57 0.5
58 0.49
59 0.46
60 0.46
61 0.41
62 0.5
63 0.55
64 0.52
65 0.56
66 0.53
67 0.53
68 0.46
69 0.49
70 0.49
71 0.43
72 0.39
73 0.38
74 0.43
75 0.48
76 0.56
77 0.59
78 0.57
79 0.61
80 0.63
81 0.65
82 0.61
83 0.58
84 0.51
85 0.49
86 0.47
87 0.41
88 0.43
89 0.4
90 0.39
91 0.39
92 0.42
93 0.36
94 0.33
95 0.35
96 0.34
97 0.34
98 0.34
99 0.32
100 0.29
101 0.29
102 0.3
103 0.29
104 0.23
105 0.22
106 0.22
107 0.2
108 0.21
109 0.2
110 0.22
111 0.2
112 0.19
113 0.15
114 0.16
115 0.16
116 0.12
117 0.12
118 0.1
119 0.1
120 0.11
121 0.15
122 0.13
123 0.14
124 0.14
125 0.16
126 0.18
127 0.2
128 0.23
129 0.27
130 0.33
131 0.34
132 0.41
133 0.44
134 0.45
135 0.45
136 0.49
137 0.46
138 0.5
139 0.54
140 0.54
141 0.51
142 0.57
143 0.65
144 0.63
145 0.67
146 0.65
147 0.64
148 0.62
149 0.68
150 0.6
151 0.52
152 0.46
153 0.38
154 0.32
155 0.27
156 0.23
157 0.15
158 0.14
159 0.13
160 0.16
161 0.16
162 0.16
163 0.19
164 0.21
165 0.24
166 0.27
167 0.3
168 0.28
169 0.28
170 0.27
171 0.24
172 0.22
173 0.18
174 0.13
175 0.09
176 0.08
177 0.08
178 0.06
179 0.07
180 0.06
181 0.06
182 0.1
183 0.1
184 0.1
185 0.13
186 0.15
187 0.18
188 0.19
189 0.22
190 0.21
191 0.3
192 0.34
193 0.34
194 0.34
195 0.35
196 0.36
197 0.34
198 0.34
199 0.28
200 0.24
201 0.21
202 0.2
203 0.16
204 0.13
205 0.12
206 0.1
207 0.09
208 0.13
209 0.18
210 0.18
211 0.22
212 0.22
213 0.23
214 0.22
215 0.2
216 0.16
217 0.11
218 0.1
219 0.06
220 0.05
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.03
225 0.02
226 0.02
227 0.02
228 0.02
229 0.02
230 0.02
231 0.02
232 0.03
233 0.04
234 0.05
235 0.06
236 0.07
237 0.07
238 0.14
239 0.17
240 0.22
241 0.31
242 0.35
243 0.41
244 0.47
245 0.48
246 0.48
247 0.48
248 0.45
249 0.37
250 0.34
251 0.28
252 0.22
253 0.22
254 0.18
255 0.16
256 0.15
257 0.14
258 0.14
259 0.19
260 0.19
261 0.17
262 0.15
263 0.15
264 0.14
265 0.14
266 0.17
267 0.13
268 0.13
269 0.15
270 0.15
271 0.15
272 0.14
273 0.18
274 0.21
275 0.19
276 0.17
277 0.16
278 0.15
279 0.15
280 0.14
281 0.11
282 0.06
283 0.06
284 0.06
285 0.06
286 0.07
287 0.09
288 0.12
289 0.23
290 0.31
291 0.4
292 0.49
293 0.59
294 0.68
295 0.76
296 0.83
297 0.83
298 0.85
299 0.87
300 0.89
301 0.9
302 0.9
303 0.9
304 0.88
305 0.85