Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A109FJF7

Protein Details
Accession A0A109FJF7    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
38-66TDPLTERGGGKKRRTRRVCTPEPVRPVRGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
46-53GGKKRRTR
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto 6, mito 3, extr 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013909  NIPA/Rsm1_C  
IPR012935  Znf_C3HC-like  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF08600  Rsm1  
PF07967  zf-C3HC  
Amino Acid Sequences MPDAAVPAADAGQPAVAPPISKRKWLDSIASLDAATRTDPLTERGGGKKRRTRRVCTPEPVRPVRGRSSPFICRTPHNTSTPALEAILARMARPSRPSEALPPATYQPTSLPALLERIATYRLTTFSPSKPPSLSALSCALHGWIHTPSTRERVQCVTCGHGVVLLPPTAGDGAWSSPAGQRLRQEYERQVSGQGQAHAEACPWKLRPCARSLYRLPGGGLGVSSGGRRRLLEELGREAATLDQNGLGQVALTLPEPAREVLGSDERRARLVKAVALVADTASGDESPSTSTTDSPSATSILLGIFGWNLLAPPAGRPSSSSLARSTSSSSISSLTEPGGSPILVCKYCTRHVLASSYLPSPGFTAGGAASGKRFDPVQQHQAFCPFVSSASAADTQTTGDAATKRGTRPDDDNKTTTSRKPGWLVRLEAVLPRPSTPLIESREAASLSKTTTSHGNTHDLLSYVRKLLGPKTSPHSRLHHVPTSKVA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.1
3 0.09
4 0.1
5 0.14
6 0.25
7 0.27
8 0.34
9 0.38
10 0.42
11 0.49
12 0.52
13 0.54
14 0.49
15 0.52
16 0.48
17 0.45
18 0.38
19 0.31
20 0.28
21 0.23
22 0.17
23 0.13
24 0.1
25 0.12
26 0.13
27 0.15
28 0.19
29 0.21
30 0.25
31 0.33
32 0.42
33 0.48
34 0.57
35 0.63
36 0.69
37 0.76
38 0.81
39 0.81
40 0.83
41 0.85
42 0.85
43 0.86
44 0.85
45 0.83
46 0.84
47 0.81
48 0.77
49 0.72
50 0.68
51 0.65
52 0.63
53 0.59
54 0.56
55 0.57
56 0.58
57 0.58
58 0.58
59 0.54
60 0.52
61 0.55
62 0.57
63 0.57
64 0.52
65 0.49
66 0.45
67 0.46
68 0.43
69 0.36
70 0.27
71 0.22
72 0.18
73 0.16
74 0.19
75 0.15
76 0.12
77 0.15
78 0.16
79 0.18
80 0.21
81 0.25
82 0.25
83 0.29
84 0.31
85 0.34
86 0.42
87 0.43
88 0.41
89 0.39
90 0.37
91 0.36
92 0.34
93 0.28
94 0.21
95 0.2
96 0.21
97 0.19
98 0.17
99 0.14
100 0.17
101 0.17
102 0.16
103 0.12
104 0.12
105 0.13
106 0.13
107 0.13
108 0.12
109 0.13
110 0.13
111 0.17
112 0.19
113 0.22
114 0.31
115 0.33
116 0.34
117 0.34
118 0.34
119 0.34
120 0.36
121 0.32
122 0.26
123 0.28
124 0.25
125 0.25
126 0.23
127 0.2
128 0.14
129 0.14
130 0.13
131 0.09
132 0.11
133 0.11
134 0.14
135 0.15
136 0.21
137 0.26
138 0.25
139 0.26
140 0.31
141 0.31
142 0.34
143 0.33
144 0.31
145 0.27
146 0.26
147 0.23
148 0.18
149 0.17
150 0.13
151 0.13
152 0.1
153 0.09
154 0.08
155 0.08
156 0.07
157 0.07
158 0.06
159 0.05
160 0.05
161 0.06
162 0.07
163 0.07
164 0.09
165 0.15
166 0.16
167 0.17
168 0.2
169 0.24
170 0.3
171 0.33
172 0.35
173 0.36
174 0.39
175 0.38
176 0.35
177 0.32
178 0.27
179 0.29
180 0.27
181 0.23
182 0.19
183 0.18
184 0.18
185 0.16
186 0.15
187 0.13
188 0.11
189 0.12
190 0.13
191 0.14
192 0.19
193 0.24
194 0.25
195 0.27
196 0.35
197 0.35
198 0.41
199 0.42
200 0.45
201 0.42
202 0.41
203 0.37
204 0.29
205 0.26
206 0.19
207 0.16
208 0.08
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.08
214 0.08
215 0.09
216 0.1
217 0.12
218 0.14
219 0.17
220 0.17
221 0.19
222 0.2
223 0.19
224 0.17
225 0.15
226 0.14
227 0.12
228 0.1
229 0.07
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.05
234 0.04
235 0.03
236 0.03
237 0.03
238 0.03
239 0.03
240 0.04
241 0.04
242 0.05
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.07
249 0.15
250 0.15
251 0.16
252 0.2
253 0.2
254 0.22
255 0.22
256 0.21
257 0.18
258 0.19
259 0.18
260 0.16
261 0.16
262 0.14
263 0.14
264 0.13
265 0.08
266 0.07
267 0.05
268 0.04
269 0.04
270 0.04
271 0.03
272 0.03
273 0.04
274 0.05
275 0.06
276 0.07
277 0.07
278 0.08
279 0.1
280 0.12
281 0.12
282 0.12
283 0.12
284 0.11
285 0.11
286 0.1
287 0.09
288 0.07
289 0.07
290 0.06
291 0.05
292 0.04
293 0.04
294 0.04
295 0.03
296 0.03
297 0.03
298 0.04
299 0.04
300 0.05
301 0.09
302 0.09
303 0.1
304 0.11
305 0.16
306 0.21
307 0.23
308 0.24
309 0.22
310 0.24
311 0.25
312 0.24
313 0.22
314 0.19
315 0.19
316 0.18
317 0.17
318 0.16
319 0.16
320 0.16
321 0.14
322 0.12
323 0.11
324 0.1
325 0.11
326 0.1
327 0.09
328 0.08
329 0.1
330 0.13
331 0.13
332 0.14
333 0.17
334 0.21
335 0.25
336 0.28
337 0.29
338 0.28
339 0.3
340 0.32
341 0.3
342 0.29
343 0.28
344 0.26
345 0.24
346 0.21
347 0.18
348 0.16
349 0.14
350 0.11
351 0.08
352 0.08
353 0.07
354 0.09
355 0.09
356 0.08
357 0.09
358 0.09
359 0.1
360 0.1
361 0.1
362 0.11
363 0.2
364 0.27
365 0.36
366 0.41
367 0.42
368 0.43
369 0.47
370 0.45
371 0.36
372 0.3
373 0.2
374 0.15
375 0.15
376 0.15
377 0.11
378 0.13
379 0.14
380 0.12
381 0.13
382 0.12
383 0.11
384 0.11
385 0.1
386 0.08
387 0.09
388 0.1
389 0.12
390 0.16
391 0.2
392 0.21
393 0.28
394 0.31
395 0.31
396 0.39
397 0.48
398 0.53
399 0.56
400 0.56
401 0.53
402 0.57
403 0.57
404 0.53
405 0.52
406 0.47
407 0.46
408 0.51
409 0.54
410 0.57
411 0.59
412 0.58
413 0.51
414 0.49
415 0.44
416 0.41
417 0.38
418 0.34
419 0.28
420 0.25
421 0.26
422 0.23
423 0.24
424 0.23
425 0.26
426 0.28
427 0.31
428 0.31
429 0.3
430 0.33
431 0.32
432 0.3
433 0.25
434 0.21
435 0.18
436 0.21
437 0.2
438 0.18
439 0.24
440 0.28
441 0.31
442 0.33
443 0.37
444 0.34
445 0.36
446 0.36
447 0.3
448 0.28
449 0.27
450 0.26
451 0.22
452 0.23
453 0.23
454 0.24
455 0.29
456 0.36
457 0.35
458 0.38
459 0.45
460 0.53
461 0.55
462 0.6
463 0.61
464 0.59
465 0.64
466 0.67
467 0.67
468 0.62