Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A109FJB4

Protein Details
Accession A0A109FJB4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
340-359SSPASGSSKKRKGDDKKDAGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
333-373KEGGGGGSSPASGSSKKRKGDDKKDAGGTGGKKAKTATKKK
Subcellular Location(s) cyto 10, nucl 9, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036279  5-3_exonuclease_C_sf  
IPR023426  Flap_endonuc  
IPR008918  HhH2  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
IPR006086  XPG-I_dom  
IPR006084  XPG/Rad2  
IPR019974  XPG_CS  
IPR006085  XPG_DNA_repair_N  
Gene Ontology GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005654  C:nucleoplasm  
GO:0008409  F:5'-3' exonuclease activity  
GO:0017108  F:5'-flap endonuclease activity  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0000287  F:magnesium ion binding  
GO:0006284  P:base-excision repair  
GO:0043137  P:DNA replication, removal of RNA primer  
Pfam View protein in Pfam  
PF00867  XPG_I  
PF00752  XPG_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00841  XPG_1  
CDD cd09901  H3TH_FEN1-like  
cd09867  PIN_FEN1  
Amino Acid Sequences MGIKGLTALINDNAPKAIKQAEMKTLFGRKVAIDASMSIYQFLIAVRQQDGQQLMNDAGETTSHLMGLFYRTIRMVENDLKPCYVFDGKPPQLKSNVLKKRFAGRQEAKEDEVEAKETGTTEDVDRMSRRQVKVTKEHNEECRRLLTLMGIPWVEVYGAGSEDMDTLTFNSPIVLRHLTFSEARKMPIDVISLDEVLAGLDLTMDKFIDMCMLCGCDYLEPLKGIGAKTALKLVREHDDMESILDHLRKGKNPPPEEWPYEEARELFKHPDVKKSSEIELKWEAPDTEGLVDFLVREKGFSEERVRKGADKLKARMSAKQQGRLDGFFTVKPKEGGGGGSSPASGSSKKRKGDDKKDAGGTGGKKAKTATKKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.17
3 0.18
4 0.2
5 0.21
6 0.27
7 0.31
8 0.39
9 0.41
10 0.43
11 0.47
12 0.49
13 0.45
14 0.4
15 0.37
16 0.27
17 0.28
18 0.26
19 0.22
20 0.16
21 0.16
22 0.2
23 0.21
24 0.21
25 0.18
26 0.17
27 0.15
28 0.15
29 0.13
30 0.12
31 0.1
32 0.12
33 0.14
34 0.16
35 0.17
36 0.2
37 0.23
38 0.21
39 0.21
40 0.2
41 0.19
42 0.17
43 0.16
44 0.12
45 0.1
46 0.09
47 0.09
48 0.09
49 0.09
50 0.09
51 0.09
52 0.09
53 0.09
54 0.12
55 0.13
56 0.11
57 0.12
58 0.13
59 0.14
60 0.15
61 0.17
62 0.2
63 0.24
64 0.31
65 0.35
66 0.36
67 0.35
68 0.34
69 0.32
70 0.31
71 0.28
72 0.21
73 0.23
74 0.33
75 0.37
76 0.44
77 0.46
78 0.45
79 0.44
80 0.49
81 0.49
82 0.49
83 0.54
84 0.52
85 0.54
86 0.53
87 0.59
88 0.6
89 0.57
90 0.57
91 0.55
92 0.59
93 0.61
94 0.61
95 0.54
96 0.48
97 0.45
98 0.36
99 0.29
100 0.23
101 0.16
102 0.13
103 0.12
104 0.12
105 0.11
106 0.09
107 0.09
108 0.08
109 0.11
110 0.11
111 0.14
112 0.15
113 0.15
114 0.22
115 0.28
116 0.29
117 0.33
118 0.38
119 0.43
120 0.51
121 0.59
122 0.6
123 0.6
124 0.65
125 0.66
126 0.68
127 0.63
128 0.55
129 0.48
130 0.4
131 0.33
132 0.28
133 0.21
134 0.16
135 0.15
136 0.14
137 0.12
138 0.11
139 0.1
140 0.1
141 0.08
142 0.05
143 0.05
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.04
153 0.05
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.07
160 0.1
161 0.11
162 0.1
163 0.11
164 0.12
165 0.13
166 0.15
167 0.16
168 0.2
169 0.2
170 0.2
171 0.2
172 0.2
173 0.19
174 0.18
175 0.17
176 0.1
177 0.1
178 0.1
179 0.1
180 0.09
181 0.08
182 0.06
183 0.05
184 0.05
185 0.03
186 0.02
187 0.02
188 0.02
189 0.03
190 0.03
191 0.03
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.07
199 0.08
200 0.08
201 0.08
202 0.09
203 0.06
204 0.07
205 0.07
206 0.08
207 0.08
208 0.08
209 0.09
210 0.1
211 0.1
212 0.1
213 0.12
214 0.11
215 0.11
216 0.17
217 0.17
218 0.16
219 0.17
220 0.19
221 0.22
222 0.22
223 0.23
224 0.18
225 0.19
226 0.18
227 0.17
228 0.15
229 0.1
230 0.11
231 0.1
232 0.1
233 0.14
234 0.17
235 0.19
236 0.25
237 0.3
238 0.38
239 0.41
240 0.43
241 0.46
242 0.49
243 0.5
244 0.49
245 0.47
246 0.4
247 0.39
248 0.37
249 0.3
250 0.27
251 0.25
252 0.23
253 0.22
254 0.23
255 0.3
256 0.3
257 0.38
258 0.39
259 0.42
260 0.45
261 0.45
262 0.46
263 0.44
264 0.43
265 0.4
266 0.41
267 0.38
268 0.33
269 0.32
270 0.26
271 0.21
272 0.21
273 0.17
274 0.13
275 0.12
276 0.11
277 0.09
278 0.09
279 0.08
280 0.09
281 0.11
282 0.1
283 0.1
284 0.1
285 0.14
286 0.16
287 0.2
288 0.27
289 0.32
290 0.36
291 0.41
292 0.42
293 0.41
294 0.47
295 0.51
296 0.5
297 0.5
298 0.52
299 0.55
300 0.61
301 0.61
302 0.6
303 0.61
304 0.62
305 0.6
306 0.64
307 0.59
308 0.58
309 0.59
310 0.53
311 0.47
312 0.4
313 0.36
314 0.3
315 0.31
316 0.27
317 0.26
318 0.25
319 0.24
320 0.22
321 0.2
322 0.19
323 0.19
324 0.17
325 0.16
326 0.16
327 0.15
328 0.13
329 0.14
330 0.15
331 0.15
332 0.21
333 0.31
334 0.39
335 0.45
336 0.52
337 0.61
338 0.7
339 0.77
340 0.81
341 0.8
342 0.8
343 0.79
344 0.73
345 0.65
346 0.61
347 0.52
348 0.5
349 0.47
350 0.39
351 0.36
352 0.38
353 0.45