FuNGI

A0A109FMX1

Protein Details

Accession

A0A109FMX1

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
38-60	IRCRECGCRVMYKKRIKRIDGSV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 15.5, cyto_nucl 11.5, cyto 6.5, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR035899 DBL_dom_sf IPR000219 DH-domain IPR006591 RNAP_P/RPABC4 IPR029040 RPABC4/Spt4
Gene Ontology	GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0005085 F:guanyl-nucleotide exchange factor activity GO:0046872 F:metal ion binding GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF03604 DNA_RNApol_7kD PF00621 RhoGEF
PROSITE	View protein in PROSITE PS50010 DH_2

Amino Acid Sequences

MNGQQAQQFRAGPGGNTAIEYSCADCAASNEIKAREPIRCRECGCRVMYKKRIKRIDGSVEARTVPARRSSPPRVLPRDLVRDWLPLTDTHLREKKIVPALSIDTAIHAGGYSDSPASAGGDSEAKGVRATPESATPSADSVEHTSTDTGDPYLTSTASPRRISSGLVQSYPSPKPLVSPAFGPSPVFPSPPSKPRSREQQRSLSPVTGVSRVISNSSTETRTPASSRPATPSSLSPPSPAVSGRLHVSATSPVLVDCDSSPSGGRQRPAPPAFSRSEPATAISREARPTLPRSLSQSAVPTSSPSPEGRGNRVSTLFKRGLFGRSKSDQQPKGSSSPMQPRSPITHLRGTETPAAYRTTPTLSLTTFPSGRSPARSESPQPLPTHSPSLRSISPIYQSYSDQQPLETARTWKSLLDNDAIVYLTLQHGHDEMHRQEIIFEIIETERAFVESMRAVVEIYGQSIRAGSIEGVPRSVARLFSRLEGILDLHSRLSSTLAVAADTQNAGRLVMHFADLFAPYISEFEVYQAYLLRFEAVTAVLDLEIAAGTSPFATFLRDHARRPEAGGMSLSSFLLKPIQRLMKYPLFFARLSDMTGPSHPDSAATSDLSDEMDEMIRALQDVKMREEEYEAMKVLEGSLVGLPDDFKLAERSRTLLFEGAVRQLHIGDRERAALDQLRTSSAGPRHSLRTRAPSETYVSSTLAAPPGRAAVPRRTSDRVLVAAKERPVSTASDSNASTTASSASCSVSTASDSNASVGASTQTSASQSSSAGTTPPGSPESSKAKIKSLRSPPAATPPGNSKRNSLVSPPSSAALPSPSPSPSLPPTPKLRLRAKESSLHVWVFSDVVILARRDEPGRLTKSDRALSALHRRVLDHVGVARLRGFEDMSNKTDYDNLLEIAVDSWSSTPHGPTHRASFYVVPPLRIKTKSGRPSSASSTFSRSSTMTSFSSKLSASTNSTSTVMPDVDLATFSNLYAALGNAQSGIDPPETAPSLGTDYWISRVRRVKADMQARRHGLA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.26
2	0.22
3	0.22
4	0.22
5	0.17
6	0.18
7	0.18
8	0.16
9	0.13
10	0.13
11	0.12
12	0.11
13	0.12
14	0.17
15	0.18
16	0.19
17	0.24
18	0.25
19	0.28
20	0.32
21	0.34
22	0.35
23	0.4
24	0.48
25	0.49
26	0.54
27	0.55
28	0.6
29	0.64
30	0.64
31	0.62
32	0.62
33	0.65
34	0.68
35	0.75
36	0.77
37	0.78
38	0.81
39	0.86
40	0.81
41	0.8
42	0.79
43	0.79
44	0.78
45	0.74
46	0.68
47	0.61
48	0.55
49	0.48
50	0.42
51	0.34
52	0.27
53	0.3
54	0.29
55	0.34
56	0.42
57	0.49
58	0.56
59	0.63
60	0.7
61	0.71
62	0.73
63	0.74
64	0.73
65	0.74
66	0.65
67	0.61
68	0.53
69	0.49
70	0.44
71	0.38
72	0.31
73	0.22
74	0.28
75	0.31
76	0.31
77	0.37
78	0.42
79	0.42
80	0.44
81	0.47
82	0.48
83	0.48
84	0.48
85	0.39
86	0.38
87	0.4
88	0.37
89	0.36
90	0.28
91	0.2
92	0.19
93	0.17
94	0.13
95	0.09
96	0.07
97	0.07
98	0.07
99	0.07
100	0.07
101	0.07
102	0.07
103	0.08
104	0.08
105	0.08
106	0.07
107	0.07
108	0.09
109	0.1
110	0.12
111	0.13
112	0.12
113	0.12
114	0.13
115	0.14
116	0.15
117	0.17
118	0.16
119	0.2
120	0.25
121	0.25
122	0.26
123	0.24
124	0.22
125	0.21
126	0.2
127	0.17
128	0.16
129	0.17
130	0.16
131	0.17
132	0.16
133	0.16
134	0.17
135	0.16
136	0.12
137	0.11
138	0.1
139	0.11
140	0.12
141	0.1
142	0.1
143	0.14
144	0.2
145	0.27
146	0.28
147	0.27
148	0.31
149	0.31
150	0.33
151	0.36
152	0.38
153	0.35
154	0.35
155	0.35
156	0.33
157	0.38
158	0.37
159	0.33
160	0.25
161	0.21
162	0.22
163	0.28
164	0.3
165	0.25
166	0.26
167	0.27
168	0.29
169	0.29
170	0.28
171	0.21
172	0.22
173	0.22
174	0.21
175	0.2
176	0.23
177	0.29
178	0.36
179	0.41
180	0.43
181	0.47
182	0.53
183	0.62
184	0.66
185	0.71
186	0.71
187	0.76
188	0.74
189	0.77
190	0.73
191	0.63
192	0.53
193	0.46
194	0.4
195	0.31
196	0.26
197	0.19
198	0.18
199	0.16
200	0.18
201	0.15
202	0.14
203	0.15
204	0.18
205	0.2
206	0.18
207	0.21
208	0.21
209	0.23
210	0.24
211	0.24
212	0.29
213	0.32
214	0.34
215	0.37
216	0.38
217	0.37
218	0.37
219	0.36
220	0.35
221	0.36
222	0.34
223	0.29
224	0.28
225	0.27
226	0.26
227	0.23
228	0.21
229	0.16
230	0.18
231	0.18
232	0.18
233	0.17
234	0.16
235	0.17
236	0.15
237	0.15
238	0.13
239	0.11
240	0.1
241	0.11
242	0.11
243	0.1
244	0.08
245	0.11
246	0.11
247	0.11
248	0.12
249	0.14
250	0.21
251	0.23
252	0.25
253	0.26
254	0.31
255	0.4
256	0.42
257	0.44
258	0.4
259	0.42
260	0.44
261	0.41
262	0.39
263	0.32
264	0.32
265	0.27
266	0.26
267	0.24
268	0.22
269	0.22
270	0.23
271	0.23
272	0.22
273	0.23
274	0.23
275	0.23
276	0.27
277	0.3
278	0.3
279	0.3
280	0.35
281	0.37
282	0.36
283	0.34
284	0.33
285	0.28
286	0.26
287	0.24
288	0.19
289	0.17
290	0.17
291	0.18
292	0.15
293	0.17
294	0.22
295	0.25
296	0.28
297	0.32
298	0.32
299	0.32
300	0.36
301	0.37
302	0.33
303	0.37
304	0.35
305	0.3
306	0.31
307	0.3
308	0.33
309	0.34
310	0.34
311	0.34
312	0.35
313	0.4
314	0.46
315	0.53
316	0.52
317	0.51
318	0.54
319	0.51
320	0.5
321	0.47
322	0.42
323	0.39
324	0.44
325	0.45
326	0.42
327	0.4
328	0.39
329	0.42
330	0.44
331	0.44
332	0.38
333	0.39
334	0.37
335	0.4
336	0.39
337	0.36
338	0.37
339	0.31
340	0.27
341	0.22
342	0.24
343	0.2
344	0.19
345	0.17
346	0.14
347	0.15
348	0.15
349	0.15
350	0.14
351	0.15
352	0.16
353	0.18
354	0.16
355	0.16
356	0.16
357	0.18
358	0.19
359	0.21
360	0.22
361	0.22
362	0.26
363	0.29
364	0.3
365	0.33
366	0.38
367	0.4
368	0.38
369	0.38
370	0.38
371	0.37
372	0.41
373	0.35
374	0.33
375	0.3
376	0.33
377	0.3
378	0.28
379	0.28
380	0.22
381	0.25
382	0.23
383	0.22
384	0.2
385	0.2
386	0.21
387	0.23
388	0.23
389	0.2
390	0.18
391	0.18
392	0.18
393	0.2
394	0.19
395	0.17
396	0.17
397	0.19
398	0.2
399	0.19
400	0.2
401	0.2
402	0.2
403	0.19
404	0.17
405	0.15
406	0.15
407	0.14
408	0.11
409	0.08
410	0.06
411	0.05
412	0.06
413	0.06
414	0.06
415	0.06
416	0.07
417	0.08
418	0.13
419	0.13
420	0.16
421	0.16
422	0.15
423	0.15
424	0.15
425	0.15
426	0.1
427	0.09
428	0.07
429	0.06
430	0.08
431	0.08
432	0.07
433	0.06
434	0.06
435	0.07
436	0.05
437	0.07
438	0.06
439	0.06
440	0.06
441	0.06
442	0.06
443	0.06
444	0.07
445	0.06
446	0.06
447	0.06
448	0.06
449	0.06
450	0.06
451	0.06
452	0.05
453	0.05
454	0.04
455	0.07
456	0.1
457	0.1
458	0.1
459	0.1
460	0.1
461	0.12
462	0.12
463	0.11
464	0.09
465	0.12
466	0.12
467	0.13
468	0.15
469	0.13
470	0.13
471	0.11
472	0.11
473	0.09
474	0.09
475	0.08
476	0.07
477	0.07
478	0.07
479	0.06
480	0.07
481	0.06
482	0.05
483	0.07
484	0.07
485	0.07
486	0.07
487	0.08
488	0.07
489	0.07
490	0.07
491	0.06
492	0.06
493	0.06
494	0.05
495	0.06
496	0.07
497	0.07
498	0.07
499	0.06
500	0.06
501	0.07
502	0.07
503	0.07
504	0.05
505	0.05
506	0.05
507	0.05
508	0.05
509	0.05
510	0.04
511	0.05
512	0.05
513	0.05
514	0.05
515	0.07
516	0.07
517	0.07
518	0.07
519	0.06
520	0.06
521	0.06
522	0.06
523	0.05
524	0.05
525	0.04
526	0.05
527	0.04
528	0.04
529	0.04
530	0.03
531	0.03
532	0.02
533	0.02
534	0.02
535	0.02
536	0.02
537	0.02
538	0.03
539	0.04
540	0.05
541	0.06
542	0.09
543	0.18
544	0.2
545	0.21
546	0.26
547	0.28
548	0.27
549	0.29
550	0.31
551	0.23
552	0.21
553	0.21
554	0.16
555	0.14
556	0.14
557	0.12
558	0.08
559	0.07
560	0.06
561	0.1
562	0.1
563	0.1
564	0.16
565	0.21
566	0.21
567	0.24
568	0.3
569	0.32
570	0.32
571	0.33
572	0.31
573	0.29
574	0.28
575	0.26
576	0.24
577	0.18
578	0.19
579	0.18
580	0.16
581	0.14
582	0.14
583	0.17
584	0.14
585	0.14
586	0.12
587	0.12
588	0.11
589	0.12
590	0.13
591	0.1
592	0.09
593	0.09
594	0.09
595	0.09
596	0.08
597	0.06
598	0.05
599	0.05
600	0.05
601	0.05
602	0.05
603	0.04
604	0.04
605	0.05
606	0.06
607	0.09
608	0.11
609	0.13
610	0.15
611	0.16
612	0.16
613	0.17
614	0.17
615	0.16
616	0.16
617	0.14
618	0.12
619	0.12
620	0.11
621	0.1
622	0.08
623	0.05
624	0.05
625	0.05
626	0.05
627	0.05
628	0.05
629	0.05
630	0.05
631	0.06
632	0.05
633	0.05
634	0.1
635	0.11
636	0.14
637	0.15
638	0.17
639	0.17
640	0.18
641	0.19
642	0.15
643	0.15
644	0.14
645	0.15
646	0.16
647	0.15
648	0.14
649	0.13
650	0.12
651	0.13
652	0.15
653	0.17
654	0.16
655	0.16
656	0.18
657	0.18
658	0.17
659	0.18
660	0.19
661	0.16
662	0.17
663	0.16
664	0.16
665	0.16
666	0.17
667	0.2
668	0.2
669	0.22
670	0.22
671	0.24
672	0.3
673	0.33
674	0.37
675	0.36
676	0.41
677	0.42
678	0.44
679	0.44
680	0.39
681	0.4
682	0.37
683	0.35
684	0.28
685	0.24
686	0.21
687	0.19
688	0.17
689	0.17
690	0.15
691	0.13
692	0.11
693	0.12
694	0.12
695	0.14
696	0.17
697	0.21
698	0.27
699	0.3
700	0.35
701	0.38
702	0.39
703	0.4
704	0.39
705	0.36
706	0.32
707	0.31
708	0.29
709	0.29
710	0.29
711	0.29
712	0.25
713	0.22
714	0.21
715	0.21
716	0.22
717	0.22
718	0.22
719	0.23
720	0.23
721	0.22
722	0.22
723	0.2
724	0.16
725	0.11
726	0.12
727	0.08
728	0.09
729	0.09
730	0.09
731	0.09
732	0.09
733	0.1
734	0.08
735	0.1
736	0.1
737	0.11
738	0.12
739	0.12
740	0.12
741	0.12
742	0.11
743	0.09
744	0.09
745	0.09
746	0.07
747	0.07
748	0.07
749	0.07
750	0.08
751	0.09
752	0.09
753	0.09
754	0.09
755	0.09
756	0.1
757	0.09
758	0.09
759	0.09
760	0.1
761	0.1
762	0.13
763	0.13
764	0.14
765	0.15
766	0.2
767	0.26
768	0.3
769	0.35
770	0.34
771	0.41
772	0.46
773	0.5
774	0.54
775	0.57
776	0.61
777	0.61
778	0.62
779	0.57
780	0.6
781	0.6
782	0.51
783	0.44
784	0.45
785	0.49
786	0.51
787	0.49
788	0.43
789	0.44
790	0.49
791	0.48
792	0.43
793	0.43
794	0.4
795	0.42
796	0.4
797	0.33
798	0.29
799	0.27
800	0.23
801	0.18
802	0.16
803	0.14
804	0.15
805	0.15
806	0.17
807	0.17
808	0.21
809	0.21
810	0.3
811	0.33
812	0.37
813	0.43
814	0.5
815	0.56
816	0.59
817	0.65
818	0.63
819	0.67
820	0.7
821	0.67
822	0.66
823	0.65
824	0.62
825	0.58
826	0.5
827	0.42
828	0.34
829	0.3
830	0.23
831	0.17
832	0.12
833	0.07
834	0.08
835	0.1
836	0.1
837	0.11
838	0.12
839	0.15
840	0.15
841	0.17
842	0.19
843	0.25
844	0.3
845	0.32
846	0.36
847	0.4
848	0.46
849	0.48
850	0.44
851	0.39
852	0.37
853	0.4
854	0.45
855	0.46
856	0.43
857	0.4
858	0.41
859	0.41
860	0.42
861	0.35
862	0.28
863	0.24
864	0.25
865	0.25
866	0.25
867	0.23
868	0.2
869	0.2
870	0.17
871	0.16
872	0.14
873	0.2
874	0.24
875	0.25
876	0.27
877	0.26
878	0.26
879	0.27
880	0.25
881	0.23
882	0.2
883	0.18
884	0.15
885	0.15
886	0.15
887	0.13
888	0.12
889	0.07
890	0.06
891	0.06
892	0.07
893	0.09
894	0.09
895	0.11
896	0.16
897	0.22
898	0.26
899	0.3
900	0.37
901	0.37
902	0.38
903	0.39
904	0.38
905	0.35
906	0.41
907	0.39
908	0.35
909	0.36
910	0.39
911	0.43
912	0.4
913	0.42
914	0.4
915	0.5
916	0.55
917	0.6
918	0.62
919	0.6
920	0.64
921	0.67
922	0.65
923	0.58
924	0.51
925	0.5
926	0.45
927	0.41
928	0.38
929	0.31
930	0.28
931	0.26
932	0.28
933	0.24
934	0.26
935	0.27
936	0.25
937	0.27
938	0.24
939	0.23
940	0.22
941	0.23
942	0.24
943	0.27
944	0.27
945	0.27
946	0.28
947	0.26
948	0.25
949	0.24
950	0.19
951	0.16
952	0.15
953	0.14
954	0.12
955	0.13
956	0.12
957	0.12
958	0.12
959	0.11
960	0.11
961	0.1
962	0.1
963	0.1
964	0.09
965	0.09
966	0.09
967	0.09
968	0.09
969	0.09
970	0.08
971	0.09
972	0.12
973	0.1
974	0.1
975	0.11
976	0.16
977	0.17
978	0.17
979	0.17
980	0.16
981	0.19
982	0.19
983	0.2
984	0.17
985	0.17
986	0.22
987	0.29
988	0.29
989	0.32
990	0.41
991	0.45
992	0.5
993	0.55
994	0.58
995	0.6
996	0.69
997	0.71
998	0.71
999	0.74

A0A109FMX1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer