FuNGI

M5BUS0

Protein Details

Accession

M5BUS0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
226-254	LSKSKQSNGKSSNKKKNKKDKGPACLNCG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
232-246	SNGKSSNKKKNKKDK

Subcellular Location(s)

nucl 16, cyto_nucl 13.5, cyto 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR025724 GAG-pre-integrase_dom IPR001878 Znf_CCHC
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity GO:0008270 F:zinc ion binding
Pfam	View protein in Pfam PF13976 gag_pre-integrs PF14223 Retrotran_gag_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50158 ZF_CCHC

Amino Acid Sequences

MSNNDYSSKKTYEIPQLKGDGSNYTAWKFRQEIVLGLRGLIEIAEGTDEPPEQLTEAEAREDSKVSGYQDQLAKWKKRDREAYAQITLNMEDEAMADVMRTRTARDAWKKVIERWEGKGVQSLSFLYQQLTTAKIEEDEDIATAFNNIRSLAKKMETLGEPISDLMLAQMMMTALPPSYSVVTSVIQTTNQASAVNPDMVQDTVLAEEERRRKGSGGLSAMFSQHLSKSKQSNGKSSNKKKNKKDKGPACLNCGKGGHSKAECWAKGGGAEGTGPHQRKKAEKQAKDKESSSTTKSESAKVAVTSEPIQTQLYALPAIDSYSPTDSWLLDSGASRHMTPNRQWFATYCPLASPVSVRIGNGKQIPAAGIGRIFVTLRNRQGKDTEAVIKEVLHVPDLQANLISVQELVNGGTNVVFQKGSGAILTANQGQGPEIGYAHQSKSLYQLNARVTHTEEIAHVGHVEPDDENEQDDREAQEFVAYAASTVARADLTTWHRRLGHISYEYVLEMVKSGAVKGMDIIGSRSPPKSPCSPCIQAKHARSPFRESQNHASQVLELMHSDLHGPTKVQAIGGYQYFSVTIDNKSRKMFVHILRSKNDYEASFKALKPLIDVVDFTRRGGT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.53
2	0.54
3	0.55
4	0.55
5	0.52
6	0.46
7	0.38
8	0.33
9	0.33
10	0.3
11	0.28
12	0.31
13	0.29
14	0.33
15	0.33
16	0.32
17	0.34
18	0.33
19	0.36
20	0.37
21	0.42
22	0.36
23	0.33
24	0.31
25	0.23
26	0.22
27	0.16
28	0.11
29	0.05
30	0.05
31	0.06
32	0.06
33	0.06
34	0.08
35	0.08
36	0.09
37	0.09
38	0.1
39	0.09
40	0.09
41	0.1
42	0.12
43	0.13
44	0.14
45	0.14
46	0.15
47	0.16
48	0.17
49	0.16
50	0.15
51	0.17
52	0.19
53	0.23
54	0.23
55	0.28
56	0.3
57	0.32
58	0.38
59	0.45
60	0.49
61	0.52
62	0.59
63	0.6
64	0.67
65	0.74
66	0.73
67	0.75
68	0.77
69	0.76
70	0.74
71	0.68
72	0.59
73	0.51
74	0.43
75	0.33
76	0.23
77	0.16
78	0.1
79	0.09
80	0.08
81	0.07
82	0.06
83	0.06
84	0.08
85	0.08
86	0.11
87	0.11
88	0.11
89	0.15
90	0.2
91	0.3
92	0.37
93	0.44
94	0.48
95	0.57
96	0.59
97	0.61
98	0.65
99	0.64
100	0.59
101	0.57
102	0.59
103	0.52
104	0.49
105	0.5
106	0.42
107	0.35
108	0.32
109	0.28
110	0.21
111	0.22
112	0.22
113	0.16
114	0.15
115	0.16
116	0.15
117	0.17
118	0.15
119	0.13
120	0.13
121	0.13
122	0.13
123	0.12
124	0.12
125	0.1
126	0.1
127	0.09
128	0.09
129	0.08
130	0.08
131	0.08
132	0.07
133	0.08
134	0.08
135	0.11
136	0.13
137	0.16
138	0.19
139	0.2
140	0.21
141	0.21
142	0.26
143	0.25
144	0.26
145	0.24
146	0.2
147	0.19
148	0.17
149	0.16
150	0.1
151	0.09
152	0.06
153	0.05
154	0.04
155	0.04
156	0.04
157	0.04
158	0.04
159	0.04
160	0.04
161	0.04
162	0.04
163	0.04
164	0.05
165	0.06
166	0.07
167	0.08
168	0.09
169	0.1
170	0.1
171	0.12
172	0.12
173	0.11
174	0.12
175	0.12
176	0.11
177	0.11
178	0.11
179	0.09
180	0.11
181	0.13
182	0.13
183	0.11
184	0.11
185	0.11
186	0.11
187	0.11
188	0.09
189	0.07
190	0.06
191	0.07
192	0.06
193	0.06
194	0.12
195	0.18
196	0.21
197	0.23
198	0.23
199	0.24
200	0.28
201	0.32
202	0.33
203	0.31
204	0.29
205	0.29
206	0.28
207	0.28
208	0.24
209	0.19
210	0.14
211	0.12
212	0.15
213	0.17
214	0.21
215	0.25
216	0.31
217	0.39
218	0.41
219	0.47
220	0.5
221	0.58
222	0.64
223	0.7
224	0.74
225	0.77
226	0.84
227	0.86
228	0.89
229	0.9
230	0.9
231	0.91
232	0.88
233	0.88
234	0.89
235	0.82
236	0.78
237	0.72
238	0.62
239	0.54
240	0.46
241	0.38
242	0.32
243	0.3
244	0.28
245	0.23
246	0.23
247	0.26
248	0.32
249	0.29
250	0.26
251	0.25
252	0.19
253	0.19
254	0.19
255	0.14
256	0.08
257	0.08
258	0.06
259	0.08
260	0.14
261	0.15
262	0.15
263	0.18
264	0.2
265	0.26
266	0.34
267	0.42
268	0.47
269	0.54
270	0.63
271	0.7
272	0.74
273	0.72
274	0.66
275	0.58
276	0.53
277	0.49
278	0.41
279	0.34
280	0.29
281	0.3
282	0.31
283	0.29
284	0.25
285	0.23
286	0.22
287	0.19
288	0.19
289	0.13
290	0.13
291	0.12
292	0.12
293	0.11
294	0.1
295	0.1
296	0.09
297	0.09
298	0.08
299	0.07
300	0.07
301	0.06
302	0.05
303	0.05
304	0.06
305	0.06
306	0.06
307	0.06
308	0.08
309	0.08
310	0.08
311	0.09
312	0.08
313	0.09
314	0.09
315	0.08
316	0.07
317	0.08
318	0.08
319	0.11
320	0.11
321	0.11
322	0.13
323	0.17
324	0.2
325	0.23
326	0.32
327	0.31
328	0.31
329	0.31
330	0.29
331	0.31
332	0.33
333	0.3
334	0.21
335	0.18
336	0.2
337	0.19
338	0.19
339	0.14
340	0.1
341	0.13
342	0.13
343	0.13
344	0.15
345	0.16
346	0.2
347	0.2
348	0.19
349	0.15
350	0.15
351	0.16
352	0.13
353	0.13
354	0.09
355	0.07
356	0.07
357	0.07
358	0.07
359	0.07
360	0.08
361	0.12
362	0.17
363	0.24
364	0.32
365	0.33
366	0.34
367	0.35
368	0.36
369	0.33
370	0.32
371	0.32
372	0.25
373	0.25
374	0.23
375	0.22
376	0.2
377	0.21
378	0.18
379	0.12
380	0.11
381	0.1
382	0.13
383	0.13
384	0.12
385	0.08
386	0.08
387	0.08
388	0.08
389	0.07
390	0.05
391	0.04
392	0.05
393	0.05
394	0.05
395	0.06
396	0.06
397	0.06
398	0.06
399	0.06
400	0.06
401	0.07
402	0.07
403	0.05
404	0.07
405	0.07
406	0.07
407	0.07
408	0.07
409	0.06
410	0.07
411	0.09
412	0.09
413	0.08
414	0.08
415	0.08
416	0.08
417	0.09
418	0.09
419	0.08
420	0.07
421	0.07
422	0.09
423	0.11
424	0.12
425	0.14
426	0.13
427	0.13
428	0.19
429	0.24
430	0.23
431	0.23
432	0.29
433	0.3
434	0.35
435	0.36
436	0.31
437	0.29
438	0.29
439	0.27
440	0.22
441	0.18
442	0.16
443	0.15
444	0.14
445	0.11
446	0.1
447	0.11
448	0.1
449	0.11
450	0.07
451	0.09
452	0.1
453	0.1
454	0.12
455	0.11
456	0.11
457	0.11
458	0.12
459	0.12
460	0.11
461	0.12
462	0.1
463	0.1
464	0.1
465	0.1
466	0.1
467	0.08
468	0.07
469	0.07
470	0.07
471	0.06
472	0.06
473	0.06
474	0.05
475	0.05
476	0.06
477	0.12
478	0.18
479	0.27
480	0.28
481	0.32
482	0.33
483	0.34
484	0.39
485	0.37
486	0.38
487	0.32
488	0.33
489	0.29
490	0.29
491	0.28
492	0.23
493	0.19
494	0.1
495	0.08
496	0.07
497	0.07
498	0.06
499	0.06
500	0.09
501	0.09
502	0.09
503	0.09
504	0.11
505	0.1
506	0.11
507	0.13
508	0.12
509	0.15
510	0.18
511	0.18
512	0.2
513	0.22
514	0.27
515	0.34
516	0.38
517	0.41
518	0.47
519	0.54
520	0.58
521	0.63
522	0.66
523	0.65
524	0.66
525	0.72
526	0.71
527	0.71
528	0.67
529	0.68
530	0.69
531	0.69
532	0.69
533	0.65
534	0.67
535	0.68
536	0.68
537	0.6
538	0.52
539	0.43
540	0.39
541	0.34
542	0.25
543	0.16
544	0.13
545	0.12
546	0.12
547	0.12
548	0.1
549	0.12
550	0.12
551	0.13
552	0.13
553	0.18
554	0.19
555	0.18
556	0.18
557	0.17
558	0.21
559	0.21
560	0.21
561	0.16
562	0.15
563	0.15
564	0.15
565	0.15
566	0.13
567	0.17
568	0.25
569	0.31
570	0.34
571	0.37
572	0.4
573	0.39
574	0.44
575	0.48
576	0.46
577	0.52
578	0.56
579	0.59
580	0.61
581	0.64
582	0.58
583	0.54
584	0.5
585	0.41
586	0.39
587	0.35
588	0.37
589	0.37
590	0.36
591	0.38
592	0.37
593	0.35
594	0.32
595	0.34
596	0.3
597	0.27
598	0.28
599	0.25
600	0.32
601	0.32

M5BUS0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer