Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B5RTM0

Protein Details
Accession B5RTM0    Localization Confidence High Confidence Score 18.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
260-285PQAGSPGAKKRKRSCHKPLLTVEQKRHydrophilic
287-306NHSLSEKKRRQSCKLAYERCHydrophilic
318-343DMKVDNSKGKSKRKQINKDGLPNLSKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
268-272KKRKR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14.833, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036638  HLH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0046983  F:protein dimerization activity  
KEGG dha:DEHA2D18370g  -  
Amino Acid Sequences MSQSNSGELGNIGDKTYEHIYGIDKIDIPEVDDNDSDIFEVSYKNMDFNDMDFEQTYTMYSTLQQKKALNVMDQLQKVQMLNEQYCTGIGQYEQVEDMKGGYAHESSKTMESQPRDDFDQFFSNTESNALEKFLDNLANSSGSSNPMHMYNDGQSNYQHDFPVFELHTMKAPAMPMPTPPQHSISPSDPQMIGHNTQGAMSNTKKSLVDALEHPSLRNLTTPDVCQLPTPLDSRQSSTSFNVVSDQDLDQDSFSSELSTPQAGSPGAKKRKRSCHKPLLTVEQKRLNHSLSEKKRRQSCKLAYERCLRLITNINDYTDMKVDNSKGKSKRKQINKDGLPNLSKHTALTKITNEMVKIKSQNDRLKKLLNLE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.16
3 0.19
4 0.17
5 0.15
6 0.16
7 0.18
8 0.23
9 0.25
10 0.23
11 0.22
12 0.22
13 0.24
14 0.23
15 0.23
16 0.22
17 0.21
18 0.21
19 0.2
20 0.2
21 0.18
22 0.18
23 0.15
24 0.11
25 0.1
26 0.08
27 0.08
28 0.08
29 0.12
30 0.12
31 0.14
32 0.13
33 0.16
34 0.16
35 0.16
36 0.22
37 0.18
38 0.19
39 0.19
40 0.19
41 0.16
42 0.16
43 0.15
44 0.1
45 0.1
46 0.09
47 0.11
48 0.21
49 0.29
50 0.33
51 0.37
52 0.38
53 0.41
54 0.46
55 0.46
56 0.38
57 0.33
58 0.36
59 0.37
60 0.36
61 0.34
62 0.29
63 0.27
64 0.25
65 0.23
66 0.2
67 0.19
68 0.19
69 0.2
70 0.2
71 0.18
72 0.18
73 0.18
74 0.14
75 0.09
76 0.08
77 0.09
78 0.09
79 0.1
80 0.1
81 0.1
82 0.1
83 0.1
84 0.1
85 0.08
86 0.08
87 0.07
88 0.08
89 0.09
90 0.1
91 0.11
92 0.12
93 0.12
94 0.14
95 0.15
96 0.18
97 0.22
98 0.23
99 0.28
100 0.29
101 0.3
102 0.32
103 0.32
104 0.3
105 0.28
106 0.31
107 0.26
108 0.24
109 0.24
110 0.2
111 0.18
112 0.18
113 0.15
114 0.11
115 0.1
116 0.1
117 0.09
118 0.08
119 0.1
120 0.1
121 0.11
122 0.1
123 0.11
124 0.11
125 0.11
126 0.1
127 0.1
128 0.09
129 0.1
130 0.1
131 0.1
132 0.1
133 0.11
134 0.12
135 0.11
136 0.13
137 0.12
138 0.16
139 0.16
140 0.17
141 0.16
142 0.18
143 0.19
144 0.19
145 0.17
146 0.13
147 0.13
148 0.13
149 0.17
150 0.14
151 0.13
152 0.13
153 0.13
154 0.15
155 0.14
156 0.13
157 0.1
158 0.1
159 0.1
160 0.1
161 0.1
162 0.1
163 0.14
164 0.16
165 0.19
166 0.2
167 0.22
168 0.22
169 0.23
170 0.25
171 0.23
172 0.25
173 0.22
174 0.22
175 0.19
176 0.18
177 0.19
178 0.18
179 0.16
180 0.13
181 0.13
182 0.12
183 0.12
184 0.14
185 0.12
186 0.13
187 0.13
188 0.15
189 0.15
190 0.16
191 0.16
192 0.13
193 0.16
194 0.14
195 0.15
196 0.14
197 0.19
198 0.21
199 0.22
200 0.21
201 0.19
202 0.19
203 0.17
204 0.17
205 0.13
206 0.12
207 0.14
208 0.15
209 0.15
210 0.16
211 0.16
212 0.14
213 0.14
214 0.12
215 0.13
216 0.14
217 0.14
218 0.18
219 0.18
220 0.21
221 0.24
222 0.24
223 0.25
224 0.24
225 0.25
226 0.21
227 0.2
228 0.19
229 0.16
230 0.15
231 0.14
232 0.13
233 0.11
234 0.12
235 0.12
236 0.09
237 0.09
238 0.09
239 0.08
240 0.07
241 0.07
242 0.07
243 0.08
244 0.09
245 0.1
246 0.1
247 0.09
248 0.11
249 0.1
250 0.12
251 0.16
252 0.25
253 0.35
254 0.39
255 0.48
256 0.55
257 0.66
258 0.76
259 0.8
260 0.81
261 0.82
262 0.85
263 0.85
264 0.82
265 0.82
266 0.81
267 0.76
268 0.72
269 0.7
270 0.64
271 0.6
272 0.57
273 0.48
274 0.42
275 0.43
276 0.46
277 0.48
278 0.58
279 0.6
280 0.64
281 0.72
282 0.76
283 0.78
284 0.78
285 0.76
286 0.76
287 0.8
288 0.8
289 0.78
290 0.79
291 0.75
292 0.68
293 0.61
294 0.51
295 0.44
296 0.46
297 0.41
298 0.41
299 0.39
300 0.36
301 0.36
302 0.37
303 0.35
304 0.28
305 0.25
306 0.18
307 0.2
308 0.22
309 0.27
310 0.31
311 0.38
312 0.44
313 0.54
314 0.63
315 0.69
316 0.76
317 0.79
318 0.85
319 0.87
320 0.89
321 0.88
322 0.89
323 0.85
324 0.83
325 0.75
326 0.66
327 0.6
328 0.52
329 0.43
330 0.34
331 0.32
332 0.3
333 0.3
334 0.34
335 0.32
336 0.33
337 0.37
338 0.38
339 0.36
340 0.36
341 0.35
342 0.36
343 0.37
344 0.38
345 0.43
346 0.5
347 0.58
348 0.62
349 0.67
350 0.66
351 0.68