Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0B7FAP2

Protein Details
Accession A0A0B7FAP2    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-30KRPAEASQPGHRKKRQAHSKGQIKNYKSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
12-22GHRKKRQAHSK
Subcellular Location(s) nucl 14, mito 8.5, cyto_mito 7, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004114  THUMP_dom  
IPR040183  THUMPD1-like  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006400  P:tRNA modification  
Pfam View protein in Pfam  
PF02926  THUMP  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51165  THUMP  
CDD cd11717  THUMP_THUMPD1_like  
Amino Acid Sequences MSKRPAEASQPGHRKKRQAHSKGQIKNYKSSVGGIPLRRAIDRPGIWAMTVKGKEKQATNELYEIIESISDRLWPKPPPTTETVPEDDEEDDEDEDIEKQLAKELSDINKPKMKDTTDRRIAICPTDTACVIYIATKPPIDPVEVVLRHMGQVAETGVSGTRALVRLVPASGICAANMTAITLLATELFIKAFGGEDVESKKYKIELRIRSHKVLAKDDVIKAIAQCVPSGKGHTVNLTNQDTTILVELFKGICTISVVPEYEKYKRFNVVQIVQEEQKKKGEQDADGSSRVAQTALVKS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.76
2 0.78
3 0.81
4 0.82
5 0.81
6 0.83
7 0.84
8 0.88
9 0.87
10 0.88
11 0.85
12 0.78
13 0.76
14 0.69
15 0.62
16 0.53
17 0.47
18 0.4
19 0.39
20 0.42
21 0.37
22 0.38
23 0.38
24 0.39
25 0.37
26 0.36
27 0.32
28 0.34
29 0.31
30 0.32
31 0.31
32 0.3
33 0.29
34 0.29
35 0.27
36 0.26
37 0.28
38 0.27
39 0.28
40 0.32
41 0.36
42 0.38
43 0.42
44 0.41
45 0.43
46 0.42
47 0.39
48 0.36
49 0.32
50 0.28
51 0.22
52 0.14
53 0.1
54 0.08
55 0.07
56 0.06
57 0.1
58 0.11
59 0.13
60 0.17
61 0.2
62 0.24
63 0.31
64 0.34
65 0.35
66 0.4
67 0.43
68 0.42
69 0.44
70 0.44
71 0.37
72 0.35
73 0.31
74 0.26
75 0.21
76 0.18
77 0.13
78 0.1
79 0.09
80 0.09
81 0.08
82 0.08
83 0.08
84 0.07
85 0.06
86 0.06
87 0.1
88 0.11
89 0.1
90 0.12
91 0.15
92 0.19
93 0.26
94 0.29
95 0.29
96 0.32
97 0.33
98 0.33
99 0.35
100 0.34
101 0.36
102 0.41
103 0.47
104 0.52
105 0.54
106 0.52
107 0.51
108 0.49
109 0.42
110 0.35
111 0.25
112 0.18
113 0.17
114 0.15
115 0.13
116 0.12
117 0.1
118 0.09
119 0.09
120 0.09
121 0.09
122 0.11
123 0.1
124 0.1
125 0.11
126 0.12
127 0.12
128 0.11
129 0.11
130 0.16
131 0.16
132 0.17
133 0.16
134 0.15
135 0.14
136 0.15
137 0.12
138 0.05
139 0.06
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.04
145 0.05
146 0.04
147 0.04
148 0.05
149 0.05
150 0.06
151 0.06
152 0.07
153 0.07
154 0.07
155 0.08
156 0.07
157 0.07
158 0.08
159 0.08
160 0.07
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.05
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.03
170 0.03
171 0.03
172 0.03
173 0.03
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.05
182 0.05
183 0.07
184 0.1
185 0.13
186 0.13
187 0.13
188 0.14
189 0.16
190 0.2
191 0.27
192 0.34
193 0.41
194 0.49
195 0.6
196 0.64
197 0.64
198 0.66
199 0.61
200 0.56
201 0.52
202 0.46
203 0.4
204 0.39
205 0.36
206 0.33
207 0.3
208 0.26
209 0.21
210 0.2
211 0.17
212 0.13
213 0.13
214 0.13
215 0.15
216 0.15
217 0.18
218 0.17
219 0.19
220 0.2
221 0.24
222 0.25
223 0.26
224 0.32
225 0.32
226 0.3
227 0.27
228 0.26
229 0.22
230 0.2
231 0.18
232 0.11
233 0.08
234 0.08
235 0.09
236 0.09
237 0.08
238 0.08
239 0.06
240 0.06
241 0.08
242 0.09
243 0.1
244 0.13
245 0.14
246 0.15
247 0.2
248 0.25
249 0.29
250 0.33
251 0.35
252 0.36
253 0.41
254 0.42
255 0.44
256 0.48
257 0.48
258 0.49
259 0.49
260 0.5
261 0.49
262 0.53
263 0.49
264 0.43
265 0.44
266 0.41
267 0.39
268 0.42
269 0.43
270 0.39
271 0.43
272 0.48
273 0.46
274 0.44
275 0.43
276 0.36
277 0.31
278 0.29
279 0.22
280 0.15