Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M5C7W0

Protein Details
Accession M5C7W0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
166-187PPPPAPAKRGRGRPRANNREVIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
160-181KAPAPPPPPPAPAKRGRGRPRA
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
IPR000608  UBQ-conjugat_E2  
IPR016135  UBQ-conjugating_enzyme/RWD  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0016874  F:ligase activity  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF00179  UQ_con  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00354  HMGI_Y  
PS50127  UBC_2  
CDD cd00195  UBCc  
Amino Acid Sequences MAAPTGRPTGMTLKRIQKEMKDLQNEDTGGITLTPSDHSLFEWTGTLPGPEGSVYEGGEFHVEITLPSDYPFHSPRLRLKTKIYHMNINDQGGICLDILKNAWSPALSLYKVMLSLSSLLTDPNPNDPLVPSIANEYTRRRKVHDTTARRWVQLHAQPVKAPAPPPPPPAPAKRGRGRPRANNREVIMVPDDDATPASTTATKRKRGGDDDREDRSKRQSTSGAGGSGSGSGSGSGSGEIIVIDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.52
2 0.57
3 0.59
4 0.55
5 0.58
6 0.62
7 0.63
8 0.61
9 0.59
10 0.57
11 0.58
12 0.53
13 0.44
14 0.35
15 0.26
16 0.18
17 0.16
18 0.12
19 0.07
20 0.07
21 0.08
22 0.09
23 0.1
24 0.1
25 0.11
26 0.14
27 0.14
28 0.14
29 0.14
30 0.13
31 0.13
32 0.13
33 0.12
34 0.09
35 0.09
36 0.08
37 0.07
38 0.07
39 0.08
40 0.08
41 0.09
42 0.08
43 0.08
44 0.08
45 0.09
46 0.08
47 0.07
48 0.06
49 0.06
50 0.05
51 0.08
52 0.08
53 0.08
54 0.08
55 0.09
56 0.09
57 0.13
58 0.15
59 0.17
60 0.2
61 0.24
62 0.32
63 0.41
64 0.45
65 0.45
66 0.49
67 0.54
68 0.58
69 0.64
70 0.59
71 0.57
72 0.54
73 0.58
74 0.54
75 0.46
76 0.4
77 0.3
78 0.27
79 0.19
80 0.18
81 0.1
82 0.08
83 0.07
84 0.06
85 0.06
86 0.07
87 0.08
88 0.07
89 0.07
90 0.06
91 0.07
92 0.09
93 0.11
94 0.1
95 0.1
96 0.1
97 0.1
98 0.11
99 0.1
100 0.07
101 0.05
102 0.06
103 0.06
104 0.06
105 0.06
106 0.06
107 0.06
108 0.08
109 0.08
110 0.1
111 0.11
112 0.1
113 0.1
114 0.1
115 0.11
116 0.11
117 0.11
118 0.08
119 0.09
120 0.1
121 0.12
122 0.14
123 0.19
124 0.26
125 0.32
126 0.33
127 0.35
128 0.41
129 0.44
130 0.53
131 0.57
132 0.57
133 0.56
134 0.65
135 0.63
136 0.56
137 0.53
138 0.44
139 0.41
140 0.37
141 0.41
142 0.35
143 0.34
144 0.34
145 0.36
146 0.36
147 0.3
148 0.26
149 0.24
150 0.26
151 0.29
152 0.34
153 0.35
154 0.37
155 0.41
156 0.45
157 0.46
158 0.48
159 0.53
160 0.55
161 0.62
162 0.67
163 0.72
164 0.76
165 0.79
166 0.82
167 0.84
168 0.81
169 0.78
170 0.69
171 0.65
172 0.56
173 0.49
174 0.4
175 0.29
176 0.25
177 0.19
178 0.18
179 0.12
180 0.13
181 0.1
182 0.09
183 0.09
184 0.09
185 0.11
186 0.14
187 0.23
188 0.31
189 0.37
190 0.41
191 0.48
192 0.54
193 0.59
194 0.67
195 0.68
196 0.7
197 0.7
198 0.73
199 0.73
200 0.68
201 0.63
202 0.62
203 0.58
204 0.5
205 0.49
206 0.47
207 0.44
208 0.48
209 0.49
210 0.41
211 0.34
212 0.32
213 0.27
214 0.22
215 0.17
216 0.11
217 0.07
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.06
224 0.06
225 0.06