Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M5C321

Protein Details
Accession M5C321    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
67-86QTPRPGPSKKQQVKLEPPANHydrophilic
300-324RINNVRRKLKLSRPPRENRPKLTATHydrophilic
345-369ANPNYVSKAKQQRQRDEKLCIKCGKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
306-316RKLKLSRPPRE
Subcellular Location(s) mito 9, cyto_nucl 7.5, cyto 7, nucl 6, pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032567  LDOC1-rel  
IPR005162  Retrotrans_gag_dom  
Pfam View protein in Pfam  
PF03732  Retrotrans_gag  
Amino Acid Sequences MDDLCDLLHRLITSVLELSTRVTETEEATKDVRATVENISQKVDIIAGKVEGPRTPDQGNPATTVDQTPRPGPSKKQQVKLEPPANIEWHSIHSDEEEEDPAPASSPKSSGSKIRAASIPVGTASQSLSCTPGGSLKPIKVKAPEPFKGGTGTEAKQWAARMSGWLRLSATQFDTKEDMVTFLLVNMEGTAAAWALPHLANIRTPKATITTPEEFDAAFEKAFFDPDEQRAAEQKITTLVQTTTAAYATEFWTLLMSLDWNNAALRAQFYKGLHWHVKQQLAQKEDQPRDLEGLIATAIRINNVRRKLKLSRPPRENRPKLTATTSTSCPANTGTTHIDLDRLKANPNYVSKAKQQRQRDEKLCIKCGKPGH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.13
3 0.11
4 0.11
5 0.12
6 0.13
7 0.13
8 0.12
9 0.13
10 0.14
11 0.16
12 0.23
13 0.23
14 0.24
15 0.25
16 0.26
17 0.24
18 0.24
19 0.23
20 0.17
21 0.17
22 0.19
23 0.25
24 0.29
25 0.29
26 0.3
27 0.29
28 0.28
29 0.25
30 0.23
31 0.16
32 0.13
33 0.13
34 0.11
35 0.14
36 0.15
37 0.16
38 0.16
39 0.21
40 0.22
41 0.25
42 0.26
43 0.26
44 0.31
45 0.35
46 0.35
47 0.32
48 0.31
49 0.29
50 0.28
51 0.28
52 0.26
53 0.25
54 0.26
55 0.25
56 0.28
57 0.32
58 0.35
59 0.4
60 0.46
61 0.53
62 0.59
63 0.66
64 0.68
65 0.73
66 0.79
67 0.82
68 0.78
69 0.7
70 0.66
71 0.59
72 0.54
73 0.45
74 0.37
75 0.28
76 0.24
77 0.23
78 0.2
79 0.17
80 0.16
81 0.15
82 0.14
83 0.14
84 0.13
85 0.11
86 0.11
87 0.11
88 0.1
89 0.1
90 0.1
91 0.1
92 0.09
93 0.1
94 0.12
95 0.15
96 0.17
97 0.23
98 0.26
99 0.32
100 0.32
101 0.34
102 0.33
103 0.32
104 0.33
105 0.27
106 0.23
107 0.17
108 0.16
109 0.13
110 0.11
111 0.1
112 0.08
113 0.08
114 0.08
115 0.09
116 0.09
117 0.09
118 0.09
119 0.13
120 0.13
121 0.16
122 0.19
123 0.21
124 0.27
125 0.28
126 0.31
127 0.3
128 0.33
129 0.36
130 0.42
131 0.41
132 0.38
133 0.37
134 0.35
135 0.33
136 0.29
137 0.25
138 0.21
139 0.19
140 0.18
141 0.18
142 0.17
143 0.17
144 0.17
145 0.15
146 0.12
147 0.12
148 0.13
149 0.13
150 0.18
151 0.17
152 0.17
153 0.17
154 0.18
155 0.19
156 0.16
157 0.17
158 0.16
159 0.16
160 0.17
161 0.18
162 0.16
163 0.16
164 0.14
165 0.13
166 0.09
167 0.09
168 0.07
169 0.06
170 0.06
171 0.05
172 0.05
173 0.04
174 0.04
175 0.03
176 0.03
177 0.03
178 0.03
179 0.03
180 0.03
181 0.03
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.05
186 0.06
187 0.09
188 0.12
189 0.14
190 0.13
191 0.14
192 0.14
193 0.15
194 0.16
195 0.16
196 0.2
197 0.2
198 0.21
199 0.21
200 0.21
201 0.18
202 0.18
203 0.17
204 0.11
205 0.09
206 0.08
207 0.08
208 0.08
209 0.09
210 0.09
211 0.09
212 0.11
213 0.13
214 0.16
215 0.15
216 0.16
217 0.18
218 0.2
219 0.19
220 0.16
221 0.15
222 0.14
223 0.15
224 0.14
225 0.12
226 0.11
227 0.11
228 0.12
229 0.12
230 0.1
231 0.1
232 0.1
233 0.08
234 0.09
235 0.08
236 0.09
237 0.08
238 0.07
239 0.08
240 0.08
241 0.08
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.07
246 0.07
247 0.07
248 0.07
249 0.07
250 0.08
251 0.07
252 0.09
253 0.1
254 0.11
255 0.15
256 0.15
257 0.2
258 0.22
259 0.29
260 0.32
261 0.32
262 0.39
263 0.41
264 0.46
265 0.45
266 0.5
267 0.49
268 0.47
269 0.48
270 0.46
271 0.51
272 0.48
273 0.49
274 0.43
275 0.37
276 0.36
277 0.34
278 0.28
279 0.18
280 0.16
281 0.12
282 0.09
283 0.08
284 0.08
285 0.08
286 0.09
287 0.12
288 0.17
289 0.24
290 0.33
291 0.38
292 0.39
293 0.46
294 0.53
295 0.61
296 0.66
297 0.69
298 0.71
299 0.76
300 0.82
301 0.87
302 0.89
303 0.88
304 0.86
305 0.83
306 0.77
307 0.71
308 0.68
309 0.63
310 0.58
311 0.54
312 0.49
313 0.44
314 0.4
315 0.36
316 0.31
317 0.26
318 0.23
319 0.19
320 0.2
321 0.21
322 0.23
323 0.25
324 0.23
325 0.26
326 0.24
327 0.26
328 0.27
329 0.24
330 0.26
331 0.27
332 0.31
333 0.33
334 0.37
335 0.41
336 0.4
337 0.44
338 0.49
339 0.58
340 0.62
341 0.64
342 0.7
343 0.74
344 0.79
345 0.85
346 0.83
347 0.81
348 0.82
349 0.82
350 0.81
351 0.77
352 0.69