Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M5C4R8

Protein Details
Accession M5C4R8    Localization Confidence Low Confidence Score 7.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
376-404KANPNYVSKAKQQRRRDKKLCIKCGKAGHHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto_nucl 9.5, nucl 8.5, cyto 7.5, mito 6, pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032567  LDOC1-rel  
IPR005162  Retrotrans_gag_dom  
Pfam View protein in Pfam  
PF03732  Retrotrans_gag  
Amino Acid Sequences MATPSQPTTTLGQPQHQGLLSPFGEASTHPGSTTLDDVHDLLHRLITAVSKLTTRVAETEEATKDVRVTVESISQQVDIIAGKVDEPRTPEQVNPIQTIDKTPQAGTTGRQRVKIKEPAPVWHSLISEDKSAPKVVTSAGNTSRIRTASIPLTPTTRLASQTPGGSTKPIKVKAPEPFKGGSGTEAKQWMARMSRWLRLSVTQFETKEDVITYLLVNMEGTALAWALPHLANIGTDKATIRTVNDFDKAFEQAFFDPDKQQAAERKITTLTQTTTAATYATEFCTLLMSLDWNNAALQAQFYKGLHWHVKQQLPQKEDQPQDLKALIAAAICIDNVCRKLKISRPPCENCPKPATTTSTSRLANTSTPCIDLDCLKANPNYVSKAKQQRRRDKKLCIKCGKAGH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.42
3 0.38
4 0.34
5 0.27
6 0.31
7 0.25
8 0.23
9 0.21
10 0.17
11 0.17
12 0.16
13 0.21
14 0.17
15 0.17
16 0.16
17 0.17
18 0.18
19 0.19
20 0.22
21 0.17
22 0.14
23 0.15
24 0.15
25 0.16
26 0.17
27 0.17
28 0.15
29 0.14
30 0.13
31 0.13
32 0.13
33 0.14
34 0.13
35 0.13
36 0.14
37 0.14
38 0.15
39 0.17
40 0.17
41 0.17
42 0.17
43 0.18
44 0.19
45 0.2
46 0.25
47 0.23
48 0.24
49 0.24
50 0.22
51 0.19
52 0.18
53 0.17
54 0.12
55 0.13
56 0.12
57 0.16
58 0.17
59 0.18
60 0.18
61 0.17
62 0.16
63 0.15
64 0.14
65 0.09
66 0.08
67 0.08
68 0.06
69 0.07
70 0.1
71 0.12
72 0.12
73 0.17
74 0.2
75 0.25
76 0.26
77 0.26
78 0.31
79 0.36
80 0.37
81 0.35
82 0.33
83 0.3
84 0.29
85 0.32
86 0.27
87 0.25
88 0.23
89 0.21
90 0.2
91 0.21
92 0.22
93 0.21
94 0.28
95 0.35
96 0.36
97 0.42
98 0.44
99 0.47
100 0.54
101 0.6
102 0.52
103 0.5
104 0.5
105 0.49
106 0.49
107 0.47
108 0.41
109 0.34
110 0.33
111 0.26
112 0.29
113 0.24
114 0.22
115 0.2
116 0.2
117 0.19
118 0.2
119 0.18
120 0.14
121 0.13
122 0.12
123 0.16
124 0.15
125 0.19
126 0.21
127 0.28
128 0.28
129 0.29
130 0.3
131 0.26
132 0.26
133 0.22
134 0.22
135 0.19
136 0.21
137 0.21
138 0.19
139 0.21
140 0.2
141 0.2
142 0.19
143 0.17
144 0.16
145 0.16
146 0.17
147 0.17
148 0.18
149 0.18
150 0.18
151 0.17
152 0.17
153 0.18
154 0.2
155 0.25
156 0.26
157 0.27
158 0.28
159 0.34
160 0.39
161 0.46
162 0.43
163 0.41
164 0.39
165 0.37
166 0.36
167 0.3
168 0.24
169 0.2
170 0.18
171 0.17
172 0.17
173 0.17
174 0.16
175 0.16
176 0.16
177 0.14
178 0.14
179 0.21
180 0.22
181 0.27
182 0.27
183 0.28
184 0.26
185 0.28
186 0.3
187 0.26
188 0.27
189 0.26
190 0.25
191 0.25
192 0.26
193 0.22
194 0.19
195 0.15
196 0.12
197 0.08
198 0.08
199 0.07
200 0.06
201 0.06
202 0.05
203 0.05
204 0.04
205 0.04
206 0.03
207 0.03
208 0.03
209 0.03
210 0.03
211 0.03
212 0.03
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.05
219 0.06
220 0.07
221 0.06
222 0.07
223 0.07
224 0.08
225 0.1
226 0.1
227 0.1
228 0.12
229 0.14
230 0.16
231 0.18
232 0.17
233 0.17
234 0.18
235 0.18
236 0.16
237 0.14
238 0.14
239 0.12
240 0.13
241 0.14
242 0.14
243 0.14
244 0.14
245 0.15
246 0.14
247 0.17
248 0.22
249 0.25
250 0.29
251 0.28
252 0.29
253 0.29
254 0.29
255 0.28
256 0.25
257 0.22
258 0.18
259 0.18
260 0.17
261 0.17
262 0.16
263 0.14
264 0.1
265 0.1
266 0.09
267 0.1
268 0.1
269 0.09
270 0.09
271 0.1
272 0.1
273 0.09
274 0.08
275 0.08
276 0.07
277 0.09
278 0.09
279 0.08
280 0.08
281 0.08
282 0.08
283 0.07
284 0.08
285 0.07
286 0.08
287 0.1
288 0.1
289 0.12
290 0.13
291 0.19
292 0.24
293 0.25
294 0.32
295 0.38
296 0.43
297 0.47
298 0.55
299 0.56
300 0.54
301 0.56
302 0.54
303 0.55
304 0.52
305 0.54
306 0.49
307 0.43
308 0.42
309 0.39
310 0.33
311 0.24
312 0.22
313 0.15
314 0.11
315 0.09
316 0.07
317 0.06
318 0.06
319 0.06
320 0.06
321 0.09
322 0.13
323 0.15
324 0.16
325 0.18
326 0.26
327 0.34
328 0.43
329 0.5
330 0.56
331 0.63
332 0.68
333 0.75
334 0.79
335 0.76
336 0.73
337 0.7
338 0.63
339 0.58
340 0.57
341 0.55
342 0.5
343 0.52
344 0.49
345 0.49
346 0.48
347 0.44
348 0.41
349 0.36
350 0.36
351 0.33
352 0.35
353 0.29
354 0.29
355 0.28
356 0.28
357 0.26
358 0.24
359 0.24
360 0.24
361 0.24
362 0.27
363 0.28
364 0.3
365 0.33
366 0.35
367 0.37
368 0.35
369 0.39
370 0.44
371 0.54
372 0.6
373 0.66
374 0.73
375 0.78
376 0.84
377 0.91
378 0.91
379 0.91
380 0.92
381 0.93
382 0.93
383 0.92
384 0.88