Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M5CDC9

Protein Details
Accession M5CDC9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
273-292RERDRDRDRDHRDSHRDRDRBasic
295-327HSSRYDRDRDRDHRDRDSRRGDRDRSRSPRRRYBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
305-327RDHRDRDSRRGDRDRSRSPRRRY
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 11, cyto 6.5, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004882  Luc7-rel  
Gene Ontology GO:0005685  C:U1 snRNP  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0006376  P:mRNA splice site selection  
Pfam View protein in Pfam  
PF03194  LUC7  
Amino Acid Sequences MGRLAEMQRKLLEQMMGPEAMGAVNANLQWFDEKVCRNFLCGTCPHALFTNTKMDLGPCPKSHTERLKTDFNEAREKNPNDPRFDQFQREYEANISSFVEECDRRIRAAHRRLEKTPEENAKTTNLMREIGEIELAIQGGTEKIESLGEEGKVEESMKELEAVEALKAEKTEKERELQQLTDTSGASGHQKLRVCDVCGAYLSVLDSDRRLADHFGGKMHLGYFELRKMLDELKQRRSQGGRGPMGPPPVPTSAPSGPGGSAPDGPRDRGYDRERDRDRDRDHRDSHRDRDRDHHSSRYDRDRDRDHRDRDSRRGDRDRSRSPRRRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.24
3 0.23
4 0.21
5 0.19
6 0.16
7 0.13
8 0.12
9 0.08
10 0.05
11 0.06
12 0.06
13 0.07
14 0.07
15 0.08
16 0.09
17 0.09
18 0.12
19 0.17
20 0.22
21 0.25
22 0.33
23 0.32
24 0.34
25 0.39
26 0.38
27 0.37
28 0.34
29 0.36
30 0.33
31 0.34
32 0.32
33 0.3
34 0.3
35 0.27
36 0.28
37 0.31
38 0.27
39 0.27
40 0.26
41 0.24
42 0.29
43 0.32
44 0.35
45 0.27
46 0.33
47 0.37
48 0.41
49 0.49
50 0.53
51 0.55
52 0.57
53 0.61
54 0.63
55 0.61
56 0.64
57 0.61
58 0.54
59 0.57
60 0.49
61 0.5
62 0.52
63 0.53
64 0.53
65 0.57
66 0.59
67 0.55
68 0.58
69 0.57
70 0.55
71 0.56
72 0.54
73 0.48
74 0.46
75 0.43
76 0.4
77 0.37
78 0.3
79 0.29
80 0.22
81 0.19
82 0.16
83 0.13
84 0.12
85 0.11
86 0.13
87 0.11
88 0.13
89 0.18
90 0.18
91 0.18
92 0.2
93 0.27
94 0.33
95 0.42
96 0.48
97 0.52
98 0.56
99 0.59
100 0.63
101 0.61
102 0.55
103 0.54
104 0.54
105 0.49
106 0.45
107 0.43
108 0.38
109 0.36
110 0.32
111 0.27
112 0.2
113 0.17
114 0.16
115 0.16
116 0.15
117 0.13
118 0.12
119 0.08
120 0.07
121 0.07
122 0.06
123 0.05
124 0.03
125 0.03
126 0.03
127 0.04
128 0.03
129 0.03
130 0.03
131 0.04
132 0.04
133 0.05
134 0.07
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.08
140 0.08
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.06
145 0.07
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.06
156 0.08
157 0.12
158 0.17
159 0.18
160 0.2
161 0.24
162 0.29
163 0.3
164 0.28
165 0.26
166 0.22
167 0.22
168 0.21
169 0.17
170 0.12
171 0.09
172 0.09
173 0.1
174 0.11
175 0.12
176 0.15
177 0.17
178 0.17
179 0.23
180 0.25
181 0.25
182 0.26
183 0.25
184 0.22
185 0.2
186 0.2
187 0.14
188 0.12
189 0.1
190 0.07
191 0.07
192 0.06
193 0.06
194 0.07
195 0.07
196 0.08
197 0.09
198 0.09
199 0.11
200 0.15
201 0.16
202 0.16
203 0.16
204 0.16
205 0.15
206 0.14
207 0.12
208 0.09
209 0.1
210 0.11
211 0.12
212 0.13
213 0.12
214 0.13
215 0.14
216 0.15
217 0.19
218 0.27
219 0.32
220 0.39
221 0.45
222 0.45
223 0.49
224 0.5
225 0.5
226 0.48
227 0.52
228 0.47
229 0.44
230 0.45
231 0.42
232 0.44
233 0.39
234 0.33
235 0.27
236 0.26
237 0.24
238 0.23
239 0.27
240 0.23
241 0.26
242 0.25
243 0.22
244 0.2
245 0.2
246 0.21
247 0.16
248 0.19
249 0.17
250 0.24
251 0.24
252 0.26
253 0.27
254 0.29
255 0.3
256 0.34
257 0.38
258 0.41
259 0.46
260 0.54
261 0.58
262 0.62
263 0.66
264 0.67
265 0.7
266 0.7
267 0.72
268 0.72
269 0.73
270 0.75
271 0.79
272 0.78
273 0.81
274 0.8
275 0.76
276 0.69
277 0.72
278 0.7
279 0.69
280 0.66
281 0.65
282 0.61
283 0.65
284 0.7
285 0.71
286 0.71
287 0.68
288 0.71
289 0.73
290 0.75
291 0.77
292 0.79
293 0.75
294 0.78
295 0.81
296 0.81
297 0.81
298 0.83
299 0.81
300 0.82
301 0.84
302 0.83
303 0.83
304 0.84
305 0.85
306 0.84
307 0.88