FuNGI

A0A0B7F4L4

Protein Details

Accession

A0A0B7F4L4

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
24-57	SPRMSRPLKRIPIPEPKRRRPPLKDSTPKRETST	Hydrophilic
159-179	EDDPKGKKKAKEDPNAKKKAF	Basic
523-542	GNGNGKKRKDHPDRAGTPTP	Basic
556-580	PTTPGASGQKKKKSKHDLVAPNGDP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
29-48	RPLKRIPIPEPKRRRPPLKD
157-184	KKEDDPKGKKKAKEDPNAKKKAFMKKTR
281-301	ARTKPKKEEEDEKPARGGRRL
528-533	KKRKDH
565-568	KKKK

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 11, mito 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MDRRTCCLSLCSHHHQATSVILDSPRMSRPLKRIPIPEPKRRRPPLKDSTPKRETSTTPAPATSDTPQGPYVDYALTSSKHSDKKWDVFKLQSHHDTPIDLHSWPAPVKLNRKDFKSRNEVEEEVGPLTPMLGHDGKPVIGPDGKVVMLNADGTRVKKEDDPKGKKKAKEDPNAKKKAFMKKTRQVHMIPDEVRAFRKEHRKDWLLEDNGGGLGANQSWSGKYSDANDKQIYAFFAPVPGNDKEFRFIPVYRFYNFTRNNNVNTERVESQHARMQAAKNNARTKPKKEEEDEKPARGGRRLRVVNNGRERYADEDHKPHLGGEGDYDEMEYEDEVQDDEEGPAEPLQDEEEKEAAQRQKREYLRNKVSERVEPESDEDEDDGKGYTEDGRQLKKLMKKMLNESDDEKNPYADSDDEEDEEENKPEQPPAVGVMPNTPTQSGTSTPRPQGSQPSQPSSQPAKPAQSATNPNSAAQRVTSPSMGGSALLAQRATSPHPIRKSPSLPGSANRATTPMSPAGTPTSGNGNGKKRKDHPDRAGTPTPPQKRPTPTPQSPTPTTPGASGQKKKKSKHDLVAPNGDPLPEIITEEHAIEYLRKMGGAVQTGEVITYFKRALKHDPENQKRLTDALKKVSSQAQKGYIKLIPQYI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.53
2	0.51
3	0.47
4	0.43
5	0.38
6	0.31
7	0.25
8	0.22
9	0.23
10	0.23
11	0.25
12	0.23
13	0.25
14	0.27
15	0.31
16	0.39
17	0.48
18	0.56
19	0.6
20	0.64
21	0.68
22	0.76
23	0.78
24	0.8
25	0.81
26	0.82
27	0.86
28	0.88
29	0.9
30	0.88
31	0.9
32	0.9
33	0.9
34	0.91
35	0.89
36	0.9
37	0.87
38	0.81
39	0.76
40	0.71
41	0.63
42	0.61
43	0.61
44	0.57
45	0.52
46	0.49
47	0.45
48	0.41
49	0.41
50	0.35
51	0.32
52	0.26
53	0.27
54	0.27
55	0.27
56	0.26
57	0.23
58	0.22
59	0.15
60	0.14
61	0.13
62	0.15
63	0.15
64	0.16
65	0.19
66	0.25
67	0.3
68	0.31
69	0.39
70	0.45
71	0.53
72	0.6
73	0.63
74	0.61
75	0.62
76	0.67
77	0.64
78	0.63
79	0.61
80	0.55
81	0.51
82	0.47
83	0.42
84	0.37
85	0.36
86	0.3
87	0.22
88	0.21
89	0.18
90	0.2
91	0.19
92	0.21
93	0.23
94	0.27
95	0.37
96	0.44
97	0.53
98	0.55
99	0.62
100	0.69
101	0.69
102	0.72
103	0.73
104	0.69
105	0.64
106	0.65
107	0.59
108	0.51
109	0.47
110	0.39
111	0.3
112	0.26
113	0.2
114	0.13
115	0.12
116	0.1
117	0.07
118	0.1
119	0.11
120	0.11
121	0.14
122	0.15
123	0.15
124	0.16
125	0.16
126	0.14
127	0.15
128	0.14
129	0.13
130	0.15
131	0.15
132	0.14
133	0.13
134	0.11
135	0.09
136	0.11
137	0.09
138	0.1
139	0.12
140	0.13
141	0.16
142	0.16
143	0.18
144	0.21
145	0.29
146	0.36
147	0.45
148	0.54
149	0.6
150	0.7
151	0.76
152	0.75
153	0.76
154	0.76
155	0.75
156	0.76
157	0.78
158	0.79
159	0.82
160	0.87
161	0.79
162	0.76
163	0.72
164	0.73
165	0.72
166	0.71
167	0.71
168	0.71
169	0.79
170	0.79
171	0.78
172	0.69
173	0.66
174	0.61
175	0.58
176	0.49
177	0.44
178	0.41
179	0.36
180	0.36
181	0.3
182	0.27
183	0.27
184	0.36
185	0.38
186	0.41
187	0.48
188	0.51
189	0.52
190	0.57
191	0.59
192	0.51
193	0.46
194	0.41
195	0.32
196	0.28
197	0.24
198	0.17
199	0.08
200	0.05
201	0.05
202	0.05
203	0.04
204	0.05
205	0.05
206	0.07
207	0.08
208	0.08
209	0.1
210	0.14
211	0.24
212	0.27
213	0.32
214	0.31
215	0.31
216	0.31
217	0.3
218	0.28
219	0.18
220	0.15
221	0.1
222	0.13
223	0.12
224	0.12
225	0.15
226	0.14
227	0.16
228	0.17
229	0.18
230	0.17
231	0.18
232	0.2
233	0.19
234	0.19
235	0.2
236	0.26
237	0.28
238	0.27
239	0.3
240	0.29
241	0.36
242	0.39
243	0.39
244	0.4
245	0.4
246	0.42
247	0.44
248	0.45
249	0.37
250	0.34
251	0.34
252	0.27
253	0.25
254	0.27
255	0.23
256	0.23
257	0.24
258	0.24
259	0.21
260	0.23
261	0.25
262	0.25
263	0.32
264	0.34
265	0.38
266	0.43
267	0.47
268	0.53
269	0.56
270	0.57
271	0.59
272	0.61
273	0.61
274	0.59
275	0.64
276	0.61
277	0.67
278	0.64
279	0.55
280	0.5
281	0.46
282	0.43
283	0.39
284	0.37
285	0.29
286	0.34
287	0.37
288	0.37
289	0.44
290	0.49
291	0.52
292	0.56
293	0.54
294	0.46
295	0.43
296	0.42
297	0.37
298	0.35
299	0.31
300	0.24
301	0.25
302	0.26
303	0.26
304	0.25
305	0.2
306	0.18
307	0.14
308	0.12
309	0.09
310	0.09
311	0.08
312	0.08
313	0.08
314	0.06
315	0.05
316	0.06
317	0.04
318	0.04
319	0.04
320	0.04
321	0.04
322	0.04
323	0.04
324	0.05
325	0.05
326	0.04
327	0.05
328	0.05
329	0.05
330	0.05
331	0.05
332	0.05
333	0.06
334	0.07
335	0.07
336	0.08
337	0.08
338	0.08
339	0.09
340	0.14
341	0.17
342	0.2
343	0.24
344	0.25
345	0.33
346	0.38
347	0.48
348	0.52
349	0.58
350	0.62
351	0.66
352	0.66
353	0.64
354	0.62
355	0.56
356	0.52
357	0.46
358	0.39
359	0.31
360	0.32
361	0.27
362	0.25
363	0.21
364	0.17
365	0.13
366	0.11
367	0.11
368	0.08
369	0.06
370	0.06
371	0.06
372	0.07
373	0.07
374	0.13
375	0.17
376	0.19
377	0.19
378	0.22
379	0.27
380	0.31
381	0.36
382	0.4
383	0.41
384	0.43
385	0.5
386	0.56
387	0.53
388	0.49
389	0.47
390	0.44
391	0.41
392	0.41
393	0.33
394	0.25
395	0.23
396	0.21
397	0.19
398	0.14
399	0.13
400	0.13
401	0.13
402	0.13
403	0.14
404	0.14
405	0.14
406	0.14
407	0.13
408	0.11
409	0.11
410	0.11
411	0.11
412	0.11
413	0.1
414	0.1
415	0.11
416	0.13
417	0.12
418	0.12
419	0.14
420	0.16
421	0.17
422	0.17
423	0.15
424	0.13
425	0.13
426	0.15
427	0.15
428	0.18
429	0.25
430	0.29
431	0.32
432	0.34
433	0.35
434	0.35
435	0.42
436	0.42
437	0.44
438	0.45
439	0.47
440	0.47
441	0.46
442	0.5
443	0.47
444	0.44
445	0.41
446	0.4
447	0.39
448	0.39
449	0.41
450	0.38
451	0.39
452	0.44
453	0.4
454	0.44
455	0.4
456	0.38
457	0.38
458	0.36
459	0.29
460	0.22
461	0.22
462	0.17
463	0.19
464	0.18
465	0.15
466	0.15
467	0.15
468	0.14
469	0.11
470	0.08
471	0.09
472	0.1
473	0.1
474	0.1
475	0.09
476	0.1
477	0.12
478	0.15
479	0.21
480	0.25
481	0.31
482	0.37
483	0.41
484	0.45
485	0.51
486	0.53
487	0.51
488	0.52
489	0.51
490	0.48
491	0.48
492	0.51
493	0.46
494	0.43
495	0.36
496	0.31
497	0.27
498	0.26
499	0.26
500	0.21
501	0.19
502	0.17
503	0.18
504	0.2
505	0.19
506	0.18
507	0.16
508	0.19
509	0.22
510	0.25
511	0.31
512	0.37
513	0.45
514	0.49
515	0.56
516	0.57
517	0.64
518	0.71
519	0.75
520	0.76
521	0.78
522	0.8
523	0.8
524	0.8
525	0.71
526	0.69
527	0.68
528	0.66
529	0.62
530	0.6
531	0.59
532	0.61
533	0.67
534	0.69
535	0.7
536	0.7
537	0.71
538	0.75
539	0.75
540	0.71
541	0.67
542	0.61
543	0.53
544	0.46
545	0.4
546	0.38
547	0.39
548	0.44
549	0.49
550	0.54
551	0.61
552	0.68
553	0.74
554	0.78
555	0.8
556	0.81
557	0.82
558	0.83
559	0.82
560	0.83
561	0.85
562	0.76
563	0.68
564	0.59
565	0.49
566	0.39
567	0.29
568	0.23
569	0.13
570	0.14
571	0.11
572	0.13
573	0.14
574	0.15
575	0.14
576	0.12
577	0.13
578	0.12
579	0.13
580	0.14
581	0.13
582	0.12
583	0.12
584	0.15
585	0.19
586	0.21
587	0.22
588	0.19
589	0.2
590	0.2
591	0.2
592	0.16
593	0.13
594	0.1
595	0.12
596	0.13
597	0.15
598	0.19
599	0.23
600	0.32
601	0.41
602	0.5
603	0.56
604	0.66
605	0.73
606	0.77
607	0.76
608	0.69
609	0.6
610	0.55
611	0.54
612	0.52
613	0.49
614	0.51
615	0.52
616	0.51
617	0.54
618	0.59
619	0.58
620	0.54
621	0.53
622	0.53
623	0.52
624	0.52
625	0.54
626	0.48
627	0.44

A0A0B7F4L4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer