Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0B7FNJ3

Protein Details
Accession A0A0B7FNJ3    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
381-409QDGLSPAKRPRGRPKGSKNKPKVTSDPTSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
387-402AKRPRGRPKGSKNKPK
Subcellular Location(s) nucl 9.5, mito 9, cyto_nucl 9, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR000116  HMGA  
IPR018482  Znf-C4H2  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF10146  zf-C4H2  
Amino Acid Sequences MLHFFVLLYRVSTNILDSITIPGLLGPRGLVLFPPATSSSFIINIFYLVGDMSVHHVDHQPGHQAYLHQTHFATPHQHQPQQQQQSTSTSPQPQYYTTPQDHANGYTNVQPYVNHQQGSYAVPAATIQQHPQIAPARISMVPPRSITQETYQSPVIAQPGSDWAKDLIRQAKASELKKHSLTLQLHTAQIISAHSSLEQRNQKLEDAKTQKEWLESERARLLDELRQVNEEREKVDLSESALQREVNELKIKIKAITEGEYGAAKNEVEIIRKELGLSPLPSLQATLEEKGTRGFIPYTSVFGVTDVGPSRIGSNHKRRLDQSDNETASIDAEIPATVPSSMVQSPQGNETIPTKRGPGRPRKVDASGNSPLLGQSTESGQDGLSPAKRPRGRPKGSKNKPKVTSDPTSI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.14
3 0.13
4 0.13
5 0.16
6 0.14
7 0.14
8 0.12
9 0.12
10 0.13
11 0.13
12 0.12
13 0.08
14 0.09
15 0.1
16 0.1
17 0.09
18 0.11
19 0.12
20 0.11
21 0.15
22 0.15
23 0.16
24 0.18
25 0.19
26 0.18
27 0.19
28 0.19
29 0.17
30 0.16
31 0.15
32 0.13
33 0.11
34 0.09
35 0.06
36 0.06
37 0.05
38 0.05
39 0.09
40 0.1
41 0.1
42 0.12
43 0.15
44 0.16
45 0.19
46 0.21
47 0.25
48 0.24
49 0.26
50 0.26
51 0.25
52 0.28
53 0.33
54 0.32
55 0.26
56 0.26
57 0.26
58 0.27
59 0.28
60 0.3
61 0.24
62 0.33
63 0.39
64 0.43
65 0.46
66 0.53
67 0.6
68 0.64
69 0.65
70 0.58
71 0.53
72 0.54
73 0.53
74 0.48
75 0.44
76 0.4
77 0.39
78 0.39
79 0.39
80 0.35
81 0.38
82 0.4
83 0.42
84 0.37
85 0.37
86 0.36
87 0.37
88 0.36
89 0.33
90 0.31
91 0.25
92 0.24
93 0.26
94 0.25
95 0.23
96 0.22
97 0.19
98 0.21
99 0.29
100 0.31
101 0.26
102 0.25
103 0.25
104 0.27
105 0.29
106 0.24
107 0.16
108 0.12
109 0.11
110 0.12
111 0.12
112 0.13
113 0.12
114 0.12
115 0.15
116 0.16
117 0.16
118 0.2
119 0.23
120 0.22
121 0.22
122 0.21
123 0.2
124 0.2
125 0.22
126 0.22
127 0.2
128 0.21
129 0.22
130 0.22
131 0.23
132 0.24
133 0.25
134 0.24
135 0.28
136 0.27
137 0.29
138 0.28
139 0.24
140 0.23
141 0.22
142 0.2
143 0.12
144 0.11
145 0.08
146 0.14
147 0.15
148 0.15
149 0.15
150 0.14
151 0.15
152 0.17
153 0.21
154 0.2
155 0.21
156 0.21
157 0.21
158 0.27
159 0.32
160 0.34
161 0.38
162 0.36
163 0.38
164 0.38
165 0.39
166 0.33
167 0.35
168 0.33
169 0.27
170 0.29
171 0.27
172 0.26
173 0.25
174 0.23
175 0.15
176 0.14
177 0.12
178 0.08
179 0.06
180 0.06
181 0.07
182 0.09
183 0.1
184 0.17
185 0.21
186 0.2
187 0.23
188 0.24
189 0.25
190 0.28
191 0.29
192 0.3
193 0.31
194 0.32
195 0.31
196 0.32
197 0.31
198 0.28
199 0.28
200 0.21
201 0.25
202 0.23
203 0.24
204 0.25
205 0.24
206 0.23
207 0.23
208 0.22
209 0.16
210 0.21
211 0.2
212 0.18
213 0.2
214 0.2
215 0.22
216 0.24
217 0.21
218 0.16
219 0.16
220 0.15
221 0.14
222 0.14
223 0.13
224 0.12
225 0.17
226 0.17
227 0.17
228 0.18
229 0.17
230 0.16
231 0.19
232 0.18
233 0.14
234 0.17
235 0.17
236 0.18
237 0.2
238 0.21
239 0.19
240 0.18
241 0.18
242 0.17
243 0.19
244 0.18
245 0.15
246 0.15
247 0.15
248 0.14
249 0.12
250 0.1
251 0.07
252 0.07
253 0.1
254 0.11
255 0.12
256 0.13
257 0.16
258 0.17
259 0.17
260 0.18
261 0.16
262 0.18
263 0.18
264 0.19
265 0.17
266 0.17
267 0.18
268 0.17
269 0.15
270 0.12
271 0.13
272 0.14
273 0.14
274 0.15
275 0.15
276 0.15
277 0.16
278 0.17
279 0.13
280 0.13
281 0.12
282 0.1
283 0.15
284 0.15
285 0.17
286 0.16
287 0.17
288 0.15
289 0.14
290 0.15
291 0.1
292 0.13
293 0.11
294 0.11
295 0.11
296 0.11
297 0.12
298 0.15
299 0.21
300 0.28
301 0.37
302 0.46
303 0.51
304 0.55
305 0.58
306 0.63
307 0.66
308 0.63
309 0.6
310 0.6
311 0.57
312 0.53
313 0.5
314 0.4
315 0.32
316 0.25
317 0.19
318 0.09
319 0.07
320 0.07
321 0.07
322 0.07
323 0.07
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.09
328 0.1
329 0.11
330 0.15
331 0.17
332 0.18
333 0.21
334 0.22
335 0.19
336 0.2
337 0.24
338 0.26
339 0.25
340 0.26
341 0.28
342 0.34
343 0.41
344 0.5
345 0.56
346 0.61
347 0.68
348 0.73
349 0.75
350 0.73
351 0.74
352 0.68
353 0.64
354 0.6
355 0.52
356 0.45
357 0.39
358 0.33
359 0.26
360 0.22
361 0.15
362 0.1
363 0.11
364 0.12
365 0.13
366 0.13
367 0.11
368 0.12
369 0.13
370 0.18
371 0.19
372 0.23
373 0.26
374 0.36
375 0.42
376 0.5
377 0.59
378 0.65
379 0.72
380 0.77
381 0.84
382 0.86
383 0.91
384 0.94
385 0.93
386 0.93
387 0.91
388 0.88
389 0.86
390 0.83