Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0B7FAP6

Protein Details
Accession A0A0B7FAP6    Localization Confidence High Confidence Score 17.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
87-107GVAPRAKMNQQRARRFRTAKDHydrophilic
357-379DSQWYKGKQRKHQQQAAEKSKSKHydrophilic
1292-1314TTGVLRVSWQSRRRRRKSYIKGGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
96-121QQRARRFRTAKDAKEAREKAEKKGEK
1303-1312RRRRRKSYIK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 11, nucl 10.5, cyto 10.5, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR016494  5_3_exoribonuclease_1  
IPR014722  Rib_L2_dom2  
IPR041385  SH3_12  
IPR040992  XRN1_D1  
IPR047007  XRN1_D1_sf  
IPR041106  XRN1_D2_D3  
IPR040486  Xrn1_D3  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR047008  XRN1_SH3_sf  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
Pfam View protein in Pfam  
PF18129  SH3_12  
PF18332  XRN1_D1  
PF18334  XRN1_D2_D3  
PF18194  Xrn1_D3  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGIPKFFRYISERYPLTSQLIEENKIPEFDNLYIDFNGIIHNCSHPNDGDVHFRLSEDQIFTAIFSYVDHLFGKIKPRKLFFMAIDGVAPRAKMNQQRARRFRTAKDAKEAREKAEKKGEKLPDEKAFDSNCITPGTVFMKKLSEQLKYFVNKKISEDANWREVQVVLSGHEVPGEGEHKIMEYIRLSKAQPDYDPNVRHCLYGLDADLIMLGLLSHDPHFCLLREEVKFGPQKNKSKGSLEAQSFYLLHISLLREYLDLEFQTLTSTLSFEYDLERIIDDFVLIAVFIGNDFLPHLPDLHIHENALERLFDIYKAVLPNAGGYLNESGEIHRGRLQMILDELATWEVDVFEKETSDSQWYKGKQRKHQQQAAEKSKSKPLTLTPSQKDLAVKIQDFIHQGHQDPSVRQLQLPNTLPAGDRAFLNGLCQELHLSVWWDEFDEEGQNLVTIALPEQDEDDEEGDEEGYQASMRVFKKYVTAQVLYPEGFDDREDDRLQAALKKWKEDYYRDKLEFKDIQKGVDELVYRYIEGLQWVMYYYYRGVASWGWFYDYHYAPRISDIKNIELFEFNYELGRPFKPFEQLMGVLPYASHELIPEAYRELMHSEHSPILHFYPENFELDMNGKKQEWEAVVKVPFIEEQKLLSSMATLEHRLTDEEKRRNSWGMSIKFSWTNDVKEYPSPSPGFLPVLPRCHCRMDEFVLPKLEGGLNLVKGLREGVFLGADALAGFPSLQTLPHSSIIQHHAVNVFNSDSKNRSVVIRVTNTFMGAKAGPIAEKMIGKRTFIGWPFLTEAQVVAVSDDLFKYEKQAVGRTTKIVPNPHHGDGLSRWRRTAEKIGTTYSKRFAVEIGDVDILLHVRPLKGLKRMDDGSLVKDYAGPEAETEQAVQISLMEVRSEDPRYIEQPAAPLEQEYPVGTNVFFLGEHTYGTPALIKAVADQKASLMIVYNPEERTEIDKFHALARENIAGSYLPARQISSSLRISGLALSRVTSSVMVTTNGNSKVNLGLSLKFEGKSMKVLGYSRKSDHGWEFSEKAIQLIQDYKAAFPTIFSALDRRGGDDITRASDLFPNGDAESQSKAAKDWLASKGVRELEPVSLFSEQLEKQNITNIEQYEAELNTKRSSEPSSTKRVMVQGVPRQALLKPDHAVHRLQNQRFSLGDRVVMVQNTGGVPLAAKGVVVGLLPTFLDVVWDVPFINGTTLNGRCTEYRGSSVTFNSVLNLTEPQFVQSTNKTRAPEPTSPNSRHAPRIGPQPSVPSRGGGAFRSASQPSQTRFESCPTLHGGGAGAQDRRTTGVLRVSWQSRRRRRKSYIKGG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.44
3 0.42
4 0.37
5 0.31
6 0.31
7 0.35
8 0.33
9 0.32
10 0.32
11 0.3
12 0.29
13 0.3
14 0.23
15 0.23
16 0.22
17 0.24
18 0.23
19 0.25
20 0.24
21 0.23
22 0.21
23 0.17
24 0.19
25 0.15
26 0.14
27 0.12
28 0.15
29 0.18
30 0.21
31 0.24
32 0.21
33 0.22
34 0.25
35 0.27
36 0.32
37 0.31
38 0.32
39 0.29
40 0.29
41 0.3
42 0.28
43 0.3
44 0.23
45 0.21
46 0.19
47 0.19
48 0.18
49 0.17
50 0.14
51 0.1
52 0.08
53 0.11
54 0.1
55 0.12
56 0.13
57 0.13
58 0.15
59 0.18
60 0.29
61 0.33
62 0.4
63 0.45
64 0.49
65 0.54
66 0.57
67 0.61
68 0.52
69 0.52
70 0.47
71 0.4
72 0.37
73 0.31
74 0.28
75 0.22
76 0.2
77 0.13
78 0.15
79 0.21
80 0.28
81 0.38
82 0.46
83 0.55
84 0.66
85 0.75
86 0.8
87 0.83
88 0.81
89 0.77
90 0.79
91 0.79
92 0.74
93 0.76
94 0.75
95 0.7
96 0.75
97 0.71
98 0.66
99 0.66
100 0.62
101 0.59
102 0.63
103 0.63
104 0.56
105 0.63
106 0.65
107 0.62
108 0.65
109 0.64
110 0.62
111 0.62
112 0.59
113 0.55
114 0.49
115 0.44
116 0.43
117 0.36
118 0.29
119 0.25
120 0.24
121 0.18
122 0.21
123 0.24
124 0.25
125 0.24
126 0.24
127 0.26
128 0.27
129 0.34
130 0.34
131 0.35
132 0.33
133 0.35
134 0.41
135 0.43
136 0.46
137 0.46
138 0.49
139 0.44
140 0.46
141 0.51
142 0.46
143 0.46
144 0.5
145 0.48
146 0.48
147 0.47
148 0.43
149 0.37
150 0.34
151 0.3
152 0.24
153 0.19
154 0.13
155 0.15
156 0.15
157 0.14
158 0.13
159 0.13
160 0.1
161 0.12
162 0.13
163 0.1
164 0.1
165 0.1
166 0.11
167 0.12
168 0.12
169 0.12
170 0.13
171 0.17
172 0.2
173 0.23
174 0.23
175 0.28
176 0.32
177 0.33
178 0.33
179 0.36
180 0.39
181 0.44
182 0.49
183 0.45
184 0.48
185 0.45
186 0.42
187 0.36
188 0.32
189 0.25
190 0.22
191 0.21
192 0.15
193 0.14
194 0.14
195 0.13
196 0.11
197 0.08
198 0.05
199 0.04
200 0.03
201 0.03
202 0.05
203 0.06
204 0.06
205 0.07
206 0.09
207 0.11
208 0.11
209 0.15
210 0.16
211 0.23
212 0.24
213 0.27
214 0.26
215 0.32
216 0.37
217 0.37
218 0.44
219 0.46
220 0.54
221 0.59
222 0.65
223 0.62
224 0.62
225 0.64
226 0.61
227 0.6
228 0.54
229 0.48
230 0.41
231 0.39
232 0.35
233 0.29
234 0.23
235 0.15
236 0.12
237 0.12
238 0.12
239 0.11
240 0.12
241 0.12
242 0.11
243 0.12
244 0.12
245 0.12
246 0.11
247 0.11
248 0.1
249 0.1
250 0.11
251 0.1
252 0.1
253 0.08
254 0.08
255 0.07
256 0.08
257 0.09
258 0.08
259 0.1
260 0.1
261 0.1
262 0.1
263 0.1
264 0.1
265 0.1
266 0.1
267 0.07
268 0.07
269 0.06
270 0.05
271 0.04
272 0.04
273 0.03
274 0.03
275 0.03
276 0.04
277 0.04
278 0.04
279 0.05
280 0.05
281 0.07
282 0.07
283 0.08
284 0.08
285 0.11
286 0.16
287 0.2
288 0.2
289 0.19
290 0.2
291 0.21
292 0.22
293 0.21
294 0.15
295 0.11
296 0.12
297 0.13
298 0.12
299 0.1
300 0.09
301 0.12
302 0.13
303 0.12
304 0.11
305 0.11
306 0.11
307 0.11
308 0.11
309 0.08
310 0.09
311 0.1
312 0.09
313 0.09
314 0.09
315 0.09
316 0.13
317 0.14
318 0.14
319 0.17
320 0.17
321 0.17
322 0.2
323 0.19
324 0.16
325 0.16
326 0.16
327 0.11
328 0.11
329 0.11
330 0.09
331 0.08
332 0.06
333 0.05
334 0.05
335 0.05
336 0.06
337 0.06
338 0.06
339 0.07
340 0.08
341 0.09
342 0.1
343 0.15
344 0.16
345 0.17
346 0.23
347 0.27
348 0.35
349 0.41
350 0.48
351 0.52
352 0.62
353 0.71
354 0.74
355 0.78
356 0.78
357 0.82
358 0.84
359 0.83
360 0.81
361 0.74
362 0.67
363 0.68
364 0.61
365 0.52
366 0.44
367 0.39
368 0.4
369 0.44
370 0.51
371 0.46
372 0.48
373 0.48
374 0.48
375 0.43
376 0.36
377 0.34
378 0.3
379 0.27
380 0.24
381 0.24
382 0.25
383 0.26
384 0.26
385 0.26
386 0.22
387 0.23
388 0.23
389 0.26
390 0.26
391 0.24
392 0.27
393 0.26
394 0.25
395 0.25
396 0.27
397 0.26
398 0.31
399 0.33
400 0.3
401 0.24
402 0.24
403 0.24
404 0.22
405 0.21
406 0.15
407 0.12
408 0.12
409 0.13
410 0.12
411 0.13
412 0.11
413 0.09
414 0.09
415 0.09
416 0.08
417 0.07
418 0.08
419 0.07
420 0.09
421 0.08
422 0.09
423 0.09
424 0.09
425 0.08
426 0.08
427 0.09
428 0.08
429 0.07
430 0.07
431 0.07
432 0.06
433 0.06
434 0.06
435 0.05
436 0.04
437 0.04
438 0.05
439 0.06
440 0.06
441 0.06
442 0.06
443 0.07
444 0.08
445 0.08
446 0.07
447 0.07
448 0.07
449 0.06
450 0.06
451 0.06
452 0.05
453 0.04
454 0.04
455 0.04
456 0.04
457 0.1
458 0.11
459 0.14
460 0.14
461 0.15
462 0.19
463 0.21
464 0.27
465 0.26
466 0.26
467 0.24
468 0.26
469 0.28
470 0.23
471 0.21
472 0.15
473 0.12
474 0.1
475 0.1
476 0.1
477 0.09
478 0.13
479 0.13
480 0.13
481 0.13
482 0.13
483 0.14
484 0.15
485 0.18
486 0.22
487 0.23
488 0.25
489 0.27
490 0.32
491 0.35
492 0.39
493 0.44
494 0.45
495 0.52
496 0.52
497 0.54
498 0.49
499 0.52
500 0.5
501 0.43
502 0.44
503 0.36
504 0.35
505 0.32
506 0.32
507 0.25
508 0.21
509 0.2
510 0.11
511 0.14
512 0.13
513 0.12
514 0.12
515 0.12
516 0.09
517 0.09
518 0.09
519 0.05
520 0.05
521 0.06
522 0.06
523 0.06
524 0.06
525 0.06
526 0.07
527 0.07
528 0.07
529 0.08
530 0.09
531 0.1
532 0.11
533 0.1
534 0.11
535 0.11
536 0.12
537 0.16
538 0.16
539 0.17
540 0.19
541 0.19
542 0.17
543 0.21
544 0.24
545 0.2
546 0.24
547 0.24
548 0.24
549 0.26
550 0.27
551 0.24
552 0.2
553 0.19
554 0.16
555 0.15
556 0.12
557 0.09
558 0.09
559 0.1
560 0.11
561 0.12
562 0.11
563 0.12
564 0.13
565 0.16
566 0.16
567 0.16
568 0.17
569 0.17
570 0.17
571 0.17
572 0.15
573 0.12
574 0.11
575 0.11
576 0.08
577 0.08
578 0.07
579 0.05
580 0.06
581 0.07
582 0.07
583 0.07
584 0.06
585 0.07
586 0.07
587 0.07
588 0.08
589 0.08
590 0.09
591 0.09
592 0.1
593 0.11
594 0.12
595 0.12
596 0.11
597 0.11
598 0.11
599 0.1
600 0.09
601 0.12
602 0.13
603 0.13
604 0.13
605 0.12
606 0.11
607 0.14
608 0.16
609 0.12
610 0.12
611 0.11
612 0.11
613 0.12
614 0.13
615 0.12
616 0.13
617 0.13
618 0.16
619 0.17
620 0.17
621 0.16
622 0.14
623 0.14
624 0.13
625 0.13
626 0.09
627 0.09
628 0.1
629 0.11
630 0.1
631 0.09
632 0.08
633 0.06
634 0.08
635 0.08
636 0.08
637 0.07
638 0.08
639 0.08
640 0.09
641 0.11
642 0.16
643 0.23
644 0.29
645 0.31
646 0.33
647 0.34
648 0.35
649 0.34
650 0.33
651 0.34
652 0.3
653 0.32
654 0.3
655 0.3
656 0.3
657 0.3
658 0.28
659 0.21
660 0.2
661 0.18
662 0.19
663 0.19
664 0.19
665 0.22
666 0.19
667 0.21
668 0.2
669 0.19
670 0.18
671 0.17
672 0.17
673 0.14
674 0.2
675 0.18
676 0.24
677 0.25
678 0.27
679 0.28
680 0.29
681 0.29
682 0.26
683 0.26
684 0.24
685 0.29
686 0.29
687 0.29
688 0.28
689 0.27
690 0.24
691 0.21
692 0.17
693 0.11
694 0.1
695 0.09
696 0.08
697 0.09
698 0.09
699 0.08
700 0.08
701 0.09
702 0.07
703 0.06
704 0.06
705 0.06
706 0.06
707 0.06
708 0.06
709 0.05
710 0.04
711 0.04
712 0.04
713 0.03
714 0.03
715 0.03
716 0.02
717 0.03
718 0.03
719 0.04
720 0.05
721 0.07
722 0.1
723 0.12
724 0.12
725 0.12
726 0.15
727 0.18
728 0.2
729 0.18
730 0.16
731 0.16
732 0.17
733 0.17
734 0.14
735 0.11
736 0.1
737 0.11
738 0.12
739 0.12
740 0.13
741 0.14
742 0.13
743 0.13
744 0.15
745 0.18
746 0.22
747 0.24
748 0.24
749 0.25
750 0.25
751 0.25
752 0.22
753 0.18
754 0.14
755 0.1
756 0.09
757 0.07
758 0.08
759 0.07
760 0.07
761 0.08
762 0.07
763 0.09
764 0.1
765 0.17
766 0.18
767 0.18
768 0.19
769 0.2
770 0.23
771 0.22
772 0.26
773 0.18
774 0.19
775 0.21
776 0.21
777 0.19
778 0.15
779 0.14
780 0.09
781 0.09
782 0.08
783 0.05
784 0.05
785 0.04
786 0.05
787 0.05
788 0.05
789 0.06
790 0.06
791 0.09
792 0.11
793 0.13
794 0.14
795 0.18
796 0.21
797 0.24
798 0.26
799 0.26
800 0.27
801 0.28
802 0.31
803 0.33
804 0.33
805 0.36
806 0.4
807 0.39
808 0.37
809 0.34
810 0.32
811 0.29
812 0.37
813 0.36
814 0.31
815 0.31
816 0.31
817 0.33
818 0.35
819 0.41
820 0.36
821 0.35
822 0.37
823 0.4
824 0.43
825 0.45
826 0.43
827 0.37
828 0.33
829 0.27
830 0.25
831 0.22
832 0.19
833 0.18
834 0.16
835 0.15
836 0.12
837 0.12
838 0.12
839 0.11
840 0.09
841 0.07
842 0.07
843 0.05
844 0.05
845 0.07
846 0.11
847 0.14
848 0.21
849 0.25
850 0.26
851 0.31
852 0.33
853 0.33
854 0.35
855 0.32
856 0.28
857 0.27
858 0.24
859 0.18
860 0.19
861 0.18
862 0.14
863 0.13
864 0.1
865 0.09
866 0.1
867 0.11
868 0.09
869 0.09
870 0.08
871 0.07
872 0.07
873 0.06
874 0.05
875 0.05
876 0.06
877 0.05
878 0.05
879 0.05
880 0.07
881 0.1
882 0.12
883 0.11
884 0.13
885 0.15
886 0.17
887 0.19
888 0.19
889 0.16
890 0.18
891 0.19
892 0.19
893 0.16
894 0.15
895 0.13
896 0.13
897 0.13
898 0.11
899 0.1
900 0.09
901 0.09
902 0.09
903 0.08
904 0.07
905 0.07
906 0.07
907 0.06
908 0.09
909 0.08
910 0.09
911 0.09
912 0.1
913 0.09
914 0.1
915 0.1
916 0.07
917 0.08
918 0.08
919 0.07
920 0.09
921 0.15
922 0.17
923 0.16
924 0.16
925 0.16
926 0.17
927 0.17
928 0.14
929 0.09
930 0.07
931 0.1
932 0.13
933 0.16
934 0.15
935 0.16
936 0.17
937 0.17
938 0.21
939 0.2
940 0.19
941 0.18
942 0.2
943 0.2
944 0.23
945 0.26
946 0.23
947 0.23
948 0.25
949 0.25
950 0.23
951 0.22
952 0.19
953 0.15
954 0.14
955 0.14
956 0.13
957 0.11
958 0.12
959 0.12
960 0.12
961 0.15
962 0.17
963 0.2
964 0.2
965 0.19
966 0.19
967 0.19
968 0.19
969 0.2
970 0.18
971 0.15
972 0.13
973 0.13
974 0.13
975 0.13
976 0.14
977 0.11
978 0.09
979 0.09
980 0.1
981 0.1
982 0.1
983 0.11
984 0.16
985 0.19
986 0.19
987 0.17
988 0.17
989 0.18
990 0.18
991 0.19
992 0.15
993 0.15
994 0.17
995 0.2
996 0.21
997 0.19
998 0.19
999 0.19
1000 0.18
1001 0.2
1002 0.19
1003 0.17
1004 0.18
1005 0.21
1006 0.29
1007 0.33
1008 0.36
1009 0.35
1010 0.38
1011 0.38
1012 0.4
1013 0.42
1014 0.39
1015 0.36
1016 0.36
1017 0.36
1018 0.32
1019 0.35
1020 0.3
1021 0.25
1022 0.21
1023 0.17
1024 0.15
1025 0.16
1026 0.17
1027 0.16
1028 0.17
1029 0.17
1030 0.17
1031 0.18
1032 0.15
1033 0.12
1034 0.14
1035 0.12
1036 0.13
1037 0.13
1038 0.15
1039 0.15
1040 0.21
1041 0.21
1042 0.21
1043 0.2
1044 0.19
1045 0.19
1046 0.2
1047 0.21
1048 0.18
1049 0.19
1050 0.17
1051 0.17
1052 0.2
1053 0.2
1054 0.17
1055 0.16
1056 0.15
1057 0.14
1058 0.16
1059 0.15
1060 0.13
1061 0.16
1062 0.16
1063 0.17
1064 0.15
1065 0.15
1066 0.16
1067 0.17
1068 0.18
1069 0.21
1070 0.23
1071 0.28
1072 0.28
1073 0.29
1074 0.33
1075 0.34
1076 0.32
1077 0.28
1078 0.26
1079 0.25
1080 0.26
1081 0.25
1082 0.22
1083 0.19
1084 0.19
1085 0.17
1086 0.2
1087 0.16
1088 0.2
1089 0.23
1090 0.22
1091 0.22
1092 0.29
1093 0.29
1094 0.27
1095 0.31
1096 0.27
1097 0.25
1098 0.24
1099 0.25
1100 0.21
1101 0.2
1102 0.2
1103 0.19
1104 0.2
1105 0.2
1106 0.21
1107 0.21
1108 0.21
1109 0.25
1110 0.29
1111 0.35
1112 0.39
1113 0.47
1114 0.49
1115 0.5
1116 0.5
1117 0.49
1118 0.45
1119 0.42
1120 0.45
1121 0.43
1122 0.48
1123 0.47
1124 0.44
1125 0.42
1126 0.39
1127 0.4
1128 0.34
1129 0.31
1130 0.26
1131 0.3
1132 0.35
1133 0.36
1134 0.38
1135 0.37
1136 0.43
1137 0.48
1138 0.49
1139 0.53
1140 0.48
1141 0.49
1142 0.46
1143 0.46
1144 0.42
1145 0.33
1146 0.31
1147 0.25
1148 0.26
1149 0.25
1150 0.25
1151 0.21
1152 0.15
1153 0.15
1154 0.14
1155 0.13
1156 0.1
1157 0.07
1158 0.07
1159 0.07
1160 0.08
1161 0.06
1162 0.06
1163 0.05
1164 0.06
1165 0.06
1166 0.06
1167 0.06
1168 0.04
1169 0.05
1170 0.05
1171 0.05
1172 0.05
1173 0.05
1174 0.06
1175 0.06
1176 0.07
1177 0.08
1178 0.08
1179 0.08
1180 0.08
1181 0.09
1182 0.09
1183 0.1
1184 0.09
1185 0.1
1186 0.16
1187 0.17
1188 0.19
1189 0.19
1190 0.21
1191 0.21
1192 0.24
1193 0.28
1194 0.25
1195 0.28
1196 0.29
1197 0.3
1198 0.31
1199 0.32
1200 0.31
1201 0.27
1202 0.24
1203 0.22
1204 0.2
1205 0.18
1206 0.16
1207 0.18
1208 0.16
1209 0.17
1210 0.17
1211 0.18
1212 0.18
1213 0.18
1214 0.22
1215 0.27
1216 0.33
1217 0.37
1218 0.42
1219 0.42
1220 0.44
1221 0.52
1222 0.55
1223 0.56
1224 0.56
1225 0.59
1226 0.63
1227 0.65
1228 0.68
1229 0.67
1230 0.64
1231 0.63
1232 0.59
1233 0.56
1234 0.52
1235 0.59
1236 0.58
1237 0.54
1238 0.51
1239 0.54
1240 0.54
1241 0.53
1242 0.48
1243 0.38
1244 0.36
1245 0.36
1246 0.37
1247 0.29
1248 0.29
1249 0.25
1250 0.25
1251 0.29
1252 0.29
1253 0.27
1254 0.3
1255 0.35
1256 0.34
1257 0.39
1258 0.4
1259 0.39
1260 0.4
1261 0.43
1262 0.44
1263 0.38
1264 0.38
1265 0.38
1266 0.38
1267 0.33
1268 0.31
1269 0.27
1270 0.22
1271 0.26
1272 0.25
1273 0.22
1274 0.2
1275 0.21
1276 0.21
1277 0.23
1278 0.22
1279 0.2
1280 0.2
1281 0.26
1282 0.28
1283 0.31
1284 0.38
1285 0.41
1286 0.49
1287 0.55
1288 0.62
1289 0.65
1290 0.74
1291 0.8
1292 0.83
1293 0.87
1294 0.89