Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6BNJ8

Protein Details
Accession Q6BNJ8    Localization Confidence High Confidence Score 19.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
32-59ASPSIKKSKSIPKTKSNEKSKVKQLQNEHydrophilic
359-392VAKIIGKKLKKQQQQEQQKLNKVTKPKKTKSISKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
19-26KSKKNGAI
29-50SPAASPSIKKSKSIPKTKSNEK
381-391VTKPKKTKSIS
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 14, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR023674  Ribosomal_L1-like  
IPR028364  Ribosomal_L1/biogenesis  
IPR016095  Ribosomal_L1_3-a/b-sand  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
KEGG dha:DEHA2E21120g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00687  Ribosomal_L1  
CDD cd00403  Ribosomal_L1  
Amino Acid Sequences MARTRSKGIASPRVPTPTKSKKNGAIANSPAASPSIKKSKSIPKTKSNEKSKVKQLQNEEAQGSIVSKNVADKAISELSKFLDREAEKEQSDKTLLFDNDEETKNLFLQITTKKYYSTKPNFKPKLIKLSNAIHNPESRSLKTCLIIRDQLITDPEQLEIIENASLPTLQQIVPLSALKTEYKHYEKRRQLYSEYDLFLVDDALLNSMPTLLGKVFYGNGNTKIPLPIRVTSTSNNKEFSITTIGNQLNKCLNSTFFLPPVGVNISVKIGSISSDFKKNQLVENLEDVLSHFDKDSLRSVMIKTDLSPSLPLYYAEKLYNDEDVLEENAKASKNTDDEQEVRLSTFEKGLLELGDADEVAKIIGKKLKKQQQQEQQKLNKVTKPKKTKSISK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.53
3 0.55
4 0.55
5 0.62
6 0.65
7 0.67
8 0.67
9 0.75
10 0.78
11 0.74
12 0.71
13 0.66
14 0.64
15 0.56
16 0.48
17 0.39
18 0.33
19 0.28
20 0.22
21 0.25
22 0.29
23 0.29
24 0.32
25 0.39
26 0.49
27 0.58
28 0.67
29 0.67
30 0.67
31 0.75
32 0.84
33 0.86
34 0.86
35 0.86
36 0.84
37 0.85
38 0.85
39 0.86
40 0.83
41 0.8
42 0.77
43 0.77
44 0.74
45 0.7
46 0.6
47 0.5
48 0.43
49 0.36
50 0.29
51 0.2
52 0.14
53 0.1
54 0.09
55 0.11
56 0.12
57 0.13
58 0.12
59 0.12
60 0.17
61 0.22
62 0.22
63 0.2
64 0.19
65 0.21
66 0.26
67 0.25
68 0.2
69 0.23
70 0.23
71 0.26
72 0.3
73 0.33
74 0.28
75 0.3
76 0.3
77 0.26
78 0.27
79 0.24
80 0.2
81 0.22
82 0.21
83 0.22
84 0.22
85 0.21
86 0.25
87 0.25
88 0.25
89 0.19
90 0.19
91 0.17
92 0.18
93 0.15
94 0.1
95 0.15
96 0.2
97 0.24
98 0.26
99 0.27
100 0.28
101 0.31
102 0.37
103 0.42
104 0.46
105 0.52
106 0.58
107 0.68
108 0.71
109 0.74
110 0.78
111 0.73
112 0.73
113 0.65
114 0.59
115 0.54
116 0.56
117 0.58
118 0.53
119 0.5
120 0.41
121 0.41
122 0.4
123 0.4
124 0.36
125 0.3
126 0.29
127 0.29
128 0.29
129 0.3
130 0.31
131 0.27
132 0.28
133 0.29
134 0.26
135 0.26
136 0.24
137 0.23
138 0.21
139 0.19
140 0.16
141 0.14
142 0.13
143 0.1
144 0.1
145 0.09
146 0.07
147 0.07
148 0.06
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.04
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.07
158 0.07
159 0.08
160 0.09
161 0.1
162 0.09
163 0.08
164 0.1
165 0.09
166 0.1
167 0.11
168 0.16
169 0.21
170 0.29
171 0.36
172 0.45
173 0.51
174 0.56
175 0.6
176 0.58
177 0.55
178 0.53
179 0.5
180 0.44
181 0.38
182 0.31
183 0.25
184 0.22
185 0.19
186 0.13
187 0.08
188 0.05
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.03
197 0.04
198 0.03
199 0.04
200 0.04
201 0.05
202 0.06
203 0.06
204 0.09
205 0.11
206 0.13
207 0.14
208 0.15
209 0.15
210 0.17
211 0.17
212 0.19
213 0.2
214 0.19
215 0.22
216 0.24
217 0.26
218 0.27
219 0.36
220 0.37
221 0.36
222 0.35
223 0.32
224 0.31
225 0.28
226 0.27
227 0.24
228 0.18
229 0.17
230 0.22
231 0.23
232 0.25
233 0.25
234 0.25
235 0.23
236 0.23
237 0.24
238 0.18
239 0.18
240 0.16
241 0.2
242 0.19
243 0.16
244 0.16
245 0.15
246 0.14
247 0.15
248 0.15
249 0.12
250 0.1
251 0.1
252 0.1
253 0.1
254 0.1
255 0.08
256 0.07
257 0.07
258 0.09
259 0.12
260 0.13
261 0.21
262 0.21
263 0.23
264 0.28
265 0.29
266 0.31
267 0.34
268 0.35
269 0.3
270 0.33
271 0.32
272 0.27
273 0.25
274 0.21
275 0.2
276 0.17
277 0.15
278 0.12
279 0.12
280 0.13
281 0.15
282 0.19
283 0.16
284 0.17
285 0.18
286 0.19
287 0.2
288 0.22
289 0.21
290 0.18
291 0.2
292 0.2
293 0.2
294 0.2
295 0.18
296 0.17
297 0.17
298 0.17
299 0.16
300 0.17
301 0.19
302 0.19
303 0.18
304 0.19
305 0.2
306 0.21
307 0.18
308 0.15
309 0.13
310 0.14
311 0.15
312 0.13
313 0.12
314 0.11
315 0.14
316 0.14
317 0.14
318 0.14
319 0.16
320 0.19
321 0.2
322 0.24
323 0.26
324 0.28
325 0.31
326 0.32
327 0.28
328 0.25
329 0.24
330 0.22
331 0.17
332 0.17
333 0.15
334 0.13
335 0.13
336 0.13
337 0.13
338 0.12
339 0.12
340 0.11
341 0.09
342 0.09
343 0.08
344 0.07
345 0.07
346 0.06
347 0.08
348 0.08
349 0.12
350 0.19
351 0.23
352 0.32
353 0.42
354 0.52
355 0.59
356 0.68
357 0.74
358 0.79
359 0.86
360 0.88
361 0.88
362 0.87
363 0.88
364 0.86
365 0.83
366 0.78
367 0.77
368 0.77
369 0.77
370 0.79
371 0.79
372 0.81