Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6BJB7

Protein Details
Accession Q6BJB7    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
791-811SSGGRRYNNHHNQNSQHNHKRHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045117  ATXN2-like  
IPR009604  LsmAD_domain  
IPR025852  SM_dom_ATX  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG dha:DEHA2G03652g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06741  LsmAD  
PF14438  SM-ATX  
Amino Acid Sequences MKGQNQNSRGSSNPRMGVNGHRRSNSRYNTGNYGNNSSQGQSNNSDESINSDKLLHLVAKSIGKKCIVTVSSGARYQGLLVSADLSSQQGQDVSSPLSIVLQSPQIFSKSLIDEKSNADKSNEIPEKLVIQAKDLMDLEVSNVDLNESAKKDSNPRSVSPTSGSNTASPSTTHESKFKTDTDISGRLQVKERELQRWVPEEDSASFALEDDTFNNSNETWDQFKVNEEKFGVESSYDEHLYTTRINTAAPDYHTKLRKAEKIAKDIENQTTGNRHVLEERGIEVDDSGIDEEDKYSGVDRRGDELMAALRNANISTESTSSNISNAPGKYVPPRQRAAQYHDDPAIISSSAAQPGKNPVENQKNDTETSTNPIVNSMANKPDSIPPKPQVANQHNESFRLNAQSEINSLREFSANFKIPHQMPTDLLPILAKDKLKQDEILKKQKEQQLLKAQRREQKQAELTKSTDSSTDVQAQESGQPQQRKKMDPTRPAFKLNPKAAAFTPSSKHTQLSPNPPKANFHRPPNNSSPRMGNQRPFTSGSGSSVGSNTNSKRHYQISPADFFGGADRIPTKEGQEQKIKDFKFSFNLFITTKKKAAADHTPVNFEKTFYTPPTWNSTIDDTYDKLFPSPNTIRGPGMGLPTSTSMPFMPSPMMGAPSPVMQSGFPGMPGTPTGNKFPLSPQQQQQQQQAAAAMAAHFQQQQFHAAMMYQQQQHQQQQFSGVPPGQPPMPMYGPGGEPPFLPPGGFMMPPGNFNAGGSPVNGNVMMGGSPYNNVSGNQMNANYNNHHQGGSSGGRRYNNHHNQNSQHNHKRGSNA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.46
3 0.44
4 0.5
5 0.52
6 0.55
7 0.54
8 0.55
9 0.57
10 0.63
11 0.7
12 0.67
13 0.64
14 0.61
15 0.6
16 0.63
17 0.65
18 0.63
19 0.58
20 0.58
21 0.51
22 0.47
23 0.43
24 0.37
25 0.35
26 0.32
27 0.32
28 0.28
29 0.31
30 0.3
31 0.29
32 0.28
33 0.24
34 0.27
35 0.29
36 0.26
37 0.23
38 0.21
39 0.2
40 0.21
41 0.23
42 0.19
43 0.13
44 0.15
45 0.18
46 0.25
47 0.3
48 0.33
49 0.35
50 0.36
51 0.36
52 0.34
53 0.39
54 0.32
55 0.3
56 0.31
57 0.34
58 0.36
59 0.37
60 0.36
61 0.29
62 0.28
63 0.25
64 0.22
65 0.17
66 0.13
67 0.11
68 0.12
69 0.11
70 0.11
71 0.11
72 0.1
73 0.1
74 0.09
75 0.1
76 0.09
77 0.09
78 0.1
79 0.12
80 0.12
81 0.11
82 0.11
83 0.11
84 0.11
85 0.11
86 0.11
87 0.1
88 0.14
89 0.15
90 0.16
91 0.18
92 0.19
93 0.19
94 0.2
95 0.23
96 0.22
97 0.26
98 0.27
99 0.27
100 0.28
101 0.33
102 0.41
103 0.39
104 0.37
105 0.33
106 0.33
107 0.33
108 0.41
109 0.41
110 0.33
111 0.3
112 0.3
113 0.3
114 0.31
115 0.34
116 0.23
117 0.21
118 0.25
119 0.24
120 0.26
121 0.24
122 0.21
123 0.17
124 0.17
125 0.15
126 0.11
127 0.11
128 0.07
129 0.07
130 0.07
131 0.07
132 0.08
133 0.11
134 0.12
135 0.15
136 0.18
137 0.2
138 0.29
139 0.36
140 0.45
141 0.45
142 0.46
143 0.52
144 0.5
145 0.51
146 0.45
147 0.42
148 0.35
149 0.34
150 0.33
151 0.27
152 0.27
153 0.26
154 0.23
155 0.18
156 0.21
157 0.24
158 0.27
159 0.28
160 0.31
161 0.34
162 0.37
163 0.4
164 0.36
165 0.35
166 0.32
167 0.34
168 0.35
169 0.37
170 0.34
171 0.39
172 0.4
173 0.36
174 0.4
175 0.39
176 0.36
177 0.38
178 0.41
179 0.38
180 0.39
181 0.42
182 0.41
183 0.43
184 0.41
185 0.35
186 0.33
187 0.3
188 0.27
189 0.25
190 0.2
191 0.16
192 0.13
193 0.12
194 0.12
195 0.1
196 0.09
197 0.08
198 0.12
199 0.13
200 0.13
201 0.14
202 0.13
203 0.14
204 0.15
205 0.17
206 0.15
207 0.16
208 0.17
209 0.16
210 0.21
211 0.27
212 0.26
213 0.27
214 0.24
215 0.25
216 0.24
217 0.24
218 0.2
219 0.13
220 0.13
221 0.12
222 0.14
223 0.13
224 0.12
225 0.12
226 0.12
227 0.13
228 0.14
229 0.12
230 0.11
231 0.11
232 0.11
233 0.12
234 0.14
235 0.16
236 0.17
237 0.22
238 0.23
239 0.3
240 0.35
241 0.35
242 0.38
243 0.42
244 0.45
245 0.48
246 0.54
247 0.54
248 0.56
249 0.6
250 0.58
251 0.56
252 0.54
253 0.49
254 0.42
255 0.36
256 0.3
257 0.27
258 0.25
259 0.23
260 0.2
261 0.18
262 0.17
263 0.18
264 0.18
265 0.16
266 0.16
267 0.14
268 0.13
269 0.12
270 0.1
271 0.09
272 0.07
273 0.06
274 0.05
275 0.04
276 0.04
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.05
282 0.06
283 0.1
284 0.12
285 0.16
286 0.16
287 0.19
288 0.2
289 0.19
290 0.18
291 0.16
292 0.16
293 0.13
294 0.12
295 0.09
296 0.08
297 0.09
298 0.09
299 0.08
300 0.06
301 0.06
302 0.08
303 0.09
304 0.1
305 0.1
306 0.12
307 0.12
308 0.11
309 0.11
310 0.11
311 0.14
312 0.13
313 0.15
314 0.14
315 0.15
316 0.2
317 0.28
318 0.36
319 0.37
320 0.39
321 0.4
322 0.47
323 0.5
324 0.52
325 0.53
326 0.47
327 0.44
328 0.43
329 0.4
330 0.32
331 0.28
332 0.22
333 0.12
334 0.09
335 0.07
336 0.07
337 0.1
338 0.11
339 0.1
340 0.1
341 0.16
342 0.19
343 0.2
344 0.2
345 0.24
346 0.34
347 0.35
348 0.38
349 0.36
350 0.36
351 0.35
352 0.35
353 0.29
354 0.2
355 0.23
356 0.21
357 0.18
358 0.15
359 0.15
360 0.14
361 0.13
362 0.15
363 0.12
364 0.13
365 0.13
366 0.14
367 0.14
368 0.19
369 0.23
370 0.24
371 0.27
372 0.26
373 0.31
374 0.32
375 0.34
376 0.39
377 0.4
378 0.42
379 0.41
380 0.45
381 0.39
382 0.4
383 0.37
384 0.28
385 0.24
386 0.22
387 0.19
388 0.14
389 0.14
390 0.13
391 0.14
392 0.14
393 0.14
394 0.11
395 0.11
396 0.1
397 0.1
398 0.1
399 0.11
400 0.15
401 0.19
402 0.19
403 0.2
404 0.24
405 0.24
406 0.27
407 0.27
408 0.22
409 0.19
410 0.21
411 0.22
412 0.17
413 0.16
414 0.12
415 0.1
416 0.11
417 0.12
418 0.1
419 0.1
420 0.15
421 0.17
422 0.19
423 0.21
424 0.26
425 0.33
426 0.41
427 0.49
428 0.46
429 0.46
430 0.51
431 0.53
432 0.55
433 0.48
434 0.48
435 0.49
436 0.58
437 0.62
438 0.63
439 0.64
440 0.62
441 0.65
442 0.63
443 0.55
444 0.53
445 0.53
446 0.53
447 0.52
448 0.48
449 0.45
450 0.4
451 0.38
452 0.3
453 0.24
454 0.19
455 0.16
456 0.15
457 0.2
458 0.18
459 0.17
460 0.17
461 0.17
462 0.17
463 0.17
464 0.19
465 0.19
466 0.25
467 0.25
468 0.33
469 0.37
470 0.39
471 0.45
472 0.51
473 0.55
474 0.59
475 0.64
476 0.64
477 0.63
478 0.63
479 0.6
480 0.58
481 0.59
482 0.52
483 0.53
484 0.45
485 0.45
486 0.4
487 0.4
488 0.33
489 0.27
490 0.26
491 0.22
492 0.25
493 0.24
494 0.24
495 0.23
496 0.3
497 0.33
498 0.42
499 0.48
500 0.53
501 0.55
502 0.55
503 0.57
504 0.55
505 0.6
506 0.55
507 0.55
508 0.57
509 0.57
510 0.63
511 0.68
512 0.71
513 0.62
514 0.58
515 0.54
516 0.5
517 0.56
518 0.53
519 0.49
520 0.46
521 0.46
522 0.47
523 0.45
524 0.4
525 0.34
526 0.3
527 0.27
528 0.23
529 0.21
530 0.18
531 0.15
532 0.15
533 0.13
534 0.17
535 0.16
536 0.2
537 0.21
538 0.23
539 0.26
540 0.29
541 0.3
542 0.32
543 0.38
544 0.38
545 0.39
546 0.38
547 0.35
548 0.31
549 0.29
550 0.24
551 0.16
552 0.1
553 0.09
554 0.09
555 0.09
556 0.11
557 0.11
558 0.13
559 0.19
560 0.25
561 0.29
562 0.37
563 0.39
564 0.44
565 0.51
566 0.49
567 0.48
568 0.45
569 0.42
570 0.4
571 0.4
572 0.37
573 0.31
574 0.34
575 0.29
576 0.33
577 0.35
578 0.32
579 0.31
580 0.29
581 0.3
582 0.28
583 0.33
584 0.36
585 0.39
586 0.43
587 0.43
588 0.46
589 0.45
590 0.47
591 0.41
592 0.33
593 0.27
594 0.23
595 0.25
596 0.23
597 0.27
598 0.25
599 0.27
600 0.34
601 0.34
602 0.32
603 0.31
604 0.32
605 0.29
606 0.29
607 0.28
608 0.21
609 0.21
610 0.22
611 0.19
612 0.16
613 0.17
614 0.15
615 0.22
616 0.25
617 0.29
618 0.32
619 0.33
620 0.33
621 0.31
622 0.33
623 0.26
624 0.26
625 0.2
626 0.16
627 0.16
628 0.17
629 0.18
630 0.15
631 0.14
632 0.11
633 0.13
634 0.13
635 0.13
636 0.13
637 0.11
638 0.13
639 0.13
640 0.15
641 0.12
642 0.12
643 0.12
644 0.12
645 0.13
646 0.12
647 0.12
648 0.09
649 0.11
650 0.13
651 0.12
652 0.11
653 0.11
654 0.1
655 0.11
656 0.12
657 0.15
658 0.17
659 0.19
660 0.23
661 0.25
662 0.26
663 0.26
664 0.29
665 0.35
666 0.37
667 0.42
668 0.44
669 0.5
670 0.57
671 0.63
672 0.65
673 0.62
674 0.56
675 0.5
676 0.44
677 0.36
678 0.28
679 0.22
680 0.15
681 0.09
682 0.09
683 0.1
684 0.11
685 0.11
686 0.13
687 0.14
688 0.17
689 0.17
690 0.17
691 0.15
692 0.13
693 0.15
694 0.18
695 0.23
696 0.22
697 0.24
698 0.3
699 0.36
700 0.44
701 0.47
702 0.45
703 0.4
704 0.43
705 0.43
706 0.39
707 0.39
708 0.33
709 0.29
710 0.28
711 0.3
712 0.24
713 0.23
714 0.22
715 0.22
716 0.22
717 0.22
718 0.22
719 0.21
720 0.22
721 0.24
722 0.25
723 0.19
724 0.18
725 0.19
726 0.21
727 0.19
728 0.17
729 0.14
730 0.15
731 0.18
732 0.17
733 0.16
734 0.18
735 0.18
736 0.2
737 0.22
738 0.2
739 0.17
740 0.18
741 0.18
742 0.15
743 0.15
744 0.16
745 0.15
746 0.13
747 0.15
748 0.14
749 0.12
750 0.1
751 0.1
752 0.08
753 0.07
754 0.08
755 0.07
756 0.08
757 0.09
758 0.1
759 0.11
760 0.11
761 0.15
762 0.18
763 0.2
764 0.22
765 0.24
766 0.26
767 0.29
768 0.32
769 0.32
770 0.34
771 0.37
772 0.35
773 0.32
774 0.29
775 0.27
776 0.29
777 0.32
778 0.33
779 0.31
780 0.35
781 0.4
782 0.43
783 0.49
784 0.54
785 0.57
786 0.62
787 0.65
788 0.68
789 0.69
790 0.78
791 0.81
792 0.8
793 0.8
794 0.77
795 0.76