Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A117NNW0

Protein Details
Accession A0A117NNW0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-31EETTMTKKRSRHARKGNAPAPVAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
15-34KKRSRHARKGNAPAPVAMKP
Subcellular Location(s) plas 9, nucl 6.5, cyto_nucl 6, mito 5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024320  LPG_synthase_C  
Gene Ontology GO:0005886  C:plasma membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF09924  LPG_synthase_C  
Amino Acid Sequences MTAPTESHEETTMTKKRSRHARKGNAPAPVAMKPKKTLFVDEIGDALVDQLLYETSKRNDDDDNIGALSLSLIDHLRTNIAARPASSCSSSATFHTMPQSSPATSVSSHEPSVASLKVSSKVDVLDQADDCFHAKTEDRDQDAVFGLDDFKTITAIQQIAALHGRVAHMGILDHSYRFFVNKTRTAALSFKPRNGVAVIGGDPLCSKEEIPELLSEFAAYRQRHNLSIAFMGASESFLNDHAKPNGWTTIRFATERVLNPQTNEVILENSGRRILTKSRQLTNQSKGGITMGVYAPAVHGINQELQTNLITIYDAWRAERNASASPQAFITVYDPFAVPSLMTFIYTRAPDGAINGFAGLRRLSSGGYHVDPCIAAPGSVTGISDLLLIMAMALLRRAGVTYLGLGVEPLQSLTSEDVSGMPRPCKKVTRGLYGHAFHRLPIGGKKAYHDKFRPDPAQESHLYLVFPSGIPSPRHVLAMTHMANISLRKIFRADVEAFVLTRKLKAGGEVVMSLRGKKEGLAEQTDKGKEFEEEVIALYAPCGR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.43
3 0.5
4 0.6
5 0.68
6 0.7
7 0.73
8 0.79
9 0.84
10 0.91
11 0.88
12 0.85
13 0.75
14 0.68
15 0.61
16 0.56
17 0.54
18 0.49
19 0.48
20 0.45
21 0.48
22 0.52
23 0.5
24 0.5
25 0.45
26 0.45
27 0.44
28 0.39
29 0.35
30 0.27
31 0.25
32 0.18
33 0.14
34 0.09
35 0.05
36 0.05
37 0.04
38 0.05
39 0.06
40 0.08
41 0.12
42 0.15
43 0.2
44 0.22
45 0.24
46 0.27
47 0.29
48 0.34
49 0.32
50 0.31
51 0.26
52 0.25
53 0.22
54 0.18
55 0.15
56 0.09
57 0.06
58 0.05
59 0.06
60 0.07
61 0.08
62 0.09
63 0.1
64 0.1
65 0.12
66 0.15
67 0.19
68 0.19
69 0.19
70 0.22
71 0.24
72 0.26
73 0.25
74 0.22
75 0.21
76 0.22
77 0.23
78 0.21
79 0.25
80 0.23
81 0.24
82 0.29
83 0.27
84 0.25
85 0.28
86 0.29
87 0.23
88 0.23
89 0.22
90 0.19
91 0.18
92 0.2
93 0.21
94 0.22
95 0.21
96 0.21
97 0.2
98 0.19
99 0.21
100 0.2
101 0.15
102 0.14
103 0.16
104 0.19
105 0.2
106 0.2
107 0.18
108 0.18
109 0.18
110 0.2
111 0.2
112 0.18
113 0.18
114 0.17
115 0.17
116 0.17
117 0.16
118 0.12
119 0.11
120 0.1
121 0.11
122 0.14
123 0.23
124 0.29
125 0.31
126 0.32
127 0.32
128 0.32
129 0.32
130 0.28
131 0.19
132 0.13
133 0.1
134 0.09
135 0.09
136 0.07
137 0.06
138 0.07
139 0.07
140 0.07
141 0.09
142 0.09
143 0.09
144 0.11
145 0.11
146 0.12
147 0.13
148 0.13
149 0.1
150 0.11
151 0.11
152 0.08
153 0.08
154 0.07
155 0.06
156 0.06
157 0.07
158 0.08
159 0.09
160 0.09
161 0.09
162 0.09
163 0.09
164 0.1
165 0.11
166 0.15
167 0.21
168 0.26
169 0.29
170 0.3
171 0.31
172 0.33
173 0.35
174 0.33
175 0.37
176 0.34
177 0.33
178 0.34
179 0.33
180 0.31
181 0.29
182 0.25
183 0.15
184 0.15
185 0.13
186 0.12
187 0.12
188 0.1
189 0.1
190 0.1
191 0.1
192 0.08
193 0.08
194 0.07
195 0.09
196 0.1
197 0.11
198 0.11
199 0.11
200 0.12
201 0.11
202 0.1
203 0.08
204 0.1
205 0.16
206 0.16
207 0.17
208 0.22
209 0.24
210 0.25
211 0.26
212 0.25
213 0.2
214 0.21
215 0.19
216 0.13
217 0.11
218 0.11
219 0.09
220 0.08
221 0.06
222 0.05
223 0.05
224 0.06
225 0.09
226 0.09
227 0.11
228 0.12
229 0.13
230 0.14
231 0.15
232 0.2
233 0.18
234 0.18
235 0.19
236 0.22
237 0.22
238 0.22
239 0.21
240 0.18
241 0.21
242 0.22
243 0.24
244 0.24
245 0.23
246 0.23
247 0.24
248 0.22
249 0.18
250 0.17
251 0.12
252 0.08
253 0.08
254 0.09
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.08
259 0.08
260 0.1
261 0.14
262 0.18
263 0.27
264 0.31
265 0.34
266 0.39
267 0.46
268 0.5
269 0.5
270 0.48
271 0.41
272 0.36
273 0.33
274 0.28
275 0.21
276 0.15
277 0.12
278 0.08
279 0.07
280 0.07
281 0.07
282 0.06
283 0.07
284 0.07
285 0.05
286 0.05
287 0.06
288 0.08
289 0.09
290 0.1
291 0.09
292 0.09
293 0.09
294 0.09
295 0.08
296 0.06
297 0.05
298 0.05
299 0.06
300 0.08
301 0.08
302 0.09
303 0.11
304 0.12
305 0.13
306 0.15
307 0.15
308 0.15
309 0.16
310 0.18
311 0.17
312 0.17
313 0.16
314 0.15
315 0.12
316 0.11
317 0.11
318 0.08
319 0.08
320 0.08
321 0.08
322 0.08
323 0.08
324 0.08
325 0.06
326 0.05
327 0.07
328 0.06
329 0.07
330 0.07
331 0.08
332 0.11
333 0.11
334 0.11
335 0.1
336 0.1
337 0.09
338 0.11
339 0.11
340 0.09
341 0.09
342 0.09
343 0.08
344 0.08
345 0.09
346 0.07
347 0.06
348 0.06
349 0.07
350 0.07
351 0.07
352 0.1
353 0.12
354 0.14
355 0.14
356 0.14
357 0.14
358 0.13
359 0.13
360 0.13
361 0.1
362 0.08
363 0.07
364 0.08
365 0.08
366 0.08
367 0.08
368 0.06
369 0.06
370 0.06
371 0.06
372 0.05
373 0.04
374 0.04
375 0.03
376 0.03
377 0.03
378 0.03
379 0.03
380 0.03
381 0.03
382 0.03
383 0.03
384 0.04
385 0.04
386 0.05
387 0.05
388 0.06
389 0.06
390 0.07
391 0.06
392 0.06
393 0.06
394 0.06
395 0.06
396 0.06
397 0.05
398 0.05
399 0.06
400 0.08
401 0.08
402 0.08
403 0.08
404 0.09
405 0.11
406 0.16
407 0.17
408 0.21
409 0.25
410 0.3
411 0.34
412 0.39
413 0.42
414 0.48
415 0.52
416 0.57
417 0.56
418 0.57
419 0.61
420 0.57
421 0.55
422 0.52
423 0.45
424 0.34
425 0.34
426 0.29
427 0.24
428 0.26
429 0.3
430 0.27
431 0.28
432 0.32
433 0.4
434 0.43
435 0.5
436 0.5
437 0.52
438 0.56
439 0.64
440 0.66
441 0.6
442 0.61
443 0.56
444 0.57
445 0.5
446 0.47
447 0.39
448 0.34
449 0.3
450 0.23
451 0.2
452 0.15
453 0.13
454 0.11
455 0.13
456 0.17
457 0.19
458 0.22
459 0.25
460 0.26
461 0.27
462 0.26
463 0.23
464 0.22
465 0.3
466 0.28
467 0.25
468 0.24
469 0.23
470 0.24
471 0.24
472 0.23
473 0.19
474 0.18
475 0.18
476 0.2
477 0.21
478 0.22
479 0.27
480 0.26
481 0.24
482 0.27
483 0.26
484 0.25
485 0.25
486 0.25
487 0.19
488 0.18
489 0.17
490 0.16
491 0.16
492 0.19
493 0.21
494 0.2
495 0.22
496 0.23
497 0.22
498 0.26
499 0.26
500 0.24
501 0.23
502 0.22
503 0.2
504 0.19
505 0.24
506 0.25
507 0.3
508 0.37
509 0.39
510 0.41
511 0.49
512 0.5
513 0.45
514 0.39
515 0.35
516 0.28
517 0.28
518 0.26
519 0.21
520 0.19
521 0.19
522 0.19
523 0.18
524 0.16