Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A117NKM3

Protein Details
Accession A0A117NKM3    Localization Confidence High Confidence Score 15.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
86-114DYEYAREKRQRGGRKKRKKNSEAHAVQNWHydrophilic
360-380VKPLEVKLEKRKKRPDSEGGGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
91-104REKRQRGGRKKRKK
368-374EKRKKRP
Subcellular Location(s) nucl 14, cyto_nucl 13, cyto 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000467  G_patch_dom  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR040052  RBM17  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF01585  G-patch  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50174  G_PATCH  
Amino Acid Sequences MASDPTPPKGGMSLYANLLNSSSDTPGIISRAPVVFKQSETEPQPDDAAAAKKQQVNPVPQPQPSANPSVPTKSTLADWTAIEDDDYEYAREKRQRGGRKKRKKNSEAHAVQNWDDIYDPSRPTNYAEYRNSDEKLAEIREWKDLLYAHVRKRSPSRYSDSEDYDGPNTRQFAPPNNFAPPSNLDDVPPAASIPNDPSGDDAFARRAALGQRFGDGSITLQAHLPTSPPPHIEHPARIPDDPTGEDAYMRRFQTAEYPPSGQVIPPPPPSRPLDAFQPSSATISRAPVRYTLPAPPEDIPASEAELEALLAQEQPADEEEPDEPAPRSLRPGQPDFGARMLSKWGWNKGSGLGATGSGIVKPLEVKLEKRKKRPDSEGGGFVTPAGRGKIIGSNKKGEYDTSKFGPMSEVVKLLGMLDGMDLDAEMEGDQNGGLMQEIGQECGDKYGDVERVFIARDVGTPIPVFVKFKHPLSGLRAVNALEGRVFNGNTITARFFDLEKFDQGVYTD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.28
3 0.27
4 0.25
5 0.24
6 0.2
7 0.17
8 0.16
9 0.15
10 0.12
11 0.12
12 0.13
13 0.14
14 0.16
15 0.15
16 0.14
17 0.16
18 0.19
19 0.2
20 0.2
21 0.25
22 0.25
23 0.25
24 0.27
25 0.27
26 0.32
27 0.34
28 0.38
29 0.34
30 0.34
31 0.34
32 0.3
33 0.28
34 0.24
35 0.24
36 0.22
37 0.24
38 0.28
39 0.32
40 0.35
41 0.43
42 0.45
43 0.49
44 0.56
45 0.61
46 0.62
47 0.58
48 0.6
49 0.54
50 0.54
51 0.49
52 0.47
53 0.39
54 0.38
55 0.39
56 0.39
57 0.38
58 0.35
59 0.33
60 0.27
61 0.27
62 0.26
63 0.25
64 0.22
65 0.2
66 0.2
67 0.2
68 0.18
69 0.16
70 0.14
71 0.12
72 0.11
73 0.12
74 0.1
75 0.12
76 0.14
77 0.2
78 0.26
79 0.27
80 0.34
81 0.43
82 0.53
83 0.61
84 0.71
85 0.76
86 0.81
87 0.9
88 0.92
89 0.94
90 0.93
91 0.92
92 0.89
93 0.89
94 0.84
95 0.8
96 0.76
97 0.68
98 0.58
99 0.52
100 0.42
101 0.31
102 0.25
103 0.18
104 0.15
105 0.16
106 0.17
107 0.16
108 0.17
109 0.18
110 0.2
111 0.28
112 0.31
113 0.35
114 0.38
115 0.41
116 0.46
117 0.49
118 0.47
119 0.4
120 0.34
121 0.27
122 0.28
123 0.25
124 0.21
125 0.21
126 0.22
127 0.24
128 0.24
129 0.23
130 0.21
131 0.19
132 0.21
133 0.26
134 0.31
135 0.33
136 0.4
137 0.41
138 0.43
139 0.51
140 0.55
141 0.52
142 0.52
143 0.54
144 0.53
145 0.59
146 0.6
147 0.56
148 0.5
149 0.45
150 0.4
151 0.35
152 0.32
153 0.25
154 0.23
155 0.21
156 0.2
157 0.23
158 0.23
159 0.29
160 0.32
161 0.36
162 0.37
163 0.38
164 0.37
165 0.34
166 0.36
167 0.3
168 0.29
169 0.27
170 0.24
171 0.21
172 0.21
173 0.21
174 0.18
175 0.15
176 0.11
177 0.08
178 0.07
179 0.08
180 0.09
181 0.12
182 0.12
183 0.11
184 0.13
185 0.13
186 0.14
187 0.14
188 0.13
189 0.1
190 0.1
191 0.1
192 0.09
193 0.1
194 0.12
195 0.15
196 0.17
197 0.16
198 0.17
199 0.17
200 0.17
201 0.16
202 0.12
203 0.1
204 0.1
205 0.09
206 0.09
207 0.09
208 0.09
209 0.1
210 0.1
211 0.1
212 0.09
213 0.11
214 0.12
215 0.13
216 0.15
217 0.18
218 0.24
219 0.25
220 0.26
221 0.27
222 0.32
223 0.32
224 0.3
225 0.28
226 0.23
227 0.23
228 0.21
229 0.19
230 0.14
231 0.12
232 0.12
233 0.12
234 0.14
235 0.17
236 0.16
237 0.14
238 0.13
239 0.13
240 0.21
241 0.25
242 0.24
243 0.22
244 0.24
245 0.24
246 0.25
247 0.25
248 0.17
249 0.15
250 0.16
251 0.18
252 0.22
253 0.23
254 0.22
255 0.26
256 0.29
257 0.3
258 0.29
259 0.27
260 0.29
261 0.31
262 0.32
263 0.28
264 0.28
265 0.23
266 0.22
267 0.21
268 0.15
269 0.11
270 0.13
271 0.16
272 0.16
273 0.16
274 0.17
275 0.18
276 0.2
277 0.21
278 0.22
279 0.21
280 0.21
281 0.23
282 0.21
283 0.22
284 0.2
285 0.18
286 0.15
287 0.12
288 0.13
289 0.1
290 0.09
291 0.07
292 0.06
293 0.06
294 0.05
295 0.04
296 0.03
297 0.03
298 0.03
299 0.03
300 0.03
301 0.04
302 0.05
303 0.06
304 0.06
305 0.07
306 0.07
307 0.1
308 0.11
309 0.12
310 0.11
311 0.12
312 0.13
313 0.12
314 0.17
315 0.21
316 0.25
317 0.29
318 0.33
319 0.32
320 0.33
321 0.35
322 0.32
323 0.27
324 0.25
325 0.19
326 0.16
327 0.18
328 0.17
329 0.2
330 0.22
331 0.26
332 0.25
333 0.26
334 0.26
335 0.25
336 0.27
337 0.22
338 0.19
339 0.14
340 0.12
341 0.11
342 0.11
343 0.1
344 0.07
345 0.08
346 0.06
347 0.06
348 0.07
349 0.07
350 0.12
351 0.14
352 0.19
353 0.29
354 0.4
355 0.48
356 0.57
357 0.67
358 0.71
359 0.78
360 0.82
361 0.8
362 0.79
363 0.76
364 0.72
365 0.64
366 0.55
367 0.46
368 0.37
369 0.28
370 0.19
371 0.15
372 0.11
373 0.08
374 0.08
375 0.1
376 0.17
377 0.24
378 0.32
379 0.34
380 0.4
381 0.41
382 0.44
383 0.43
384 0.39
385 0.39
386 0.36
387 0.37
388 0.33
389 0.36
390 0.32
391 0.32
392 0.31
393 0.26
394 0.23
395 0.19
396 0.17
397 0.14
398 0.14
399 0.14
400 0.12
401 0.1
402 0.08
403 0.06
404 0.05
405 0.05
406 0.04
407 0.04
408 0.04
409 0.03
410 0.03
411 0.04
412 0.03
413 0.04
414 0.04
415 0.04
416 0.04
417 0.04
418 0.04
419 0.04
420 0.04
421 0.04
422 0.04
423 0.09
424 0.1
425 0.11
426 0.11
427 0.12
428 0.12
429 0.15
430 0.15
431 0.09
432 0.1
433 0.14
434 0.2
435 0.19
436 0.2
437 0.19
438 0.2
439 0.21
440 0.21
441 0.17
442 0.12
443 0.13
444 0.16
445 0.16
446 0.16
447 0.15
448 0.16
449 0.17
450 0.18
451 0.19
452 0.17
453 0.26
454 0.28
455 0.31
456 0.36
457 0.36
458 0.4
459 0.44
460 0.52
461 0.44
462 0.41
463 0.41
464 0.35
465 0.36
466 0.31
467 0.25
468 0.17
469 0.16
470 0.17
471 0.19
472 0.18
473 0.15
474 0.16
475 0.17
476 0.16
477 0.19
478 0.19
479 0.16
480 0.18
481 0.19
482 0.19
483 0.2
484 0.25
485 0.26
486 0.27
487 0.28
488 0.26