Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q6BXF9

Protein Details
Accession Q6BXF9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-39ESLNSKKPSSSPKPSLRFKPKVVARKTKEERAKEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
11-40KKPSSSPKPSLRFKPKVVARKTKEERAKEA
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007811  RPC4  
Gene Ontology GO:0005666  C:RNA polymerase III complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006383  P:transcription by RNA polymerase III  
KEGG dha:DEHA2B03344g  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05132  RNA_pol_Rpc4  
Amino Acid Sequences MSNRLESLNSKKPSSSPKPSLRFKPKVVARKTKEERAKEAPQIKQENGDYKPSGRDHTSSRGGHSKRGGRGNYSGTHLVSAGPLASGSVSIGNVNGSKLGLTRDKSYNSVSPTPEFLQSLKLKDSKPKSKSPTPSRDYYESDEEDPTKIDMNKEYRFADEETILFPVRPERDEYIADTVITPLQSKDASIEPESNEEFETEPSPVKDEPIEAKLEQVKEHKAHLETKITETVDVLNKEEKTKIVSDHQAILDLVTDKLDGLSTDSNDNKTGNNNYTLFHLPTVLPEYYNQESTTEQHTVEDEGKVTNFASNVTPLRGQIGHLNIHKSGKISINLGNNNNLAVSQGSAAHFLQEVIMLEMNETDNTEDVEMMNEDGEKIKGKLYRFGQADGKIIGTPAIH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.6
3 0.61
4 0.67
5 0.74
6 0.81
7 0.87
8 0.87
9 0.85
10 0.8
11 0.8
12 0.79
13 0.79
14 0.8
15 0.81
16 0.76
17 0.79
18 0.82
19 0.81
20 0.82
21 0.78
22 0.76
23 0.74
24 0.75
25 0.73
26 0.73
27 0.69
28 0.69
29 0.69
30 0.62
31 0.6
32 0.57
33 0.55
34 0.49
35 0.5
36 0.42
37 0.39
38 0.44
39 0.4
40 0.4
41 0.37
42 0.37
43 0.36
44 0.42
45 0.48
46 0.43
47 0.46
48 0.51
49 0.49
50 0.52
51 0.55
52 0.54
53 0.53
54 0.6
55 0.57
56 0.52
57 0.56
58 0.55
59 0.49
60 0.46
61 0.42
62 0.33
63 0.31
64 0.27
65 0.22
66 0.17
67 0.14
68 0.09
69 0.06
70 0.06
71 0.05
72 0.05
73 0.04
74 0.05
75 0.05
76 0.05
77 0.05
78 0.06
79 0.07
80 0.07
81 0.08
82 0.08
83 0.07
84 0.07
85 0.08
86 0.11
87 0.15
88 0.17
89 0.22
90 0.26
91 0.28
92 0.31
93 0.34
94 0.34
95 0.35
96 0.38
97 0.35
98 0.32
99 0.34
100 0.33
101 0.31
102 0.28
103 0.22
104 0.25
105 0.26
106 0.27
107 0.27
108 0.3
109 0.3
110 0.38
111 0.47
112 0.49
113 0.52
114 0.58
115 0.62
116 0.66
117 0.75
118 0.77
119 0.78
120 0.73
121 0.73
122 0.7
123 0.66
124 0.62
125 0.56
126 0.51
127 0.43
128 0.39
129 0.35
130 0.3
131 0.26
132 0.23
133 0.18
134 0.16
135 0.15
136 0.15
137 0.18
138 0.23
139 0.25
140 0.27
141 0.27
142 0.25
143 0.26
144 0.26
145 0.22
146 0.17
147 0.16
148 0.13
149 0.14
150 0.13
151 0.1
152 0.09
153 0.12
154 0.12
155 0.13
156 0.15
157 0.16
158 0.18
159 0.19
160 0.21
161 0.21
162 0.19
163 0.18
164 0.15
165 0.14
166 0.11
167 0.11
168 0.09
169 0.06
170 0.07
171 0.07
172 0.07
173 0.08
174 0.09
175 0.11
176 0.12
177 0.13
178 0.13
179 0.15
180 0.15
181 0.14
182 0.13
183 0.11
184 0.1
185 0.09
186 0.1
187 0.08
188 0.09
189 0.08
190 0.1
191 0.09
192 0.1
193 0.09
194 0.1
195 0.11
196 0.13
197 0.15
198 0.13
199 0.15
200 0.18
201 0.18
202 0.18
203 0.19
204 0.21
205 0.2
206 0.22
207 0.23
208 0.22
209 0.25
210 0.26
211 0.29
212 0.26
213 0.27
214 0.3
215 0.27
216 0.24
217 0.21
218 0.21
219 0.19
220 0.18
221 0.17
222 0.17
223 0.18
224 0.19
225 0.19
226 0.17
227 0.16
228 0.17
229 0.18
230 0.19
231 0.23
232 0.24
233 0.27
234 0.26
235 0.25
236 0.23
237 0.2
238 0.16
239 0.13
240 0.11
241 0.07
242 0.07
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.05
247 0.06
248 0.08
249 0.09
250 0.13
251 0.15
252 0.16
253 0.17
254 0.18
255 0.16
256 0.19
257 0.22
258 0.21
259 0.24
260 0.24
261 0.23
262 0.27
263 0.29
264 0.25
265 0.21
266 0.2
267 0.15
268 0.16
269 0.2
270 0.16
271 0.14
272 0.14
273 0.19
274 0.2
275 0.22
276 0.2
277 0.17
278 0.18
279 0.2
280 0.23
281 0.19
282 0.17
283 0.16
284 0.17
285 0.18
286 0.19
287 0.17
288 0.13
289 0.13
290 0.13
291 0.13
292 0.12
293 0.11
294 0.1
295 0.1
296 0.11
297 0.13
298 0.15
299 0.16
300 0.17
301 0.16
302 0.19
303 0.18
304 0.18
305 0.19
306 0.21
307 0.25
308 0.27
309 0.3
310 0.29
311 0.31
312 0.31
313 0.27
314 0.27
315 0.26
316 0.26
317 0.26
318 0.29
319 0.35
320 0.4
321 0.4
322 0.4
323 0.35
324 0.33
325 0.3
326 0.24
327 0.17
328 0.12
329 0.1
330 0.07
331 0.1
332 0.1
333 0.13
334 0.13
335 0.13
336 0.13
337 0.12
338 0.11
339 0.1
340 0.1
341 0.1
342 0.11
343 0.1
344 0.1
345 0.11
346 0.12
347 0.1
348 0.1
349 0.09
350 0.09
351 0.1
352 0.1
353 0.09
354 0.08
355 0.1
356 0.1
357 0.1
358 0.1
359 0.09
360 0.09
361 0.1
362 0.12
363 0.12
364 0.12
365 0.17
366 0.21
367 0.23
368 0.31
369 0.33
370 0.41
371 0.41
372 0.45
373 0.47
374 0.46
375 0.48
376 0.4
377 0.38
378 0.29
379 0.27