Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E5A0N9

Protein Details
Accession E5A0N9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
272-327YDSRSRSRSRSYDSRRRSRSHSRSHSRSDRRSYDSRDQTRSRSSRRQDGHDERERSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
286-293RRRSRSHS
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 14, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF03371  PRP38  
Amino Acid Sequences MSSKPQFDRADASALLDDRGYKGALIRGQNPALLFEKGVRERITESYYWKEQCFGLNAATLCDRAAELKFIGGITGITGKPTPFLCLAFKLLQLVPEKAIILEYLNFRSDDGEEDEATNGQNGHANGEEEEGNVDEGDKQVHKPQDLNAAGKLGDFKYLRCLAAFYIRLAWQPVEIYKTLEPLLTDYRKIKRRLKDGYTLTYIDQFIDDLLTKDRICATSLWKLPSRANLEDLDLLEPRESPLGDEVDALDEDMGERSERSARSYSSRTGSYDSRSRSRSRSYDSRRRSRSHSRSHSRSDRRSYDSRDQTRSRSSRRQDGHDERERS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.25
3 0.2
4 0.18
5 0.14
6 0.16
7 0.14
8 0.11
9 0.13
10 0.17
11 0.22
12 0.25
13 0.28
14 0.32
15 0.33
16 0.34
17 0.32
18 0.31
19 0.28
20 0.25
21 0.22
22 0.19
23 0.26
24 0.27
25 0.31
26 0.28
27 0.27
28 0.29
29 0.33
30 0.34
31 0.28
32 0.31
33 0.33
34 0.39
35 0.4
36 0.37
37 0.35
38 0.32
39 0.33
40 0.32
41 0.27
42 0.21
43 0.23
44 0.22
45 0.22
46 0.22
47 0.19
48 0.15
49 0.13
50 0.12
51 0.1
52 0.11
53 0.11
54 0.1
55 0.1
56 0.11
57 0.1
58 0.1
59 0.08
60 0.07
61 0.06
62 0.09
63 0.08
64 0.09
65 0.1
66 0.1
67 0.12
68 0.13
69 0.15
70 0.12
71 0.15
72 0.16
73 0.17
74 0.21
75 0.2
76 0.2
77 0.2
78 0.19
79 0.21
80 0.22
81 0.21
82 0.18
83 0.17
84 0.17
85 0.14
86 0.14
87 0.1
88 0.08
89 0.09
90 0.11
91 0.11
92 0.12
93 0.12
94 0.12
95 0.13
96 0.13
97 0.13
98 0.14
99 0.14
100 0.13
101 0.14
102 0.14
103 0.13
104 0.13
105 0.11
106 0.08
107 0.06
108 0.09
109 0.08
110 0.09
111 0.1
112 0.1
113 0.1
114 0.11
115 0.11
116 0.08
117 0.08
118 0.07
119 0.07
120 0.06
121 0.06
122 0.05
123 0.05
124 0.06
125 0.07
126 0.07
127 0.12
128 0.15
129 0.16
130 0.16
131 0.18
132 0.26
133 0.28
134 0.28
135 0.23
136 0.22
137 0.21
138 0.2
139 0.19
140 0.1
141 0.13
142 0.11
143 0.11
144 0.16
145 0.18
146 0.18
147 0.16
148 0.16
149 0.12
150 0.18
151 0.18
152 0.13
153 0.14
154 0.14
155 0.14
156 0.15
157 0.14
158 0.09
159 0.09
160 0.09
161 0.09
162 0.09
163 0.11
164 0.1
165 0.12
166 0.12
167 0.12
168 0.11
169 0.11
170 0.17
171 0.16
172 0.18
173 0.21
174 0.28
175 0.35
176 0.42
177 0.47
178 0.49
179 0.57
180 0.63
181 0.64
182 0.65
183 0.63
184 0.61
185 0.56
186 0.5
187 0.42
188 0.36
189 0.31
190 0.21
191 0.17
192 0.12
193 0.08
194 0.08
195 0.08
196 0.06
197 0.08
198 0.1
199 0.1
200 0.11
201 0.12
202 0.12
203 0.13
204 0.14
205 0.17
206 0.22
207 0.26
208 0.29
209 0.31
210 0.33
211 0.33
212 0.39
213 0.41
214 0.34
215 0.33
216 0.3
217 0.29
218 0.28
219 0.27
220 0.22
221 0.16
222 0.15
223 0.12
224 0.12
225 0.1
226 0.1
227 0.09
228 0.08
229 0.11
230 0.11
231 0.11
232 0.11
233 0.11
234 0.11
235 0.11
236 0.1
237 0.08
238 0.06
239 0.06
240 0.07
241 0.07
242 0.05
243 0.06
244 0.07
245 0.12
246 0.13
247 0.17
248 0.2
249 0.22
250 0.28
251 0.32
252 0.36
253 0.35
254 0.37
255 0.35
256 0.36
257 0.37
258 0.37
259 0.4
260 0.41
261 0.44
262 0.46
263 0.49
264 0.5
265 0.56
266 0.56
267 0.58
268 0.63
269 0.66
270 0.73
271 0.78
272 0.83
273 0.82
274 0.81
275 0.81
276 0.81
277 0.81
278 0.81
279 0.82
280 0.82
281 0.82
282 0.87
283 0.9
284 0.89
285 0.88
286 0.86
287 0.83
288 0.8
289 0.8
290 0.78
291 0.78
292 0.79
293 0.77
294 0.77
295 0.74
296 0.73
297 0.75
298 0.76
299 0.74
300 0.74
301 0.74
302 0.75
303 0.77
304 0.78
305 0.79
306 0.8
307 0.81