Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E5AFG2

Protein Details
Accession E5AFG2    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
108-133YQEVDEKMDKRRRARREAREQQERDEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
117-123KRRRARR
Subcellular Location(s) mito 12, mito_nucl 11.333, nucl 9.5, cyto_mito 8.833, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR010491  PRP1_N  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF06424  PRP1_N  
PF13432  TPR_16  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MSGRRDFLSMPAPENYVAGLGRGATGFTTRSDLGPAREGPSEEQMKEMLAKRAASLGQAAPAAYGVTERKEEEHDDEEDRFQDPDNEVGLFSSGMNYDKEDDEADRIYQEVDEKMDKRRRARREAREQQERDEYEKNNPKIQLQFADLKRALGSVSEEEWAALPEVGDMTGKAKRAREARMANSRSYAVPDSVLQAAAKSGELDTSISANDADSGTMTNFASIGAAQLSALTVRLDSAASNGPGTQTTTSGTATSVDPKGYITALDKKQAMGDEVPVEDINRARVLLESAVKTNVHNGPGYVALSRLEEVAGKVHTAKKVIQKGCEMCPKSIVVWEEAIRLNKENVHNAKIIAANGIKLNPKAIRLWQQAIDLEQTPAARKKVTRQALDHNPQSVELWKTLINDTEDIENVKLLFAKATETVPLSEELWISYARVSDAEAAQQVLNKARKAIPTSWAIWIHACRLQEELGKVEMCDRIMERAVKALIKENAMIKREEWLAQAEICEEEGDKGTAASIVKATIGWGLDEDDERRDIWLEDAKSISSRGRFETARAILGHAVSIFPYSTTVWHASADLEKHHGTAESLLSVLERAVTACPNSESLWLLYAREMWQSGDPEGARKVLGRSFEKLPGNENLYTRAVDFEVDAGNYDQARSFLQVARESAATDRIFMKSAVLERQLGNFEVALDICNQALQNWPHSWKLHAVKGQIYEQLSKLKEAQEAFNIGTRAAPKSPTLYILLSRIQEKQGAIVKARSTLDRGRQQNPKNPELLCEAVRLERRQQNIPAAQKIMAIALQECPNSGLLWAEKIMHLEARTQRKPRALEAIRKVENDAQLFVVVARIFWAERRLDKAATWFTKAVVLDPDYGDGWVWYYKFLEQHGTEEKKAEVLAKVGMAEPRHGEVWQAVKKDPKFARQSVEDVLKIAAKVAE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.24
3 0.18
4 0.15
5 0.12
6 0.1
7 0.09
8 0.09
9 0.09
10 0.09
11 0.08
12 0.09
13 0.1
14 0.11
15 0.15
16 0.15
17 0.16
18 0.2
19 0.23
20 0.25
21 0.3
22 0.3
23 0.29
24 0.31
25 0.32
26 0.31
27 0.36
28 0.38
29 0.33
30 0.32
31 0.29
32 0.28
33 0.32
34 0.33
35 0.31
36 0.29
37 0.29
38 0.28
39 0.32
40 0.31
41 0.26
42 0.26
43 0.2
44 0.19
45 0.19
46 0.19
47 0.14
48 0.14
49 0.13
50 0.09
51 0.11
52 0.1
53 0.12
54 0.14
55 0.15
56 0.17
57 0.21
58 0.25
59 0.27
60 0.29
61 0.3
62 0.31
63 0.32
64 0.32
65 0.3
66 0.27
67 0.22
68 0.19
69 0.21
70 0.19
71 0.2
72 0.19
73 0.18
74 0.17
75 0.17
76 0.17
77 0.12
78 0.11
79 0.09
80 0.09
81 0.1
82 0.11
83 0.12
84 0.13
85 0.14
86 0.15
87 0.15
88 0.16
89 0.17
90 0.18
91 0.17
92 0.15
93 0.15
94 0.14
95 0.13
96 0.14
97 0.13
98 0.14
99 0.2
100 0.21
101 0.31
102 0.39
103 0.45
104 0.52
105 0.6
106 0.66
107 0.72
108 0.8
109 0.82
110 0.85
111 0.89
112 0.9
113 0.91
114 0.84
115 0.8
116 0.78
117 0.7
118 0.64
119 0.59
120 0.51
121 0.51
122 0.58
123 0.55
124 0.52
125 0.51
126 0.5
127 0.49
128 0.51
129 0.44
130 0.39
131 0.44
132 0.4
133 0.47
134 0.43
135 0.39
136 0.34
137 0.31
138 0.26
139 0.18
140 0.2
141 0.13
142 0.14
143 0.14
144 0.13
145 0.13
146 0.13
147 0.13
148 0.11
149 0.08
150 0.07
151 0.07
152 0.07
153 0.07
154 0.07
155 0.06
156 0.08
157 0.11
158 0.14
159 0.18
160 0.2
161 0.26
162 0.32
163 0.38
164 0.44
165 0.49
166 0.55
167 0.62
168 0.63
169 0.58
170 0.54
171 0.5
172 0.41
173 0.37
174 0.31
175 0.21
176 0.19
177 0.18
178 0.18
179 0.17
180 0.17
181 0.13
182 0.11
183 0.11
184 0.1
185 0.09
186 0.07
187 0.07
188 0.06
189 0.07
190 0.07
191 0.08
192 0.08
193 0.08
194 0.07
195 0.07
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.06
200 0.06
201 0.07
202 0.07
203 0.08
204 0.08
205 0.07
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.06
210 0.06
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.04
220 0.04
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.08
225 0.1
226 0.1
227 0.11
228 0.11
229 0.11
230 0.11
231 0.13
232 0.12
233 0.09
234 0.1
235 0.11
236 0.12
237 0.12
238 0.11
239 0.11
240 0.11
241 0.15
242 0.15
243 0.13
244 0.13
245 0.13
246 0.14
247 0.12
248 0.12
249 0.12
250 0.2
251 0.21
252 0.26
253 0.26
254 0.25
255 0.27
256 0.26
257 0.25
258 0.17
259 0.17
260 0.14
261 0.14
262 0.15
263 0.13
264 0.12
265 0.11
266 0.11
267 0.11
268 0.09
269 0.09
270 0.08
271 0.09
272 0.1
273 0.11
274 0.14
275 0.13
276 0.14
277 0.16
278 0.16
279 0.16
280 0.2
281 0.2
282 0.19
283 0.17
284 0.16
285 0.16
286 0.17
287 0.17
288 0.12
289 0.1
290 0.09
291 0.09
292 0.09
293 0.08
294 0.07
295 0.07
296 0.07
297 0.09
298 0.08
299 0.08
300 0.1
301 0.14
302 0.15
303 0.17
304 0.21
305 0.27
306 0.35
307 0.38
308 0.39
309 0.42
310 0.44
311 0.48
312 0.52
313 0.47
314 0.38
315 0.37
316 0.35
317 0.29
318 0.29
319 0.24
320 0.16
321 0.16
322 0.16
323 0.17
324 0.19
325 0.2
326 0.18
327 0.18
328 0.17
329 0.2
330 0.21
331 0.26
332 0.27
333 0.28
334 0.28
335 0.27
336 0.28
337 0.25
338 0.23
339 0.18
340 0.15
341 0.13
342 0.12
343 0.14
344 0.14
345 0.12
346 0.15
347 0.14
348 0.15
349 0.16
350 0.19
351 0.26
352 0.28
353 0.31
354 0.3
355 0.31
356 0.3
357 0.29
358 0.27
359 0.19
360 0.15
361 0.13
362 0.11
363 0.12
364 0.15
365 0.15
366 0.15
367 0.15
368 0.22
369 0.31
370 0.38
371 0.4
372 0.41
373 0.49
374 0.57
375 0.62
376 0.57
377 0.5
378 0.42
379 0.38
380 0.35
381 0.29
382 0.2
383 0.14
384 0.13
385 0.12
386 0.13
387 0.13
388 0.15
389 0.13
390 0.12
391 0.13
392 0.12
393 0.12
394 0.11
395 0.11
396 0.09
397 0.07
398 0.07
399 0.07
400 0.06
401 0.06
402 0.05
403 0.06
404 0.07
405 0.07
406 0.08
407 0.08
408 0.09
409 0.09
410 0.1
411 0.09
412 0.09
413 0.08
414 0.07
415 0.08
416 0.07
417 0.07
418 0.06
419 0.06
420 0.06
421 0.06
422 0.06
423 0.06
424 0.07
425 0.07
426 0.07
427 0.07
428 0.07
429 0.08
430 0.09
431 0.13
432 0.15
433 0.15
434 0.16
435 0.18
436 0.2
437 0.23
438 0.24
439 0.22
440 0.23
441 0.25
442 0.27
443 0.25
444 0.23
445 0.21
446 0.19
447 0.18
448 0.17
449 0.15
450 0.12
451 0.12
452 0.13
453 0.14
454 0.14
455 0.13
456 0.12
457 0.12
458 0.11
459 0.12
460 0.12
461 0.1
462 0.1
463 0.09
464 0.09
465 0.11
466 0.12
467 0.1
468 0.11
469 0.12
470 0.12
471 0.12
472 0.16
473 0.15
474 0.15
475 0.16
476 0.19
477 0.22
478 0.22
479 0.22
480 0.18
481 0.19
482 0.19
483 0.19
484 0.15
485 0.13
486 0.13
487 0.12
488 0.12
489 0.1
490 0.09
491 0.08
492 0.07
493 0.05
494 0.05
495 0.05
496 0.06
497 0.05
498 0.05
499 0.05
500 0.06
501 0.06
502 0.06
503 0.06
504 0.05
505 0.06
506 0.06
507 0.06
508 0.05
509 0.05
510 0.05
511 0.05
512 0.06
513 0.06
514 0.07
515 0.08
516 0.07
517 0.08
518 0.08
519 0.08
520 0.08
521 0.08
522 0.09
523 0.13
524 0.13
525 0.13
526 0.14
527 0.14
528 0.13
529 0.14
530 0.15
531 0.13
532 0.14
533 0.15
534 0.18
535 0.19
536 0.2
537 0.26
538 0.25
539 0.24
540 0.23
541 0.22
542 0.18
543 0.18
544 0.17
545 0.09
546 0.08
547 0.06
548 0.06
549 0.05
550 0.04
551 0.05
552 0.05
553 0.06
554 0.09
555 0.11
556 0.11
557 0.11
558 0.11
559 0.11
560 0.13
561 0.14
562 0.12
563 0.13
564 0.13
565 0.13
566 0.13
567 0.12
568 0.1
569 0.11
570 0.1
571 0.07
572 0.07
573 0.07
574 0.06
575 0.06
576 0.06
577 0.04
578 0.04
579 0.04
580 0.05
581 0.06
582 0.06
583 0.07
584 0.08
585 0.09
586 0.1
587 0.1
588 0.11
589 0.1
590 0.12
591 0.12
592 0.11
593 0.1
594 0.11
595 0.11
596 0.11
597 0.11
598 0.1
599 0.12
600 0.13
601 0.13
602 0.15
603 0.14
604 0.15
605 0.16
606 0.15
607 0.13
608 0.12
609 0.14
610 0.13
611 0.19
612 0.2
613 0.23
614 0.25
615 0.32
616 0.34
617 0.33
618 0.34
619 0.32
620 0.33
621 0.32
622 0.3
623 0.27
624 0.25
625 0.24
626 0.21
627 0.18
628 0.14
629 0.12
630 0.11
631 0.09
632 0.08
633 0.07
634 0.08
635 0.08
636 0.09
637 0.09
638 0.09
639 0.08
640 0.08
641 0.09
642 0.1
643 0.11
644 0.13
645 0.16
646 0.18
647 0.19
648 0.2
649 0.19
650 0.18
651 0.17
652 0.2
653 0.17
654 0.16
655 0.16
656 0.16
657 0.17
658 0.16
659 0.16
660 0.13
661 0.15
662 0.17
663 0.18
664 0.19
665 0.18
666 0.21
667 0.21
668 0.2
669 0.17
670 0.14
671 0.12
672 0.11
673 0.1
674 0.08
675 0.08
676 0.07
677 0.07
678 0.07
679 0.07
680 0.07
681 0.13
682 0.14
683 0.18
684 0.21
685 0.24
686 0.27
687 0.28
688 0.29
689 0.31
690 0.35
691 0.37
692 0.38
693 0.38
694 0.38
695 0.41
696 0.41
697 0.37
698 0.33
699 0.29
700 0.27
701 0.3
702 0.27
703 0.26
704 0.26
705 0.24
706 0.26
707 0.26
708 0.27
709 0.24
710 0.25
711 0.24
712 0.25
713 0.23
714 0.19
715 0.19
716 0.18
717 0.18
718 0.17
719 0.18
720 0.16
721 0.19
722 0.2
723 0.2
724 0.21
725 0.2
726 0.21
727 0.22
728 0.24
729 0.23
730 0.24
731 0.24
732 0.23
733 0.24
734 0.22
735 0.24
736 0.28
737 0.29
738 0.29
739 0.3
740 0.3
741 0.32
742 0.33
743 0.29
744 0.27
745 0.31
746 0.38
747 0.43
748 0.48
749 0.51
750 0.59
751 0.65
752 0.69
753 0.7
754 0.65
755 0.61
756 0.56
757 0.51
758 0.47
759 0.43
760 0.35
761 0.3
762 0.27
763 0.27
764 0.33
765 0.32
766 0.35
767 0.37
768 0.4
769 0.43
770 0.47
771 0.5
772 0.52
773 0.56
774 0.52
775 0.49
776 0.45
777 0.4
778 0.36
779 0.28
780 0.21
781 0.16
782 0.12
783 0.13
784 0.15
785 0.14
786 0.14
787 0.15
788 0.14
789 0.13
790 0.13
791 0.12
792 0.1
793 0.12
794 0.12
795 0.13
796 0.13
797 0.14
798 0.15
799 0.16
800 0.15
801 0.21
802 0.28
803 0.37
804 0.44
805 0.48
806 0.53
807 0.57
808 0.6
809 0.57
810 0.61
811 0.58
812 0.61
813 0.64
814 0.68
815 0.65
816 0.63
817 0.61
818 0.55
819 0.53
820 0.45
821 0.37
822 0.28
823 0.24
824 0.23
825 0.19
826 0.17
827 0.12
828 0.1
829 0.1
830 0.1
831 0.1
832 0.12
833 0.17
834 0.18
835 0.21
836 0.27
837 0.3
838 0.3
839 0.31
840 0.37
841 0.42
842 0.41
843 0.43
844 0.37
845 0.34
846 0.38
847 0.36
848 0.31
849 0.26
850 0.25
851 0.23
852 0.23
853 0.24
854 0.2
855 0.2
856 0.18
857 0.12
858 0.12
859 0.13
860 0.12
861 0.12
862 0.13
863 0.15
864 0.18
865 0.2
866 0.26
867 0.24
868 0.3
869 0.39
870 0.42
871 0.41
872 0.41
873 0.4
874 0.33
875 0.33
876 0.3
877 0.22
878 0.19
879 0.19
880 0.17
881 0.18
882 0.19
883 0.22
884 0.19
885 0.2
886 0.21
887 0.22
888 0.22
889 0.21
890 0.2
891 0.21
892 0.29
893 0.32
894 0.33
895 0.34
896 0.42
897 0.44
898 0.52
899 0.54
900 0.54
901 0.57
902 0.59
903 0.63
904 0.59
905 0.62
906 0.59
907 0.6
908 0.51
909 0.43
910 0.4
911 0.34
912 0.29