Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C6HJK1

Protein Details
Accession C6HJK1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
278-302YWGRVKCIKCRVRHNVVYKRRQWATHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 13.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039723  Vps71/ZNHIT1  
IPR007529  Znf_HIT  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
Pfam View protein in Pfam  
PF04438  zf-HIT  
Amino Acid Sequences MSLNKIEILPTSSSHLTPGWAYVPDTRYGNSTDTGRATGRAAGARKRAVRDLGVIGRAEASSSRQNTATLRHIAELDRENHKDTYIPIPTKQKSAIAKDKPRGKTTSNVRRILLSQKTFKNYLDDEEAALAQAQSHSPAAGQPSSTTTAATARSTPLKSSKPSTPRTSSHPATATPNKTSSTTGQPSEPPNVASSRASTSTIQKPQPNQQLIASNYDNDPLLRSYIPSAPSERLMQLLLAEPPLSYNASLATVAPLDCGPGTPAVSKPPRHFCSICGYWGRVKCIKCRVRHNVVYKRRQWATVGRKFQGMTGL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.22
3 0.2
4 0.19
5 0.2
6 0.16
7 0.16
8 0.18
9 0.22
10 0.24
11 0.25
12 0.26
13 0.25
14 0.25
15 0.26
16 0.26
17 0.23
18 0.23
19 0.23
20 0.23
21 0.25
22 0.24
23 0.22
24 0.21
25 0.21
26 0.22
27 0.24
28 0.26
29 0.3
30 0.35
31 0.41
32 0.44
33 0.45
34 0.47
35 0.45
36 0.42
37 0.4
38 0.4
39 0.37
40 0.35
41 0.31
42 0.27
43 0.24
44 0.22
45 0.19
46 0.13
47 0.13
48 0.17
49 0.19
50 0.21
51 0.21
52 0.23
53 0.24
54 0.29
55 0.31
56 0.28
57 0.27
58 0.26
59 0.27
60 0.26
61 0.29
62 0.29
63 0.27
64 0.29
65 0.3
66 0.32
67 0.31
68 0.3
69 0.27
70 0.24
71 0.28
72 0.29
73 0.29
74 0.31
75 0.4
76 0.41
77 0.43
78 0.42
79 0.4
80 0.38
81 0.45
82 0.5
83 0.51
84 0.58
85 0.62
86 0.69
87 0.68
88 0.67
89 0.63
90 0.55
91 0.54
92 0.57
93 0.6
94 0.6
95 0.59
96 0.55
97 0.52
98 0.52
99 0.51
100 0.48
101 0.42
102 0.39
103 0.4
104 0.43
105 0.43
106 0.42
107 0.38
108 0.31
109 0.29
110 0.27
111 0.23
112 0.2
113 0.18
114 0.18
115 0.13
116 0.12
117 0.09
118 0.05
119 0.05
120 0.04
121 0.05
122 0.05
123 0.05
124 0.05
125 0.06
126 0.08
127 0.08
128 0.08
129 0.07
130 0.1
131 0.12
132 0.13
133 0.11
134 0.1
135 0.11
136 0.13
137 0.13
138 0.11
139 0.1
140 0.13
141 0.14
142 0.15
143 0.18
144 0.2
145 0.22
146 0.26
147 0.31
148 0.35
149 0.41
150 0.46
151 0.46
152 0.45
153 0.5
154 0.53
155 0.48
156 0.44
157 0.4
158 0.35
159 0.36
160 0.41
161 0.37
162 0.31
163 0.32
164 0.29
165 0.28
166 0.29
167 0.25
168 0.26
169 0.26
170 0.25
171 0.25
172 0.27
173 0.28
174 0.29
175 0.27
176 0.2
177 0.18
178 0.18
179 0.19
180 0.16
181 0.15
182 0.15
183 0.16
184 0.17
185 0.17
186 0.22
187 0.28
188 0.34
189 0.37
190 0.38
191 0.41
192 0.47
193 0.55
194 0.52
195 0.46
196 0.42
197 0.44
198 0.41
199 0.43
200 0.35
201 0.27
202 0.25
203 0.24
204 0.21
205 0.15
206 0.15
207 0.1
208 0.11
209 0.1
210 0.11
211 0.13
212 0.16
213 0.18
214 0.18
215 0.2
216 0.2
217 0.22
218 0.23
219 0.21
220 0.18
221 0.17
222 0.15
223 0.13
224 0.13
225 0.11
226 0.1
227 0.09
228 0.08
229 0.08
230 0.1
231 0.1
232 0.08
233 0.08
234 0.08
235 0.09
236 0.09
237 0.09
238 0.08
239 0.08
240 0.08
241 0.09
242 0.08
243 0.08
244 0.08
245 0.08
246 0.08
247 0.09
248 0.1
249 0.11
250 0.13
251 0.21
252 0.27
253 0.33
254 0.39
255 0.48
256 0.5
257 0.56
258 0.55
259 0.49
260 0.52
261 0.49
262 0.48
263 0.42
264 0.42
265 0.42
266 0.45
267 0.5
268 0.46
269 0.46
270 0.48
271 0.54
272 0.59
273 0.6
274 0.66
275 0.69
276 0.74
277 0.8
278 0.82
279 0.82
280 0.86
281 0.88
282 0.84
283 0.84
284 0.77
285 0.71
286 0.65
287 0.65
288 0.65
289 0.65
290 0.67
291 0.59
292 0.6
293 0.57