Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C6HPJ6

Protein Details
Accession C6HPJ6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
221-245MVPNEERKKRIRKEERRKLRVSWKPBasic
625-647RTNGEFKHKKHPKAGLVPCRYWKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
226-240ERKKRIRKEERRKLR
621-637NKRARTNGEFKHKKHPK
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto_nucl 12.333, cyto 10.5, mito_nucl 8.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MTKFVTMDQAMLEKTKNDKILSRFVKKGGDIIKQLAQTILSNAAELTKRKAEIAKASPKKTESALNEDGLVAMEPEIVIRNPLPSTTGAKRPRELETDSSPSTKRSVTTSNGKPAVKPTTVAVTKRTTTTAPDVKSTAAAGNAAAAKPKPNMVIPKPTPSLFSSLMSASKKPGTSNAARAAAAAKERANPPEQKPAPPPAVVQKPAFSFSETMADLAAKGMVPNEERKKRIRKEERRKLRVSWKPDDSLTEIRLFTHDPEEDIGHDDSMIRDVADVGGEGRTLKLHRGMDDLDDEDEDDDPEARTKTFHPYTSPTEIDFSELDSEERQRNFIKRGGIQKPESAEKLAQEQRESKTLSVFYTSLADIPSSPKEPPAPDADESYDPEVPFGEPGDQTKARSAKYFAARAPIQPLPQPQSAQTPQNSSTVDISSLLKLIQQAPQSGQPQPSQPPIPIPDLEKTYGQFVGNQGQPTPTSIPQVPQIPQATQPATLPGGLDIQALLAVMNAQTQLQQGAPAFPPAQGPAASSSQAPNLASILSQFQIPVVTGQTQTQPPQQQQQQQPPSQPLAYNQNQSKQHGSFYEDADRKRMREGHGHGHKKHGGYDNYDEVSHGHGHGHGHGNKRARTNGEFKHKKHPKAGLVPCRYWKEDKCLKGDDCTFRHDPLD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.29
3 0.32
4 0.32
5 0.38
6 0.41
7 0.51
8 0.57
9 0.59
10 0.58
11 0.57
12 0.6
13 0.54
14 0.55
15 0.52
16 0.5
17 0.46
18 0.46
19 0.47
20 0.42
21 0.42
22 0.35
23 0.29
24 0.23
25 0.21
26 0.22
27 0.16
28 0.16
29 0.15
30 0.18
31 0.21
32 0.21
33 0.25
34 0.25
35 0.26
36 0.29
37 0.33
38 0.35
39 0.4
40 0.48
41 0.53
42 0.57
43 0.61
44 0.64
45 0.61
46 0.58
47 0.51
48 0.5
49 0.44
50 0.44
51 0.44
52 0.39
53 0.38
54 0.35
55 0.33
56 0.25
57 0.19
58 0.11
59 0.07
60 0.06
61 0.05
62 0.06
63 0.07
64 0.07
65 0.09
66 0.09
67 0.11
68 0.12
69 0.12
70 0.14
71 0.15
72 0.21
73 0.25
74 0.34
75 0.4
76 0.45
77 0.49
78 0.5
79 0.53
80 0.52
81 0.51
82 0.48
83 0.46
84 0.48
85 0.46
86 0.46
87 0.42
88 0.38
89 0.36
90 0.32
91 0.26
92 0.24
93 0.27
94 0.3
95 0.39
96 0.45
97 0.52
98 0.57
99 0.56
100 0.52
101 0.52
102 0.53
103 0.44
104 0.37
105 0.3
106 0.33
107 0.37
108 0.37
109 0.36
110 0.34
111 0.35
112 0.36
113 0.36
114 0.28
115 0.27
116 0.34
117 0.37
118 0.33
119 0.34
120 0.34
121 0.32
122 0.31
123 0.28
124 0.21
125 0.14
126 0.12
127 0.09
128 0.11
129 0.12
130 0.11
131 0.12
132 0.12
133 0.14
134 0.15
135 0.17
136 0.16
137 0.2
138 0.28
139 0.3
140 0.41
141 0.41
142 0.48
143 0.49
144 0.47
145 0.45
146 0.39
147 0.39
148 0.31
149 0.28
150 0.23
151 0.21
152 0.25
153 0.24
154 0.24
155 0.21
156 0.23
157 0.23
158 0.21
159 0.25
160 0.27
161 0.29
162 0.35
163 0.39
164 0.38
165 0.36
166 0.36
167 0.32
168 0.28
169 0.25
170 0.2
171 0.15
172 0.17
173 0.19
174 0.22
175 0.26
176 0.29
177 0.32
178 0.41
179 0.42
180 0.42
181 0.45
182 0.48
183 0.46
184 0.41
185 0.39
186 0.37
187 0.42
188 0.4
189 0.37
190 0.34
191 0.32
192 0.33
193 0.32
194 0.25
195 0.19
196 0.16
197 0.19
198 0.16
199 0.15
200 0.12
201 0.12
202 0.1
203 0.09
204 0.08
205 0.04
206 0.04
207 0.05
208 0.06
209 0.08
210 0.16
211 0.25
212 0.31
213 0.34
214 0.43
215 0.52
216 0.58
217 0.68
218 0.71
219 0.74
220 0.8
221 0.87
222 0.91
223 0.89
224 0.86
225 0.82
226 0.81
227 0.78
228 0.74
229 0.71
230 0.65
231 0.58
232 0.55
233 0.51
234 0.45
235 0.4
236 0.34
237 0.29
238 0.24
239 0.21
240 0.22
241 0.2
242 0.16
243 0.16
244 0.14
245 0.12
246 0.13
247 0.13
248 0.13
249 0.15
250 0.14
251 0.1
252 0.1
253 0.09
254 0.08
255 0.09
256 0.08
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.04
267 0.04
268 0.05
269 0.06
270 0.07
271 0.12
272 0.13
273 0.14
274 0.16
275 0.17
276 0.17
277 0.18
278 0.17
279 0.12
280 0.11
281 0.11
282 0.09
283 0.08
284 0.07
285 0.06
286 0.05
287 0.05
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.08
292 0.09
293 0.17
294 0.19
295 0.2
296 0.22
297 0.26
298 0.31
299 0.35
300 0.34
301 0.27
302 0.26
303 0.24
304 0.23
305 0.19
306 0.14
307 0.1
308 0.1
309 0.1
310 0.09
311 0.11
312 0.13
313 0.13
314 0.14
315 0.16
316 0.18
317 0.21
318 0.24
319 0.25
320 0.26
321 0.35
322 0.39
323 0.42
324 0.4
325 0.39
326 0.38
327 0.37
328 0.33
329 0.26
330 0.21
331 0.16
332 0.22
333 0.23
334 0.22
335 0.21
336 0.24
337 0.24
338 0.28
339 0.28
340 0.22
341 0.2
342 0.2
343 0.19
344 0.17
345 0.15
346 0.12
347 0.12
348 0.12
349 0.1
350 0.09
351 0.09
352 0.07
353 0.09
354 0.11
355 0.11
356 0.11
357 0.12
358 0.14
359 0.15
360 0.17
361 0.19
362 0.21
363 0.2
364 0.21
365 0.23
366 0.22
367 0.22
368 0.23
369 0.2
370 0.16
371 0.15
372 0.14
373 0.11
374 0.1
375 0.09
376 0.09
377 0.07
378 0.08
379 0.14
380 0.15
381 0.15
382 0.2
383 0.23
384 0.22
385 0.24
386 0.25
387 0.26
388 0.31
389 0.34
390 0.3
391 0.33
392 0.33
393 0.32
394 0.34
395 0.3
396 0.26
397 0.25
398 0.28
399 0.26
400 0.27
401 0.27
402 0.23
403 0.29
404 0.31
405 0.33
406 0.31
407 0.3
408 0.29
409 0.32
410 0.31
411 0.25
412 0.24
413 0.19
414 0.18
415 0.15
416 0.15
417 0.11
418 0.11
419 0.1
420 0.09
421 0.1
422 0.11
423 0.13
424 0.14
425 0.15
426 0.16
427 0.22
428 0.24
429 0.25
430 0.27
431 0.25
432 0.27
433 0.29
434 0.32
435 0.28
436 0.26
437 0.27
438 0.27
439 0.29
440 0.27
441 0.26
442 0.25
443 0.26
444 0.27
445 0.24
446 0.21
447 0.21
448 0.21
449 0.18
450 0.17
451 0.15
452 0.2
453 0.22
454 0.22
455 0.2
456 0.19
457 0.19
458 0.2
459 0.22
460 0.17
461 0.18
462 0.19
463 0.2
464 0.23
465 0.27
466 0.25
467 0.27
468 0.28
469 0.25
470 0.27
471 0.31
472 0.28
473 0.24
474 0.23
475 0.2
476 0.18
477 0.17
478 0.14
479 0.1
480 0.1
481 0.1
482 0.1
483 0.07
484 0.06
485 0.06
486 0.06
487 0.05
488 0.03
489 0.03
490 0.03
491 0.04
492 0.04
493 0.04
494 0.05
495 0.06
496 0.07
497 0.07
498 0.09
499 0.09
500 0.12
501 0.12
502 0.14
503 0.14
504 0.14
505 0.15
506 0.14
507 0.16
508 0.13
509 0.14
510 0.14
511 0.16
512 0.16
513 0.16
514 0.16
515 0.16
516 0.18
517 0.17
518 0.13
519 0.12
520 0.11
521 0.1
522 0.1
523 0.11
524 0.09
525 0.09
526 0.08
527 0.08
528 0.08
529 0.09
530 0.09
531 0.09
532 0.1
533 0.11
534 0.13
535 0.17
536 0.19
537 0.22
538 0.28
539 0.32
540 0.34
541 0.42
542 0.48
543 0.53
544 0.59
545 0.67
546 0.69
547 0.68
548 0.69
549 0.65
550 0.62
551 0.55
552 0.48
553 0.42
554 0.42
555 0.43
556 0.46
557 0.45
558 0.49
559 0.5
560 0.53
561 0.55
562 0.47
563 0.45
564 0.39
565 0.41
566 0.36
567 0.36
568 0.42
569 0.4
570 0.4
571 0.44
572 0.45
573 0.41
574 0.45
575 0.46
576 0.41
577 0.46
578 0.51
579 0.54
580 0.61
581 0.7
582 0.64
583 0.68
584 0.68
585 0.6
586 0.61
587 0.58
588 0.52
589 0.49
590 0.53
591 0.51
592 0.47
593 0.46
594 0.39
595 0.31
596 0.3
597 0.25
598 0.19
599 0.14
600 0.14
601 0.15
602 0.2
603 0.28
604 0.3
605 0.35
606 0.41
607 0.48
608 0.51
609 0.55
610 0.56
611 0.53
612 0.55
613 0.57
614 0.61
615 0.64
616 0.69
617 0.67
618 0.72
619 0.75
620 0.77
621 0.76
622 0.76
623 0.75
624 0.76
625 0.83
626 0.83
627 0.82
628 0.81
629 0.8
630 0.77
631 0.72
632 0.69
633 0.64
634 0.64
635 0.64
636 0.65
637 0.63
638 0.65
639 0.62
640 0.63
641 0.66
642 0.65
643 0.59
644 0.6
645 0.56