Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C6HMG5

Protein Details
Accession C6HMG5    Localization Confidence High Confidence Score 17.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
120-146ARLANTQGKKAKRKARERQLEESRRLAHydrophilic
219-239QEEDPDRKRRKNDKSGNSAFAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
127-153GKKAKRKARERQLEESRRLAVLQKRRE
225-230RKRRKN
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR047242  CDC5L/Cef1  
IPR021786  Cdc5p/Cef1_C  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR017930  Myb_dom  
IPR001005  SANT/Myb  
IPR047240  SANT_CDC5L_II  
Gene Ontology GO:0000974  C:Prp19 complex  
GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF11831  Myb_Cef  
PF00249  Myb_DNA-binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51294  HTH_MYB  
PS50090  MYB_LIKE  
CDD cd11659  SANT_CDC5_II  
Amino Acid Sequences MPVVKGGVWTNIEDEIVKVAVSKYGLNQWARWRTIAPIVGRTATQCLERYQKLLDEAEARESDELGLGGPAGGETAAPSADDVRRLRPGELDPDPESKPARPDTIDLDEDEKEMLSEARARLANTQGKKAKRKARERQLEESRRLAVLQKRRELKNAGINIKVVTRKKGQMDYNADIPFEKQPAPGFYDTLEEEARNERQRALFDPRKQQLASKRKGDQEEDPDRKRRKNDKSGNSAFAAAAKAGQMQKIREAEQSSKRRALVLPSPQVSETELEEIVKMGMAGERASKMAGEEENDGTRGLISNYSTIVGGTPIRTPRAPAEEDRIANEIRNIKALTETQSSLLGGENTPLHEGGGSTGFEGIAPRKHALVTPNPMATPFRQAGANGIGATPMKTPMGVGATPLRTPRDNFAINKDASMGTLVGNTPKEMKLREDFLRRQLSSQLSSLPAPKEVEWELEEMPTEQAEPIGKEVPSEEDAAERDRRNKAAADKAAQAEFERQSQVYKRGLPRPSVIKLDTLMEKSSNVSDPIQNLIIQEMVTLIAHDARKFPLPGARIEGKAPKLTSFSDAQLARGRAAITSEVTRFPPQQDWQDTFTTSWSSLHESASLPGLSLYSDDDDYETQEQQMIAAFENVHTSLLASAEQGNKLEKKISLHNGGYQARAKTLRAKIIEASEALEKARFELDAFRTLQLGEESGIGRRLEGLRDEVTFVARREREAQELYKSRKEELESLEGGGVNGWHR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.14
3 0.12
4 0.11
5 0.1
6 0.1
7 0.12
8 0.13
9 0.14
10 0.15
11 0.22
12 0.29
13 0.3
14 0.34
15 0.42
16 0.49
17 0.5
18 0.49
19 0.43
20 0.4
21 0.45
22 0.46
23 0.39
24 0.36
25 0.37
26 0.36
27 0.36
28 0.33
29 0.3
30 0.26
31 0.26
32 0.23
33 0.25
34 0.32
35 0.33
36 0.34
37 0.33
38 0.35
39 0.35
40 0.35
41 0.33
42 0.3
43 0.29
44 0.32
45 0.29
46 0.27
47 0.23
48 0.22
49 0.19
50 0.15
51 0.13
52 0.08
53 0.07
54 0.06
55 0.06
56 0.05
57 0.05
58 0.04
59 0.04
60 0.03
61 0.04
62 0.05
63 0.05
64 0.05
65 0.06
66 0.09
67 0.11
68 0.18
69 0.19
70 0.23
71 0.3
72 0.32
73 0.33
74 0.34
75 0.36
76 0.37
77 0.4
78 0.41
79 0.37
80 0.4
81 0.4
82 0.39
83 0.38
84 0.33
85 0.34
86 0.33
87 0.34
88 0.31
89 0.32
90 0.35
91 0.38
92 0.37
93 0.33
94 0.32
95 0.28
96 0.27
97 0.25
98 0.18
99 0.12
100 0.11
101 0.1
102 0.08
103 0.12
104 0.12
105 0.17
106 0.19
107 0.2
108 0.22
109 0.3
110 0.36
111 0.35
112 0.44
113 0.46
114 0.53
115 0.62
116 0.68
117 0.69
118 0.72
119 0.8
120 0.81
121 0.85
122 0.88
123 0.86
124 0.87
125 0.89
126 0.88
127 0.81
128 0.74
129 0.65
130 0.54
131 0.47
132 0.43
133 0.4
134 0.4
135 0.44
136 0.48
137 0.54
138 0.56
139 0.61
140 0.59
141 0.58
142 0.58
143 0.58
144 0.54
145 0.48
146 0.46
147 0.41
148 0.41
149 0.41
150 0.35
151 0.31
152 0.33
153 0.37
154 0.42
155 0.48
156 0.48
157 0.51
158 0.56
159 0.54
160 0.55
161 0.5
162 0.45
163 0.38
164 0.35
165 0.28
166 0.22
167 0.2
168 0.15
169 0.17
170 0.19
171 0.24
172 0.23
173 0.21
174 0.19
175 0.21
176 0.2
177 0.2
178 0.18
179 0.13
180 0.13
181 0.17
182 0.22
183 0.23
184 0.24
185 0.24
186 0.26
187 0.28
188 0.31
189 0.37
190 0.41
191 0.43
192 0.52
193 0.52
194 0.55
195 0.53
196 0.54
197 0.55
198 0.57
199 0.57
200 0.55
201 0.58
202 0.59
203 0.63
204 0.61
205 0.57
206 0.56
207 0.6
208 0.61
209 0.6
210 0.63
211 0.65
212 0.67
213 0.7
214 0.7
215 0.7
216 0.73
217 0.78
218 0.79
219 0.83
220 0.83
221 0.77
222 0.68
223 0.58
224 0.47
225 0.38
226 0.28
227 0.18
228 0.12
229 0.08
230 0.11
231 0.1
232 0.13
233 0.15
234 0.15
235 0.2
236 0.23
237 0.24
238 0.24
239 0.27
240 0.31
241 0.38
242 0.45
243 0.45
244 0.46
245 0.45
246 0.44
247 0.41
248 0.4
249 0.37
250 0.38
251 0.4
252 0.37
253 0.38
254 0.36
255 0.35
256 0.31
257 0.24
258 0.17
259 0.12
260 0.11
261 0.1
262 0.1
263 0.09
264 0.08
265 0.07
266 0.06
267 0.04
268 0.05
269 0.05
270 0.05
271 0.06
272 0.07
273 0.07
274 0.07
275 0.07
276 0.06
277 0.08
278 0.08
279 0.09
280 0.1
281 0.12
282 0.12
283 0.13
284 0.12
285 0.1
286 0.1
287 0.09
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.07
292 0.07
293 0.08
294 0.08
295 0.07
296 0.07
297 0.06
298 0.07
299 0.07
300 0.09
301 0.1
302 0.13
303 0.13
304 0.14
305 0.16
306 0.2
307 0.22
308 0.2
309 0.26
310 0.28
311 0.29
312 0.29
313 0.28
314 0.23
315 0.21
316 0.23
317 0.2
318 0.15
319 0.17
320 0.16
321 0.14
322 0.15
323 0.16
324 0.17
325 0.15
326 0.16
327 0.14
328 0.14
329 0.14
330 0.13
331 0.12
332 0.09
333 0.06
334 0.07
335 0.07
336 0.07
337 0.07
338 0.07
339 0.06
340 0.06
341 0.06
342 0.05
343 0.06
344 0.06
345 0.06
346 0.06
347 0.06
348 0.06
349 0.06
350 0.07
351 0.08
352 0.09
353 0.1
354 0.1
355 0.1
356 0.12
357 0.15
358 0.19
359 0.22
360 0.22
361 0.23
362 0.22
363 0.23
364 0.22
365 0.2
366 0.19
367 0.14
368 0.13
369 0.12
370 0.12
371 0.14
372 0.14
373 0.14
374 0.09
375 0.09
376 0.09
377 0.08
378 0.09
379 0.07
380 0.06
381 0.06
382 0.05
383 0.05
384 0.06
385 0.08
386 0.07
387 0.08
388 0.11
389 0.12
390 0.13
391 0.14
392 0.15
393 0.14
394 0.16
395 0.17
396 0.2
397 0.23
398 0.23
399 0.27
400 0.31
401 0.3
402 0.29
403 0.28
404 0.22
405 0.18
406 0.17
407 0.12
408 0.06
409 0.07
410 0.07
411 0.08
412 0.08
413 0.08
414 0.09
415 0.11
416 0.12
417 0.13
418 0.16
419 0.17
420 0.22
421 0.27
422 0.33
423 0.34
424 0.4
425 0.47
426 0.43
427 0.42
428 0.42
429 0.4
430 0.34
431 0.32
432 0.26
433 0.2
434 0.2
435 0.22
436 0.18
437 0.17
438 0.17
439 0.16
440 0.17
441 0.16
442 0.17
443 0.15
444 0.16
445 0.14
446 0.13
447 0.13
448 0.11
449 0.1
450 0.08
451 0.08
452 0.06
453 0.06
454 0.07
455 0.07
456 0.08
457 0.1
458 0.1
459 0.1
460 0.11
461 0.13
462 0.13
463 0.14
464 0.12
465 0.11
466 0.12
467 0.16
468 0.2
469 0.19
470 0.23
471 0.24
472 0.26
473 0.26
474 0.29
475 0.31
476 0.35
477 0.38
478 0.36
479 0.37
480 0.38
481 0.36
482 0.33
483 0.28
484 0.24
485 0.21
486 0.19
487 0.17
488 0.15
489 0.18
490 0.21
491 0.26
492 0.25
493 0.3
494 0.35
495 0.41
496 0.45
497 0.45
498 0.46
499 0.47
500 0.47
501 0.46
502 0.4
503 0.34
504 0.31
505 0.31
506 0.29
507 0.24
508 0.21
509 0.17
510 0.16
511 0.16
512 0.17
513 0.15
514 0.14
515 0.15
516 0.15
517 0.16
518 0.18
519 0.18
520 0.16
521 0.15
522 0.13
523 0.12
524 0.1
525 0.09
526 0.06
527 0.06
528 0.05
529 0.05
530 0.05
531 0.08
532 0.1
533 0.1
534 0.12
535 0.13
536 0.16
537 0.17
538 0.18
539 0.19
540 0.2
541 0.22
542 0.27
543 0.29
544 0.27
545 0.29
546 0.34
547 0.31
548 0.34
549 0.32
550 0.27
551 0.26
552 0.26
553 0.27
554 0.23
555 0.22
556 0.25
557 0.24
558 0.25
559 0.28
560 0.28
561 0.25
562 0.24
563 0.23
564 0.16
565 0.18
566 0.17
567 0.12
568 0.15
569 0.16
570 0.16
571 0.19
572 0.22
573 0.22
574 0.23
575 0.27
576 0.29
577 0.36
578 0.4
579 0.41
580 0.42
581 0.42
582 0.41
583 0.35
584 0.32
585 0.26
586 0.2
587 0.18
588 0.16
589 0.19
590 0.19
591 0.19
592 0.19
593 0.18
594 0.18
595 0.21
596 0.19
597 0.13
598 0.12
599 0.11
600 0.09
601 0.09
602 0.1
603 0.09
604 0.09
605 0.09
606 0.11
607 0.11
608 0.14
609 0.16
610 0.15
611 0.13
612 0.15
613 0.14
614 0.13
615 0.15
616 0.12
617 0.11
618 0.12
619 0.12
620 0.1
621 0.13
622 0.13
623 0.11
624 0.1
625 0.09
626 0.08
627 0.09
628 0.09
629 0.08
630 0.11
631 0.13
632 0.15
633 0.16
634 0.2
635 0.22
636 0.23
637 0.25
638 0.24
639 0.26
640 0.33
641 0.4
642 0.43
643 0.43
644 0.47
645 0.52
646 0.51
647 0.51
648 0.47
649 0.41
650 0.38
651 0.38
652 0.35
653 0.36
654 0.4
655 0.44
656 0.41
657 0.43
658 0.41
659 0.43
660 0.43
661 0.34
662 0.3
663 0.25
664 0.23
665 0.21
666 0.2
667 0.16
668 0.15
669 0.16
670 0.14
671 0.12
672 0.19
673 0.21
674 0.25
675 0.27
676 0.26
677 0.26
678 0.26
679 0.27
680 0.2
681 0.18
682 0.12
683 0.13
684 0.13
685 0.14
686 0.18
687 0.16
688 0.15
689 0.18
690 0.19
691 0.2
692 0.22
693 0.25
694 0.23
695 0.24
696 0.26
697 0.23
698 0.25
699 0.26
700 0.24
701 0.29
702 0.28
703 0.3
704 0.35
705 0.37
706 0.4
707 0.42
708 0.46
709 0.47
710 0.55
711 0.58
712 0.59
713 0.58
714 0.54
715 0.53
716 0.53
717 0.5
718 0.47
719 0.47
720 0.41
721 0.41
722 0.4
723 0.35
724 0.3
725 0.24