Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C6HRA5

Protein Details
Accession C6HRA5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
8-48NDDSPKSQRKSRAHTLTRVRNNQRRCRERRRQYIAALEQRVHydrophilic
69-88LMECGSRRRHHPHHANQLAEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 14, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011012  Longin-like_dom_sf  
IPR007233  TRAPPC  
Gene Ontology GO:0005783  C:endoplasmic reticulum  
GO:0005794  C:Golgi apparatus  
GO:0030008  C:TRAPP complex  
GO:0048193  P:Golgi vesicle transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF04099  Sybindin  
Amino Acid Sequences MSSPTSNNDDSPKSQRKSRAHTLTRVRNNQRRCRERRRQYIAALEQRVEETGRLLEEARAEIDSLKSQLMECGSRRRHHPHHANQLAEGESAVSDSGGGRGGGDSIDAAAWMMPLGQQGGYRQVSGQIEEVGELPALLPGPLPAPPEREDDWPATTSHQQTSDIEYNATPNMLALQQLDNTHPRQPSSSSLALANQRETAVCGSRLPNAVNSDTTLATSTNAPSPLSTLWTPTLTALQLEGLILPDIPDTSNSDYTVSPADESTTPCSQAFIFISQQNFKGLDASSIERWLCRGFRQATEPREGCRVENTLLLQLLDFLFSYESLDSAIRSSWGKSGGFTTSRRGAPKVLESLAPRNLCLCCINILPIQRPNRPCFRYLPPHPLLRAPNKLYCRESFVKQTCTLRTNPTTTPSSVPSAGTAIPSHTHVHSSSSSISSPLNPSTTPTVTSSSLPSNTTVPNPTQPITGIEVLETDKFRLTCFQTVTGTKFLLFTDPLMAGVDVVMRKIYELYADYVMKNPFYQLEMPVRCEAFDRHVAGWVKGRG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.64
3 0.68
4 0.72
5 0.78
6 0.78
7 0.76
8 0.81
9 0.84
10 0.85
11 0.86
12 0.88
13 0.88
14 0.85
15 0.88
16 0.89
17 0.89
18 0.89
19 0.89
20 0.89
21 0.9
22 0.92
23 0.93
24 0.92
25 0.88
26 0.84
27 0.84
28 0.83
29 0.81
30 0.74
31 0.63
32 0.55
33 0.48
34 0.42
35 0.33
36 0.23
37 0.15
38 0.13
39 0.13
40 0.13
41 0.13
42 0.13
43 0.14
44 0.15
45 0.14
46 0.13
47 0.13
48 0.13
49 0.14
50 0.15
51 0.14
52 0.14
53 0.13
54 0.13
55 0.15
56 0.17
57 0.2
58 0.21
59 0.3
60 0.36
61 0.41
62 0.48
63 0.55
64 0.6
65 0.66
66 0.74
67 0.74
68 0.79
69 0.81
70 0.75
71 0.67
72 0.61
73 0.52
74 0.41
75 0.3
76 0.19
77 0.12
78 0.11
79 0.09
80 0.06
81 0.04
82 0.05
83 0.05
84 0.06
85 0.06
86 0.06
87 0.06
88 0.06
89 0.06
90 0.06
91 0.05
92 0.05
93 0.05
94 0.04
95 0.04
96 0.04
97 0.04
98 0.04
99 0.04
100 0.04
101 0.04
102 0.05
103 0.06
104 0.07
105 0.08
106 0.15
107 0.16
108 0.16
109 0.16
110 0.2
111 0.2
112 0.21
113 0.21
114 0.15
115 0.14
116 0.14
117 0.15
118 0.1
119 0.09
120 0.07
121 0.06
122 0.06
123 0.06
124 0.05
125 0.05
126 0.04
127 0.05
128 0.07
129 0.1
130 0.1
131 0.14
132 0.16
133 0.21
134 0.23
135 0.26
136 0.28
137 0.28
138 0.29
139 0.27
140 0.25
141 0.24
142 0.26
143 0.25
144 0.24
145 0.24
146 0.23
147 0.23
148 0.29
149 0.31
150 0.27
151 0.25
152 0.22
153 0.22
154 0.2
155 0.19
156 0.12
157 0.07
158 0.07
159 0.07
160 0.07
161 0.07
162 0.08
163 0.09
164 0.11
165 0.13
166 0.15
167 0.17
168 0.22
169 0.21
170 0.21
171 0.21
172 0.23
173 0.25
174 0.28
175 0.28
176 0.24
177 0.24
178 0.26
179 0.29
180 0.28
181 0.25
182 0.19
183 0.18
184 0.16
185 0.17
186 0.15
187 0.12
188 0.12
189 0.13
190 0.13
191 0.16
192 0.18
193 0.17
194 0.19
195 0.19
196 0.2
197 0.18
198 0.18
199 0.17
200 0.15
201 0.14
202 0.12
203 0.09
204 0.09
205 0.09
206 0.09
207 0.1
208 0.11
209 0.1
210 0.09
211 0.11
212 0.11
213 0.13
214 0.12
215 0.12
216 0.12
217 0.13
218 0.13
219 0.12
220 0.13
221 0.09
222 0.09
223 0.07
224 0.06
225 0.06
226 0.05
227 0.05
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.05
236 0.07
237 0.1
238 0.11
239 0.11
240 0.12
241 0.12
242 0.13
243 0.14
244 0.12
245 0.09
246 0.08
247 0.09
248 0.09
249 0.1
250 0.14
251 0.13
252 0.14
253 0.14
254 0.14
255 0.13
256 0.13
257 0.13
258 0.11
259 0.12
260 0.13
261 0.15
262 0.15
263 0.16
264 0.16
265 0.15
266 0.13
267 0.12
268 0.1
269 0.1
270 0.1
271 0.12
272 0.11
273 0.12
274 0.12
275 0.11
276 0.12
277 0.12
278 0.11
279 0.11
280 0.18
281 0.18
282 0.2
283 0.28
284 0.33
285 0.35
286 0.41
287 0.41
288 0.35
289 0.38
290 0.36
291 0.29
292 0.25
293 0.25
294 0.18
295 0.19
296 0.18
297 0.15
298 0.15
299 0.14
300 0.11
301 0.09
302 0.08
303 0.07
304 0.06
305 0.05
306 0.05
307 0.05
308 0.06
309 0.05
310 0.05
311 0.06
312 0.06
313 0.06
314 0.06
315 0.06
316 0.07
317 0.07
318 0.08
319 0.09
320 0.12
321 0.12
322 0.12
323 0.14
324 0.16
325 0.19
326 0.2
327 0.22
328 0.25
329 0.28
330 0.3
331 0.29
332 0.28
333 0.27
334 0.3
335 0.29
336 0.25
337 0.25
338 0.25
339 0.28
340 0.32
341 0.3
342 0.25
343 0.24
344 0.23
345 0.21
346 0.2
347 0.16
348 0.12
349 0.13
350 0.15
351 0.15
352 0.18
353 0.2
354 0.26
355 0.31
356 0.36
357 0.4
358 0.43
359 0.5
360 0.49
361 0.48
362 0.47
363 0.5
364 0.53
365 0.55
366 0.6
367 0.54
368 0.56
369 0.55
370 0.55
371 0.53
372 0.5
373 0.53
374 0.47
375 0.5
376 0.5
377 0.54
378 0.52
379 0.46
380 0.47
381 0.43
382 0.42
383 0.45
384 0.46
385 0.46
386 0.46
387 0.5
388 0.47
389 0.46
390 0.46
391 0.43
392 0.42
393 0.42
394 0.39
395 0.39
396 0.38
397 0.37
398 0.37
399 0.32
400 0.31
401 0.28
402 0.26
403 0.22
404 0.2
405 0.18
406 0.17
407 0.14
408 0.12
409 0.12
410 0.14
411 0.16
412 0.15
413 0.16
414 0.15
415 0.19
416 0.18
417 0.2
418 0.2
419 0.2
420 0.2
421 0.19
422 0.19
423 0.18
424 0.2
425 0.2
426 0.19
427 0.17
428 0.2
429 0.24
430 0.25
431 0.24
432 0.23
433 0.24
434 0.24
435 0.25
436 0.26
437 0.24
438 0.25
439 0.24
440 0.23
441 0.23
442 0.23
443 0.25
444 0.25
445 0.24
446 0.28
447 0.3
448 0.3
449 0.28
450 0.27
451 0.26
452 0.28
453 0.26
454 0.21
455 0.17
456 0.17
457 0.18
458 0.2
459 0.18
460 0.14
461 0.16
462 0.16
463 0.17
464 0.22
465 0.25
466 0.28
467 0.3
468 0.32
469 0.34
470 0.38
471 0.41
472 0.38
473 0.34
474 0.28
475 0.26
476 0.23
477 0.21
478 0.18
479 0.15
480 0.15
481 0.15
482 0.15
483 0.15
484 0.14
485 0.11
486 0.1
487 0.13
488 0.1
489 0.1
490 0.1
491 0.09
492 0.09
493 0.1
494 0.1
495 0.1
496 0.12
497 0.15
498 0.19
499 0.21
500 0.22
501 0.26
502 0.27
503 0.26
504 0.24
505 0.22
506 0.19
507 0.21
508 0.22
509 0.23
510 0.31
511 0.33
512 0.37
513 0.4
514 0.39
515 0.36
516 0.36
517 0.34
518 0.3
519 0.33
520 0.33
521 0.29
522 0.37
523 0.39
524 0.38