Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C6HGN1

Protein Details
Accession C6HGN1    Localization Confidence High Confidence Score 15.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-36SSGMVTARKSMKRRKKLCDSESDTVSHydrophilic
39-72SQSASSNQKRANKTKHRLEKLRKLTRKLLNHPDQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
22-25KRRK
48-62RANKTKHRLEKLRKL
Subcellular Location(s) nucl 13.5, mito_nucl 12, mito 9.5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011907  RNase_III  
IPR000999  RNase_III_dom  
IPR036389  RNase_III_sf  
Gene Ontology GO:0004525  F:ribonuclease III activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF00636  Ribonuclease_3  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50142  RNASE_3_2  
CDD cd00593  RIBOc  
Amino Acid Sequences MDTKRKFELESSGMVTARKSMKRRKKLCDSESDTVSTNSQSASSNQKRANKTKHRLEKLRKLTRKLLNHPDQVQEALDGSEPDLVVVLAALAKALSPEKPTPESLYYSQSPRSRLRSSSLELHAQSKLPPLPPVLDKQLQTAMFTHEGVHNPNTASLPEKNYERMELLGDAYIEIIATRLVWDTFPRLPAGRLSQIRELLVKNETLAEYTSLYGLDQKLQVPPNIRDQVKTWTKIKGDLFEAYVAAVILSNRDNGVQLAEDWLTQLWIPKLEQIEKDKPVLRYKEDLAKLVMDKGIKLSYLDEKQSICHSGGLQTFFVGVYLTGWGHKNECLGSGTGFSKVIAGNEAARKALEHPVTHRAAAAKKAYHAAKKEEAAGIRL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.3
3 0.28
4 0.32
5 0.35
6 0.4
7 0.49
8 0.59
9 0.69
10 0.79
11 0.82
12 0.86
13 0.89
14 0.88
15 0.89
16 0.86
17 0.82
18 0.76
19 0.68
20 0.58
21 0.49
22 0.42
23 0.32
24 0.23
25 0.17
26 0.15
27 0.14
28 0.15
29 0.25
30 0.31
31 0.38
32 0.44
33 0.52
34 0.59
35 0.67
36 0.75
37 0.76
38 0.79
39 0.81
40 0.86
41 0.88
42 0.9
43 0.91
44 0.91
45 0.91
46 0.92
47 0.89
48 0.85
49 0.84
50 0.83
51 0.82
52 0.81
53 0.8
54 0.78
55 0.78
56 0.74
57 0.68
58 0.6
59 0.52
60 0.42
61 0.32
62 0.23
63 0.17
64 0.14
65 0.1
66 0.09
67 0.09
68 0.09
69 0.08
70 0.07
71 0.06
72 0.05
73 0.05
74 0.04
75 0.03
76 0.03
77 0.03
78 0.03
79 0.03
80 0.04
81 0.05
82 0.07
83 0.11
84 0.14
85 0.18
86 0.21
87 0.23
88 0.26
89 0.28
90 0.31
91 0.29
92 0.33
93 0.31
94 0.31
95 0.36
96 0.35
97 0.38
98 0.39
99 0.44
100 0.42
101 0.41
102 0.44
103 0.43
104 0.44
105 0.46
106 0.44
107 0.42
108 0.39
109 0.39
110 0.35
111 0.3
112 0.27
113 0.23
114 0.23
115 0.19
116 0.19
117 0.18
118 0.2
119 0.21
120 0.24
121 0.25
122 0.27
123 0.26
124 0.26
125 0.3
126 0.27
127 0.26
128 0.23
129 0.21
130 0.18
131 0.18
132 0.17
133 0.14
134 0.15
135 0.17
136 0.17
137 0.15
138 0.14
139 0.15
140 0.14
141 0.12
142 0.14
143 0.14
144 0.16
145 0.17
146 0.18
147 0.2
148 0.2
149 0.21
150 0.18
151 0.17
152 0.15
153 0.13
154 0.12
155 0.09
156 0.08
157 0.07
158 0.06
159 0.05
160 0.04
161 0.04
162 0.03
163 0.03
164 0.03
165 0.03
166 0.03
167 0.04
168 0.04
169 0.05
170 0.08
171 0.1
172 0.1
173 0.11
174 0.11
175 0.12
176 0.14
177 0.16
178 0.19
179 0.2
180 0.22
181 0.24
182 0.25
183 0.25
184 0.25
185 0.22
186 0.18
187 0.16
188 0.13
189 0.11
190 0.1
191 0.1
192 0.09
193 0.09
194 0.08
195 0.07
196 0.07
197 0.07
198 0.06
199 0.06
200 0.08
201 0.08
202 0.08
203 0.09
204 0.1
205 0.13
206 0.15
207 0.17
208 0.2
209 0.22
210 0.29
211 0.34
212 0.34
213 0.31
214 0.32
215 0.39
216 0.4
217 0.43
218 0.36
219 0.35
220 0.36
221 0.41
222 0.4
223 0.34
224 0.31
225 0.28
226 0.27
227 0.21
228 0.21
229 0.14
230 0.13
231 0.09
232 0.06
233 0.05
234 0.04
235 0.05
236 0.05
237 0.06
238 0.06
239 0.06
240 0.07
241 0.07
242 0.08
243 0.07
244 0.07
245 0.08
246 0.08
247 0.08
248 0.08
249 0.08
250 0.07
251 0.07
252 0.1
253 0.08
254 0.1
255 0.1
256 0.13
257 0.17
258 0.2
259 0.25
260 0.3
261 0.35
262 0.36
263 0.41
264 0.43
265 0.44
266 0.48
267 0.48
268 0.44
269 0.42
270 0.44
271 0.48
272 0.45
273 0.43
274 0.36
275 0.34
276 0.31
277 0.28
278 0.27
279 0.18
280 0.16
281 0.17
282 0.16
283 0.13
284 0.13
285 0.14
286 0.19
287 0.22
288 0.24
289 0.25
290 0.24
291 0.26
292 0.28
293 0.28
294 0.22
295 0.2
296 0.18
297 0.21
298 0.24
299 0.25
300 0.22
301 0.19
302 0.18
303 0.16
304 0.16
305 0.11
306 0.07
307 0.05
308 0.07
309 0.07
310 0.09
311 0.11
312 0.12
313 0.13
314 0.15
315 0.17
316 0.16
317 0.17
318 0.17
319 0.17
320 0.16
321 0.18
322 0.18
323 0.17
324 0.17
325 0.15
326 0.15
327 0.14
328 0.14
329 0.13
330 0.13
331 0.17
332 0.21
333 0.22
334 0.21
335 0.2
336 0.2
337 0.21
338 0.28
339 0.28
340 0.26
341 0.3
342 0.38
343 0.41
344 0.4
345 0.39
346 0.36
347 0.36
348 0.39
349 0.41
350 0.36
351 0.36
352 0.43
353 0.48
354 0.5
355 0.51
356 0.52
357 0.52
358 0.52
359 0.53
360 0.51