Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C6HM39

Protein Details
Accession C6HM39    Localization Confidence Low Confidence Score 6.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
240-260VYARKCFPRRTEKLKASKSKGHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 10.5, cyto_nucl 10, mito 8, nucl 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR026739  AP_beta  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR002553  Clathrin/coatomer_adapt-like_N  
Gene Ontology GO:0030117  C:membrane coat  
GO:0006886  P:intracellular protein transport  
GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF01602  Adaptin_N  
Amino Acid Sequences MLSTARELTVEAAHNASSSRGAFKSTSPYRHTSFSQIKKLLDSRNDRDILDGLRKVIALMYRAEPCLPFFSSVVKNVANPNIEVKKLVYIYLLHHAESEPDLALLSINAIQKSLTDQNPQVRAMALRTMSGIRVPVINQIVSLAIKRGCGDMSPHVRKAAALAIPKCYNLDPSTLPQLLEYLSTLLGDSQYFVVGPAVSSFLEVCPDRIDLVHKHYRNLVRKLVDMDEWGQLATLRLMVVYARKCFPRRTEKLKASKSKGFYEEEDEGNADAEESGEEIQVIDPDLDLLLRACKPLLQSRNAAVIVSVVRLFLYAGTNAYLDSAVGPLVALLRGPQDIQYVALYNIICVALIDPNPFLKNLNSPIPTLRTSP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.16
3 0.15
4 0.14
5 0.13
6 0.16
7 0.16
8 0.19
9 0.2
10 0.22
11 0.32
12 0.36
13 0.43
14 0.44
15 0.49
16 0.5
17 0.53
18 0.53
19 0.53
20 0.55
21 0.56
22 0.6
23 0.59
24 0.57
25 0.59
26 0.63
27 0.61
28 0.6
29 0.6
30 0.56
31 0.6
32 0.6
33 0.54
34 0.5
35 0.45
36 0.4
37 0.37
38 0.33
39 0.25
40 0.24
41 0.24
42 0.22
43 0.21
44 0.19
45 0.14
46 0.15
47 0.18
48 0.19
49 0.2
50 0.21
51 0.2
52 0.19
53 0.21
54 0.2
55 0.18
56 0.16
57 0.21
58 0.23
59 0.26
60 0.27
61 0.24
62 0.25
63 0.27
64 0.31
65 0.27
66 0.24
67 0.29
68 0.28
69 0.28
70 0.27
71 0.24
72 0.24
73 0.23
74 0.22
75 0.17
76 0.15
77 0.17
78 0.24
79 0.24
80 0.2
81 0.2
82 0.2
83 0.19
84 0.19
85 0.17
86 0.09
87 0.08
88 0.08
89 0.07
90 0.07
91 0.05
92 0.05
93 0.08
94 0.1
95 0.1
96 0.1
97 0.1
98 0.1
99 0.15
100 0.19
101 0.19
102 0.21
103 0.25
104 0.31
105 0.35
106 0.35
107 0.31
108 0.26
109 0.24
110 0.21
111 0.21
112 0.15
113 0.12
114 0.13
115 0.13
116 0.12
117 0.12
118 0.11
119 0.08
120 0.09
121 0.09
122 0.12
123 0.13
124 0.12
125 0.12
126 0.11
127 0.12
128 0.11
129 0.11
130 0.09
131 0.08
132 0.09
133 0.09
134 0.09
135 0.09
136 0.09
137 0.11
138 0.17
139 0.26
140 0.3
141 0.3
142 0.3
143 0.3
144 0.29
145 0.28
146 0.25
147 0.18
148 0.19
149 0.19
150 0.23
151 0.23
152 0.23
153 0.23
154 0.19
155 0.18
156 0.14
157 0.16
158 0.13
159 0.15
160 0.2
161 0.19
162 0.19
163 0.16
164 0.16
165 0.13
166 0.12
167 0.1
168 0.06
169 0.05
170 0.05
171 0.05
172 0.04
173 0.05
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.04
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.07
190 0.07
191 0.08
192 0.08
193 0.08
194 0.08
195 0.08
196 0.12
197 0.11
198 0.19
199 0.26
200 0.26
201 0.27
202 0.33
203 0.41
204 0.45
205 0.49
206 0.47
207 0.41
208 0.42
209 0.43
210 0.39
211 0.31
212 0.25
213 0.22
214 0.17
215 0.15
216 0.13
217 0.11
218 0.09
219 0.09
220 0.07
221 0.06
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.05
226 0.1
227 0.12
228 0.14
229 0.16
230 0.21
231 0.24
232 0.29
233 0.37
234 0.43
235 0.48
236 0.55
237 0.63
238 0.68
239 0.76
240 0.81
241 0.82
242 0.78
243 0.77
244 0.72
245 0.67
246 0.61
247 0.54
248 0.46
249 0.43
250 0.39
251 0.33
252 0.3
253 0.25
254 0.21
255 0.18
256 0.16
257 0.1
258 0.06
259 0.06
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.05
268 0.06
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.07
277 0.08
278 0.09
279 0.09
280 0.1
281 0.14
282 0.23
283 0.29
284 0.3
285 0.33
286 0.36
287 0.42
288 0.4
289 0.37
290 0.27
291 0.23
292 0.19
293 0.17
294 0.15
295 0.08
296 0.08
297 0.08
298 0.08
299 0.07
300 0.09
301 0.08
302 0.09
303 0.09
304 0.1
305 0.09
306 0.1
307 0.09
308 0.07
309 0.07
310 0.06
311 0.05
312 0.05
313 0.05
314 0.04
315 0.05
316 0.05
317 0.05
318 0.05
319 0.07
320 0.08
321 0.09
322 0.1
323 0.11
324 0.12
325 0.13
326 0.14
327 0.14
328 0.14
329 0.17
330 0.15
331 0.13
332 0.14
333 0.12
334 0.11
335 0.09
336 0.1
337 0.1
338 0.12
339 0.14
340 0.14
341 0.17
342 0.18
343 0.19
344 0.2
345 0.19
346 0.24
347 0.28
348 0.35
349 0.34
350 0.35
351 0.4
352 0.43