FuNGI

C6HKU2

Protein Details

Accession

C6HKU2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
60-87	ERIRRGAESKYQARRRRDKRLEVKIGHG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
69-79	KYQARRRRDKR

Subcellular Location(s)

mito 11, nucl 10.5, cyto_nucl 8, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR020103 PsdUridine_synth_cat_dom_sf IPR002501 PsdUridine_synth_N IPR014780 tRNA_psdUridine_synth_TruB
Gene Ontology	GO:0009982 F:pseudouridine synthase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0001522 P:pseudouridine synthesis GO:0008033 P:tRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF01509 TruB_N

Amino Acid Sequences

MTFRFRFRTRDFPVRMSDNRNLEGVFAVHKPPGISSAEVLRNLQQHFTPSQFFRPWIETERIRRGAESKYQARRRRDKRLEVKIGHGGTLDPMATGVLIAGVGRGTKELNNFLACTKSYEAVVLFGAATDTYDSVGKVVSRAPYEHITRDKVEKALENFRGKILQRPSIFSALRVQGKKLYEYAREGIEPPVEILKRPVEVTKLEILDWYEGGTHDYVWPTEEASNMEKSVAQKMLSKGSSSSGPSTTDRTTSAPSTTEEEQQNATAQPEEGSHGIKRKLSASPTPEEERKFSPSTKRPKPPVDSTADDSLTNDASITTDPIISNAVSATSKPPPPPPAVKLSMTVSSGFYVRSLAHDLGLALDSNAIMSSLVRTRQADFTLEPEKVLEYRDLEAGEEVWGPKLQSFLDEWMEKKKDGAGGKTDKGVKKGSNKEDGEREVVDREVGVQSD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.68
2	0.67
3	0.64
4	0.64
5	0.59
6	0.56
7	0.52
8	0.44
9	0.37
10	0.32
11	0.26
12	0.21
13	0.17
14	0.17
15	0.16
16	0.18
17	0.17
18	0.16
19	0.19
20	0.19
21	0.18
22	0.18
23	0.25
24	0.28
25	0.29
26	0.3
27	0.31
28	0.33
29	0.33
30	0.33
31	0.27
32	0.26
33	0.28
34	0.3
35	0.32
36	0.3
37	0.36
38	0.36
39	0.37
40	0.36
41	0.37
42	0.38
43	0.38
44	0.42
45	0.42
46	0.47
47	0.55
48	0.57
49	0.54
50	0.51
51	0.49
52	0.48
53	0.5
54	0.51
55	0.5
56	0.55
57	0.64
58	0.71
59	0.78
60	0.82
61	0.83
62	0.85
63	0.86
64	0.87
65	0.87
66	0.9
67	0.9
68	0.82
69	0.79
70	0.75
71	0.65
72	0.55
73	0.44
74	0.33
75	0.24
76	0.22
77	0.16
78	0.08
79	0.07
80	0.06
81	0.06
82	0.05
83	0.04
84	0.03
85	0.03
86	0.03
87	0.03
88	0.03
89	0.04
90	0.04
91	0.05
92	0.06
93	0.08
94	0.11
95	0.14
96	0.17
97	0.18
98	0.19
99	0.19
100	0.21
101	0.19
102	0.2
103	0.19
104	0.17
105	0.15
106	0.16
107	0.15
108	0.13
109	0.13
110	0.1
111	0.07
112	0.06
113	0.07
114	0.05
115	0.05
116	0.04
117	0.05
118	0.05
119	0.06
120	0.06
121	0.06
122	0.07
123	0.06
124	0.07
125	0.09
126	0.12
127	0.13
128	0.14
129	0.17
130	0.21
131	0.24
132	0.28
133	0.3
134	0.31
135	0.31
136	0.35
137	0.33
138	0.3
139	0.3
140	0.29
141	0.29
142	0.34
143	0.39
144	0.38
145	0.36
146	0.35
147	0.38
148	0.34
149	0.37
150	0.33
151	0.34
152	0.31
153	0.34
154	0.37
155	0.38
156	0.38
157	0.32
158	0.32
159	0.3
160	0.35
161	0.32
162	0.3
163	0.28
164	0.3
165	0.3
166	0.28
167	0.27
168	0.23
169	0.26
170	0.27
171	0.23
172	0.23
173	0.23
174	0.2
175	0.17
176	0.14
177	0.11
178	0.14
179	0.13
180	0.12
181	0.13
182	0.13
183	0.13
184	0.14
185	0.14
186	0.12
187	0.13
188	0.16
189	0.17
190	0.17
191	0.16
192	0.16
193	0.15
194	0.13
195	0.13
196	0.1
197	0.06
198	0.06
199	0.07
200	0.06
201	0.06
202	0.06
203	0.07
204	0.07
205	0.07
206	0.07
207	0.07
208	0.07
209	0.08
210	0.09
211	0.1
212	0.11
213	0.1
214	0.1
215	0.11
216	0.11
217	0.14
218	0.13
219	0.12
220	0.15
221	0.17
222	0.21
223	0.2
224	0.2
225	0.17
226	0.18
227	0.19
228	0.17
229	0.17
230	0.13
231	0.15
232	0.16
233	0.19
234	0.18
235	0.17
236	0.17
237	0.17
238	0.19
239	0.17
240	0.17
241	0.15
242	0.15
243	0.18
244	0.18
245	0.22
246	0.2
247	0.21
248	0.2
249	0.19
250	0.19
251	0.16
252	0.15
253	0.1
254	0.09
255	0.08
256	0.08
257	0.09
258	0.09
259	0.1
260	0.11
261	0.16
262	0.18
263	0.18
264	0.19
265	0.2
266	0.23
267	0.26
268	0.3
269	0.3
270	0.32
271	0.35
272	0.39
273	0.4
274	0.38
275	0.37
276	0.34
277	0.35
278	0.34
279	0.33
280	0.38
281	0.42
282	0.51
283	0.58
284	0.64
285	0.67
286	0.73
287	0.76
288	0.74
289	0.72
290	0.68
291	0.63
292	0.58
293	0.55
294	0.47
295	0.4
296	0.33
297	0.27
298	0.2
299	0.16
300	0.12
301	0.07
302	0.07
303	0.07
304	0.08
305	0.07
306	0.08
307	0.08
308	0.08
309	0.09
310	0.08
311	0.08
312	0.07
313	0.08
314	0.07
315	0.08
316	0.11
317	0.15
318	0.18
319	0.21
320	0.26
321	0.29
322	0.35
323	0.4
324	0.4
325	0.43
326	0.45
327	0.44
328	0.41
329	0.4
330	0.37
331	0.32
332	0.29
333	0.22
334	0.18
335	0.17
336	0.15
337	0.12
338	0.1
339	0.09
340	0.11
341	0.14
342	0.14
343	0.13
344	0.14
345	0.14
346	0.13
347	0.14
348	0.11
349	0.07
350	0.07
351	0.06
352	0.06
353	0.06
354	0.05
355	0.04
356	0.04
357	0.07
358	0.1
359	0.12
360	0.15
361	0.17
362	0.2
363	0.24
364	0.25
365	0.26
366	0.23
367	0.27
368	0.29
369	0.28
370	0.25
371	0.22
372	0.22
373	0.19
374	0.2
375	0.18
376	0.15
377	0.17
378	0.18
379	0.18
380	0.17
381	0.17
382	0.16
383	0.14
384	0.13
385	0.12
386	0.12
387	0.13
388	0.12
389	0.12
390	0.14
391	0.12
392	0.13
393	0.15
394	0.17
395	0.22
396	0.24
397	0.25
398	0.33
399	0.36
400	0.34
401	0.33
402	0.32
403	0.32
404	0.35
405	0.39
406	0.39
407	0.44
408	0.46
409	0.52
410	0.56
411	0.54
412	0.53
413	0.54
414	0.51
415	0.54
416	0.62
417	0.63
418	0.65
419	0.65
420	0.68
421	0.7
422	0.67
423	0.61
424	0.53
425	0.47
426	0.39
427	0.36
428	0.29
429	0.21
430	0.2

C6HKU2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer