Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C6HD90

Protein Details
Accession C6HD90    Localization Confidence Low Confidence Score 5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
111-134ALGHFAFRRRQQRKLERVRLLQDTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) plas 24, E.R. 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032190  NPC1_N  
IPR003392  Ptc/Disp  
IPR000731  SSD  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0015918  P:sterol transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF16414  NPC1_N  
PF02460  Patched  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50156  SSD  
Amino Acid Sequences MDFIGGGAKNYSLFLKFLGDKKLLGSPFQINFVTGSKGHENLGMRPLPEIPKTCSDSDEKYRCSCVDCPAVCPQLPALTEESYCHVGYLPCLSFSVIVIYAVFLLLLVAGALGHFAFRRRQQRKLERVRLLQDTSPSDDEDEGDLIDDAGILDRPQTSYRLNSIFDAMFNRLGGACARFPALTITTSIILCGLLSLGWLRFAVEIDPVKLWVSPDSAAAREKAFFDENFGPFFRAEQAFLVNDTHPSGPGPVLSYETLSWWFDVESRVRRMISLDKGLSLDDICFNPTGKACVVQSLTGYFGGSFANVDPNTWETHLKHCTESPGSVECLPDFQQPLKPEMILGGYGQTDNVLNATALVVTWVVNNHAPGTIAEAGAIDWEGSLKRVLEVVQEEATEHGLRVSFNTEISLEQELNKSTNTDAKIVVISYVIMFVYASLALGSTTLTWKSILSNPANSLVQSKFTLGIVGILIVLMSVSASVGIFSAAGIKVTLIIAEVIPFLVLAIGVDNIFLIVHEFERVNGNHPDEEIDERIARSLGRMGPSILLSATTETIAFAMGAFVGMPAVKNFAAYAAGAVLINALLQVTMFVSVLALNQRRVESLRADCLPCLTVRKANSSSIPGGQPYDHAEEGALQRFIRKIYATRLLQKRTKFLVVTVFLGIFTAGLALLPTVALGLDQRIAIPSDSYLIDYFNDMYDYFGSGPPVYFVTRDVNITTRNHQKQLCGRFSTCEEYSLALSSTDPSVPMNPPWNISLHGMPEGSEFIHYAQKWLQSPTDETCPLGGLAPYSNALVLDSKHVMTNASHFRTSHTPLRSQKDFIKAYASARRIADGISQEHGIDVFPYSKFYIFFDQYTSIIRLTGTLLGCATAIIFVVTSIFVGSIATGAVVTATVIMTVVDIIGTMAVANVSLNAVSLVNLIICVGIAFEFCAHVARAFMFPSSPLLEQARGKFRHRTARSWVALVNVGSSVFTGITVTKLLGVCVLAFTRSKIFEIYYFRIWLALVIFAASHALIFLPVALSFLGGDGYCDPQTDGGLEEDLAARRYRSLLPDDYDSEDDS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.18
3 0.22
4 0.27
5 0.32
6 0.32
7 0.31
8 0.33
9 0.39
10 0.34
11 0.31
12 0.31
13 0.32
14 0.32
15 0.36
16 0.33
17 0.27
18 0.28
19 0.28
20 0.27
21 0.2
22 0.24
23 0.23
24 0.24
25 0.24
26 0.27
27 0.28
28 0.28
29 0.35
30 0.32
31 0.28
32 0.29
33 0.32
34 0.32
35 0.36
36 0.36
37 0.34
38 0.39
39 0.43
40 0.43
41 0.42
42 0.43
43 0.45
44 0.51
45 0.54
46 0.51
47 0.49
48 0.52
49 0.5
50 0.5
51 0.45
52 0.42
53 0.44
54 0.4
55 0.41
56 0.45
57 0.49
58 0.44
59 0.42
60 0.36
61 0.31
62 0.31
63 0.29
64 0.24
65 0.21
66 0.22
67 0.22
68 0.24
69 0.22
70 0.21
71 0.19
72 0.18
73 0.16
74 0.17
75 0.23
76 0.2
77 0.17
78 0.18
79 0.18
80 0.17
81 0.17
82 0.18
83 0.12
84 0.11
85 0.1
86 0.1
87 0.09
88 0.09
89 0.08
90 0.04
91 0.04
92 0.03
93 0.03
94 0.03
95 0.02
96 0.02
97 0.02
98 0.03
99 0.03
100 0.04
101 0.05
102 0.08
103 0.14
104 0.22
105 0.34
106 0.39
107 0.48
108 0.59
109 0.69
110 0.78
111 0.83
112 0.86
113 0.84
114 0.86
115 0.83
116 0.79
117 0.72
118 0.64
119 0.58
120 0.51
121 0.47
122 0.41
123 0.35
124 0.3
125 0.27
126 0.25
127 0.21
128 0.17
129 0.12
130 0.11
131 0.1
132 0.09
133 0.08
134 0.07
135 0.05
136 0.05
137 0.06
138 0.05
139 0.06
140 0.07
141 0.09
142 0.11
143 0.14
144 0.16
145 0.2
146 0.25
147 0.28
148 0.29
149 0.28
150 0.3
151 0.27
152 0.26
153 0.25
154 0.22
155 0.19
156 0.18
157 0.17
158 0.14
159 0.14
160 0.14
161 0.14
162 0.12
163 0.12
164 0.14
165 0.13
166 0.13
167 0.16
168 0.15
169 0.13
170 0.14
171 0.15
172 0.15
173 0.15
174 0.15
175 0.11
176 0.1
177 0.09
178 0.07
179 0.05
180 0.03
181 0.04
182 0.05
183 0.05
184 0.06
185 0.06
186 0.07
187 0.07
188 0.08
189 0.08
190 0.12
191 0.13
192 0.14
193 0.15
194 0.15
195 0.15
196 0.15
197 0.15
198 0.12
199 0.13
200 0.12
201 0.15
202 0.16
203 0.18
204 0.18
205 0.19
206 0.18
207 0.18
208 0.18
209 0.18
210 0.19
211 0.17
212 0.22
213 0.26
214 0.26
215 0.27
216 0.27
217 0.25
218 0.22
219 0.23
220 0.21
221 0.16
222 0.16
223 0.15
224 0.16
225 0.15
226 0.17
227 0.18
228 0.14
229 0.14
230 0.15
231 0.14
232 0.12
233 0.12
234 0.12
235 0.1
236 0.11
237 0.12
238 0.1
239 0.12
240 0.12
241 0.13
242 0.12
243 0.13
244 0.15
245 0.13
246 0.13
247 0.1
248 0.1
249 0.1
250 0.13
251 0.18
252 0.22
253 0.25
254 0.28
255 0.28
256 0.28
257 0.3
258 0.33
259 0.33
260 0.33
261 0.3
262 0.28
263 0.29
264 0.28
265 0.26
266 0.19
267 0.15
268 0.1
269 0.1
270 0.1
271 0.11
272 0.11
273 0.12
274 0.12
275 0.14
276 0.12
277 0.14
278 0.13
279 0.17
280 0.17
281 0.16
282 0.16
283 0.15
284 0.16
285 0.13
286 0.13
287 0.09
288 0.08
289 0.07
290 0.07
291 0.06
292 0.05
293 0.11
294 0.11
295 0.11
296 0.12
297 0.13
298 0.15
299 0.16
300 0.19
301 0.14
302 0.21
303 0.26
304 0.27
305 0.28
306 0.27
307 0.31
308 0.3
309 0.29
310 0.25
311 0.22
312 0.23
313 0.22
314 0.21
315 0.16
316 0.16
317 0.17
318 0.17
319 0.16
320 0.16
321 0.2
322 0.2
323 0.23
324 0.22
325 0.2
326 0.17
327 0.17
328 0.16
329 0.11
330 0.1
331 0.08
332 0.07
333 0.07
334 0.07
335 0.07
336 0.06
337 0.06
338 0.06
339 0.05
340 0.04
341 0.04
342 0.05
343 0.04
344 0.04
345 0.04
346 0.04
347 0.04
348 0.04
349 0.05
350 0.06
351 0.07
352 0.08
353 0.08
354 0.08
355 0.08
356 0.08
357 0.12
358 0.11
359 0.1
360 0.1
361 0.09
362 0.09
363 0.09
364 0.09
365 0.04
366 0.03
367 0.04
368 0.04
369 0.04
370 0.05
371 0.05
372 0.06
373 0.07
374 0.07
375 0.09
376 0.1
377 0.12
378 0.12
379 0.12
380 0.12
381 0.11
382 0.13
383 0.1
384 0.09
385 0.07
386 0.07
387 0.07
388 0.08
389 0.09
390 0.08
391 0.08
392 0.09
393 0.09
394 0.08
395 0.1
396 0.11
397 0.09
398 0.1
399 0.12
400 0.12
401 0.12
402 0.12
403 0.11
404 0.1
405 0.14
406 0.15
407 0.15
408 0.14
409 0.14
410 0.14
411 0.13
412 0.13
413 0.08
414 0.07
415 0.05
416 0.06
417 0.04
418 0.04
419 0.04
420 0.03
421 0.04
422 0.03
423 0.03
424 0.03
425 0.03
426 0.03
427 0.03
428 0.03
429 0.03
430 0.05
431 0.05
432 0.05
433 0.06
434 0.06
435 0.08
436 0.12
437 0.17
438 0.18
439 0.2
440 0.21
441 0.23
442 0.23
443 0.21
444 0.2
445 0.15
446 0.15
447 0.14
448 0.13
449 0.11
450 0.11
451 0.11
452 0.08
453 0.08
454 0.06
455 0.05
456 0.04
457 0.03
458 0.03
459 0.03
460 0.03
461 0.02
462 0.02
463 0.01
464 0.01
465 0.02
466 0.02
467 0.02
468 0.02
469 0.02
470 0.02
471 0.02
472 0.04
473 0.04
474 0.04
475 0.04
476 0.04
477 0.04
478 0.04
479 0.04
480 0.03
481 0.03
482 0.03
483 0.04
484 0.04
485 0.03
486 0.03
487 0.03
488 0.03
489 0.02
490 0.02
491 0.02
492 0.02
493 0.03
494 0.03
495 0.03
496 0.03
497 0.03
498 0.03
499 0.03
500 0.03
501 0.03
502 0.03
503 0.05
504 0.05
505 0.05
506 0.09
507 0.1
508 0.13
509 0.15
510 0.16
511 0.15
512 0.15
513 0.16
514 0.13
515 0.15
516 0.12
517 0.11
518 0.1
519 0.1
520 0.1
521 0.09
522 0.08
523 0.07
524 0.09
525 0.1
526 0.11
527 0.11
528 0.11
529 0.12
530 0.12
531 0.12
532 0.09
533 0.07
534 0.06
535 0.06
536 0.06
537 0.05
538 0.05
539 0.04
540 0.05
541 0.04
542 0.04
543 0.03
544 0.03
545 0.03
546 0.03
547 0.02
548 0.02
549 0.02
550 0.02
551 0.03
552 0.03
553 0.05
554 0.05
555 0.05
556 0.05
557 0.05
558 0.05
559 0.05
560 0.05
561 0.04
562 0.04
563 0.04
564 0.04
565 0.03
566 0.03
567 0.03
568 0.03
569 0.02
570 0.02
571 0.02
572 0.02
573 0.02
574 0.03
575 0.03
576 0.03
577 0.03
578 0.03
579 0.04
580 0.08
581 0.1
582 0.1
583 0.11
584 0.12
585 0.13
586 0.14
587 0.16
588 0.16
589 0.17
590 0.2
591 0.21
592 0.21
593 0.2
594 0.2
595 0.19
596 0.15
597 0.17
598 0.14
599 0.16
600 0.17
601 0.23
602 0.24
603 0.26
604 0.27
605 0.26
606 0.26
607 0.25
608 0.24
609 0.18
610 0.17
611 0.15
612 0.15
613 0.14
614 0.16
615 0.14
616 0.13
617 0.12
618 0.14
619 0.15
620 0.16
621 0.14
622 0.1
623 0.12
624 0.13
625 0.13
626 0.12
627 0.12
628 0.12
629 0.17
630 0.26
631 0.27
632 0.35
633 0.42
634 0.47
635 0.51
636 0.51
637 0.5
638 0.45
639 0.46
640 0.38
641 0.32
642 0.32
643 0.29
644 0.28
645 0.23
646 0.2
647 0.16
648 0.16
649 0.14
650 0.07
651 0.05
652 0.03
653 0.02
654 0.02
655 0.02
656 0.02
657 0.02
658 0.02
659 0.02
660 0.02
661 0.02
662 0.02
663 0.02
664 0.03
665 0.04
666 0.04
667 0.04
668 0.05
669 0.06
670 0.06
671 0.06
672 0.06
673 0.07
674 0.08
675 0.09
676 0.08
677 0.08
678 0.08
679 0.09
680 0.09
681 0.07
682 0.08
683 0.07
684 0.08
685 0.07
686 0.08
687 0.09
688 0.09
689 0.1
690 0.09
691 0.09
692 0.09
693 0.1
694 0.1
695 0.09
696 0.1
697 0.12
698 0.13
699 0.14
700 0.15
701 0.16
702 0.19
703 0.21
704 0.25
705 0.32
706 0.35
707 0.39
708 0.4
709 0.43
710 0.48
711 0.55
712 0.55
713 0.5
714 0.47
715 0.44
716 0.46
717 0.46
718 0.38
719 0.31
720 0.25
721 0.21
722 0.21
723 0.19
724 0.16
725 0.1
726 0.1
727 0.09
728 0.09
729 0.08
730 0.08
731 0.08
732 0.1
733 0.11
734 0.14
735 0.19
736 0.18
737 0.2
738 0.21
739 0.21
740 0.21
741 0.21
742 0.21
743 0.16
744 0.17
745 0.16
746 0.15
747 0.14
748 0.13
749 0.11
750 0.1
751 0.08
752 0.08
753 0.14
754 0.13
755 0.15
756 0.16
757 0.2
758 0.22
759 0.24
760 0.24
761 0.21
762 0.25
763 0.26
764 0.3
765 0.26
766 0.24
767 0.22
768 0.21
769 0.19
770 0.16
771 0.13
772 0.08
773 0.08
774 0.08
775 0.09
776 0.08
777 0.08
778 0.07
779 0.07
780 0.08
781 0.08
782 0.1
783 0.11
784 0.12
785 0.12
786 0.13
787 0.13
788 0.13
789 0.2
790 0.24
791 0.26
792 0.27
793 0.27
794 0.31
795 0.35
796 0.4
797 0.4
798 0.36
799 0.41
800 0.47
801 0.55
802 0.55
803 0.53
804 0.53
805 0.55
806 0.53
807 0.45
808 0.43
809 0.37
810 0.39
811 0.43
812 0.39
813 0.34
814 0.32
815 0.32
816 0.27
817 0.26
818 0.25
819 0.21
820 0.21
821 0.19
822 0.19
823 0.17
824 0.17
825 0.16
826 0.12
827 0.09
828 0.08
829 0.09
830 0.08
831 0.11
832 0.12
833 0.13
834 0.13
835 0.16
836 0.21
837 0.21
838 0.22
839 0.23
840 0.24
841 0.23
842 0.26
843 0.25
844 0.18
845 0.16
846 0.15
847 0.13
848 0.12
849 0.16
850 0.13
851 0.12
852 0.12
853 0.12
854 0.12
855 0.11
856 0.09
857 0.05
858 0.04
859 0.04
860 0.04
861 0.03
862 0.04
863 0.04
864 0.04
865 0.04
866 0.04
867 0.04
868 0.04
869 0.04
870 0.04
871 0.04
872 0.04
873 0.03
874 0.03
875 0.03
876 0.03
877 0.03
878 0.03
879 0.03
880 0.03
881 0.03
882 0.03
883 0.04
884 0.04
885 0.03
886 0.03
887 0.03
888 0.03
889 0.03
890 0.03
891 0.03
892 0.03
893 0.03
894 0.03
895 0.03
896 0.03
897 0.04
898 0.04
899 0.04
900 0.05
901 0.05
902 0.05
903 0.06
904 0.06
905 0.05
906 0.05
907 0.05
908 0.04
909 0.04
910 0.04
911 0.04
912 0.04
913 0.04
914 0.04
915 0.05
916 0.05
917 0.06
918 0.08
919 0.08
920 0.08
921 0.09
922 0.1
923 0.12
924 0.12
925 0.12
926 0.11
927 0.11
928 0.14
929 0.16
930 0.15
931 0.17
932 0.19
933 0.23
934 0.28
935 0.34
936 0.4
937 0.41
938 0.45
939 0.5
940 0.55
941 0.62
942 0.62
943 0.62
944 0.62
945 0.67
946 0.66
947 0.6
948 0.54
949 0.46
950 0.45
951 0.38
952 0.3
953 0.2
954 0.17
955 0.14
956 0.13
957 0.11
958 0.07
959 0.07
960 0.06
961 0.06
962 0.08
963 0.08
964 0.08
965 0.11
966 0.11
967 0.11
968 0.11
969 0.11
970 0.1
971 0.12
972 0.12
973 0.11
974 0.11
975 0.13
976 0.17
977 0.18
978 0.19
979 0.19
980 0.2
981 0.24
982 0.31
983 0.34
984 0.34
985 0.34
986 0.33
987 0.32
988 0.29
989 0.25
990 0.18
991 0.14
992 0.1
993 0.09
994 0.09
995 0.08
996 0.09
997 0.07
998 0.06
999 0.05
1000 0.05
1001 0.05
1002 0.05
1003 0.05
1004 0.05
1005 0.05
1006 0.06
1007 0.06
1008 0.06
1009 0.06
1010 0.06
1011 0.07
1012 0.06
1013 0.08
1014 0.08
1015 0.12
1016 0.12
1017 0.13
1018 0.14
1019 0.13
1020 0.14
1021 0.14
1022 0.14
1023 0.11
1024 0.12
1025 0.11
1026 0.12
1027 0.14
1028 0.15
1029 0.16
1030 0.16
1031 0.15
1032 0.15
1033 0.19
1034 0.22
1035 0.24
1036 0.29
1037 0.33
1038 0.37
1039 0.42
1040 0.43
1041 0.45