Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C6HTC0

Protein Details
Accession C6HTC0    Localization Confidence High Confidence Score 22.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
149-173GDSPRSSGSRRTRSRHGRDYNSEDEHydrophilic
242-291DVIQRARSYHRSKSRRRTESLDRGRDRSRERRHRHRRRRSRSSSDSHVKTBasic
306-338VALARKKSQKQPGKSKNNSHDRRSRSRHRRGSGBasic
415-439ESESSERKEKNHRRRSRSRSMARSSHydrophilic
666-697SLSTWTSTPRPPSRKKSRTRSSSQPGRAPRTKHydrophilic
745-769HRHDRIPDRARQHQQQHPRYRNTTEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
251-282HRSKSRRRTESLDRGRDRSRERRHRHRRRRSR
309-353ARKKSQKQPGKSKNNSHDRRSRSRHRRGSGSSSNEDRAASHRNKR
369-388ERARSKSRSRKGEKSPGRIR
409-434KHKEKKESESSERKEKNHRRRSRSRS
676-693PPSRKKSRTRSSSQPGRA
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12, cyto 3.5, plas 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024436  DUF3824  
Pfam View protein in Pfam  
PF12868  DUF3824  
Amino Acid Sequences MYRRDEHPMSERELVIRRPHDRDSRYDYEYRRERDYDRESTIPNRIHSHPYGSSEQPPREEHHYHAQTIFINREHKPTIVKDVYRPSSYGTSRDDLDYQIVNRSEADENWALRSARDHREDDFYYTRSTREYDNGRHHRDEYEERYYYGDSPRSSGSRRTRSRHGRDYNSEDETTYSRRERHHHHDESPHHYKRHLAEGALVGVGAAELMRRKSKKDGDESGGLNRIGRDVGAGALGVVTADVIQRARSYHRSKSRRRTESLDRGRDRSRERRHRHRRRRSRSSSDSHVKTLAGLGLGAAAIAGAVALARKKSQKQPGKSKNNSHDRRSRSRHRRGSGSSSNEDRAASHRNKRTAEAGLAGAAVAGLIERARSKSRSRKGEKSPGRIRQGIPIAVAGLGSAAIANLYEKHKEKKESESSERKEKNHRRRSRSRSMARSSTYPDPSRSSPQLIERSSRRASHSRSRTRSHHYRDDGSRSGSSFSDRGHSHKNRTYAHDHDYSDSYEDGYEPAPYPPSPPSNGPNYYAQGSQFPPPPGAAPVPPPNVQPGPYNPADYPPPPGAAPQPPSNYPYPPPPGVDAYAPRSARGDENVSAVPTLNPALSYGQRHTSSEGLTMTSPGQIPLPSLPPHLFGKSNNKPDHYTFTTTPSIPIRRPAAFSVNSPSSASLSTWTSTPRPPSRKKSRTRSSSQPGRAPRTKSVQFDLRPRYGTPPYGSRRARTPTGDLHGYETDDSDSTVDGLDRFRIHRHDRIPDRARQHQQQHPRYRNTTESVEVASDSTIELPDRFDSHGRRLLEYRV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.46
3 0.5
4 0.5
5 0.51
6 0.58
7 0.63
8 0.61
9 0.64
10 0.65
11 0.64
12 0.63
13 0.65
14 0.61
15 0.62
16 0.67
17 0.63
18 0.6
19 0.58
20 0.55
21 0.58
22 0.61
23 0.58
24 0.55
25 0.55
26 0.52
27 0.53
28 0.58
29 0.53
30 0.49
31 0.47
32 0.45
33 0.48
34 0.47
35 0.48
36 0.43
37 0.44
38 0.46
39 0.44
40 0.49
41 0.5
42 0.52
43 0.5
44 0.49
45 0.48
46 0.5
47 0.49
48 0.46
49 0.48
50 0.49
51 0.47
52 0.45
53 0.43
54 0.39
55 0.41
56 0.4
57 0.34
58 0.35
59 0.33
60 0.39
61 0.38
62 0.36
63 0.37
64 0.36
65 0.42
66 0.44
67 0.45
68 0.46
69 0.54
70 0.57
71 0.54
72 0.51
73 0.45
74 0.45
75 0.45
76 0.43
77 0.38
78 0.35
79 0.35
80 0.36
81 0.33
82 0.27
83 0.28
84 0.26
85 0.22
86 0.26
87 0.24
88 0.23
89 0.21
90 0.23
91 0.22
92 0.19
93 0.25
94 0.22
95 0.22
96 0.24
97 0.28
98 0.25
99 0.23
100 0.29
101 0.3
102 0.34
103 0.39
104 0.39
105 0.38
106 0.45
107 0.46
108 0.47
109 0.44
110 0.38
111 0.37
112 0.35
113 0.34
114 0.28
115 0.28
116 0.25
117 0.28
118 0.34
119 0.37
120 0.48
121 0.56
122 0.61
123 0.63
124 0.62
125 0.56
126 0.55
127 0.55
128 0.51
129 0.5
130 0.44
131 0.41
132 0.42
133 0.41
134 0.37
135 0.34
136 0.32
137 0.24
138 0.26
139 0.29
140 0.3
141 0.32
142 0.38
143 0.43
144 0.48
145 0.56
146 0.6
147 0.67
148 0.74
149 0.81
150 0.83
151 0.82
152 0.8
153 0.8
154 0.82
155 0.77
156 0.7
157 0.61
158 0.5
159 0.43
160 0.37
161 0.31
162 0.29
163 0.27
164 0.26
165 0.31
166 0.37
167 0.43
168 0.5
169 0.58
170 0.59
171 0.62
172 0.67
173 0.69
174 0.72
175 0.74
176 0.7
177 0.61
178 0.55
179 0.53
180 0.47
181 0.5
182 0.43
183 0.33
184 0.3
185 0.3
186 0.3
187 0.25
188 0.21
189 0.12
190 0.09
191 0.08
192 0.05
193 0.03
194 0.03
195 0.05
196 0.07
197 0.15
198 0.16
199 0.19
200 0.28
201 0.36
202 0.43
203 0.49
204 0.54
205 0.53
206 0.57
207 0.56
208 0.51
209 0.48
210 0.4
211 0.32
212 0.25
213 0.2
214 0.15
215 0.13
216 0.1
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.05
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.03
225 0.03
226 0.02
227 0.02
228 0.03
229 0.04
230 0.04
231 0.05
232 0.06
233 0.07
234 0.12
235 0.21
236 0.26
237 0.35
238 0.45
239 0.55
240 0.64
241 0.74
242 0.81
243 0.8
244 0.79
245 0.77
246 0.77
247 0.79
248 0.79
249 0.78
250 0.71
251 0.68
252 0.67
253 0.66
254 0.63
255 0.62
256 0.63
257 0.64
258 0.7
259 0.76
260 0.84
261 0.89
262 0.93
263 0.94
264 0.94
265 0.94
266 0.96
267 0.95
268 0.93
269 0.91
270 0.86
271 0.84
272 0.82
273 0.74
274 0.64
275 0.56
276 0.45
277 0.36
278 0.3
279 0.21
280 0.12
281 0.08
282 0.06
283 0.05
284 0.05
285 0.04
286 0.03
287 0.02
288 0.02
289 0.02
290 0.02
291 0.01
292 0.01
293 0.02
294 0.03
295 0.04
296 0.06
297 0.1
298 0.15
299 0.23
300 0.34
301 0.42
302 0.51
303 0.62
304 0.71
305 0.79
306 0.82
307 0.84
308 0.83
309 0.85
310 0.82
311 0.78
312 0.76
313 0.72
314 0.74
315 0.74
316 0.75
317 0.75
318 0.79
319 0.82
320 0.78
321 0.78
322 0.73
323 0.74
324 0.71
325 0.66
326 0.59
327 0.52
328 0.49
329 0.41
330 0.36
331 0.28
332 0.23
333 0.24
334 0.26
335 0.31
336 0.35
337 0.4
338 0.41
339 0.43
340 0.43
341 0.37
342 0.33
343 0.26
344 0.21
345 0.15
346 0.14
347 0.12
348 0.08
349 0.06
350 0.04
351 0.02
352 0.02
353 0.02
354 0.02
355 0.02
356 0.03
357 0.06
358 0.08
359 0.11
360 0.19
361 0.28
362 0.37
363 0.47
364 0.54
365 0.61
366 0.68
367 0.76
368 0.76
369 0.77
370 0.77
371 0.75
372 0.73
373 0.68
374 0.59
375 0.55
376 0.5
377 0.41
378 0.32
379 0.24
380 0.18
381 0.15
382 0.14
383 0.07
384 0.04
385 0.03
386 0.03
387 0.02
388 0.02
389 0.02
390 0.02
391 0.02
392 0.04
393 0.05
394 0.09
395 0.11
396 0.16
397 0.2
398 0.25
399 0.28
400 0.35
401 0.43
402 0.47
403 0.54
404 0.59
405 0.59
406 0.64
407 0.67
408 0.61
409 0.63
410 0.66
411 0.69
412 0.7
413 0.75
414 0.75
415 0.81
416 0.87
417 0.87
418 0.87
419 0.85
420 0.83
421 0.8
422 0.76
423 0.67
424 0.61
425 0.55
426 0.5
427 0.47
428 0.39
429 0.35
430 0.33
431 0.34
432 0.36
433 0.34
434 0.3
435 0.27
436 0.31
437 0.36
438 0.34
439 0.36
440 0.33
441 0.37
442 0.38
443 0.38
444 0.37
445 0.37
446 0.41
447 0.46
448 0.54
449 0.58
450 0.61
451 0.65
452 0.66
453 0.68
454 0.72
455 0.7
456 0.69
457 0.63
458 0.64
459 0.62
460 0.63
461 0.56
462 0.5
463 0.43
464 0.34
465 0.32
466 0.25
467 0.22
468 0.17
469 0.15
470 0.17
471 0.17
472 0.2
473 0.29
474 0.33
475 0.38
476 0.42
477 0.48
478 0.46
479 0.51
480 0.53
481 0.48
482 0.49
483 0.47
484 0.43
485 0.38
486 0.36
487 0.32
488 0.27
489 0.22
490 0.17
491 0.11
492 0.11
493 0.09
494 0.08
495 0.08
496 0.08
497 0.08
498 0.1
499 0.1
500 0.12
501 0.14
502 0.17
503 0.19
504 0.21
505 0.24
506 0.29
507 0.31
508 0.32
509 0.32
510 0.31
511 0.3
512 0.28
513 0.25
514 0.21
515 0.21
516 0.22
517 0.23
518 0.22
519 0.21
520 0.2
521 0.2
522 0.19
523 0.19
524 0.17
525 0.17
526 0.23
527 0.26
528 0.27
529 0.26
530 0.29
531 0.28
532 0.28
533 0.26
534 0.24
535 0.26
536 0.26
537 0.28
538 0.23
539 0.25
540 0.27
541 0.25
542 0.26
543 0.21
544 0.21
545 0.19
546 0.2
547 0.22
548 0.24
549 0.27
550 0.28
551 0.3
552 0.31
553 0.34
554 0.35
555 0.34
556 0.31
557 0.34
558 0.34
559 0.32
560 0.32
561 0.31
562 0.31
563 0.29
564 0.3
565 0.27
566 0.26
567 0.31
568 0.29
569 0.27
570 0.26
571 0.26
572 0.24
573 0.24
574 0.24
575 0.18
576 0.21
577 0.21
578 0.21
579 0.19
580 0.18
581 0.15
582 0.11
583 0.11
584 0.08
585 0.07
586 0.08
587 0.1
588 0.13
589 0.16
590 0.17
591 0.23
592 0.24
593 0.25
594 0.27
595 0.26
596 0.24
597 0.24
598 0.22
599 0.17
600 0.16
601 0.16
602 0.14
603 0.14
604 0.13
605 0.11
606 0.11
607 0.1
608 0.11
609 0.12
610 0.16
611 0.16
612 0.19
613 0.19
614 0.21
615 0.24
616 0.25
617 0.25
618 0.26
619 0.35
620 0.41
621 0.5
622 0.51
623 0.52
624 0.54
625 0.55
626 0.58
627 0.53
628 0.5
629 0.42
630 0.43
631 0.44
632 0.4
633 0.4
634 0.39
635 0.38
636 0.33
637 0.39
638 0.38
639 0.36
640 0.39
641 0.39
642 0.39
643 0.36
644 0.37
645 0.38
646 0.35
647 0.34
648 0.32
649 0.29
650 0.23
651 0.22
652 0.2
653 0.15
654 0.15
655 0.14
656 0.15
657 0.18
658 0.19
659 0.23
660 0.32
661 0.39
662 0.47
663 0.56
664 0.66
665 0.74
666 0.81
667 0.87
668 0.89
669 0.9
670 0.89
671 0.88
672 0.87
673 0.87
674 0.87
675 0.85
676 0.82
677 0.8
678 0.8
679 0.79
680 0.74
681 0.71
682 0.7
683 0.68
684 0.65
685 0.63
686 0.62
687 0.61
688 0.65
689 0.66
690 0.62
691 0.58
692 0.55
693 0.55
694 0.5
695 0.5
696 0.45
697 0.47
698 0.48
699 0.56
700 0.57
701 0.54
702 0.57
703 0.58
704 0.59
705 0.54
706 0.54
707 0.51
708 0.54
709 0.55
710 0.48
711 0.46
712 0.41
713 0.38
714 0.33
715 0.26
716 0.21
717 0.17
718 0.17
719 0.12
720 0.11
721 0.09
722 0.1
723 0.09
724 0.09
725 0.1
726 0.13
727 0.15
728 0.17
729 0.22
730 0.3
731 0.36
732 0.43
733 0.49
734 0.56
735 0.62
736 0.71
737 0.73
738 0.72
739 0.74
740 0.76
741 0.78
742 0.77
743 0.77
744 0.76
745 0.8
746 0.83
747 0.86
748 0.85
749 0.86
750 0.82
751 0.79
752 0.76
753 0.71
754 0.65
755 0.57
756 0.5
757 0.42
758 0.37
759 0.31
760 0.25
761 0.2
762 0.15
763 0.12
764 0.1
765 0.1
766 0.1
767 0.1
768 0.12
769 0.14
770 0.16
771 0.19
772 0.24
773 0.29
774 0.35
775 0.42
776 0.42
777 0.44