Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C6HCV8

Protein Details
Accession C6HCV8    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
39-60VSQCPHCRGLRKSRTTHTKCECHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001083  Cu_fist_DNA-bd_dom  
IPR036395  Cu_fist_DNA-bd_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005507  F:copper ion binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF00649  Copper-fist  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50073  COPPER_FIST_2  
Amino Acid Sequences MLIKGEKWACEACIRGHRVSNCQHADRPLSHINKKGRPVSQCPHCRGLRKSRTTHTKCECGEKGHTKAECPTKEASDNQVGNRKQCCCGHGSRCTCANKRDSNLETVPEVGPPRSRASSNLGQKRPHLATTKADDALSGFPTRHTKNRVNDTCKRGVPYSIPRSHTVHASSDIARHSADHLPLPETGIEQDGTLAVDSITKVAFPVRLVRSEHGSPANAPLLGIEEMNNGIPHLDISVAPLDPTNSTPGLFDRQDQSLDQFYSPETEAFPETPNFNVPPVDWSTFGLPFNPSDLHTTFSQPPSYASFDNSNFSHSNLTHSSSGELSEVEDISLATGIGMSNPDKLDVLSASDGSGNGMYRLSPSSCVDFSQSQMLSPSDLQSVDIDAFLKAGAALSQPPQPFDIIATSPRVRLNSYQVPQTTLLQIVRPSVQRWRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.41
3 0.46
4 0.48
5 0.52
6 0.56
7 0.6
8 0.58
9 0.57
10 0.58
11 0.56
12 0.59
13 0.53
14 0.53
15 0.52
16 0.53
17 0.54
18 0.58
19 0.62
20 0.63
21 0.69
22 0.7
23 0.67
24 0.67
25 0.7
26 0.71
27 0.73
28 0.74
29 0.72
30 0.73
31 0.72
32 0.72
33 0.72
34 0.73
35 0.74
36 0.73
37 0.75
38 0.77
39 0.83
40 0.81
41 0.83
42 0.79
43 0.78
44 0.71
45 0.73
46 0.66
47 0.6
48 0.63
49 0.61
50 0.59
51 0.58
52 0.56
53 0.49
54 0.53
55 0.57
56 0.49
57 0.45
58 0.42
59 0.39
60 0.42
61 0.42
62 0.41
63 0.4
64 0.41
65 0.42
66 0.48
67 0.46
68 0.47
69 0.5
70 0.47
71 0.44
72 0.43
73 0.41
74 0.38
75 0.45
76 0.47
77 0.51
78 0.53
79 0.52
80 0.57
81 0.62
82 0.62
83 0.6
84 0.6
85 0.57
86 0.57
87 0.6
88 0.55
89 0.54
90 0.5
91 0.46
92 0.38
93 0.33
94 0.29
95 0.24
96 0.23
97 0.17
98 0.18
99 0.19
100 0.22
101 0.22
102 0.23
103 0.23
104 0.29
105 0.36
106 0.44
107 0.51
108 0.52
109 0.52
110 0.53
111 0.57
112 0.52
113 0.48
114 0.43
115 0.37
116 0.37
117 0.4
118 0.42
119 0.36
120 0.34
121 0.29
122 0.26
123 0.24
124 0.2
125 0.15
126 0.11
127 0.12
128 0.19
129 0.21
130 0.26
131 0.32
132 0.38
133 0.45
134 0.56
135 0.63
136 0.65
137 0.71
138 0.72
139 0.71
140 0.66
141 0.61
142 0.51
143 0.44
144 0.42
145 0.43
146 0.46
147 0.45
148 0.46
149 0.46
150 0.48
151 0.47
152 0.44
153 0.37
154 0.29
155 0.25
156 0.25
157 0.22
158 0.21
159 0.2
160 0.18
161 0.15
162 0.14
163 0.14
164 0.15
165 0.15
166 0.14
167 0.15
168 0.15
169 0.15
170 0.16
171 0.13
172 0.1
173 0.1
174 0.09
175 0.08
176 0.06
177 0.06
178 0.06
179 0.06
180 0.05
181 0.05
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.05
190 0.06
191 0.06
192 0.13
193 0.14
194 0.17
195 0.19
196 0.2
197 0.24
198 0.24
199 0.26
200 0.2
201 0.19
202 0.16
203 0.17
204 0.17
205 0.12
206 0.11
207 0.09
208 0.09
209 0.09
210 0.08
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.07
215 0.07
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.03
223 0.05
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.06
228 0.07
229 0.07
230 0.08
231 0.09
232 0.08
233 0.09
234 0.09
235 0.1
236 0.14
237 0.14
238 0.15
239 0.15
240 0.16
241 0.17
242 0.17
243 0.18
244 0.16
245 0.17
246 0.15
247 0.13
248 0.12
249 0.13
250 0.14
251 0.12
252 0.09
253 0.09
254 0.1
255 0.11
256 0.13
257 0.11
258 0.12
259 0.12
260 0.14
261 0.13
262 0.13
263 0.12
264 0.11
265 0.13
266 0.16
267 0.17
268 0.15
269 0.16
270 0.17
271 0.19
272 0.19
273 0.17
274 0.14
275 0.12
276 0.14
277 0.14
278 0.12
279 0.15
280 0.16
281 0.17
282 0.17
283 0.21
284 0.23
285 0.24
286 0.25
287 0.2
288 0.22
289 0.23
290 0.25
291 0.22
292 0.21
293 0.23
294 0.23
295 0.27
296 0.25
297 0.26
298 0.22
299 0.23
300 0.24
301 0.19
302 0.23
303 0.21
304 0.25
305 0.22
306 0.22
307 0.22
308 0.19
309 0.19
310 0.15
311 0.13
312 0.1
313 0.09
314 0.09
315 0.08
316 0.07
317 0.06
318 0.06
319 0.06
320 0.05
321 0.04
322 0.04
323 0.04
324 0.04
325 0.06
326 0.07
327 0.09
328 0.09
329 0.1
330 0.1
331 0.1
332 0.12
333 0.1
334 0.12
335 0.11
336 0.11
337 0.11
338 0.11
339 0.11
340 0.1
341 0.11
342 0.09
343 0.08
344 0.08
345 0.08
346 0.09
347 0.12
348 0.12
349 0.14
350 0.16
351 0.2
352 0.2
353 0.21
354 0.24
355 0.23
356 0.24
357 0.28
358 0.26
359 0.22
360 0.24
361 0.23
362 0.21
363 0.21
364 0.21
365 0.15
366 0.15
367 0.16
368 0.14
369 0.15
370 0.13
371 0.13
372 0.11
373 0.09
374 0.09
375 0.08
376 0.08
377 0.06
378 0.05
379 0.06
380 0.06
381 0.08
382 0.11
383 0.17
384 0.18
385 0.19
386 0.2
387 0.2
388 0.19
389 0.19
390 0.21
391 0.17
392 0.19
393 0.25
394 0.25
395 0.27
396 0.3
397 0.31
398 0.3
399 0.32
400 0.38
401 0.41
402 0.43
403 0.48
404 0.46
405 0.48
406 0.47
407 0.45
408 0.39
409 0.34
410 0.31
411 0.27
412 0.27
413 0.26
414 0.29
415 0.3
416 0.3