Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0W7VTD3

Protein Details
Accession A0A0W7VTD3    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
298-322EPSASPKAQRSRPKRPRKDDLEDHYBasic
394-423LSAWKTNRRANYHRKRRRWARTRQIVDATRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
304-315KAQRSRPKRPRK
405-413YHRKRRRWA
568-572RKKAK
Subcellular Location(s) mito 18.5, cyto_mito 12.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0008168  F:methyltransferase activity  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MSRNTVQPNGWVAIRLPSEVTRVLQVVPHTTISLGKYGSFPSNLLIERPFHLTYEIQDKLDGESFPRLRVVPGTELNADKLADVSATESADADEVIEPGNGEELTLVDESGKVVARSTREVIDESARQTLTMAEIDQLKKEGAAAGKELIAKLMLSHTAIDQKTAYSLAKYKLLKEKKYMRRFTVLPLDVAMLGHWMLFERDGSKVMEMRQEMIGLLGCWADVHFGGLPIDGEQGPHGGRWLAVDDTGGLLVAAMAERMGILHAEPSEGDEATKEAVEDEENPKTQPAGVEADAAAAEPSASPKAQRSRPKRPRKDDLEDHYALTNSITLIHANSQPNLSLLRHFDYEHSDPNPPYPYHPLFTNLLPISWLQLLDPESDPTYSEPVPEVGSDVLSAWKTNRRANYHRKRRRWARTRQIVDATRAGGFSGLAVASTMDPISVLRHALPLLAGGAPVAIYSPTIEPLTQLADCFSIGRRGAWVSNPPAEAEGKTAVELENWPGTAEFPINPALLIGAQVQTSRARRWQVLPGRTHPFMTERGGASGYVFTGWRAIPAEGNITARGKFNNRKKAKTG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.24
3 0.22
4 0.21
5 0.24
6 0.25
7 0.25
8 0.21
9 0.21
10 0.21
11 0.21
12 0.21
13 0.23
14 0.23
15 0.23
16 0.2
17 0.2
18 0.22
19 0.21
20 0.22
21 0.18
22 0.17
23 0.17
24 0.2
25 0.23
26 0.21
27 0.2
28 0.19
29 0.23
30 0.23
31 0.23
32 0.23
33 0.21
34 0.22
35 0.27
36 0.26
37 0.21
38 0.23
39 0.22
40 0.23
41 0.29
42 0.3
43 0.25
44 0.25
45 0.25
46 0.25
47 0.28
48 0.24
49 0.19
50 0.25
51 0.26
52 0.26
53 0.28
54 0.25
55 0.23
56 0.27
57 0.28
58 0.25
59 0.27
60 0.29
61 0.3
62 0.31
63 0.31
64 0.29
65 0.25
66 0.19
67 0.16
68 0.12
69 0.09
70 0.08
71 0.08
72 0.08
73 0.09
74 0.09
75 0.08
76 0.08
77 0.08
78 0.08
79 0.08
80 0.06
81 0.06
82 0.07
83 0.07
84 0.07
85 0.06
86 0.08
87 0.07
88 0.06
89 0.06
90 0.05
91 0.08
92 0.08
93 0.08
94 0.06
95 0.07
96 0.07
97 0.09
98 0.1
99 0.07
100 0.09
101 0.12
102 0.14
103 0.18
104 0.2
105 0.21
106 0.21
107 0.23
108 0.24
109 0.26
110 0.26
111 0.24
112 0.26
113 0.23
114 0.21
115 0.2
116 0.18
117 0.15
118 0.13
119 0.12
120 0.1
121 0.15
122 0.16
123 0.16
124 0.17
125 0.15
126 0.14
127 0.14
128 0.15
129 0.12
130 0.13
131 0.13
132 0.13
133 0.15
134 0.16
135 0.15
136 0.13
137 0.11
138 0.09
139 0.08
140 0.09
141 0.08
142 0.07
143 0.08
144 0.09
145 0.15
146 0.15
147 0.16
148 0.15
149 0.14
150 0.15
151 0.16
152 0.15
153 0.11
154 0.15
155 0.16
156 0.23
157 0.24
158 0.28
159 0.36
160 0.44
161 0.46
162 0.5
163 0.59
164 0.63
165 0.72
166 0.74
167 0.68
168 0.67
169 0.64
170 0.61
171 0.6
172 0.51
173 0.41
174 0.34
175 0.31
176 0.24
177 0.23
178 0.17
179 0.07
180 0.06
181 0.05
182 0.05
183 0.04
184 0.04
185 0.05
186 0.05
187 0.06
188 0.07
189 0.08
190 0.09
191 0.1
192 0.12
193 0.13
194 0.17
195 0.16
196 0.17
197 0.16
198 0.15
199 0.14
200 0.13
201 0.12
202 0.07
203 0.07
204 0.05
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.05
211 0.04
212 0.05
213 0.05
214 0.06
215 0.06
216 0.05
217 0.07
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.06
226 0.06
227 0.06
228 0.07
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.06
235 0.05
236 0.03
237 0.03
238 0.03
239 0.03
240 0.02
241 0.02
242 0.02
243 0.02
244 0.02
245 0.02
246 0.02
247 0.02
248 0.02
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.04
253 0.05
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.05
258 0.06
259 0.06
260 0.06
261 0.05
262 0.04
263 0.04
264 0.05
265 0.07
266 0.1
267 0.12
268 0.12
269 0.12
270 0.12
271 0.12
272 0.12
273 0.1
274 0.09
275 0.1
276 0.1
277 0.1
278 0.1
279 0.1
280 0.09
281 0.09
282 0.07
283 0.04
284 0.03
285 0.03
286 0.04
287 0.04
288 0.05
289 0.05
290 0.1
291 0.17
292 0.25
293 0.35
294 0.43
295 0.54
296 0.64
297 0.75
298 0.81
299 0.83
300 0.86
301 0.85
302 0.85
303 0.82
304 0.78
305 0.75
306 0.65
307 0.57
308 0.48
309 0.39
310 0.3
311 0.21
312 0.15
313 0.06
314 0.06
315 0.06
316 0.05
317 0.06
318 0.08
319 0.12
320 0.13
321 0.14
322 0.13
323 0.13
324 0.14
325 0.15
326 0.13
327 0.11
328 0.12
329 0.14
330 0.15
331 0.15
332 0.16
333 0.2
334 0.22
335 0.24
336 0.23
337 0.24
338 0.23
339 0.26
340 0.29
341 0.23
342 0.24
343 0.27
344 0.27
345 0.26
346 0.26
347 0.27
348 0.25
349 0.25
350 0.28
351 0.21
352 0.19
353 0.18
354 0.17
355 0.15
356 0.14
357 0.14
358 0.07
359 0.09
360 0.1
361 0.12
362 0.13
363 0.12
364 0.12
365 0.12
366 0.13
367 0.12
368 0.14
369 0.12
370 0.12
371 0.11
372 0.11
373 0.12
374 0.11
375 0.11
376 0.08
377 0.08
378 0.07
379 0.07
380 0.08
381 0.08
382 0.08
383 0.09
384 0.16
385 0.19
386 0.24
387 0.31
388 0.37
389 0.46
390 0.57
391 0.67
392 0.72
393 0.79
394 0.84
395 0.87
396 0.9
397 0.92
398 0.91
399 0.91
400 0.91
401 0.91
402 0.87
403 0.83
404 0.8
405 0.73
406 0.66
407 0.58
408 0.48
409 0.37
410 0.32
411 0.25
412 0.16
413 0.12
414 0.08
415 0.07
416 0.05
417 0.04
418 0.04
419 0.05
420 0.05
421 0.05
422 0.05
423 0.04
424 0.04
425 0.05
426 0.06
427 0.07
428 0.08
429 0.08
430 0.09
431 0.09
432 0.1
433 0.09
434 0.08
435 0.08
436 0.07
437 0.07
438 0.05
439 0.05
440 0.05
441 0.05
442 0.04
443 0.03
444 0.03
445 0.05
446 0.06
447 0.08
448 0.09
449 0.09
450 0.09
451 0.11
452 0.14
453 0.12
454 0.12
455 0.11
456 0.11
457 0.11
458 0.12
459 0.12
460 0.14
461 0.15
462 0.15
463 0.16
464 0.18
465 0.19
466 0.22
467 0.28
468 0.27
469 0.31
470 0.31
471 0.3
472 0.29
473 0.29
474 0.25
475 0.22
476 0.19
477 0.15
478 0.15
479 0.15
480 0.14
481 0.13
482 0.14
483 0.15
484 0.14
485 0.14
486 0.14
487 0.13
488 0.14
489 0.14
490 0.15
491 0.12
492 0.11
493 0.14
494 0.13
495 0.13
496 0.12
497 0.11
498 0.09
499 0.1
500 0.1
501 0.08
502 0.09
503 0.09
504 0.11
505 0.17
506 0.2
507 0.23
508 0.28
509 0.33
510 0.37
511 0.41
512 0.5
513 0.53
514 0.58
515 0.61
516 0.62
517 0.64
518 0.62
519 0.58
520 0.5
521 0.44
522 0.39
523 0.37
524 0.35
525 0.29
526 0.29
527 0.29
528 0.27
529 0.24
530 0.21
531 0.17
532 0.13
533 0.11
534 0.09
535 0.12
536 0.12
537 0.13
538 0.15
539 0.15
540 0.16
541 0.18
542 0.22
543 0.21
544 0.23
545 0.24
546 0.24
547 0.24
548 0.24
549 0.28
550 0.33
551 0.41
552 0.49
553 0.57
554 0.64