Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C6HHA8

Protein Details
Accession C6HHA8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
143-168DRSTSVPGGRQRRRRKSPGANFVRDSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
151-159GRQRRRRKS
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12, cyto 4.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045030  LYSM1-4  
IPR018392  LysM_dom  
IPR036779  LysM_dom_sf  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51782  LYSM  
Amino Acid Sequences MTSNTNKSDVFNSSTASANSSSGVRPRNRRLISLADDDDDDILGTTANDHVLSSNPLLTPSAPRSRACTPSPTPSRHPSRPPTASSTTQRLSNGARLENGSTDIRQTKPASPFVTDFLESSWVSLQGLASSVLGNEDIFGKADRSTSVPGGRQRRRRKSPGANFVRDSGSGHSSWGPASFLSKQLGSSGSNAREARQSTIETLKRQALLEANGDVTPDGWGNYKRRDSGDAPRGYSTPPAEQDDSDALVYVHHVQPNDSITGVSIKYGCQPAVMRKLNGFWPSDSIQARKTVLIPIEACTLKGRRLPAKEDDVNLFEDLNTSTEDPYRDITSLATDSEASSAFGYEDSSLRDEYPGSATSSISSKTQKQEPLWKHECWVQIDGFPDAVEIGRVTRKTLGFFPRARRKSLAPLSTPYSDLDDIRHPLYQKQTQNTRTANASSSINSSPFDSHLSPSSHTFDRSKPSLRSLSNPNIHRYRSSFTLLGHGGVGTLGPNVKVPGPAEDKLNQFVKTHLPQLAVSPPQSSLQIPPSSNSYGRRTSVESTSTVVSNTSSTGLENVSGAIEGWMRKMARSAKAGVTEFQQQDGRLGIGGMGDLIELADTPDGKGTSSHIEPGVDTSSSTRDGTGSDINFSPLISSRSGSESESTIGLFTSRDGSNGSVRGWRKKGD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.28
3 0.27
4 0.23
5 0.18
6 0.18
7 0.18
8 0.19
9 0.22
10 0.3
11 0.36
12 0.44
13 0.53
14 0.62
15 0.63
16 0.64
17 0.63
18 0.63
19 0.61
20 0.59
21 0.52
22 0.43
23 0.41
24 0.38
25 0.33
26 0.24
27 0.18
28 0.1
29 0.08
30 0.07
31 0.06
32 0.06
33 0.06
34 0.07
35 0.07
36 0.07
37 0.08
38 0.1
39 0.13
40 0.14
41 0.15
42 0.15
43 0.16
44 0.17
45 0.17
46 0.22
47 0.26
48 0.33
49 0.34
50 0.35
51 0.4
52 0.46
53 0.51
54 0.48
55 0.5
56 0.46
57 0.53
58 0.6
59 0.6
60 0.61
61 0.65
62 0.71
63 0.7
64 0.74
65 0.73
66 0.75
67 0.75
68 0.72
69 0.7
70 0.67
71 0.67
72 0.63
73 0.62
74 0.54
75 0.52
76 0.48
77 0.43
78 0.4
79 0.39
80 0.37
81 0.31
82 0.31
83 0.29
84 0.29
85 0.27
86 0.27
87 0.23
88 0.19
89 0.22
90 0.24
91 0.23
92 0.28
93 0.3
94 0.34
95 0.37
96 0.43
97 0.41
98 0.4
99 0.4
100 0.38
101 0.38
102 0.32
103 0.27
104 0.21
105 0.23
106 0.19
107 0.19
108 0.16
109 0.13
110 0.12
111 0.12
112 0.11
113 0.08
114 0.09
115 0.08
116 0.07
117 0.07
118 0.07
119 0.07
120 0.07
121 0.06
122 0.06
123 0.06
124 0.07
125 0.07
126 0.08
127 0.09
128 0.09
129 0.1
130 0.11
131 0.13
132 0.15
133 0.18
134 0.21
135 0.26
136 0.33
137 0.43
138 0.5
139 0.58
140 0.66
141 0.73
142 0.79
143 0.83
144 0.86
145 0.87
146 0.89
147 0.9
148 0.88
149 0.84
150 0.75
151 0.69
152 0.6
153 0.49
154 0.4
155 0.33
156 0.26
157 0.19
158 0.19
159 0.18
160 0.16
161 0.16
162 0.15
163 0.12
164 0.09
165 0.13
166 0.13
167 0.14
168 0.15
169 0.15
170 0.15
171 0.16
172 0.18
173 0.15
174 0.17
175 0.2
176 0.2
177 0.26
178 0.26
179 0.26
180 0.29
181 0.29
182 0.29
183 0.26
184 0.25
185 0.22
186 0.31
187 0.33
188 0.31
189 0.33
190 0.32
191 0.31
192 0.3
193 0.29
194 0.23
195 0.22
196 0.21
197 0.18
198 0.16
199 0.15
200 0.15
201 0.12
202 0.1
203 0.08
204 0.07
205 0.06
206 0.08
207 0.12
208 0.16
209 0.23
210 0.26
211 0.28
212 0.3
213 0.35
214 0.36
215 0.42
216 0.48
217 0.45
218 0.44
219 0.43
220 0.42
221 0.37
222 0.36
223 0.28
224 0.22
225 0.21
226 0.23
227 0.22
228 0.22
229 0.23
230 0.21
231 0.2
232 0.16
233 0.13
234 0.1
235 0.08
236 0.09
237 0.1
238 0.1
239 0.11
240 0.11
241 0.11
242 0.13
243 0.15
244 0.15
245 0.12
246 0.1
247 0.09
248 0.11
249 0.1
250 0.09
251 0.08
252 0.08
253 0.11
254 0.12
255 0.11
256 0.11
257 0.13
258 0.18
259 0.27
260 0.29
261 0.27
262 0.27
263 0.29
264 0.31
265 0.32
266 0.28
267 0.19
268 0.2
269 0.2
270 0.25
271 0.24
272 0.22
273 0.2
274 0.21
275 0.22
276 0.19
277 0.19
278 0.16
279 0.15
280 0.16
281 0.15
282 0.14
283 0.18
284 0.17
285 0.16
286 0.16
287 0.16
288 0.16
289 0.18
290 0.2
291 0.22
292 0.25
293 0.29
294 0.32
295 0.38
296 0.38
297 0.37
298 0.35
299 0.31
300 0.29
301 0.25
302 0.2
303 0.12
304 0.11
305 0.1
306 0.08
307 0.08
308 0.07
309 0.07
310 0.08
311 0.09
312 0.09
313 0.1
314 0.11
315 0.1
316 0.1
317 0.1
318 0.1
319 0.09
320 0.09
321 0.08
322 0.07
323 0.06
324 0.07
325 0.07
326 0.06
327 0.05
328 0.05
329 0.05
330 0.05
331 0.05
332 0.05
333 0.06
334 0.06
335 0.08
336 0.08
337 0.08
338 0.08
339 0.08
340 0.08
341 0.1
342 0.09
343 0.09
344 0.1
345 0.09
346 0.1
347 0.11
348 0.11
349 0.11
350 0.13
351 0.16
352 0.19
353 0.24
354 0.28
355 0.3
356 0.39
357 0.42
358 0.49
359 0.5
360 0.46
361 0.43
362 0.43
363 0.44
364 0.36
365 0.34
366 0.25
367 0.22
368 0.23
369 0.21
370 0.17
371 0.13
372 0.1
373 0.08
374 0.07
375 0.05
376 0.04
377 0.05
378 0.08
379 0.08
380 0.09
381 0.13
382 0.14
383 0.16
384 0.22
385 0.26
386 0.3
387 0.35
388 0.44
389 0.5
390 0.52
391 0.54
392 0.51
393 0.48
394 0.51
395 0.54
396 0.5
397 0.42
398 0.43
399 0.44
400 0.42
401 0.4
402 0.31
403 0.26
404 0.21
405 0.19
406 0.17
407 0.16
408 0.17
409 0.17
410 0.19
411 0.16
412 0.19
413 0.26
414 0.31
415 0.33
416 0.39
417 0.46
418 0.49
419 0.56
420 0.54
421 0.49
422 0.44
423 0.41
424 0.34
425 0.28
426 0.25
427 0.18
428 0.2
429 0.19
430 0.17
431 0.16
432 0.15
433 0.14
434 0.14
435 0.17
436 0.15
437 0.15
438 0.19
439 0.21
440 0.21
441 0.23
442 0.26
443 0.23
444 0.25
445 0.26
446 0.25
447 0.3
448 0.33
449 0.37
450 0.35
451 0.39
452 0.43
453 0.43
454 0.44
455 0.46
456 0.5
457 0.52
458 0.53
459 0.54
460 0.52
461 0.52
462 0.5
463 0.45
464 0.39
465 0.36
466 0.37
467 0.32
468 0.27
469 0.31
470 0.28
471 0.25
472 0.22
473 0.18
474 0.13
475 0.11
476 0.11
477 0.05
478 0.05
479 0.05
480 0.05
481 0.06
482 0.07
483 0.08
484 0.1
485 0.1
486 0.15
487 0.2
488 0.21
489 0.24
490 0.28
491 0.29
492 0.32
493 0.35
494 0.3
495 0.25
496 0.26
497 0.3
498 0.29
499 0.31
500 0.29
501 0.27
502 0.26
503 0.29
504 0.32
505 0.28
506 0.26
507 0.22
508 0.21
509 0.2
510 0.21
511 0.2
512 0.17
513 0.21
514 0.25
515 0.24
516 0.25
517 0.28
518 0.3
519 0.33
520 0.35
521 0.34
522 0.34
523 0.35
524 0.37
525 0.36
526 0.37
527 0.37
528 0.35
529 0.31
530 0.28
531 0.28
532 0.25
533 0.21
534 0.18
535 0.14
536 0.12
537 0.11
538 0.11
539 0.09
540 0.09
541 0.1
542 0.1
543 0.1
544 0.09
545 0.09
546 0.07
547 0.07
548 0.07
549 0.06
550 0.08
551 0.08
552 0.09
553 0.13
554 0.13
555 0.14
556 0.2
557 0.26
558 0.3
559 0.33
560 0.37
561 0.36
562 0.43
563 0.44
564 0.39
565 0.36
566 0.38
567 0.35
568 0.34
569 0.32
570 0.26
571 0.26
572 0.25
573 0.23
574 0.14
575 0.14
576 0.1
577 0.08
578 0.08
579 0.06
580 0.05
581 0.04
582 0.04
583 0.03
584 0.03
585 0.03
586 0.04
587 0.05
588 0.05
589 0.06
590 0.09
591 0.1
592 0.1
593 0.11
594 0.13
595 0.18
596 0.19
597 0.22
598 0.2
599 0.21
600 0.21
601 0.23
602 0.23
603 0.17
604 0.17
605 0.15
606 0.17
607 0.19
608 0.19
609 0.17
610 0.14
611 0.15
612 0.18
613 0.23
614 0.21
615 0.22
616 0.22
617 0.23
618 0.23
619 0.22
620 0.2
621 0.16
622 0.18
623 0.16
624 0.16
625 0.16
626 0.19
627 0.21
628 0.21
629 0.2
630 0.19
631 0.19
632 0.19
633 0.17
634 0.14
635 0.13
636 0.12
637 0.1
638 0.09
639 0.12
640 0.12
641 0.12
642 0.14
643 0.17
644 0.22
645 0.24
646 0.25
647 0.28
648 0.34
649 0.42