FuNGI

C6HNJ1

Protein Details

Accession

C6HNJ1

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
83-114	RSERRDRDRDLDRERKRRNRSRERRHERDADG	Basic
127-159	SANGSNRSRKRSRSRDSGKRHSRRDRDDPYRSS	Basic
195-216	RDDDRRSSKRDRDGRRRSPSSS	Basic
412-432	EPTPDEKRKVPKPQVNAKPLP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
86-152	RRDRDRDLDRERKRRNRSRERRHERDADGDEEMKSPKSDRASANGSNRSRKRSRSRDSGKRHSRRDR
189-221	RSRRDERDDDRRSSKRDRDGRRRSPSSSRRRSR

Subcellular Location(s)

nucl 11, extr 11, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR029123 RBM39_linker IPR006509 RBM39_SF IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF15519 RBM39linker PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12285 RRM3_RBM39_like

Amino Acid Sequences

MALIIVSHSPLIASIFGHNVYSSTTTEQFFLPPLPSDGRIQPIFAMSGIDVEALLESTAAPAAPPHPPEETPDKSHDESNGSRSERRDRDRDLDRERKRRNRSRERRHERDADGDEEMKSPKSDRASANGSNRSRKRSRSRDSGKRHSRRDRDDPYRSSGGDYYRGPGRTTRSRSRSPYDDRYYRPTGRSRRDERDDDRRSSKRDRDGRRRSPSSSRRRSRSPEPQLTEDERDRRTVFVQQLAARLRTKELIAFFEKVGPVKEAQIVKDRVSGRSKGRGRSRGYGFVQFRDPNQAREALEKMNGFDLAGRPIRVGLGNDKFTPESTANLLQRFQGQGAHHNFQGSLFSGHGGRGAQAGGSGHFDRAGGRDNDKAAGGASALDDTDVAGVNFNNYSRDALMRKLARTDEPAIEPTPDEKRKVPKPQVNAKPLPVSVNMASRCVLLRNMFDPAEEEGESWIKELEDDVRAECEDKYGHVVHIALDPNTQGDIYLKFDRVQGGENAIKGLNGRFFGGRQISAQPVVDAVYSSLFTRSKAI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.1
2	0.12
3	0.13
4	0.14
5	0.13
6	0.12
7	0.14
8	0.15
9	0.15
10	0.17
11	0.2
12	0.21
13	0.22
14	0.22
15	0.21
16	0.2
17	0.21
18	0.18
19	0.17
20	0.2
21	0.22
22	0.23
23	0.26
24	0.28
25	0.32
26	0.31
27	0.3
28	0.27
29	0.25
30	0.24
31	0.2
32	0.18
33	0.11
34	0.11
35	0.1
36	0.09
37	0.07
38	0.07
39	0.07
40	0.05
41	0.05
42	0.04
43	0.04
44	0.04
45	0.05
46	0.05
47	0.04
48	0.05
49	0.08
50	0.12
51	0.14
52	0.16
53	0.2
54	0.2
55	0.26
56	0.33
57	0.37
58	0.37
59	0.41
60	0.44
61	0.43
62	0.45
63	0.42
64	0.41
65	0.38
66	0.38
67	0.41
68	0.38
69	0.4
70	0.42
71	0.49
72	0.52
73	0.56
74	0.58
75	0.57
76	0.62
77	0.67
78	0.72
79	0.72
80	0.74
81	0.77
82	0.8
83	0.84
84	0.86
85	0.88
86	0.88
87	0.9
88	0.91
89	0.92
90	0.93
91	0.94
92	0.94
93	0.92
94	0.91
95	0.88
96	0.8
97	0.78
98	0.7
99	0.62
100	0.54
101	0.46
102	0.39
103	0.32
104	0.3
105	0.22
106	0.18
107	0.17
108	0.18
109	0.21
110	0.26
111	0.26
112	0.31
113	0.36
114	0.42
115	0.49
116	0.53
117	0.54
118	0.58
119	0.6
120	0.63
121	0.62
122	0.65
123	0.68
124	0.7
125	0.74
126	0.75
127	0.81
128	0.83
129	0.87
130	0.89
131	0.89
132	0.88
133	0.89
134	0.89
135	0.88
136	0.86
137	0.86
138	0.85
139	0.84
140	0.84
141	0.77
142	0.74
143	0.67
144	0.59
145	0.51
146	0.44
147	0.36
148	0.31
149	0.28
150	0.24
151	0.25
152	0.26
153	0.25
154	0.25
155	0.3
156	0.35
157	0.42
158	0.49
159	0.51
160	0.57
161	0.63
162	0.66
163	0.67
164	0.66
165	0.68
166	0.67
167	0.67
168	0.63
169	0.64
170	0.64
171	0.6
172	0.57
173	0.56
174	0.56
175	0.59
176	0.65
177	0.65
178	0.67
179	0.71
180	0.73
181	0.71
182	0.73
183	0.7
184	0.66
185	0.66
186	0.62
187	0.61
188	0.62
189	0.62
190	0.61
191	0.64
192	0.68
193	0.71
194	0.78
195	0.82
196	0.84
197	0.81
198	0.77
199	0.78
200	0.78
201	0.78
202	0.78
203	0.76
204	0.72
205	0.75
206	0.77
207	0.75
208	0.76
209	0.75
210	0.74
211	0.7
212	0.67
213	0.64
214	0.61
215	0.56
216	0.5
217	0.45
218	0.36
219	0.35
220	0.32
221	0.28
222	0.25
223	0.26
224	0.24
225	0.22
226	0.25
227	0.23
228	0.28
229	0.28
230	0.29
231	0.25
232	0.23
233	0.21
234	0.18
235	0.17
236	0.15
237	0.14
238	0.15
239	0.17
240	0.18
241	0.17
242	0.17
243	0.18
244	0.16
245	0.15
246	0.12
247	0.1
248	0.1
249	0.14
250	0.14
251	0.15
252	0.21
253	0.22
254	0.22
255	0.27
256	0.27
257	0.27
258	0.29
259	0.32
260	0.28
261	0.36
262	0.39
263	0.41
264	0.48
265	0.52
266	0.53
267	0.56
268	0.57
269	0.55
270	0.53
271	0.54
272	0.47
273	0.41
274	0.42
275	0.35
276	0.32
277	0.34
278	0.33
279	0.26
280	0.26
281	0.28
282	0.23
283	0.25
284	0.26
285	0.18
286	0.19
287	0.18
288	0.17
289	0.14
290	0.14
291	0.11
292	0.1
293	0.1
294	0.11
295	0.12
296	0.11
297	0.11
298	0.11
299	0.11
300	0.11
301	0.12
302	0.14
303	0.18
304	0.2
305	0.2
306	0.21
307	0.21
308	0.2
309	0.23
310	0.17
311	0.14
312	0.15
313	0.2
314	0.21
315	0.22
316	0.22
317	0.19
318	0.2
319	0.2
320	0.17
321	0.16
322	0.14
323	0.22
324	0.27
325	0.28
326	0.27
327	0.26
328	0.26
329	0.22
330	0.22
331	0.15
332	0.1
333	0.09
334	0.09
335	0.09
336	0.09
337	0.1
338	0.09
339	0.08
340	0.07
341	0.07
342	0.06
343	0.07
344	0.07
345	0.06
346	0.1
347	0.1
348	0.09
349	0.1
350	0.1
351	0.1
352	0.11
353	0.16
354	0.15
355	0.16
356	0.19
357	0.2
358	0.21
359	0.2
360	0.19
361	0.13
362	0.11
363	0.09
364	0.07
365	0.06
366	0.05
367	0.05
368	0.05
369	0.04
370	0.04
371	0.04
372	0.04
373	0.04
374	0.05
375	0.05
376	0.06
377	0.07
378	0.07
379	0.08
380	0.09
381	0.1
382	0.1
383	0.14
384	0.15
385	0.16
386	0.24
387	0.26
388	0.26
389	0.29
390	0.31
391	0.29
392	0.33
393	0.35
394	0.31
395	0.3
396	0.31
397	0.28
398	0.27
399	0.25
400	0.23
401	0.28
402	0.28
403	0.29
404	0.32
405	0.4
406	0.48
407	0.58
408	0.65
409	0.63
410	0.69
411	0.77
412	0.81
413	0.82
414	0.77
415	0.71
416	0.65
417	0.59
418	0.52
419	0.43
420	0.37
421	0.3
422	0.32
423	0.29
424	0.26
425	0.25
426	0.23
427	0.22
428	0.2
429	0.21
430	0.16
431	0.18
432	0.19
433	0.23
434	0.22
435	0.21
436	0.21
437	0.2
438	0.21
439	0.18
440	0.16
441	0.15
442	0.16
443	0.16
444	0.14
445	0.13
446	0.1
447	0.1
448	0.1
449	0.12
450	0.13
451	0.14
452	0.15
453	0.16
454	0.17
455	0.18
456	0.17
457	0.16
458	0.13
459	0.14
460	0.17
461	0.17
462	0.17
463	0.18
464	0.18
465	0.17
466	0.21
467	0.23
468	0.18
469	0.18
470	0.17
471	0.16
472	0.17
473	0.15
474	0.1
475	0.1
476	0.11
477	0.16
478	0.2
479	0.21
480	0.21
481	0.23
482	0.26
483	0.26
484	0.27
485	0.23
486	0.26
487	0.27
488	0.27
489	0.27
490	0.23
491	0.22
492	0.21
493	0.22
494	0.19
495	0.17
496	0.19
497	0.18
498	0.19
499	0.26
500	0.28
501	0.26
502	0.25
503	0.28
504	0.3
505	0.31
506	0.31
507	0.24
508	0.2
509	0.2
510	0.17
511	0.14
512	0.11
513	0.1
514	0.1
515	0.11
516	0.15
517	0.15

C6HNJ1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer