Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C6HDX0

Protein Details
Accession C6HDX0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
216-242RYRSRYKSVVHKKVRKHGRKILSRSVLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
226-235HKKVRKHGRK
Subcellular Location(s) nucl 13.5, mito_nucl 9, cyto 8, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR017930  Myb_dom  
IPR039024  RTC4  
IPR028094  RTC4_C  
IPR001005  SANT/Myb  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF13921  Myb_DNA-bind_6  
PF14474  RTC4  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51294  HTH_MYB  
PS50090  MYB_LIKE  
CDD cd00167  SANT  
Amino Acid Sequences MTASDLAGEATAAADIERDYSERKVESLDGKRRRWTREEDVRLAALKQDGFSWSEIEERFPQRQLGSLRQRWYTKLQRRKQATLPPTARWQRGNVSAPTDPPLTPLETSHRYPGGQPQPADGRAMPNVKPCTPSPPTTVTAMCPVCNSVIEVEAFSVFNAANNRMRVREQLRFCHQKETARCEWSRLRYPIIAWDRLNDRLIQFHPRLRWILDDSRYRSRYKSVVHKKVRKHGRKILSRSVLHSTGYYGLRGHEILSAHVVSHFKDAIDSLAGINSVVLKYGTVVYAQEVLVPELLEMLVQEDMGVDVKGARRILKESNKIGNLLNFE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.04
2 0.05
3 0.06
4 0.07
5 0.09
6 0.12
7 0.14
8 0.18
9 0.18
10 0.19
11 0.2
12 0.24
13 0.31
14 0.39
15 0.47
16 0.52
17 0.56
18 0.65
19 0.69
20 0.72
21 0.69
22 0.68
23 0.68
24 0.7
25 0.74
26 0.7
27 0.67
28 0.62
29 0.57
30 0.48
31 0.4
32 0.32
33 0.23
34 0.18
35 0.16
36 0.15
37 0.16
38 0.16
39 0.15
40 0.12
41 0.16
42 0.16
43 0.19
44 0.24
45 0.27
46 0.29
47 0.29
48 0.32
49 0.27
50 0.33
51 0.34
52 0.38
53 0.43
54 0.47
55 0.5
56 0.53
57 0.55
58 0.53
59 0.57
60 0.58
61 0.58
62 0.63
63 0.67
64 0.7
65 0.76
66 0.78
67 0.77
68 0.76
69 0.71
70 0.71
71 0.67
72 0.6
73 0.62
74 0.63
75 0.58
76 0.5
77 0.48
78 0.42
79 0.46
80 0.47
81 0.39
82 0.38
83 0.36
84 0.34
85 0.34
86 0.31
87 0.23
88 0.21
89 0.2
90 0.17
91 0.16
92 0.17
93 0.2
94 0.22
95 0.24
96 0.25
97 0.25
98 0.24
99 0.24
100 0.32
101 0.34
102 0.34
103 0.33
104 0.33
105 0.35
106 0.35
107 0.36
108 0.27
109 0.21
110 0.21
111 0.24
112 0.21
113 0.24
114 0.27
115 0.26
116 0.28
117 0.27
118 0.3
119 0.31
120 0.33
121 0.3
122 0.31
123 0.32
124 0.31
125 0.31
126 0.25
127 0.27
128 0.25
129 0.21
130 0.17
131 0.16
132 0.14
133 0.13
134 0.12
135 0.06
136 0.07
137 0.07
138 0.07
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.05
143 0.06
144 0.04
145 0.06
146 0.07
147 0.09
148 0.12
149 0.14
150 0.15
151 0.15
152 0.16
153 0.2
154 0.23
155 0.29
156 0.29
157 0.34
158 0.41
159 0.48
160 0.48
161 0.5
162 0.48
163 0.47
164 0.48
165 0.5
166 0.47
167 0.45
168 0.44
169 0.41
170 0.45
171 0.44
172 0.47
173 0.41
174 0.38
175 0.33
176 0.34
177 0.38
178 0.37
179 0.35
180 0.28
181 0.29
182 0.29
183 0.3
184 0.31
185 0.23
186 0.19
187 0.18
188 0.19
189 0.23
190 0.23
191 0.25
192 0.26
193 0.27
194 0.29
195 0.26
196 0.27
197 0.26
198 0.3
199 0.32
200 0.37
201 0.39
202 0.47
203 0.49
204 0.47
205 0.44
206 0.41
207 0.41
208 0.4
209 0.46
210 0.48
211 0.57
212 0.66
213 0.72
214 0.75
215 0.8
216 0.85
217 0.83
218 0.81
219 0.8
220 0.8
221 0.82
222 0.82
223 0.82
224 0.8
225 0.72
226 0.66
227 0.62
228 0.54
229 0.44
230 0.37
231 0.28
232 0.24
233 0.23
234 0.2
235 0.15
236 0.14
237 0.15
238 0.15
239 0.14
240 0.12
241 0.12
242 0.12
243 0.14
244 0.14
245 0.12
246 0.14
247 0.14
248 0.13
249 0.15
250 0.15
251 0.12
252 0.12
253 0.13
254 0.12
255 0.12
256 0.11
257 0.09
258 0.09
259 0.09
260 0.08
261 0.08
262 0.08
263 0.06
264 0.07
265 0.06
266 0.06
267 0.07
268 0.08
269 0.08
270 0.08
271 0.08
272 0.09
273 0.11
274 0.11
275 0.12
276 0.12
277 0.12
278 0.12
279 0.12
280 0.1
281 0.09
282 0.09
283 0.06
284 0.05
285 0.06
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.06
291 0.07
292 0.07
293 0.05
294 0.08
295 0.11
296 0.16
297 0.17
298 0.2
299 0.22
300 0.27
301 0.37
302 0.44
303 0.5
304 0.54
305 0.61
306 0.6
307 0.6
308 0.59