Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C6HAP8

Protein Details
Accession C6HAP8    Localization Confidence High Confidence Score 16.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
147-169AISGAKKKRKRAPPDPNAPKRALHydrophilic
298-322SPEPVREPTPPRSNKRRRTTGGATSHydrophilic
335-356SAKKASPEKKMRGAARKEKEKEBasic
369-390ANETPKGERRGGKKKRKSEAGDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
151-166AKKKRKRAPPDPNAPK
336-387AKKASPEKKMRGAARKEKEKEETAAKPKRGAAAANETPKGERRGGKKKRKSE
Subcellular Location(s) mito 17, cyto 7, nucl 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MPSSRATLPTILRHLFTPNSPPYTHAPPLSLTPPPSLLETINRVILPINVACGNLIAASEDPTNRNALALTHIQVIVSLATLQSAVSDLSRAYINHANTVLNRGPSTLDLGGITSSLLENGFLSGGRGLSPGGGLAAGPRTLGGVDAISGAKKKRKRAPPDPNAPKRALTPYFLYMQHNRASIAQELGENARPKEVADEGTRRWAEMPDEEKQIWKKLYAENLAVYQEKMRAYKAGLPVPEDGLSTTAAANANANAAAMQLQQGVHRAAAGEEDVSSEGSEQESDEEDEEEEEEEESSPEPVREPTPPRSNKRRRTTGGATSDVKVATPTAGSASAKKASPEKKMRGAARKEKEKEETAAKPKRGAAAANETPKGERRGGKKKRKSEAGD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.35
3 0.34
4 0.36
5 0.35
6 0.38
7 0.37
8 0.4
9 0.41
10 0.45
11 0.47
12 0.4
13 0.35
14 0.32
15 0.36
16 0.37
17 0.35
18 0.3
19 0.27
20 0.28
21 0.27
22 0.28
23 0.25
24 0.23
25 0.24
26 0.27
27 0.27
28 0.27
29 0.26
30 0.24
31 0.23
32 0.22
33 0.2
34 0.15
35 0.15
36 0.13
37 0.13
38 0.13
39 0.13
40 0.12
41 0.08
42 0.08
43 0.06
44 0.06
45 0.09
46 0.11
47 0.12
48 0.14
49 0.15
50 0.16
51 0.15
52 0.15
53 0.13
54 0.12
55 0.14
56 0.16
57 0.16
58 0.17
59 0.17
60 0.16
61 0.16
62 0.16
63 0.11
64 0.09
65 0.07
66 0.05
67 0.05
68 0.05
69 0.05
70 0.04
71 0.05
72 0.05
73 0.05
74 0.06
75 0.05
76 0.07
77 0.09
78 0.08
79 0.13
80 0.18
81 0.18
82 0.21
83 0.22
84 0.22
85 0.21
86 0.27
87 0.24
88 0.21
89 0.2
90 0.18
91 0.18
92 0.17
93 0.2
94 0.15
95 0.13
96 0.11
97 0.11
98 0.1
99 0.09
100 0.09
101 0.05
102 0.05
103 0.05
104 0.04
105 0.04
106 0.04
107 0.04
108 0.05
109 0.04
110 0.05
111 0.05
112 0.05
113 0.05
114 0.06
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.04
120 0.04
121 0.03
122 0.04
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.05
127 0.05
128 0.05
129 0.05
130 0.05
131 0.04
132 0.04
133 0.05
134 0.05
135 0.06
136 0.08
137 0.1
138 0.17
139 0.21
140 0.29
141 0.38
142 0.48
143 0.57
144 0.67
145 0.75
146 0.79
147 0.86
148 0.89
149 0.88
150 0.83
151 0.74
152 0.64
153 0.55
154 0.51
155 0.42
156 0.33
157 0.27
158 0.25
159 0.26
160 0.27
161 0.28
162 0.24
163 0.25
164 0.25
165 0.23
166 0.21
167 0.19
168 0.2
169 0.17
170 0.15
171 0.12
172 0.1
173 0.1
174 0.11
175 0.13
176 0.13
177 0.12
178 0.12
179 0.11
180 0.11
181 0.12
182 0.12
183 0.11
184 0.13
185 0.16
186 0.16
187 0.23
188 0.23
189 0.21
190 0.21
191 0.19
192 0.17
193 0.19
194 0.22
195 0.18
196 0.21
197 0.21
198 0.23
199 0.24
200 0.27
201 0.23
202 0.21
203 0.2
204 0.21
205 0.26
206 0.26
207 0.26
208 0.22
209 0.23
210 0.23
211 0.21
212 0.18
213 0.13
214 0.13
215 0.13
216 0.13
217 0.13
218 0.12
219 0.13
220 0.18
221 0.22
222 0.23
223 0.22
224 0.24
225 0.24
226 0.24
227 0.23
228 0.18
229 0.13
230 0.11
231 0.1
232 0.08
233 0.08
234 0.08
235 0.08
236 0.08
237 0.08
238 0.07
239 0.07
240 0.07
241 0.06
242 0.04
243 0.04
244 0.05
245 0.04
246 0.05
247 0.05
248 0.06
249 0.07
250 0.09
251 0.09
252 0.09
253 0.09
254 0.09
255 0.07
256 0.08
257 0.08
258 0.06
259 0.05
260 0.06
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.06
265 0.06
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.07
271 0.08
272 0.09
273 0.09
274 0.09
275 0.09
276 0.1
277 0.09
278 0.08
279 0.07
280 0.07
281 0.07
282 0.07
283 0.07
284 0.08
285 0.08
286 0.08
287 0.09
288 0.11
289 0.12
290 0.19
291 0.24
292 0.32
293 0.42
294 0.51
295 0.59
296 0.68
297 0.77
298 0.81
299 0.85
300 0.87
301 0.82
302 0.82
303 0.81
304 0.79
305 0.75
306 0.71
307 0.64
308 0.54
309 0.51
310 0.42
311 0.34
312 0.25
313 0.18
314 0.13
315 0.1
316 0.09
317 0.08
318 0.11
319 0.12
320 0.14
321 0.18
322 0.21
323 0.22
324 0.24
325 0.31
326 0.34
327 0.44
328 0.51
329 0.55
330 0.6
331 0.68
332 0.74
333 0.76
334 0.8
335 0.8
336 0.81
337 0.83
338 0.8
339 0.79
340 0.77
341 0.71
342 0.66
343 0.64
344 0.63
345 0.63
346 0.67
347 0.62
348 0.6
349 0.58
350 0.58
351 0.53
352 0.46
353 0.42
354 0.43
355 0.48
356 0.5
357 0.49
358 0.44
359 0.44
360 0.47
361 0.45
362 0.42
363 0.41
364 0.44
365 0.54
366 0.64
367 0.72
368 0.77
369 0.83
370 0.87