Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C6HND1

Protein Details
Accession C6HND1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-53MDPPISLPKRKRPPFNPPRPRNGAGITKPSTTSTRSKSKPKPKPNSTARTTTQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-44PKRKRPPFNPPRPRNGAGITKPSTTSTRSKSKPKPKP
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018552  CENP-X  
IPR009072  Histone-fold  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0051382  P:kinetochore assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF09415  CENP-X  
Amino Acid Sequences MDPPISLPKRKRPPFNPPRPRNGAGITKPSTTSTRSKSKPKPKPNSTARTTTQKSASSSSTIHRRSPSTAHNNDNDDDTRASSTSSRTPSPSGPNSSPRVTPSSDYESRSRSRSPSDEPDYILAEITEPAPLDPREELESSDPLIKPKLLTTLLHRHFQNDKTKITKDAVRALAKYVDIFVREALARASYERAEGQSGKSASRDTRGRVEMIILEELY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.85
2 0.89
3 0.9
4 0.87
5 0.89
6 0.87
7 0.81
8 0.74
9 0.69
10 0.68
11 0.62
12 0.62
13 0.55
14 0.48
15 0.47
16 0.45
17 0.41
18 0.36
19 0.38
20 0.36
21 0.43
22 0.47
23 0.57
24 0.64
25 0.73
26 0.79
27 0.83
28 0.87
29 0.86
30 0.9
31 0.9
32 0.89
33 0.83
34 0.8
35 0.74
36 0.73
37 0.67
38 0.61
39 0.56
40 0.51
41 0.48
42 0.43
43 0.4
44 0.33
45 0.31
46 0.32
47 0.36
48 0.35
49 0.36
50 0.36
51 0.36
52 0.36
53 0.4
54 0.43
55 0.44
56 0.47
57 0.48
58 0.49
59 0.49
60 0.47
61 0.45
62 0.37
63 0.29
64 0.24
65 0.2
66 0.16
67 0.14
68 0.14
69 0.12
70 0.13
71 0.16
72 0.19
73 0.19
74 0.2
75 0.22
76 0.25
77 0.3
78 0.32
79 0.32
80 0.32
81 0.37
82 0.39
83 0.38
84 0.36
85 0.31
86 0.3
87 0.26
88 0.24
89 0.23
90 0.26
91 0.27
92 0.29
93 0.29
94 0.3
95 0.3
96 0.32
97 0.29
98 0.24
99 0.25
100 0.26
101 0.29
102 0.34
103 0.38
104 0.36
105 0.35
106 0.35
107 0.32
108 0.28
109 0.23
110 0.14
111 0.09
112 0.08
113 0.07
114 0.06
115 0.05
116 0.05
117 0.07
118 0.08
119 0.09
120 0.09
121 0.1
122 0.13
123 0.13
124 0.14
125 0.14
126 0.15
127 0.15
128 0.18
129 0.17
130 0.15
131 0.16
132 0.15
133 0.14
134 0.14
135 0.17
136 0.15
137 0.16
138 0.22
139 0.31
140 0.34
141 0.39
142 0.38
143 0.38
144 0.41
145 0.46
146 0.49
147 0.44
148 0.46
149 0.46
150 0.48
151 0.47
152 0.46
153 0.45
154 0.39
155 0.42
156 0.44
157 0.42
158 0.41
159 0.39
160 0.38
161 0.33
162 0.29
163 0.23
164 0.17
165 0.15
166 0.15
167 0.13
168 0.13
169 0.13
170 0.13
171 0.12
172 0.12
173 0.11
174 0.12
175 0.14
176 0.12
177 0.14
178 0.15
179 0.16
180 0.19
181 0.2
182 0.21
183 0.26
184 0.26
185 0.26
186 0.26
187 0.28
188 0.27
189 0.33
190 0.36
191 0.33
192 0.41
193 0.42
194 0.42
195 0.39
196 0.39
197 0.34
198 0.32