FuNGI

A0A2K0T6W0

Protein Details

Accession

A0A2K0T6W0

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
6-51	GNPNGPPRSQKPNPLRPLRKKPVNPLVSSSRKPAPKPNRPPTNSAA	Hydrophilic
185-208	VAKEVVPKRPKKQKEEKTMFNRAP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
13-44	RSQKPNPLRPLRKKPVNPLVSSSRKPAPKPNR
191-202	PKRPKKQKEEKT
492-509	QKLSEMGKKGKSLKRAGS
523-526	KKFK
664-670	KRLRRRK

Subcellular Location(s)

nucl 18, mito 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSAPSGNPNGPPRSQKPNPLRPLRKKPVNPLVSSSRKPAPKPNRPPTNSAASSSAKATANGSKPNIEELRKQYGGWSEPPPPYPFNDIPIMTTKKALLNGIRYHLMKFSQTKLGDKPIDPTDQDEFARPVTLHRRDARQPPPGRVVKEEEPERPPVDEQEAERMAQIKAEREAQRAIDQAKIAPVAKEVVPKRPKKQKEEKTMFNRAPKTSAAKKESDLRYEEALPWHLEDADGKNVWVGSYVAALSESSVAFMIDKSVFRMIPLEKSYKFNAKPPFQPFTIDQAEAFMNRKVDVGRWVMKDEEKKAGLNDLEATRRMLYGRGQMIKTESDTFKAASRAEKMEHDELDVSGDEFQDDDETPHFERNDDEDTKDSKERIRREQLGANLFGEGDEQEVDKELQEQLREELERQKYGKTTKKALIKRDREDIYESDDSGSNPWSSSSDDDSSDEEEEAGKDDEKKEGENKDGQGDGKDKSKSQSAKGSTTPQGKQKLSEMGKKGKSLKRAGSPALSESSGNESTRKKFKKASGAATDSRPSTPGLQTNTVRRPKITAGSGSDGEFTAGEMSDGAMQKKKIKLIGSSRGTPSASRAGSPNPAQAGASPSSSGGLIESWEILEKIPADGITIGDLINLFQGRVGDGPGRMPRQEWIGLVKQLCDYGPDKRLRRRK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.59
2	0.64
3	0.68
4	0.73
5	0.78
6	0.81
7	0.87
8	0.87
9	0.92
10	0.93
11	0.93
12	0.9
13	0.9
14	0.9
15	0.87
16	0.79
17	0.75
18	0.74
19	0.72
20	0.67
21	0.62
22	0.59
23	0.57
24	0.58
25	0.62
26	0.64
27	0.66
28	0.74
29	0.79
30	0.82
31	0.81
32	0.83
33	0.78
34	0.77
35	0.68
36	0.6
37	0.55
38	0.47
39	0.44
40	0.39
41	0.38
42	0.29
43	0.27
44	0.27
45	0.29
46	0.31
47	0.36
48	0.37
49	0.35
50	0.35
51	0.42
52	0.45
53	0.41
54	0.43
55	0.43
56	0.5
57	0.47
58	0.46
59	0.42
60	0.43
61	0.43
62	0.4
63	0.39
64	0.37
65	0.4
66	0.44
67	0.44
68	0.39
69	0.39
70	0.42
71	0.39
72	0.36
73	0.37
74	0.34
75	0.32
76	0.38
77	0.4
78	0.32
79	0.32
80	0.3
81	0.28
82	0.3
83	0.32
84	0.29
85	0.31
86	0.34
87	0.37
88	0.4
89	0.37
90	0.36
91	0.35
92	0.32
93	0.3
94	0.3
95	0.3
96	0.33
97	0.35
98	0.38
99	0.39
100	0.46
101	0.44
102	0.41
103	0.42
104	0.38
105	0.41
106	0.37
107	0.37
108	0.32
109	0.31
110	0.31
111	0.28
112	0.25
113	0.21
114	0.23
115	0.19
116	0.21
117	0.28
118	0.33
119	0.38
120	0.41
121	0.48
122	0.52
123	0.62
124	0.64
125	0.65
126	0.64
127	0.63
128	0.68
129	0.67
130	0.62
131	0.57
132	0.56
133	0.52
134	0.55
135	0.53
136	0.49
137	0.46
138	0.48
139	0.45
140	0.4
141	0.34
142	0.29
143	0.29
144	0.27
145	0.24
146	0.28
147	0.27
148	0.26
149	0.25
150	0.25
151	0.2
152	0.2
153	0.2
154	0.16
155	0.17
156	0.25
157	0.26
158	0.27
159	0.3
160	0.29
161	0.3
162	0.31
163	0.3
164	0.24
165	0.22
166	0.21
167	0.2
168	0.2
169	0.18
170	0.15
171	0.14
172	0.14
173	0.14
174	0.21
175	0.21
176	0.29
177	0.38
178	0.44
179	0.52
180	0.6
181	0.67
182	0.7
183	0.8
184	0.8
185	0.82
186	0.84
187	0.85
188	0.84
189	0.85
190	0.8
191	0.76
192	0.72
193	0.61
194	0.56
195	0.49
196	0.47
197	0.45
198	0.49
199	0.46
200	0.42
201	0.43
202	0.5
203	0.51
204	0.47
205	0.42
206	0.36
207	0.34
208	0.33
209	0.33
210	0.25
211	0.24
212	0.2
213	0.17
214	0.16
215	0.13
216	0.11
217	0.11
218	0.12
219	0.14
220	0.13
221	0.12
222	0.12
223	0.12
224	0.12
225	0.11
226	0.09
227	0.05
228	0.06
229	0.06
230	0.05
231	0.06
232	0.06
233	0.05
234	0.06
235	0.05
236	0.05
237	0.05
238	0.05
239	0.05
240	0.05
241	0.07
242	0.07
243	0.07
244	0.09
245	0.1
246	0.1
247	0.1
248	0.14
249	0.13
250	0.17
251	0.2
252	0.23
253	0.23
254	0.26
255	0.29
256	0.33
257	0.34
258	0.35
259	0.41
260	0.41
261	0.47
262	0.49
263	0.5
264	0.43
265	0.45
266	0.4
267	0.38
268	0.36
269	0.29
270	0.23
271	0.2
272	0.2
273	0.18
274	0.18
275	0.13
276	0.1
277	0.1
278	0.11
279	0.1
280	0.11
281	0.14
282	0.16
283	0.2
284	0.21
285	0.22
286	0.22
287	0.25
288	0.28
289	0.27
290	0.27
291	0.23
292	0.23
293	0.22
294	0.24
295	0.2
296	0.17
297	0.17
298	0.14
299	0.14
300	0.14
301	0.15
302	0.12
303	0.12
304	0.12
305	0.11
306	0.11
307	0.14
308	0.18
309	0.21
310	0.21
311	0.21
312	0.22
313	0.22
314	0.21
315	0.2
316	0.16
317	0.14
318	0.14
319	0.15
320	0.15
321	0.16
322	0.15
323	0.14
324	0.16
325	0.16
326	0.16
327	0.18
328	0.2
329	0.21
330	0.2
331	0.18
332	0.16
333	0.14
334	0.14
335	0.12
336	0.08
337	0.06
338	0.06
339	0.05
340	0.05
341	0.05
342	0.05
343	0.05
344	0.06
345	0.06
346	0.08
347	0.09
348	0.12
349	0.12
350	0.11
351	0.12
352	0.14
353	0.19
354	0.18
355	0.19
356	0.19
357	0.21
358	0.24
359	0.25
360	0.23
361	0.22
362	0.27
363	0.32
364	0.38
365	0.44
366	0.46
367	0.48
368	0.51
369	0.51
370	0.48
371	0.44
372	0.35
373	0.27
374	0.22
375	0.18
376	0.14
377	0.09
378	0.05
379	0.05
380	0.04
381	0.04
382	0.06
383	0.06
384	0.06
385	0.07
386	0.08
387	0.09
388	0.1
389	0.1
390	0.11
391	0.13
392	0.14
393	0.14
394	0.21
395	0.22
396	0.25
397	0.25
398	0.26
399	0.28
400	0.35
401	0.42
402	0.39
403	0.43
404	0.45
405	0.54
406	0.57
407	0.63
408	0.66
409	0.67
410	0.66
411	0.67
412	0.63
413	0.56
414	0.54
415	0.45
416	0.41
417	0.34
418	0.3
419	0.23
420	0.22
421	0.2
422	0.17
423	0.17
424	0.1
425	0.09
426	0.1
427	0.09
428	0.1
429	0.12
430	0.15
431	0.15
432	0.16
433	0.17
434	0.18
435	0.19
436	0.18
437	0.16
438	0.12
439	0.11
440	0.1
441	0.11
442	0.1
443	0.09
444	0.11
445	0.11
446	0.15
447	0.15
448	0.17
449	0.21
450	0.22
451	0.26
452	0.29
453	0.29
454	0.29
455	0.3
456	0.28
457	0.26
458	0.26
459	0.23
460	0.24
461	0.25
462	0.23
463	0.24
464	0.31
465	0.31
466	0.33
467	0.4
468	0.39
469	0.42
470	0.44
471	0.47
472	0.47
473	0.51
474	0.5
475	0.49
476	0.52
477	0.49
478	0.47
479	0.45
480	0.48
481	0.46
482	0.49
483	0.49
484	0.5
485	0.52
486	0.56
487	0.61
488	0.56
489	0.59
490	0.58
491	0.59
492	0.58
493	0.6
494	0.58
495	0.52
496	0.49
497	0.44
498	0.39
499	0.33
500	0.25
501	0.21
502	0.23
503	0.22
504	0.21
505	0.23
506	0.24
507	0.29
508	0.4
509	0.43
510	0.42
511	0.47
512	0.54
513	0.61
514	0.64
515	0.68
516	0.66
517	0.68
518	0.67
519	0.63
520	0.59
521	0.5
522	0.43
523	0.34
524	0.27
525	0.24
526	0.24
527	0.26
528	0.28
529	0.33
530	0.37
531	0.44
532	0.52
533	0.56
534	0.53
535	0.49
536	0.48
537	0.46
538	0.49
539	0.45
540	0.4
541	0.38
542	0.41
543	0.41
544	0.38
545	0.34
546	0.27
547	0.23
548	0.17
549	0.13
550	0.09
551	0.07
552	0.07
553	0.06
554	0.06
555	0.1
556	0.12
557	0.14
558	0.17
559	0.19
560	0.26
561	0.3
562	0.33
563	0.34
564	0.36
565	0.42
566	0.48
567	0.56
568	0.56
569	0.57
570	0.56
571	0.55
572	0.52
573	0.44
574	0.39
575	0.37
576	0.32
577	0.28
578	0.28
579	0.28
580	0.34
581	0.35
582	0.36
583	0.29
584	0.29
585	0.28
586	0.26
587	0.28
588	0.22
589	0.21
590	0.17
591	0.15
592	0.15
593	0.15
594	0.14
595	0.09
596	0.08
597	0.07
598	0.08
599	0.08
600	0.07
601	0.09
602	0.09
603	0.08
604	0.1
605	0.1
606	0.1
607	0.11
608	0.11
609	0.11
610	0.11
611	0.11
612	0.11
613	0.1
614	0.09
615	0.09
616	0.09
617	0.07
618	0.1
619	0.1
620	0.08
621	0.09
622	0.1
623	0.1
624	0.11
625	0.14
626	0.13
627	0.14
628	0.2
629	0.26
630	0.3
631	0.29
632	0.3
633	0.3
634	0.33
635	0.35
636	0.31
637	0.31
638	0.33
639	0.38
640	0.38
641	0.37
642	0.32
643	0.31
644	0.29
645	0.27
646	0.23
647	0.25
648	0.33
649	0.4
650	0.47

A0A2K0T6W0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer