Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0W7VPD3

Protein Details
Accession A0A0W7VPD3    Localization Confidence High Confidence Score 15.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
226-246AGTGGKKQRERERKVKQTVDFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
89-112DGPRGGQGARVRGGRGGRFPRDRD
232-239KQRERERK
255-290RTRGGGRGGRGGPRGGRGGDRGGDQPRGGRGNFRGG
Subcellular Location(s) nucl 11.5, cyto_nucl 11.5, cyto 8.5, pero 3, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039764  HABP4/SERBP1  
IPR006861  HABP4_PAIRBP1-bd  
IPR019084  Stm1-like_N  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF09598  Stm1_N  
Amino Acid Sequences MSQVASQNRFAYLGNDSDGEEKPVVPVKTVDKATARTTKRNVEPQAPAAPLRTGGNRRGNLGGNEGAFRDRAAGRERNQGRSTEETPRDGPRGGQGARVRGGRGGRFPRDRDDRHPHKSGATTGSDKQAAQSWGATEGNAELKDEQAGEAIAESEKKDEAENVAAEEPAEPEDKSISFADYQAQQAEKKGAFDSEISIRSANEGSKIDKKWAAAKPLEKEEDVYFAGTGGKKQRERERKVKQTVDFDPRFVEPERTRGGGRGGRGGPRGGRGGDRGGDQPRGGRGNFRGGRGGQAASINTKDESAFPSLGN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.18
3 0.18
4 0.2
5 0.2
6 0.21
7 0.19
8 0.17
9 0.18
10 0.24
11 0.23
12 0.21
13 0.24
14 0.25
15 0.32
16 0.33
17 0.35
18 0.32
19 0.36
20 0.41
21 0.47
22 0.47
23 0.48
24 0.53
25 0.57
26 0.61
27 0.67
28 0.65
29 0.63
30 0.63
31 0.6
32 0.6
33 0.52
34 0.46
35 0.38
36 0.33
37 0.28
38 0.25
39 0.27
40 0.25
41 0.32
42 0.4
43 0.39
44 0.41
45 0.43
46 0.44
47 0.39
48 0.39
49 0.33
50 0.24
51 0.24
52 0.22
53 0.19
54 0.16
55 0.14
56 0.14
57 0.12
58 0.14
59 0.2
60 0.26
61 0.28
62 0.38
63 0.42
64 0.46
65 0.48
66 0.46
67 0.45
68 0.45
69 0.46
70 0.45
71 0.44
72 0.4
73 0.41
74 0.42
75 0.4
76 0.34
77 0.31
78 0.26
79 0.29
80 0.26
81 0.3
82 0.29
83 0.3
84 0.33
85 0.34
86 0.3
87 0.26
88 0.29
89 0.25
90 0.3
91 0.33
92 0.37
93 0.41
94 0.43
95 0.48
96 0.53
97 0.55
98 0.56
99 0.6
100 0.61
101 0.63
102 0.65
103 0.58
104 0.52
105 0.5
106 0.44
107 0.37
108 0.32
109 0.29
110 0.26
111 0.28
112 0.26
113 0.24
114 0.21
115 0.22
116 0.19
117 0.16
118 0.15
119 0.12
120 0.14
121 0.14
122 0.13
123 0.08
124 0.08
125 0.1
126 0.09
127 0.09
128 0.07
129 0.07
130 0.07
131 0.07
132 0.06
133 0.05
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.04
141 0.05
142 0.05
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.07
147 0.09
148 0.08
149 0.09
150 0.09
151 0.09
152 0.09
153 0.08
154 0.07
155 0.07
156 0.07
157 0.06
158 0.06
159 0.07
160 0.07
161 0.09
162 0.09
163 0.09
164 0.09
165 0.09
166 0.11
167 0.12
168 0.12
169 0.11
170 0.13
171 0.12
172 0.13
173 0.16
174 0.14
175 0.14
176 0.14
177 0.12
178 0.12
179 0.12
180 0.14
181 0.14
182 0.15
183 0.14
184 0.14
185 0.14
186 0.14
187 0.15
188 0.13
189 0.12
190 0.12
191 0.15
192 0.22
193 0.23
194 0.25
195 0.26
196 0.27
197 0.32
198 0.35
199 0.38
200 0.36
201 0.41
202 0.43
203 0.47
204 0.48
205 0.4
206 0.38
207 0.32
208 0.3
209 0.25
210 0.21
211 0.14
212 0.12
213 0.15
214 0.13
215 0.15
216 0.19
217 0.26
218 0.29
219 0.37
220 0.47
221 0.55
222 0.63
223 0.71
224 0.75
225 0.78
226 0.84
227 0.84
228 0.8
229 0.77
230 0.76
231 0.76
232 0.66
233 0.57
234 0.5
235 0.42
236 0.4
237 0.34
238 0.35
239 0.26
240 0.31
241 0.33
242 0.33
243 0.33
244 0.32
245 0.37
246 0.32
247 0.32
248 0.34
249 0.33
250 0.36
251 0.37
252 0.39
253 0.33
254 0.33
255 0.35
256 0.29
257 0.28
258 0.26
259 0.28
260 0.27
261 0.27
262 0.29
263 0.3
264 0.31
265 0.29
266 0.3
267 0.31
268 0.34
269 0.32
270 0.33
271 0.32
272 0.4
273 0.43
274 0.42
275 0.42
276 0.39
277 0.43
278 0.39
279 0.37
280 0.28
281 0.28
282 0.27
283 0.25
284 0.26
285 0.23
286 0.2
287 0.2
288 0.19
289 0.18
290 0.19
291 0.2