Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C6HHT5

Protein Details
Accession C6HHT5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
362-387KSPTTPGGMKERTKRRKSKILSTAVVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
365-380TTPGGMKERTKRRKSK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 13.5, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007018  Mediator_Med6  
IPR038566  Mediator_Med6_sf  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF04934  Med6  
Amino Acid Sequences MAAQPEVPLEEITWRSPQHVQMMGGYLHSNNILFYFAESPFFDKTSNNASLAVQASYNENFRHFLETREAFEGRLKGMQGLEFMVVHDPLQEAAAAGGIQQQRVQQEPSNVWVIRKQMRKKRAGLGSGPAGSDDEIQVLATYFVVGDSVYMAPSVLKIVGSRILSTVTSLTKALSAASPLPIFSPSYGHTYMPPVPKALESSRPGVQQSDQQSVADTPMPDALLQSKDASALSSTAEQPSASTSVSPLTSSSTTMQDSRSLIEAFNLLSRYGDEYMDDAPLLGEPGSFIIGKTSTEPLVVGMRQPVNSEASKAPTPAPSTGVGGSMSKPGTPAATGTTTALSAIKTDPATIGVGKTGKGGEKSPTTPGGMKERTKRRKSKILSTAVVSSATGPGAGVS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.26
3 0.3
4 0.33
5 0.35
6 0.37
7 0.36
8 0.33
9 0.36
10 0.33
11 0.3
12 0.27
13 0.2
14 0.16
15 0.16
16 0.14
17 0.1
18 0.1
19 0.1
20 0.09
21 0.11
22 0.13
23 0.13
24 0.16
25 0.16
26 0.18
27 0.19
28 0.2
29 0.19
30 0.16
31 0.2
32 0.24
33 0.27
34 0.25
35 0.24
36 0.23
37 0.26
38 0.27
39 0.24
40 0.17
41 0.14
42 0.17
43 0.17
44 0.2
45 0.17
46 0.17
47 0.19
48 0.19
49 0.26
50 0.23
51 0.25
52 0.3
53 0.31
54 0.33
55 0.36
56 0.35
57 0.29
58 0.33
59 0.31
60 0.24
61 0.24
62 0.21
63 0.18
64 0.19
65 0.19
66 0.15
67 0.15
68 0.14
69 0.11
70 0.12
71 0.11
72 0.1
73 0.09
74 0.09
75 0.08
76 0.07
77 0.08
78 0.07
79 0.05
80 0.05
81 0.05
82 0.05
83 0.04
84 0.09
85 0.1
86 0.1
87 0.12
88 0.14
89 0.16
90 0.18
91 0.21
92 0.19
93 0.23
94 0.24
95 0.26
96 0.3
97 0.29
98 0.28
99 0.28
100 0.3
101 0.33
102 0.41
103 0.47
104 0.5
105 0.59
106 0.66
107 0.68
108 0.71
109 0.71
110 0.67
111 0.61
112 0.56
113 0.52
114 0.45
115 0.39
116 0.3
117 0.23
118 0.19
119 0.16
120 0.11
121 0.07
122 0.06
123 0.06
124 0.06
125 0.05
126 0.05
127 0.04
128 0.04
129 0.03
130 0.03
131 0.03
132 0.03
133 0.03
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.05
139 0.04
140 0.05
141 0.05
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.06
146 0.1
147 0.1
148 0.1
149 0.1
150 0.11
151 0.11
152 0.11
153 0.12
154 0.08
155 0.09
156 0.09
157 0.09
158 0.08
159 0.08
160 0.08
161 0.07
162 0.07
163 0.07
164 0.08
165 0.08
166 0.08
167 0.08
168 0.08
169 0.09
170 0.08
171 0.09
172 0.09
173 0.13
174 0.14
175 0.14
176 0.14
177 0.17
178 0.22
179 0.23
180 0.22
181 0.18
182 0.18
183 0.18
184 0.2
185 0.19
186 0.21
187 0.2
188 0.22
189 0.24
190 0.25
191 0.25
192 0.23
193 0.21
194 0.2
195 0.22
196 0.22
197 0.2
198 0.19
199 0.19
200 0.18
201 0.19
202 0.15
203 0.11
204 0.08
205 0.08
206 0.09
207 0.08
208 0.08
209 0.09
210 0.08
211 0.09
212 0.09
213 0.08
214 0.08
215 0.09
216 0.09
217 0.07
218 0.06
219 0.07
220 0.08
221 0.08
222 0.09
223 0.09
224 0.08
225 0.08
226 0.09
227 0.1
228 0.08
229 0.07
230 0.07
231 0.09
232 0.09
233 0.09
234 0.08
235 0.1
236 0.1
237 0.12
238 0.13
239 0.14
240 0.15
241 0.16
242 0.17
243 0.16
244 0.16
245 0.16
246 0.17
247 0.15
248 0.14
249 0.13
250 0.13
251 0.1
252 0.12
253 0.11
254 0.09
255 0.09
256 0.09
257 0.11
258 0.12
259 0.11
260 0.1
261 0.1
262 0.11
263 0.11
264 0.1
265 0.07
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.05
270 0.04
271 0.04
272 0.04
273 0.06
274 0.06
275 0.06
276 0.07
277 0.07
278 0.08
279 0.1
280 0.12
281 0.11
282 0.11
283 0.11
284 0.11
285 0.14
286 0.13
287 0.13
288 0.16
289 0.17
290 0.18
291 0.19
292 0.19
293 0.2
294 0.2
295 0.22
296 0.19
297 0.22
298 0.23
299 0.23
300 0.23
301 0.23
302 0.26
303 0.24
304 0.25
305 0.21
306 0.22
307 0.21
308 0.2
309 0.17
310 0.15
311 0.15
312 0.16
313 0.15
314 0.13
315 0.13
316 0.13
317 0.13
318 0.12
319 0.12
320 0.12
321 0.14
322 0.15
323 0.15
324 0.15
325 0.14
326 0.14
327 0.14
328 0.1
329 0.1
330 0.1
331 0.13
332 0.12
333 0.13
334 0.13
335 0.13
336 0.15
337 0.14
338 0.14
339 0.14
340 0.15
341 0.15
342 0.16
343 0.17
344 0.19
345 0.2
346 0.22
347 0.24
348 0.3
349 0.32
350 0.35
351 0.36
352 0.36
353 0.37
354 0.39
355 0.43
356 0.45
357 0.5
358 0.55
359 0.63
360 0.7
361 0.77
362 0.83
363 0.83
364 0.86
365 0.87
366 0.88
367 0.87
368 0.86
369 0.79
370 0.73
371 0.68
372 0.58
373 0.5
374 0.4
375 0.3
376 0.22
377 0.17
378 0.13