Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C6HDQ9

Protein Details
Accession C6HDQ9    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
153-178AEVEKEKKLRNLRKKLRQARELGRGKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
92-105NKNAKKREAKRRAK
157-174KEKKLRNLRKKLRQAREL
Subcellular Location(s) cyto 24.5, cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039333  PYM1  
IPR015362  WIBG_mago-bd  
IPR036348  WIBG_N_sf  
Gene Ontology GO:1903259  P:exon-exon junction complex disassembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF09282  Mago-bind  
Amino Acid Sequences MPPKSESEPISSSGITVNALTGERHIPASTRADGSQRREIKIRPGYRPPEDIQVYKNRTAEAWKNRGKGGIPGAEGLGEESARSAAATAASNKNAKKREAKRRAKAVEGENDLPTTSGKVEGGAPGKAKEKENWRERKEEENPGADADVVHDAEVEKEKKLRNLRKKLRQARELGRGKTLWYMMDLLRDDIQTMVRGEKKEGGFVTSIIISFEVAHSNGVTEASCDGYVD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.16
3 0.14
4 0.11
5 0.09
6 0.1
7 0.1
8 0.11
9 0.12
10 0.12
11 0.13
12 0.13
13 0.13
14 0.17
15 0.21
16 0.22
17 0.23
18 0.23
19 0.29
20 0.35
21 0.4
22 0.46
23 0.46
24 0.46
25 0.49
26 0.5
27 0.52
28 0.56
29 0.57
30 0.55
31 0.59
32 0.64
33 0.64
34 0.67
35 0.59
36 0.58
37 0.54
38 0.48
39 0.44
40 0.46
41 0.46
42 0.45
43 0.44
44 0.35
45 0.33
46 0.37
47 0.41
48 0.4
49 0.45
50 0.47
51 0.48
52 0.48
53 0.5
54 0.45
55 0.4
56 0.36
57 0.3
58 0.25
59 0.23
60 0.22
61 0.2
62 0.18
63 0.14
64 0.09
65 0.05
66 0.04
67 0.04
68 0.04
69 0.04
70 0.04
71 0.04
72 0.04
73 0.05
74 0.06
75 0.1
76 0.12
77 0.14
78 0.18
79 0.19
80 0.26
81 0.28
82 0.31
83 0.38
84 0.45
85 0.55
86 0.62
87 0.71
88 0.73
89 0.8
90 0.79
91 0.73
92 0.68
93 0.62
94 0.57
95 0.51
96 0.45
97 0.35
98 0.32
99 0.27
100 0.22
101 0.17
102 0.11
103 0.07
104 0.06
105 0.05
106 0.05
107 0.06
108 0.08
109 0.1
110 0.1
111 0.11
112 0.12
113 0.16
114 0.18
115 0.19
116 0.21
117 0.29
118 0.37
119 0.46
120 0.55
121 0.54
122 0.58
123 0.59
124 0.64
125 0.6
126 0.6
127 0.54
128 0.46
129 0.44
130 0.38
131 0.35
132 0.26
133 0.2
134 0.12
135 0.1
136 0.07
137 0.07
138 0.06
139 0.06
140 0.08
141 0.13
142 0.12
143 0.12
144 0.16
145 0.18
146 0.25
147 0.35
148 0.45
149 0.51
150 0.61
151 0.71
152 0.78
153 0.87
154 0.9
155 0.9
156 0.87
157 0.85
158 0.82
159 0.82
160 0.79
161 0.7
162 0.64
163 0.54
164 0.48
165 0.43
166 0.36
167 0.25
168 0.19
169 0.19
170 0.15
171 0.2
172 0.2
173 0.18
174 0.19
175 0.18
176 0.17
177 0.15
178 0.16
179 0.13
180 0.14
181 0.17
182 0.2
183 0.21
184 0.23
185 0.29
186 0.29
187 0.32
188 0.31
189 0.28
190 0.25
191 0.24
192 0.24
193 0.18
194 0.17
195 0.13
196 0.12
197 0.1
198 0.09
199 0.1
200 0.1
201 0.1
202 0.1
203 0.1
204 0.1
205 0.1
206 0.11
207 0.1
208 0.08
209 0.09
210 0.11