Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C6HCJ7

Protein Details
Accession C6HCJ7    Localization Confidence High Confidence Score 20.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
38-70LTEPDSDVPRDRRRGKRKRRQLHYRPSTSVPKKBasic
144-164TISRYCRKKEAEPSAHRKWRDHydrophilic
526-545EKFARRKDDVKKTRNRLLYRBasic
626-647LEGGPRRGRRPKAPPPSPPLPPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
47-58RDRRRGKRKRRQ
630-640PRRGRRPKAPP
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021842  DUF3435  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
Pfam View protein in Pfam  
PF11917  DUF3435  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
Amino Acid Sequences MPKRRHNQVISSNDGGTTDESSRMDMNSGSDYGYETELTEPDSDVPRDRRRGKRKRRQLHYRPSTSVPKKVVAAAATDDSDDDTDPEDDTDDEISSGDEDDDYSPGARRLIARMEDHWQRSASLSPARNPLPPLNPRFGTDRETISRYCRKKEAEPSAHRKWRDPIDALRAAGRSDLYRFFNWRFGLKLGEGRSSTEGDEQVELPEGRLEELPALLRGRDWQQGRCTADAVDAEGKSHSPIGRRLSRLIVVEEPSTAGQEAWAGHTGEGEDAGRDPSGGPHLPTVEFRYRFTKKHLGLTPTNTFILPEIIYEPSLILSPHNFLFGILFFFGAFKATNLTSMEKLRGLTIGGGRQQKPIPLKPEMADHYVFCKVTKEGGKVRILPEEKMDPSSAIRTIAEICGFLHPWFNHRCRYGGGLILNKSGLVGDAEQNLVLKHASIRTFLDHYIPRTVSINMQPLISGLEPNAPLMRAITRIGRWLDKRRPRHLTDAQKATVEQDPELQEVIQKRDRAGRRAVQTNSPGAIEKFARRKDDVKKTRNRLLYRYRKQVREEFDDEQAVIDIERQLSGMALDEEAKETLEEEQMLPAQIHLLSKLLTWPTSRSVEEELRRRDAGVEAVRMYCGVLEGGPRRGRRPKAPPPSPPLPPTQTLVETDGRSKTNDEVSPEAWSDALRAAEEHIRDAKQPRGCFECYAHPGSSDHRRIHRYSRPADLSRHFRDDHLLHLKDGEPAWCSWCEIKLEHKMHVQNHAKMVHRVHT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.36
3 0.27
4 0.23
5 0.17
6 0.17
7 0.17
8 0.19
9 0.2
10 0.19
11 0.19
12 0.16
13 0.17
14 0.17
15 0.17
16 0.15
17 0.14
18 0.15
19 0.15
20 0.16
21 0.14
22 0.12
23 0.13
24 0.13
25 0.14
26 0.14
27 0.13
28 0.15
29 0.19
30 0.2
31 0.26
32 0.34
33 0.41
34 0.5
35 0.59
36 0.67
37 0.73
38 0.83
39 0.87
40 0.9
41 0.93
42 0.94
43 0.95
44 0.96
45 0.95
46 0.96
47 0.95
48 0.92
49 0.86
50 0.82
51 0.82
52 0.77
53 0.74
54 0.67
55 0.6
56 0.53
57 0.5
58 0.47
59 0.36
60 0.33
61 0.27
62 0.26
63 0.22
64 0.2
65 0.18
66 0.15
67 0.15
68 0.13
69 0.1
70 0.1
71 0.1
72 0.11
73 0.11
74 0.11
75 0.1
76 0.11
77 0.11
78 0.09
79 0.09
80 0.09
81 0.09
82 0.08
83 0.08
84 0.07
85 0.06
86 0.07
87 0.08
88 0.08
89 0.09
90 0.09
91 0.1
92 0.12
93 0.12
94 0.13
95 0.14
96 0.17
97 0.23
98 0.27
99 0.28
100 0.29
101 0.36
102 0.42
103 0.43
104 0.42
105 0.36
106 0.32
107 0.31
108 0.32
109 0.29
110 0.29
111 0.3
112 0.31
113 0.38
114 0.39
115 0.4
116 0.41
117 0.42
118 0.43
119 0.48
120 0.49
121 0.49
122 0.48
123 0.47
124 0.48
125 0.45
126 0.42
127 0.37
128 0.37
129 0.34
130 0.37
131 0.36
132 0.39
133 0.46
134 0.46
135 0.48
136 0.49
137 0.5
138 0.55
139 0.64
140 0.67
141 0.69
142 0.74
143 0.77
144 0.8
145 0.83
146 0.76
147 0.7
148 0.66
149 0.64
150 0.6
151 0.56
152 0.52
153 0.53
154 0.55
155 0.51
156 0.47
157 0.39
158 0.32
159 0.29
160 0.23
161 0.16
162 0.15
163 0.19
164 0.2
165 0.21
166 0.26
167 0.27
168 0.32
169 0.32
170 0.31
171 0.29
172 0.26
173 0.27
174 0.24
175 0.28
176 0.24
177 0.27
178 0.26
179 0.26
180 0.27
181 0.25
182 0.24
183 0.21
184 0.2
185 0.16
186 0.17
187 0.15
188 0.13
189 0.15
190 0.14
191 0.12
192 0.12
193 0.11
194 0.11
195 0.11
196 0.11
197 0.08
198 0.09
199 0.09
200 0.1
201 0.1
202 0.09
203 0.09
204 0.11
205 0.14
206 0.2
207 0.22
208 0.25
209 0.29
210 0.36
211 0.38
212 0.36
213 0.34
214 0.27
215 0.27
216 0.22
217 0.2
218 0.17
219 0.14
220 0.14
221 0.13
222 0.13
223 0.12
224 0.14
225 0.13
226 0.13
227 0.19
228 0.26
229 0.32
230 0.34
231 0.36
232 0.36
233 0.38
234 0.36
235 0.34
236 0.29
237 0.24
238 0.22
239 0.2
240 0.18
241 0.14
242 0.13
243 0.11
244 0.08
245 0.06
246 0.07
247 0.07
248 0.08
249 0.1
250 0.1
251 0.09
252 0.1
253 0.1
254 0.09
255 0.09
256 0.07
257 0.05
258 0.05
259 0.06
260 0.06
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.1
265 0.1
266 0.11
267 0.11
268 0.13
269 0.13
270 0.15
271 0.2
272 0.23
273 0.24
274 0.25
275 0.32
276 0.35
277 0.36
278 0.41
279 0.45
280 0.4
281 0.48
282 0.51
283 0.49
284 0.49
285 0.53
286 0.49
287 0.42
288 0.4
289 0.31
290 0.26
291 0.2
292 0.18
293 0.12
294 0.09
295 0.08
296 0.08
297 0.08
298 0.08
299 0.08
300 0.06
301 0.07
302 0.06
303 0.05
304 0.06
305 0.07
306 0.07
307 0.08
308 0.08
309 0.07
310 0.08
311 0.08
312 0.08
313 0.06
314 0.06
315 0.05
316 0.05
317 0.05
318 0.06
319 0.06
320 0.04
321 0.06
322 0.06
323 0.08
324 0.09
325 0.11
326 0.12
327 0.13
328 0.15
329 0.14
330 0.14
331 0.12
332 0.11
333 0.1
334 0.1
335 0.1
336 0.11
337 0.15
338 0.2
339 0.21
340 0.24
341 0.24
342 0.26
343 0.29
344 0.31
345 0.31
346 0.29
347 0.3
348 0.28
349 0.32
350 0.3
351 0.29
352 0.25
353 0.21
354 0.2
355 0.2
356 0.2
357 0.15
358 0.14
359 0.11
360 0.15
361 0.18
362 0.2
363 0.23
364 0.28
365 0.3
366 0.31
367 0.32
368 0.34
369 0.32
370 0.28
371 0.26
372 0.23
373 0.22
374 0.21
375 0.2
376 0.14
377 0.13
378 0.14
379 0.13
380 0.1
381 0.09
382 0.09
383 0.09
384 0.09
385 0.09
386 0.07
387 0.07
388 0.08
389 0.09
390 0.08
391 0.12
392 0.11
393 0.15
394 0.21
395 0.23
396 0.26
397 0.27
398 0.28
399 0.25
400 0.28
401 0.25
402 0.22
403 0.23
404 0.22
405 0.22
406 0.21
407 0.2
408 0.16
409 0.15
410 0.11
411 0.09
412 0.05
413 0.05
414 0.06
415 0.07
416 0.07
417 0.07
418 0.07
419 0.07
420 0.07
421 0.06
422 0.05
423 0.05
424 0.08
425 0.09
426 0.1
427 0.12
428 0.13
429 0.15
430 0.15
431 0.19
432 0.18
433 0.2
434 0.23
435 0.22
436 0.2
437 0.2
438 0.21
439 0.19
440 0.2
441 0.23
442 0.19
443 0.19
444 0.18
445 0.16
446 0.17
447 0.14
448 0.11
449 0.06
450 0.09
451 0.09
452 0.09
453 0.1
454 0.08
455 0.08
456 0.08
457 0.09
458 0.08
459 0.09
460 0.11
461 0.11
462 0.15
463 0.18
464 0.22
465 0.27
466 0.35
467 0.44
468 0.51
469 0.58
470 0.63
471 0.69
472 0.68
473 0.72
474 0.72
475 0.72
476 0.72
477 0.7
478 0.62
479 0.55
480 0.51
481 0.44
482 0.38
483 0.28
484 0.2
485 0.17
486 0.17
487 0.17
488 0.17
489 0.15
490 0.14
491 0.16
492 0.22
493 0.22
494 0.22
495 0.22
496 0.3
497 0.35
498 0.37
499 0.41
500 0.43
501 0.45
502 0.52
503 0.53
504 0.5
505 0.49
506 0.47
507 0.4
508 0.34
509 0.29
510 0.21
511 0.22
512 0.18
513 0.21
514 0.27
515 0.3
516 0.33
517 0.35
518 0.42
519 0.49
520 0.58
521 0.62
522 0.65
523 0.71
524 0.75
525 0.8
526 0.82
527 0.76
528 0.73
529 0.74
530 0.75
531 0.74
532 0.77
533 0.76
534 0.74
535 0.76
536 0.74
537 0.7
538 0.67
539 0.64
540 0.56
541 0.51
542 0.46
543 0.39
544 0.32
545 0.26
546 0.17
547 0.12
548 0.1
549 0.08
550 0.07
551 0.07
552 0.07
553 0.06
554 0.06
555 0.07
556 0.07
557 0.06
558 0.06
559 0.07
560 0.07
561 0.08
562 0.08
563 0.09
564 0.07
565 0.07
566 0.08
567 0.09
568 0.09
569 0.08
570 0.1
571 0.1
572 0.11
573 0.1
574 0.09
575 0.09
576 0.09
577 0.09
578 0.08
579 0.08
580 0.08
581 0.08
582 0.12
583 0.12
584 0.13
585 0.14
586 0.16
587 0.2
588 0.24
589 0.24
590 0.23
591 0.28
592 0.34
593 0.4
594 0.46
595 0.46
596 0.48
597 0.47
598 0.45
599 0.41
600 0.35
601 0.35
602 0.3
603 0.28
604 0.24
605 0.25
606 0.24
607 0.23
608 0.21
609 0.13
610 0.1
611 0.07
612 0.06
613 0.11
614 0.14
615 0.21
616 0.27
617 0.29
618 0.36
619 0.44
620 0.51
621 0.55
622 0.63
623 0.66
624 0.72
625 0.79
626 0.81
627 0.8
628 0.81
629 0.77
630 0.7
631 0.67
632 0.61
633 0.54
634 0.48
635 0.44
636 0.39
637 0.35
638 0.36
639 0.33
640 0.29
641 0.3
642 0.31
643 0.28
644 0.27
645 0.27
646 0.26
647 0.29
648 0.3
649 0.31
650 0.31
651 0.31
652 0.33
653 0.32
654 0.29
655 0.22
656 0.19
657 0.16
658 0.14
659 0.14
660 0.1
661 0.1
662 0.12
663 0.17
664 0.17
665 0.2
666 0.22
667 0.23
668 0.27
669 0.31
670 0.36
671 0.38
672 0.4
673 0.42
674 0.43
675 0.44
676 0.44
677 0.43
678 0.45
679 0.44
680 0.47
681 0.42
682 0.37
683 0.37
684 0.39
685 0.46
686 0.44
687 0.45
688 0.48
689 0.54
690 0.57
691 0.65
692 0.68
693 0.67
694 0.65
695 0.68
696 0.69
697 0.68
698 0.71
699 0.7
700 0.7
701 0.67
702 0.68
703 0.59
704 0.51
705 0.54
706 0.48
707 0.49
708 0.49
709 0.44
710 0.38
711 0.39
712 0.39
713 0.35
714 0.35
715 0.28
716 0.2
717 0.2
718 0.23
719 0.21
720 0.23
721 0.21
722 0.24
723 0.25
724 0.25
725 0.32
726 0.39
727 0.41
728 0.43
729 0.49
730 0.53
731 0.53
732 0.61
733 0.62
734 0.57
735 0.61
736 0.62
737 0.58
738 0.57